斜纹夜蛾核型多角体病毒侵染SL221细胞早期阶段转录分析
斜纹夜蛾(Spodoptera litura, S. litura)是来源于印度的谷物类害虫,属鳞翅目类昆虫,目前在多个国家都有广泛的分布。核型多角体病毒(nucleopolyhedrovirus, NPV)可寄生于鳞翅目昆虫的血、脂肪、氯管、皮肢等细胞的细胞核内发育,对其产生致命影响。然而由于缺乏参考基因组序列以及转录组数据,以致迄今为止,并未有关于斜纹夜蛾核型多角体病毒(SpltNPV)侵染斜纹夜蛾细胞时细胞内早期变化的报道。在农业生产上,对现代农业粮食安全也产生了较大的威胁。本研究中,研究者对18h侵染循环的宿主斜纹夜蛾细胞进行链特异性转录组测序(Strand-specific RNA sequencing, RNA-seq),序列拼接后得到99180个非重复序列。在整个侵染过程中,有超过2000个斜纹夜蛾基因被显著性差异调控。在侵染6 小时后(hours post infection, hpi),病毒mRNA水平开始......阅读全文
真核细胞表达系统的类型与常用真核细胞表达载体
原核表达系统是常被用来研究基因功能的成熟系统,由于原核表达系统具有包涵体蛋白不易纯化、蛋白修饰不完整等缺陷,人们也开始利用真核细胞表达系统来研究基因。自上世纪70年代基因工程 技术诞生以来,基因表达技术已渗透到生命科学研究的各个领域。并随着人类基因组计划实施的进行,在技术方法上得到了很大发展,时至今
水稻条纹病毒通过干扰植物蛋白棕榈酰化建立侵染新机制
水稻条纹病毒(Rice stripe virus, RSV)引起的水稻条纹叶枯病是目前我国以及东亚地区粳稻生产上最严重的病毒病害之一, 最近几十年在我国多次爆发流行。中国农科院植物保护研究所所长周雪平教授带领团队在前期对该病毒的生物学、编码蛋白功能及病毒病防控基础上,进一步深入探索了RSV和寄
单链RNA的基本信息介绍
一般来说生物学家是根据RNA能否直接起mRNA作用而分成正链ssRNA病毒与负链ssRNA病毒两种。 (1)正链RNA病毒(如脊髓灰质炎病毒)的ssRNA可直接起mRNA作用,转译早期蛋白质,包括RNA多聚酶和抑制宿主细胞合成代谢的调控蛋白。然后在RNA多聚酶的作用下,以ssRNA(正链)为模板
实用技巧二——单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析
基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析,在上一篇中,我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容(具体内容查看链接)。在这里,我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。 细胞谱系分析,最简明的理解就是细胞领域的进化树,通常指的是某类祖源细胞,在特定条件下,有多
实用技巧二——单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析
基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析,在上一篇中,我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容(具体内容查看链接)。在这里,我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。 细胞谱系分析,最简明的理解就是细胞领域的进化树,通常指的是某类祖源细胞,在特定条件下,有多
反转录病毒产毒细胞系建立实验——培养细胞的Xgal染色
实验材料转染细胞试剂、试剂盒PBS戊二醛低聚甲醛Xgal溶液仪器、耗材培养箱离心机实验步骤1. 弃培荞上清并加固定液,室温下,在通风橱中与2%低聚甲醛共育60 min,或与0.05%戊二醛共育5~15 min。2. 根据实验室化学物弃置规程弃去固定液,室温下用PBS充分洗涤细胞3次,第1次和第3
反转录病毒的传播介绍
反转录病毒在自然界的传播分为水平传播和垂直传播。水平传播是通过个体接触而传播,例如猫白血病病毒的传播。垂直传播即由上一代向下一代的传递,病原体长期在机体内潜伏,不表现出任何特征,也不引起疾病的任何症状。只有在特殊条件的影响下,病毒才活跃起来,对宿主而言,就有可能诱发肿瘤的发生发展,以至死亡。这种
