强强联合：在CRISPR／Cas9相关研究中应用高通量测序技术
摘要： CRISPR/Cas9基因组编辑技术和新一代测序技术（也称高通量测序技术），是当今对生命科学研究有重大影响的两项技术。二者并非毫不相干。有效地将二者联用，有时可以大大加速科研进程。两者之间有什么样的联系呢？在哪些研究领域或方向上可以联用呢？上海伯豪生物根据在这两个领域的技术服务经验，对相关内容进行了系统地整理。 一．引言 在分子生物学的发展历史中，人们曾经不止一次地从微生物的某些生命活动中得到启示，发展出了对于DNA操作有重要意义的工具，如分子克隆用的限制性内切酶和PCR用的耐热聚合酶。它们为分子生物学的发展带来了革命性的影响。近两三年来，另一种从细菌的获得性免疫系统发展而来的革命性的基因操作工具CRISPR/Cas9受到广泛关注，其应用和影响范围仍在不断扩大。CRISPR/Cas9系统的发现与DNA测序技术分不开，它的发展与推广仍然得益于DNA测序技术。CRISPR/Cas9技术与近五、六......阅读全文
CRISPR女神创办公司放“大招”
CRISPR的火热及其在临床上应用的美好愿景，令这一技术相关的公司不断涌现，除了张锋等人创办的Editas Medicine，Emmanuelle Charpentier等人的ERS Genomics，另外一位CRISPR先驱Jennifer Doudna也创办了自家公司：Caribou Bio
同济大学刘琦教授Cell子刊探讨CRISPR的insilico－sgRNA设计
CRISPR/Cas9系统是目前进行基因编辑的有效技术。实现CRISPR/Cas9系统的核心问题之一是进行高效以及特异性的sgRNA设计。近日，同济大学生命科学与技术学院刘琦教授课题组受邀在Cell子刊，Trends系列著名杂志《Trends in Biotechnology》（影响因子：12）
Nature发布CRISPR/Cas9系统应用新突破
来自洛克菲勒大学的研究人员报告称，他们利用CRISPR/Cas9成功地有效引入了特异的纯合子和杂合子突变。这一突破性的成果发布在4月27日的《自然》（Nature）杂志上。 细菌CRISPR/Cas9系统使得人们能够在许多生物中实现序列特异性的基因编辑，有望成为在人类多能干细胞中建立人类疾病模
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发，利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结（reversible terminator）”，实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发，利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结（reversible terminator）”，实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
高通量测序的应用及前景
一、高通量测序的应用 高通量测序可以帮助研究者跨过文库构建这一实验步骤，避免了亚克隆过程中引入的偏差。 依靠后期强大的生物信息学分析能力，对照一个参比基因组（reference genome）高通量测序技术可以非常轻松完成基因组重测序（re-sequence），2007年van Orsouw
全球首次利用CRISPR技术,在珊瑚里面进行基因操作
2018年4月25日，德克萨斯大学奥斯汀分校Matz研究组在PNAS杂志发表了题为“CRISPR/Cas9-mediated genome editing in a reef-building coral”的研究论文，该论文首次使用CRISPR技术， 靶向GFP和RFP等基因，取得了预期的研究
全球首次利用CRISPR技术,在珊瑚里面进行基因操作
2018年4月25日，德克萨斯大学奥斯汀分校Matz研究组在PNAS杂志发表了题为“CRISPR/Cas9-mediated genome editing in a reef-building coral”的研究论文，该论文首次使用CRISPR技术， 靶向GFP和RFP等基因，取得了预期的研究结
全球首次利用CRISPR技术,在珊瑚里面进行基因操作
