双脱氧链终止法测定DNA序列实验原理、操作步骤和仪器...2
3.制备电泳凝胶及电泳(1)制备胶模:取双块制胶玻板,先用泡沫海绵沾“洗洁净”液仔细擦洗,用水彻底淋洗,干燥后继用酒精清洗,晾干,再用硅烷剂(repel- silane)将玻板的—面擦一遍,蒸馏水淋洗,干燥 (注意:清洗时应戴一次性手套操作)。将其中一块玻板平置台上(硅烷处理过的—面朝上),两侧各放置一条隔离条(最好选用上方厚为0.2mm,下方厚0.4mm的楔形条),另取—块玻板 (硅烷化处理过的—面朝下),对准放置在上述玻板上,两侧及—面边缘用胶带封严,并用文具夹夹紧,制成胶模。(2)配制电泳凝胶:向1只100ml烧杯中加入下列试剂;20%丙烯酰胺溶液20ml;10×TBE缓冲液5ml;46.7%尿素溶液25ml。总体积50ml(凝胶的丙烯酰胺浓度为8%)。混匀,过滤除去不溶物,置100ml梨形瓶中连接水泵抽气5分钟,加入250μl 10%过硫酸铵,50μlTEMED混匀。(3)注胶:立即将配好的凝胶用50ml注射器小心注......阅读全文
双脱氧链终止法测定DNA序列实验原理、操作步骤和仪器...2
3.制备电泳凝胶及电泳(1)制备胶模:取双块制胶玻板,先用泡沫海绵沾“洗洁净”液仔细擦洗,用水彻底淋洗,干燥后继用酒精清洗,晾干,再用硅烷剂(repel- silane)将玻板的—面擦一遍,蒸馏水淋洗,干燥 (注意:清洗时应戴一次性手套操作)。将其中一块玻板平置台上(硅烷处理过的—面朝上),两侧各放
双脱氧链终止法测定DNA序列实验原理、操作步骤和仪器...1
[目的]掌握双脱氧链终止法测定DNA序列的原理与方法[原理]DNA聚合酶催化的DNA链延伸是在3’-OH末端上进行的。由于2’,3’-双脱氧三磷酸核苷酸(ddNTP)的3’-位脱氧而失去游离-OH,当它参入到DNA链后,3’-OH末端消失,使DNA链的延伸终止。本实验根据此原理,将待测DNA片段插入
双脱氧链终止法测定DNA序列实验原理、操作步骤和仪器...3
3.单链模板的分离(1)沉淀M13:在上述M13培养物上清中,加入0.2倍体积的3.5mol/L醋酸铵/20%多聚乙二醇溶液,颠倒混匀数次,置冰浴30分钟。离心15-30分钟(11000g)可见白色噬菌体沉淀。小心除去上清液,可将试管倒置并吸去多余液体。(2)分离纯化模板:向沉淀中加入TE缓冲液10
双脱氧链终止法测定DNA序列
[目的] 掌握双脱氧链终止法测定DNA序列的原理与方法[原理]DNA聚合酶催化的DNA链延伸是在3’-OH末端上进行的。由于2’,3’-双脱氧三磷酸核苷酸(ddNTP)的3’-位脱氧而失去游离-OH,当它参入到DNA链后,3’-OH末端消失,使DNA链的延伸终止。本实验根据此原理,将待测DNA片段插
DNA序列测定技术(Sanger双脱氧链终止法与Maxam-Gilbert...2
二、Maxam-Gilbert DNA 化学降解法与包括合成反应的链终止技术不同,Maxam-Gilbert法要对原DNA 进行化学降解。这一方法是在体外研究lac阻抑制与lac操纵基因相互作用时酝酿发展起来的。时至今日,可以探测DNA 构象的蛋白质-DNA 相到作用,仍然是Maxam- G
DNA序列测定技术(Sanger双脱氧链终止法与Maxam-Gilbert-...
