PNAS将破译所有真核生物基因组,极大改善物种保护工作
深圳特区报讯 昨日,《美国科学院院刊》正式发布“地球生物基因组计划”(以下简称“EBP”)的科研展望文章。该项目是一个全球范围的基因组测序项目,有望极大改善物种保护工作,并为农业、医药和生态系统服务提供新的基因资源。深圳企业华大基因是该项目的发起单位之一。 “EBP项目是继人类基因组计划之后,生命科学领域又一件大事,目标是破译地球上所有真核生物的基因组。”项目负责人介绍说,这一具有里程碑意义的项目吸引了全球科学家的关注,可以让世界上数千名科学家和数百万民众参与,所产出的数据超过1EB(相当于1亿部高清电影,播放2.3万年),将推动全新计算算法、分析方法和模型的创立,革新对生物学的理解,有望极大改善物种保护工作,并为农业、医药和生态系统服务提供新的基因资源。 根据项目计划,科学家将对所有真核生物的基因组内容进行全面编目,并免费公开共享数据,作为未来科学发现的基础。 相关新闻 ......阅读全文
基因组的分类
病毒基因组病毒基因组可以由RNA或DNA组成。 RNA病毒的基因组包含单链或双链RNA,也包含一种或多种单独的RNA分子。 DNA病毒基因组可以是单链或双链DNA。大多数DNA病毒基因组由单个线性DNA分子组成,但有些由DNA病毒基因组由环状DNA分子组成 。原核基因组原核生物和真核生物基因组由D
环保总局:到2020年,生物物种资源得到有效保护
15年遏制物种丧失? 当环境已被国家提到“生态文明”的高度时,国家环境保护总局生态司司长万本太认为实施生态保护的资金已不成问题。 在12月7日由国家环境保护总局举行的《全国生物物种资源保护与利用规划纲要》和《国家重点生态功能保护区规划纲要》新闻发布会上,虽然资金来源依然是各大媒体紧追不舍的经典问题
科学家倡议像保护濒危物种一样保护微生物
爪哇犀牛、毛伊岛鹦嘴雀与B.coahuilensis—— 一种从墨西哥库托西涅加斯山谷富盐的潟湖中分离出来的细菌有什么共同之处?它们都是濒临灭绝的物种,但像B.coahuilensis这样的微生物的消失并没有在微生物界以外引起太多关注。据《科学》报道,近日,在美国斯克利普斯海洋研究所举行的会议上,一
真核基因表达载体的构建
提高目的基因在哺乳动物细胞中表达的策略:1、DNA水平:增加基因拷贝数(1)高拷贝载体;(2)基因共扩增;2、转录水平:利用强启动子、增强子,可诱导启动子,如CMV、Tet;3、翻译水平:优化翻译起始序列和非编码区序列。本篇文章来源于网络,如有异议请联系我们,我们将在3个工作日内作出处理。
真核载体的概念和应用
中文名称真核载体英文名称eukaryotic vector定 义能携带插入的外源核酸序列进入真核细胞中复制的载体。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
真核起始因子的相关疾病
已知的真核起始因子中,eIF2B与人类遗传病的关系最为密切。eIF2B的五个亚基基因的常染色体遗传性隐性突变会导致白质异常,在临床上表现为一系列严重的连续症状,称为“eIF2B相关紊乱”。典型的如脑白质病,即白质消失(vanishing white matter,VWM)和卵巢衰竭(ovaria
真核premRNA加工过程
mRNA的加工在真核生物、细菌和古细菌中差异很大。实质上,非真核mRNA在转录时是成熟的,除极少数情况外不需要加工。然而,真核pre-mRNA需要大量加工。5’端加帽子:5‘ 帽(也称为RNA帽,RNA 7-甲基鸟苷帽或RNA m7G帽)就是一个经修饰的鸟嘌呤核苷酸,在转录开始不久后就被添加到新产生
真原核基因表达的区别
1、原核生物染色体为一个基因连锁群,而真核为两个或以上,当一个有缺陷时另一个可以补充;2、原核生物染色体不与组蛋白结合,省去的解聚的步骤;3、原核生物的转录与翻译都在同一区间,而真核是分开的;4、真核生物基因内有内含子,mRNA会有一个自我剪接的修饰过程,原核生物则不会;5、真核生物蛋白质的翻译后修