反转录病毒的特点介绍
1)病毒为球形,直径100~120纳米,衣壳20面体立体对称,有包膜; 2)基因组为二倍体(唯一基因组非单倍体的病毒),两个相同+ssRNA; 3)含有逆转录酶和整合酶; 4)复制通过DNA中间体,并与宿主细胞的染色体整合(唯一会主动整合的病毒); 5)具有gag、pol、env编码基因
反转录病毒原液检测实验
辅助病毒是一种有时存在于无复制能力病毒原液中的有复制能力的病毒,辅助病毒的存在在动物的感染及谱系分析中会成为问题。实验材料病毒细胞试剂、试剂盒polybrene小牛血清DMEM仪器、耗材培养皿滤膜实验步骤1. 在开始分析的前1天,按1:50将NIH 3T3细胞分传于3个6 cm 培养皿中。将1个培
反转录病毒原液检测实验
实验材料 病毒细胞试剂、试剂盒 polybrene小牛血清DMEM仪器、耗材 培养皿滤膜实验步骤 1. 在开始分析的前1天,按1:50将NIH 3T3细胞分传于3个6 cm 培养皿中。将1个培养皿标记为阳性对照,1个为阴性对照,1个用于待测病毒原液。2. 含有选择标记的待测病毒的制备:加0.01
反转录病毒原液检测实验
实验材料 病毒细胞 试剂、试剂盒 polybrene 小牛血清 DMEM
单细胞核RNA测序技术建立了种子早期胚乳发育的转录图谱
种子是裸子植物和被子植物特有的繁殖体,是胚珠经过受精以后形成的结构,在植物生命周期中处于关键位置。种子主要由种皮、胚和胚乳组成。其中胚乳是大多数开花植物双受精后产生的组织,一般为三倍体(每个细胞核有三套染色体),胚乳中含有丰富的营养物质,是人类消耗热量的主要来源。 基因组印迹是一种表观遗传基因
南昌发现世界首报染色体异常核型
近日,南昌市医科所附属医院发现的一例“人类染色体异常核型”获中国遗传学鉴定权威机构认定,确认为世界首报新的人类染色体异常核型。 今年3月,一名男性患者因无精子症及第二性征不发育等原因到南昌市医科所附属医院就诊,基因检测时诊断为染色体异常,而且为罕见的涉及两条染色体之间的相互易位。
高脂血症大鼠种植体早期骨结合界面的微观分析
目的研究高脂血症大鼠种植体早期骨结合界面的微观形态和微观成分,并探究其与Dishevelled-2 (DVL2)相关的可能的分子机制。方法(1).Wistar大鼠60只,均为雄性,依照随机原则,分为实验组和对照组分别以高脂饲料和普通饲料喂养。(2).12周后,检测实验组大鼠血脂水平,去除实验组中不符
正常细胞常规核型的标本制备实验
微量全血培养人淋巴细胞染色体标本制备肿瘤细胞的染色体标本制备人体染色体常规核型的分析实验方法原理采用微量全血培养人体外周血中淋巴细胞,在淋巴母细胞分裂高峰时加入秋水仙素,破坏细胞纺锤体的形成,使细胞停止在分裂中期。然后收集细胞,低渗处理,使细胞胀大,染色体伸展。接着进行固定并除去中期分裂相中残存的蛋
正常细胞常规核型的标本制备实验
微量全血培养 人淋巴细胞染色体标本制备 肿瘤细胞的染色体标本制备 人体染色体常规核型的分析 实验方法原理 采用微量全血培养人体外
正常细胞常规核型的标本制备实验
微量全血培养 人淋巴细胞染色体标本制备 肿瘤细胞的染色体标本制备 人体染色体常规核型的分析 实验方法原理 采用微量全血培养人体外
转录宿主反应特征揭秘,有助于早期治疗
研究人员已经生成了一个基因特征,可以检测宿主对 COVID-19 的反应,他们说这可以改进诊断工具并用于早期治疗。 在近日表在《细胞系统》杂志上的两篇论文中,来自耶鲁大学和西奈山伊坎医学院的研究人员开发了一个框架,用于生成转录宿主反应特征,可以可靠地检测病原体,同时减轻与其他非 -目标感染。
核转录分析
实验材料 cDNA 0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA 试剂、试剂盒 PBS
核转录分析
实验材料 cDNA0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA试剂、试剂盒 PBS NP-40 裂解缓: 20XSSC LNaOH 甘油储存缓冲液 10X 转录缓冲液 核苷酸:ATPGTPCTP 200uCi「α32P]-UTP 10XSET 蛋占酶 K 无 RNase 的 DNase
