PNAS将破译所有真核生物基因组,极大改善物种保护工作
深圳特区报讯 昨日,《美国科学院院刊》正式发布“地球生物基因组计划”(以下简称“EBP”)的科研展望文章。该项目是一个全球范围的基因组测序项目,有望极大改善物种保护工作,并为农业、医药和生态系统服务提供新的基因资源。深圳企业华大基因是该项目的发起单位之一。 “EBP项目是继人类基因组计划之后,生命科学领域又一件大事,目标是破译地球上所有真核生物的基因组。”项目负责人介绍说,这一具有里程碑意义的项目吸引了全球科学家的关注,可以让世界上数千名科学家和数百万民众参与,所产出的数据超过1EB(相当于1亿部高清电影,播放2.3万年),将推动全新计算算法、分析方法和模型的创立,革新对生物学的理解,有望极大改善物种保护工作,并为农业、医药和生态系统服务提供新的基因资源。 根据项目计划,科学家将对所有真核生物的基因组内容进行全面编目,并免费公开共享数据,作为未来科学发现的基础。 相关新闻 ......阅读全文
关于真核生物的基因调控—翻译控制的基本介绍
真核生物的翻译控制的主要形式是控制mRNA的稳定性。mRNA5′端的加帽作用以及它的3′端的多聚A的加尾作用都有助于 mRNA分子的稳定。在某些真核生物中mRNA进入细胞质以后并不立即作为模板进行蛋白质合成,而是与一些蛋白质结合形成RNA蛋白质(RNP)颗粒,在这种状态的mRNA半衰期可以延长。
真核生物钙调素的酶联免疫测定法
原理 本法是一种测定抗体的竞争性固相酶联免疫测定法(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)。先将抗原──CaM与固相载体(聚苯乙烯微量滴定板)结合,然后将经待检CaM(标准样品或检样)部分中和的兔抗CaM抗体加入微量滴定板孔中,抑制固相CaM和
关于真核生物的基因调控—RNA加工的步骤介绍
RNA加工过程中的调控—真核生物的RNA加工过程主要包括三个步骤: ①在新生RNA的5′端加上一个甲基化的鸟嘌呤核苷酸,形成一个所谓的帽子(cap)即m7GpppN(m7G是7-甲基鸟嘌呤核苷,P是磷酸,N是 RNA的5′端第一个核苷酸)这一过程通常发生在新生链完成之前。 ②在转录后的RNA
真核生物基因表达调控发生在哪些水平上
真核生物基因表达的调控远比原核生物复杂,可以发生在DNA水平、转录水平、转录后的修饰、翻译水平和翻译后的修饰等多种不同层次(真核生物基因表达中可能的调控环节)。但是,最经济、最主要的调控环节仍然是在转录水平上。DNA水平上的调控是通过改变基因组中有关基因的数量、结构顺序和活性而控制基因的表达。这一类
科研人员破解真核生物光合碳浓缩机制
近期,中国科学院分子植物科学卓越创新中心揭示了莱茵衣藻CO2浓缩机制(CCM)中HCO3⁻转运通道LciA蛋白的底物选择性机制,并通过结构指导的分子设计,实现了HCO3⁻转运活性的理性改造,为利用CCM改造C3(如小麦、水稻等)作物以提升光合效率,提供了重要元件与分子策略。在长期演化中,光合藻类形成
地球生物基因组计划正式启动
据物理学家组织网报道,科学家近日在英国伦敦正式启动了一个庞大的全球性项目——地球生物基因组计划(EBP),准备在10年内对地球上所有150万种已知真核生物的基因组进行测序、编目和分类,预计耗资47亿美元。 科学家称,地球生物基因组计划是继人类基因组计划(HGP)之后的“下一个生物学登月计划”
真核表达系统的特点
真核表达系统的特点是蛋白翻译后加工机会多,甚至可被改造成人源型;真核细胞易被转染,具有遗传稳定性和可重复性;产物可被分泌,提纯简单,成本低。
真核mRNA的降解过程
真核细胞的翻译和mRNA衰变之间存在着平衡。正在被翻译的mRNA被核糖体,真核起始因子eIF-4E和eIF-4G以及poly(A)结合蛋白结合,不能接触外泌体复合物,mRNA得到保护。mRNA的poly(A)尾巴被特异性外切核酸酶缩短,该核酸外切酶通过RNA上的顺式调节序列和反式作用RNA结合蛋白的
真核起始因子的介绍
真核起始因子(英文:eukaryotic initiation factor,简称为eIF),又称为真核翻译起始因子,是指参与真核翻译起始这一过程的蛋白质。与原核起始因子只有三种(IF1、IF2、IF3)相比,真核起始因子种类多且复杂,已鉴定的真核起始因子共有12种。通过这些真核起始因子之间以及