动物全物种基因组测序仍有很大空白
近日,美国华盛顿州立大学领导的一项研究发现,目前对动物基因组进行的测序多数集中在与人类相似的动物上,研究人员警告称,该现状可能会忽视大量的生物多样性和机会。相关研究结果发表于美国《国家科学院院刊》。 研究人员分析发现,近3300种动物的基因组已被测序。虽然动物物种测序工作一直在进行,但与世界
日破译人工栽培草莓基因组
日本研究人员27日报告说,他们破译了人工栽培草莓的基因组,这一成果将有助于开发更好看好吃并能抵抗虫害的新品种草莓。 位于千叶县木更津市的上总DNA研究所在英国《DNA研究》杂志网络版上介绍说,研究人员将人工栽培草莓品种“丽红”的染色体DNA序列分成片段,分析碱基对的排列,并与4种野生草莓进
我国首次成功破译茶树基因组
茶作为最早饮料,其相关的可信记录可以推至公元前三世纪--商代时期。茶叶不仅在中国而且在世界范围内具有巨大的经济和文化价值。日前,我国科学家经过七年研究,终于率先在国际上破解了茶树的基因组。 相对于“世界三大饮料植物”中的咖啡和可可而言,茶树基因组具有高杂合、高重复和基因组庞大等特点。由中科
科学家破译蓝鲸基因组
蓝鲸是地球上现存体型最大的动物。德国和瑞典研究人员最新报告说,他们破译了蓝鲸以及其他3种须鲸的完整基因组。 研究团队在新一期美国《科学进展》杂志上发表了相关论文。他们认为,这将有助于科学界以“前所未有的细节”追寻蓝鲸及其“亲戚”的进化历程。 须鲸包括蓝鲸、座头鲸、灰鲸、长须鲸等种类。来自
迄今最古老植物基因组破译
一个国际科研团队对在利比亚撒哈拉沙漠考古遗址收集的新石器时代的西瓜种子进行测序,破译了迄今最古老的植物基因组。对6000年前的西瓜种子进行测序,为西瓜的驯化提供了新线索,有助研究如何增强西瓜的抗旱、抗病虫害能力。相关论文发表于最近的《分子生物学与进化》杂志。 科学家们普遍认为西瓜来自非洲,但究
中国科学团队破译甘蔗基因组
福建农林大学明瑞光教授团队在英国《自然—遗传学》期刊在线发表研究论文,公布了甘蔗的基因组,这是甘蔗基因组研究的一个重大突破。 研究团队负责人、福建农林大学基因组中心主任明瑞光告诉记者,该研究由福建农林大学联合美国、巴西、加拿大、哥伦比亚等国家的研究机构共同完成。研究团队攻克了同源多倍体基因组拼
首个深海水虱基因组破译
深海水虱体型巨大化和营养高效利用相关通路 海洋所供图 不同生态位等足类体型结构特征 海洋所供图 近日,中科院海洋研究所研究员李富花和李新正课题组合作破译了国际上首个深海甲壳动物——深海水虱(Bathynomus jamesi)的基因组,并揭示了深海水虱体型巨大化和深海寡营养环境
科学家破译蓝鲸基因组
新华社柏林4月8日电 蓝鲸是地球上现存体型最大的动物。德国和瑞典研究人员最新报告说,他们破译了蓝鲸以及其他3种须鲸的完整基因组。 研究团队在新一期美国《科学进展》杂志上发表了相关论文。他们认为,这将有助于科学界以“前所未有的细节”追寻蓝鲸及其“亲戚”的进化历程。 须鲸包括蓝鲸、座头鲸
返座假基因的作用
在进化年代上,所有的返座假基因都在哺乳动物辐射(mammalianradiation)之后出现,即返座假基因只存在于哺乳动物中。人DHFRΨ1假基因在人群中甚至还有一定的多态性。由于返座假基因对于物种本身没有提供什么明显的选择优势,因此曾被认为是一种“分子寄生物”(molecularparasite
返座假基因的作用原理
在进化年代上,所有的返座假基因都在哺乳动物辐射(mammalianradiation)之后出现,即返座假基因只存在于哺乳动物中。人DHFRΨ1假基因在人群中甚至还有一定的多态性。由于返座假基因对于物种本身没有提供什么明显的选择优势,因此曾被认为是一种“分子寄生物”(molecularparasite
关于返座假基因的作用介绍
在进化年代上,所有的返座假基因都在哺乳动物辐射(mammalianradiation)之后出现,即返座假基因只存在于哺乳动物中。人DHFRΨ1假基因在人群中甚至还有一定的多态性。由于返座假基因对于物种本身没有提供什么明显的选择优势,因此曾被认为是一种“分子寄生物”(molecularparasi