选择随机定向测定策略的影响因素(1)计算设备 任何大规模的测序计划将在很大程度上依赖计算机程序对原始序列资料进行分类、整理和排列(Staden,1986)。在权衡随机法的利与弊之时,必须将与适当的计算机设备进行联机的问题放到压倒一切的位置上来考虑。如果这些设备尚无从适当的计算机设备进行联机的问题
DNA测序原理、仪器试剂和操作步骤2
【操作步骤】1.PCR测序反应(1) 取0.2ml的PCR管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂: 所加试剂测定模板管标准对照管 BigDye Mix 1μl 1μl 待测的质粒DNA 1μl- pGEM-3Zf (+) 双链DNA-1μl 待测
DNA序列测定技术(Sanger双脱氧链终止法与Maxam-Gilbert...4
序列测定的技术和策略Sanger双脱氧链终止法Maxam-Gilbert DNA 化学降解法测序策略目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的若干组带放射性标记的
DNA序列测定技术(Sanger双脱氧链终止法与Maxam-Gilbert...3
3.DNA 聚合酶通常用于双脱氧法序列测定的有几种不同的酶,其中包括大肠杆菌DNA 聚合酶I的Klenow片段(Sanger等,1977),反转录酶(见文献,如Mieredorf和Prfeffer,1987)经过修饰消除了 3'→5'外节酶活性的T7噬菌体DNA 聚合酶(
DNA测序原理、仪器试剂和操作步骤1
DNA序列测定分手工测序和自动测序,手工测序包括Sanger双脱氧链终止法和Maxam-Gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今DNA序列分析的主流。美国PE ABI公司已生产出373型、377型、310型、3700和3100型等DNA测序仪,其中310型是临床检测实验室中使用最
双脱氧链终止法测序用变性模板的制备实验
试剂、试剂盒 乙酸铵 氯仿 异戊醇 DMSO 乙醇 NaOH酚 测序反应缓冲液 琼脂糖凝胶
双脱氧链终止法测序用变性模板的制备实验
双脱氧链终止法变性模板 分子克隆实验指南(第三版)下册 第12章 方案2下面通过碱变性质粒 DNA 的方法应与方案 3 联合使用,因在此过程中采用测序酶催化双脱氧测序反应。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。试剂、试剂盒乙酸铵氯仿异戊醇DMSO
双脱氧链终止法测序用变性模板的制备实验
试剂、试剂盒 乙酸铵氯仿异戊醇DMSO乙醇NaOH酚测序反应缓冲液琼脂糖凝胶寡核苷酸引物闭环双链质粒 DNA仪器、耗材 干冰-乙醇浴65°C 水浴实验步骤 材料缓冲液和溶液试剂、缓冲液、储液的组成参见附录 1, 储液使用前稀释到适当浓度。乙酸铵(5mol/L, 非缓冲,pH~7.4)氯仿:异戊醇(2
DNA的酶切实验原理和操作步骤
一、实验目的 本实验学习、了解限制性内切酶的特性,学习根据具体目的设计适当的酶切体系并实施之。 二、实验原理 利用限制性内切酶切割DNA是DNA重组过程中的关键步骤之一。成功的酶切为后续工作提供了有效的实验材料。限制性内切酶是细菌体内限制修
重组DNA的转化实验原理和操作步骤
实验目的制备出感受态细胞,把体外重组的DNA引入受体细胞,使受体菌具有新遗传性,并从中选择出转化子。实验原理感受态就是细菌吸收转化因子的生理状态,只有发展为感受态的细胞才能稳定摄取外来的DNA分子。pUC18的LacZ基因区域当有DNA片段插入时,LacZ基因失活,转化进入大肠杆菌并在含有IPTG和
双脱氧法DNA测序实验
实验材料 DNA试剂、试剂盒 寡核苷酸引物测序酶终止混合液测序酶缓冲液焦磷酸酶混合液仪器、耗材 离心机离心管微量滴定板实验步骤 1. 对于每个单链模板:将下列试剂混合于0.5 ml 微量离心管中(1)0.5 pmol 单链DNA模板(2)0.5 pmol 引物(3)1 μl 10×测序酶缓冲液(4
双脱氧法DNA测序实验
测序酶进行标记测序反应 α-标记核苷酸进行热循环测序反应 实验材料 DNA
DNA酶切及凝胶电泳实验原理、仪器试剂和操作步骤
【实验原理】DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和分子筛效应。DNA分子在高于等电点的pH溶液中带负电荷在电场中向正极移动。由于糖-磷酸骨架在结构上的重复性质,相同数量的双链DNA几乎具有等量的净电荷,因此他们能以相同的速度向正极方向移动。在一定的电场强度下,DNA 分子的迁移速度取决于分子