虎尾海马全基因组破译
中科院南海海洋研究所、德国康斯坦茨大学、华大基因和新加坡A*STAR研究院联合破译了虎尾海马的全基因组。有关研究成果日前以封面文章的形式发表在《自然》杂志上。 海马隶属于海龙科。与其他硬骨鱼不同,海马呈现高度特殊的形态,例如头部前方具有管状长嘴,无腹鳍和尾鳍,尾端卷曲,全身覆盖硬骨骼,没有鳞片
吴东东:每个生命都值得爱护
吴东东 昆明动物所供图“长长生命河,漫漫进化路。赛道领跑,破译灵长类遗传密码;协同突破,解析起源与演化历程。洞察生命之树的异彩,为基因发展的未来筑基。”这是中国科学院昆明动物研究所(以下简称昆明动物所)研究员吴东东获评2023年“云岭最美科技人”称号时的选树词。而这也是吴东东作为灵长类基因组计划发起
关于细胞核起源的病毒性真核生物起源模型的基本介绍
病毒性真核生物起源模型(viral eukaryogenesis model)认为,病毒感染原核生物导致了膜结合的细胞核与其他真核生物特征的产生。证据是真核生物和病毒在大分子结构上存在一定相似性,譬如,线性DNA链、mRNA的加帽,以及与蛋白质的紧密结合(病毒的外套膜类似于组蛋白)。该假说的其中
研究团队均可加入!万种原生生物基因组计划启动!
近日,全球首个万种原生生物基因组计划(Protist 10000 Genomes Project, 简称P10K)正式发布,旨在绘制万种代表性原生生物基因组图谱,建立一个大规模的原生生物遗传资源数据库。 原生生物是生物五界(植物界、真菌界、动物界、原生生物界和原核生物界)之一,主要是由单细胞
全球首个万种原生生物基因组计划正式发布
近日,全球首个万种原生生物基因组计划(Protist 10000 Genomes Project, 简称P10K)正式发布,旨在绘制万种代表性原生生物基因组图谱,建立一个大规模的原生生物遗传资源数据库。 原生生物是生物五界(植物界、真菌界、动物界、原生生物界和原核生物界)之一,主要是由单细胞真
用于基因组文库的真核DNA的部分酶切(制备反应)实验
实验方法原理 通过限制酶部分酶切可将高分子质量 DNA 片段化。在预实验中,建立了适宜的部分酶切条件。对于将用于克隆的基因组 DNA 来说,预实验的结果确定了对其进行制备的三个大规模反应的条件,这将在本方案叙述。实验材料 限制性内切核酸酶基因组 DNAλ 噬菌体 DNA质粒寡聚体试剂、试剂盒 乙酸铵
用于基因组文库的真核DNA的部分酶切(制备反应)实验
通过限制酶部分酶切可将高分子质量 DNA 片段化。在预实验中,建立了适宜的部分酶切条件。对于将用于克隆的基因组 DNA 来说,预实验的结果确定了对其进行制备的三个大规模反应的条件,这将在本方案叙述。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理通过限制酶部分酶切可将高分子质量 DNA
用于基因组文库的真核DNA的部分酶切(制备反应)实验
实验方法原理 通过限制酶部分酶切可将高分子质量 DNA 片段化。在预实验中,建立了适宜的部分酶切条件。对于将用于克隆的基因组 DNA 来说,预实验的结果确定了对其进行制备的三个大规模反应的条件,这将在本方案叙述。
单分子测序改善微生物基因组组装
美国国家生物防卫分析和反制中心的研究人员近日在《Genome Biology》上发表文章,介绍了SMRT技术在微生物基因组组装上的应用。他们认为,单分子测序数据能降低测序费用,并带来更多完整的基因组,改善微生物基因组数据库的质量。 随着测序费用的不断下降,测序项目的数量也在不断上升。G
关于真核生物的基因调控—染色质丢失的介绍
染色质丢失— 在发育过程中一些体细胞失去了某些基因,这些基因便永不表达,这是一种极端形式的不可逆的基因调控。 在某些线虫、原生动物、甲壳动物发育过程中的体细胞有遗传物质丢失现象。在这些生物中,只有生殖细胞才保留着该种生物基因组的全套基因。例如在马副蛔虫(Ascaris megacephala)
泡了8年化石,发现迄今最早的多细胞真核生物