2018年4月25日，德克萨斯大学奥斯汀分校Matz研究组在PNAS杂志发表了题为“CRISPR/Cas9-mediated genome editing in a reef-building coral”的研究论文，该论文首次使用CRISPR技术， 靶向GFP和RFP等基因，取得了预期的研究结
盘点全基因组检测CRISPR脱靶位点的几种重要技术
在2013年，来自麻省总医院的研究人员发现使用CRISPR-Cas RNA引导性核酸酶的一个重要局限：会在预期靶点以外的位点上生成多余的DNA突变。此后陆续有研究直接说明了CRISPR/Cas9存在严重的脱靶性，即该技术可以发生非特异性切割，引起基因组非靶向位点的突变，这样会造成研究结果的不确定
CRISPR/Cas9－技术，热度背后的冷思考
近年来，CRISPR/Cas9 基因编辑技术正在给整个科研界带来革命性变化，该技术使用 CRISPR 系统将 Cas9 蛋白和向导 RNA 注入小鼠受精卵，就能轻松实现基因敲除，同时，注入 Donor DNA 则可实现基因敲入，甚至国际著名学术期刊 Genome Biology 有文章指出这
CRISPR/Cas9技术，热度背后的冷思考
近年来，CRISPR/Cas9基因编辑技术正在给整个科研界带来革命性变化，该技术使用CRISPR系统将Cas9蛋白和向导RNA注入小鼠受精卵，就能轻松实现基因敲除，同时，注入Donor DNA则可实现基因敲入，甚至国际著名学术期刊Genome Biology有文章指出这项新技术将很快取代使用胚胎
基因编辑CRISPR/Cas9新技术路在何方？
CRISPR/Cas9这项新技术使人们能更精准地对DNA代码进行控制，引发了遗传学和细胞生物学领域的革新，科学家们对它寄予厚望，希望借助它的力量，治疗包括癌症在内的疾病并进一步解开人类细胞身上笼罩的谜团。 但这一基因编辑技术也引发了科学家们的忧虑。据美国趣味科学网站报道，有科学家担心，这一新工
CRISPR/Cas9技术，热度背后的冷思考
俞晓峰博士现任赛业模式生物副总裁、高级科学家，负责基因修饰模式动物的研发与技术服务等工作。 俞博士在遗传基因模式动物领域有超过20年研发与管理等方面的丰富经验，在干细胞相关领域及哺乳动物细胞系基因改造研究也取得了巨大成就，其研究成果多次发表在Nature Immunology、Hum Mo
CRISPR/Cas9技术，热度背后的冷思考
近年来，CRISPR/Cas9基因编辑技术正在给整个科研界带来革命性变化，该技术使用CRISPR系统将Cas9蛋白和向导RNA注入小鼠受精卵，就能轻松实现基因敲除，同时，注入Donor DNA则可实现基因敲入，甚至国际著名学术期刊Genome Biology有文章指出这项新技术将很快取代使用胚胎
北大魏文胜权威期刊连发重要成果
北京大学生命科学学院魏文胜研究员带领的课题组，致力于基因组编辑、疾病与感染方面的科学研究。着重发展真核基因修饰技术（i.e. TALE & CRISPR系统）及高通量功能基因组学，在此基础上通过多种手段研究人源宿主细胞参与病原微生物感染的蛋白、信号通路及分子机制，为发展宿主导向的治疗手段提供新的
CRISPR介导的基因编辑技术在小麦中的研究进展
2021年6月5日，Plant Communications杂志在线发表了中国农业科学院作物科学研究所夏兰琴团队撰写的题为Present and future prospects of wheat improvement through genome editing and advanced t
遗传学大牛PNAS、Nature子刊连发新成果
George M. Church是哈佛医学院的遗传学教授、Wyss研究所的核心成员。他被誉为是个人基因组学和合成生物学的先锋。1984年，Church和Walter Gilbert发表了首个直接基因组测序方法，该文章中的一些策略现在仍应用在二代测序技术中。此外，如今的多重化分子技术和条码式标签也
遗传学大牛PNAS、Nature子刊连发新成果
George M. Church是哈佛医学院的遗传学教授、Wyss研究所的核心成员。他被誉为是个人基因组学和合成生物学的先锋。1984年，Church和Walter Gilbert发表了首个直接基因组测序方法，该文章中的一些策略现在仍应用在二代测序技术中。此外，如今的多重化分子技术和条码式标签也