PCR扩增DNA(PCR-Amplify-DNA)实验原理、材料和操作步骤
【实验原理】聚合酶链反应(polymerasechainreaction,PCR)是一种体外 DNA扩增技术,1985年由Mullis等人创立。该技术能在几小时的实验操作中,将人为选定的一段DNA扩增几百万倍,具有灵敏度高、特异性强、操作简便和应用广泛等优点,目前已成为分子生物学及基因工程中极为
DNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理、仪器试剂和操作步骤
一、原理DNA在碱性的溶液中带有负电荷,因此,在电场作用下朝正极移动。在琼脂糖凝胶中电泳时,由于琼脂糖凝胶具有一定孔径,长度不同的DNA分子由于所受凝胶的阻遏作用大小不一,迁移的速度不同,从而可以按照分子量大小得到有效分离。溴化乙锭可插入到DNA分子的双链中。在紫外光的照射下,插入溴化乙锭的DNA呈
基因诊断技术的DNA测序的相关介绍
目前在实验室手工测序常用Sanger双脱氧链终止法。Sanger法就是使用DNA聚合酶和双脱氧链终止物测定DNA核苷酸序列的方法。它要求使用一种单链的DNA模板或经变性的双链DNA模板和一种恰当的DNA合成引物。其基本原理是DNA聚合酶利用单链的DNA模板,合成出准确互补链,在合成时,某种dNT
免疫沉淀实验原理、仪器试剂和操作步骤
(一)原理免疫沉淀是利用抗原抗体特异性反应纯化富集目的蛋白的一种方法。抗体与细胞裂解液或表达上清中相应的蛋白结合后,再与蛋白 A/G(Protein A/G)或二抗偶联的agaose或Sepharose珠子孵育,通过离心得到珠子-蛋白A/G或二抗-抗体-目的蛋白复合物,沉淀经洗涤后,重悬于电泳上
化学发光双脱氧DNA测序实验
实验材料 DNA试剂、试剂盒 生物素Tris·ClMgCl2DNA聚合酶dATPdCTPdGTPdTTP仪器、耗材 热循环仪尼龙膜滤纸离心机实验步骤 1. 在微量离心管中混匀下列试剂,配制DNA摸板混合物(1)1 μg 单链DNA模板或1~3 μg 变性双链DNA模板(2)0.5 pmol 生物素
化学发光双脱氧DNA测序实验
利用生物素标记引物 实验材料 DNA 试剂、试剂盒
化学发光双脱氧DNA测序实验
标准的双脱氧DNA测序可以很容易和很有效地使用非同位索标记的化学发光法进行检测。在测序反应中,使用生物素标记的引物。用非同位素标记如生物素衍生化的引物,可用于为5’-末端标记引物而设的入测序反应的工作方案。实验材料DNA试剂、试剂盒生物素Tris·ClMgCl2DNA聚合酶dATPdCTPdGTPd
Southern-Blotting实验原理、操作步骤和注意事项2
按先将水和DNA 按反应体系所需的量取至一1.5毫升离心管中,混匀,短暂离心至管底,放至100℃干浴中变性10 min,变性探针迅速置于冰浴上 5 min,按反应体系将反应混合液(dNTP,Random primer,Klenow )加入变性DNA中,在同位素操作台上,加入32P 标记的dN
DNA的定量实验原理和步骤
一、 实验原理核酸分子(DNA或RNA)由于含有嘌吟环和嘧啶环的共轭双键,在260 nm波长处有特异的紫外吸收峰,其吸收强度与核酸的浓度成正比,这个物理特性为测定核酸溶液浓度提供了基础。1 OD260相当于dsDNA 50 ug/ml,ssDNA 33 ug/ml和ssRNA 40 ug/ml。可以
什么是DNA测序技术?
DNA测序技术系指分析DNA碱基构成和碱基顺序的技术,即用于确定DNA片段中腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)的构成和排列方式。一般采用双脱氧链终止法进行DNA测序。其原理是利用2',3'-双脱氧核苷三磷酸(2',3'-ddNTP)作为链终止试剂
酵母RNA的提制实验原理、仪器试剂和操作步骤
一、目的:学习和掌握从酵母中提制RNA 的原理和方法,从而加深对核酸性质的认识。二、原理:提取和制备RNA 的首要问题是选RNA 含量高的材料。微生物是工业上大量生产核酸的原料,其中RNA 的提制以酵母最为理想,因为酵母核酸中主要是RNA(2.67~10.0%),DNA 很少(0.03~0.51
放射性同位素标记的DNA序列测定分析
放射性同位素标记的DNA序列测定分析 测定DNA的核苷酸序列是分析基因结构与功能关系的前提。从小片段重叠法到加减法、双脱氧链终止法、化学降解法、自动测序,DNA测序技术发展很快。目前在实验室手工测序常用Sanger双脱氧链终止法。Sanger法就是使用DNA聚合酶和双脱氧链终止物测定DNA核苷