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516737.shtm她泡了8年的化石,做了无数次实验,也曾想过要放弃,但她最终还是坚持了下来,于是有了今天的成果——1月25日,中国科学院南京地质古生物研究所(以下简称南京古生物所)研究员朱茂炎领导的地球
科学家发现高等真核生物中DNA新修饰方式
DNA甲基化作为重要表观遗传机制调控基因的表达,从而影响一系列的生物学过程,如细胞命运决定、发育和组织、器官的稳态维持。医学上,DNA甲基化失调与人类疾病密切相关,如肿瘤。DNA甲基化以多种修饰方式[5-methylcytosine (5mC), N6-methyladenine (6mA) 和
张锋团队首次在真核生物中发现CRISPR样系统
CRISPR-Cas 系统是存在于原核生物(细菌和古菌)中的一类古老的免疫系统,用于抵御防御外源遗传元件(例如噬菌体)入侵。通过对该系统的研究,科学家们开发出了一系列强大的基因编辑工具,例如 CRISPR-Cas9,其通过 RNA 引导的 Cas9 核酸酶,对 DNA 进行切割,实现基因组编辑。
Science:第一个真核生物染色体合成
——这是合成生物学研究领域的一项重大进展 报道:由纽约大学Langone医学中心系统遗传学研究所主任Jef Boeke领导的一个国际研究小组宣布,他们已经合成了第一个酵母功能性染色体,这是合成生物学领域的一项重大进步。这一研究成果公布在3月27日Science杂志上
真核生物基因表达的dna水平调控包括什么方式
1、转录起始水平。这一环节是调控的最主要环节,由对基因转录活性的调控来完成,包括基因的空间结构、折叠状态、DNA上的调控序列、与调控因子的相互作用等。a.活化染色质:在真核生物体内,RNApol与启动子的结合受染色质结构的限制,需通过染色质重塑来活化转录。常态下,组蛋白可使DNA链形成核小体结构而抑
关于真核生物的基因调控—翻译后控制的基本介绍
翻译后控制的事例不多。一般认为脑垂体后叶细胞产生的促肾上腺皮质激素和脂肪酸释放激素是由同一原始翻译产物经不同的加工而形成的。迄今为止对于真核生物基因调控作用的了解仍然处在探索的阶段,特别是对于高等动植物的基因调控过程了解得更少,还不能形成一个完整的模式。1972年美国学者E.戴维森和R.J.布里
Science:第一个真核生物染色体合成
由纽约大学Langone医学中心系统遗传学研究所主任Jef Boeke领导的一个国际研究小组宣布,他们已经合成了第一个酵母功能性染色体,这是合成生物学领域的一项重大进步。这一研究成果公布在3月27日Science杂志上。 在过去的五年中,科学家们已经完成了细菌染色体和病毒DNA的构建
研究揭示真核生物磷脂酶D的结构与机制
10月16日,Cell research 在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心张鹏研究组题为Crystal structure of plant PLDα1 reveals catalytic and regulatory mechanisms of eukaryotic phospho
科学家首次改造了真核生物超过50%的DNA
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511977.shtm11月8日,合成酵母基因组计划(Sc2.0)的研究人员在《细胞》和《细胞基因组学》上发表了3篇研究,表示制造出了一种基因组中超过50%的DNA序列均是人工合成的酿酒酵母菌株。标准酿酒
关于真核生物的基因调控—染色质活化的介绍
染色质处在固缩的状态称为异染色质化。在异染色质化部位的基因的转录活性显著降低。真核生物可以改变染色体某一区域的异染色质化的程度而控制基因的表达。雌性哺乳动物细胞中的一个 X染色体的失活便是高度异染色质化的结果(见剂量补偿效应)。基因由于改变位置而处在异染色质区附近时,转录作用也会受到阻碍(见位置
泡了8年化石,发现迄今最早的多细胞真核生物
她泡了8年的化石,做了无数次实验,也曾想过要放弃,但她最终还是坚持了下来,于是有了今天的成果——1月25日,中国科学院南京地质古生物研究所(以下简称南京古生物所)研究员朱茂炎领导的地球-生命系统早期演化团队在《科学进展》(Science Advances)杂志发文,报道了团队在华北燕山地区16.3亿