高通量测序技术总结与展望
第一代测序技术凭借其长的序列片段和高的准确率，适合对新物种进行基因组长距框架的搭建以及后期GAP填补，但是成本昂贵，而且难以胜任微量DNA样品的测序工作。第二代测序技术中，454序列片段最长，比较适合对未知基因组从头测序，搭建主体结构，但是在判断连续单碱基重复区时准确度不高。Solexa较454
高通量测序技术核酸片段分选
近年来，高通量测序技术已经日渐成为基因组学研究项目的标准。从样品制备到文库制备及最终测序，大多步骤都要求精确高效化、易于自动化操作，并且许多高通量测序应用都要求核酸片段在特定范围内紧密分布，因此精准快速的进行片段选择步骤更具挑战性。在进行核酸片段分选的过程中，传统的琼脂糖凝胶回收法不适于安全、高通量
高通量测序技术及原理介绍
高通量测序技术及原理介绍如下：1.什么是高通量测序高通量测序技术也被称作二代测序技术（Next Generation Sequencing, NGS），这是相对一代测序技术（Sanger Sequencing）而言的，同时由于高通量测序的出现使得我们能对一个物种的基因组和转录组进行全面、细致的分析成
BioTechniques：2015最受欢迎的技术文章
BioTechniques杂志日前评出了2015年最受欢迎的十篇技术文章，涵盖了对PCR、DNA提取、无细胞蛋白表达等常规技术的改良，以及CRISPR/Cas9、Hi-Plex、微图案化等新技术的应用。 1. Visual detection of isothermal nucleic aci
二代测序技术在临床诊疗中的应用（二）
二二代测序在心血管疾病诊断中的应用1. 二代测序在心血管疾病研究中的应用潜力巨大：NGS已被证明可成功鉴定出单基因疾病和心血管系统常见疾病的新型致病突变34。NGS在常见心血管疾病（cardiovascular diseases, CVD）中正变得越来越重要，因为与仅提供已知单核苷酸多态性（si
二代测序技术在临床诊疗中的应用（一）
Sanger测序在过去的二十年间是基因组研究的主流方法，取得了包括人类基因组计划(human genome project, HGP)等一系列重大成就，这使得单基因遗传病的鉴定和靶向治疗成为可能1,2。随着基因组大数据时代的到来，尽管Sanger测序是基因检测的金标准，但是NGS）技术应运而
国内首家高通量测序技术创新应用示范中心揭牌
9月1日，解码（上海）生物医药科技有限公司（以下简称“解码DNA”）和深圳华大智造科技股份有限公司（以下简称“华大智造”）举行合作签约仪式，并正式为国内首家“高通量测序技术创新应用示范中心”揭牌。该中心将基于全球最高日通量的基因测序仪DNBSEQ-T7等国产化测序平台，面向长三角地区的高通量测序
利用CRISPR/Cas9技术研究小麦TaGW2基因功能
小麦是全球最重要的粮食作物之一，是世界上40%人口的主要食物，提高小麦产量和品质对保障粮食安全和人体健康具有重要意义。谷类作物中GW2基因是影响籽粒粒重的一个关键遗传因子，该基因在六倍体普通小麦中有3个亚基因组拷贝，即TaGW2-A1, TaGW2-B1和TaGW2-D1。已有的研究表明TaG
同济教授用CRISPR制备瘦素缺陷大鼠
Leptin（LEP）是由脂肪细胞分泌的蛋白质类激素，主要由白色脂肪组织产生。其前体由167个氨基酸残基组成，N末端有21个氨基酸残基信号 肽，该前体的信号肽在血液中被切掉而成为146氨基酸，分子量为16KD，形成Leptin。Leptin具有广泛的生物学效应，其中较重要的是作用于下 丘脑的代谢
刘小乐教授：CRISPR高通量筛选的新算法
高通量的CRISPR筛选，已在功能基因组学研究中显示出巨大的潜力。12月16日，华人女学者、哈佛大学公共卫生学院Dana-Farber癌症研究所的刘小乐教授，在国际著名学术期刊《Genome Biology》发表题为“Quality control, modeling, and visualiz
空间转录组测序技术在肿瘤研究进展的应用
空间转录组测序技术是一种基于组织空间结构进行高通量转录组测序的技术。通过该技术，可以得到组织空间位置的基因表达图谱。因此，空间转录组技术是现阶段可实现空间二维基因表达检测的高通量技术。该技术为基于空间的发育研究和疾病异质性问题提供了一个解决方案。 空间转录组测序运用方向（Trends Bi