研究揭示转录因子NIN在根瘤菌侵染时的关键作用
2月1日,Plant Physiology 杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所、中国科学院-英国约翰·英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心(Center of Excellence for Plant and Microbial Sciences; CEPAM
研究揭示转录因子NIN在根瘤菌侵染时的关键作用
2月1日,Plant Physiology 杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所、中国科学院-英国约翰·英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心(Center of Excellence for Plant and Microbial Sciences; CEPAM
太阳能杀虫灯在蔬菜害虫防治上的应用方法
频振式杀虫灯是 利用害虫的趋光、波、色等特性,配以颇振高压电网触杀害虫。上海菜区从2《XX】年开始引进频振式杀虫灯,2002年起,在试验示范的基础上进行推广。上 海菜区的大型蔬菜生产基地,蔬菜标准化园艺场及出口蔬菜基地等,每年推广应用杀虫灯约20(力台,2(X)5年推广2110台,2(X拓年推广21
概述T4噬菌体的增殖过程
噬菌体的增殖过程基本同其他病毒。 1、吸附 噬菌体的吸附有两个阶段:①可逆阶段,由随机碰撞或静电引力或氢键作用而相互接触,无任何特异性;②不可逆特异性结合阶段,不仅噬菌体与相应细胞表面产生牢固结合,且病毒粒子表面发生结构改变。 T4噬菌体尾部能与宿主细胞壁表面上的受体发生特异性结合,吸附于
棉花源新型广谱杀虫蛋白可有效防控鳞翅目害虫
近日,中国农业科学院棉花研究所棉花分子遗传改良创新团队在棉花中发现了一个新型高效广谱杀虫蛋白,可以高效毒杀鳞翅目害虫。相关研究成果发表在《自然—植物》(Nature Plants)上。草地贪夜蛾、棉铃虫、玉米螟、稻纵卷叶螟、小菜蛾等鳞翅目害虫是联合国粮农组织认定的全球重大农业害虫,对农业生产构成重大
研究发现精准捕获“糖链”有助揭示病毒侵染机制
记者日前从中国科学院大连化学物理研究所获悉,该所科研人员提出了一种全新的基于席夫碱水解的动态共价化学方法,实现了对唾液酸糖链的精确捕获,这为后续揭示病毒侵染机制、发现新的疾病生物标记物和药物靶点,以及开发抗病毒药物或疫苗打下基础。该成果发表在《美国化学会志》上。 唾液酸糖链的异常表达是恶性肿瘤
甘薯曲叶病毒接种侵染体系获发明专利
近日,由中国科学院华南植物园研究员邓书林等科研人员完成的“一种甘薯曲叶病毒侵染性克隆的构建方法及甘薯高效简易的侵染方法”获国家发明专利授权。 该发明公开了一种甘薯曲叶病毒侵染性克隆的构建方法及甘薯高效简易的侵染方法,是将1.01个重复的甘薯曲叶病毒基因组序列插入到双元载体中,得到甘薯曲叶病毒侵
甘薯曲叶病毒接种侵染体系获发明专利
近日,由中国科学院华南植物园研究员邓书林等科研人员完成的“一种甘薯曲叶病毒侵染性克隆的构建方法及甘薯高效简易的侵染方法”获国家发明专利授权。该发明公开了一种甘薯曲叶病毒侵染性克隆的构建方法及甘薯高效简易的侵染方法,是将1.01个重复的甘薯曲叶病毒基因组序列插入到双元载体中,得到甘薯曲叶病毒侵染性克隆
FLIMFRET在病毒侵染动态研究中的应用
2020年, “病毒“这个词反复出现在公众的视野里。当我们在感慨着病毒凶猛、人类渺小和生命无常的同时,对于病毒以及相关的研究技术,我们又了解多少呢?研究难点病毒是一种个体微小、结构简单、只含一种核酸(DNA或RNA)、必须在活细胞内寄生并以复制方式增殖的非细胞型生物。而病毒侵染宿主细胞却是一个非常复
“记忆假体”步入人体测试阶段
据英国《每日邮报》网站6月25日(北京时间)报道,在2012年好莱坞热门影片《全面回忆》中,科林·法瑞尔饰演的主角被植入“假记忆”,这一电影情节有望在真实生活中上演。美国科学家表示,他们正在对15名患有癫痫病的志愿者进行试验,测试一种用来恢复脑损伤病人记忆的植入设备。 这种被称为“记忆假体