发表论文的捷径?线粒体测序论文太多
David Roy Smith是来自加拿大韦仕敦大学的一位生物学助理教授,近期他在The Scientist杂志上发文,指出目前涌现了太多线粒体基因组测序论文,2014年GenBank中新增的线粒体基因组序列信息多达上千条,这几乎比上一年激增了15%。 Smith指出,很少有人会质疑这些线粒体
PNAS:物种灭绝率或远超预期
近几十年来,生物多样性下降一直都是环保人士以及科学家们非常关注的问题。尤其是在美国作家蕾切尔·卡森的《寂静的春天》在1960年代出版后,生物多样性及其保护更是获得广泛关注。进入1980年代以来,一直有观点认为我们处在一个物种大量消亡的时代。然而,在1900万种生物中,仅仅记录了799种是灭绝的,
PNAS破解新物种进化的难题
经过将近5000亿次的尝试,美国德克萨斯大学(UT)奥斯汀分校的研究人员,见证了一个罕见的事件,也许解决了一个进化的难题:内含子——位于基因中的非编码DNA序列,在基因组中是如何增加的。研究结果发表在《PNAS》杂志上,解决了关于新物种进化的基本问题,并可以增进我们对于“基因表达以及癌
用于基因组文库中的真核DNA的部分酶切(预反应)实验
实验方法原理 不管高分子质量 DNA 的碱基组成与序列如何,通过水压机械剪切(hydrodynamic shearing) 均可将其以半随机形式片段化。但是,用这种方法制备的 DNA 需进行一系列酶反应操作(末端修复、甲基化、接头连接
用于基因组文库中的真核DNA的部分酶切(预反应)实验
实验方法原理 不管高分子质量 DNA 的碱基组成与序列如何,通过水压机械剪切(hydrodynamic shearing) 均可将其以半随机形式片段化。但是,用这种方法制备的 DNA 需进行一系列酶反应操作(末端修复、甲基化、接头连接、接头消化)以保护内部限制位点,以及产生一些黏性末端。
用于基因组文库中的真核DNA的部分酶切(预反应)实验
不管高分子质量 DNA 的碱基组成与序列如何,通过水压机械剪切(hydrodynamic shearing) 均可将其以半随机形式片段化。但是,用这种方法制备的 DNA 需进行一系列酶反应操作(末端修复、甲基化、接头连接、接头消化)以保护内部限制位点,以及产生一些黏性末端。本实验来源「分子克隆实验指
昆明植物所Nature子刊遗传学新文章
来自中科院昆明植物所和东卡罗来纳州立大学的研究人员10月23日在《自然通讯》(Nature Communications)杂志上发表题为“Widespread impact of horizontal gene transfer on plant colonization of land”的论文,
《自然》:700种转录组的补充数据
这是令生物信息学研究人员欢欣鼓舞的一天,因为美国国家基因组研究中心NCGR,联合戈登和贝蒂・摩尔基金会,以及全球各个科学研究机构,完成了700种海洋藻类基因组测序工作,其中包含了地球上最古怪,也最令人着迷的海洋藻类,这一项目是迄今为止同一领域中规模最大的研究项目,将有助于解析海洋微生物多样性,塑
万种原生生物基因组计划取得阶段性进展
原生生物(Protist)是一大类单细胞真核生物的集合,包括单细胞真核藻类和原生动物等,组成了原生生物界。原生生物具有高度多样性,广泛分布于各类水环境中,在生态平衡、物质和能量循环、环境健康、动植物疾病发生等方面发挥重要作用。它们是水生态系统的重要组分,是重要的初级生产力和氧气的制造者、碳循环的
万种原生生物基因组计划取得阶段性进展
原生生物(Protist)是一大类单细胞真核生物的集合,包括单细胞真核藻类和原生动物等,组成了原生生物界。原生生物具有高度多样性,广泛分布于各类水环境中,在生态平衡、物质和能量循环、环境健康、动植物疾病发生等方面发挥重要作用。它们是水生态系统的重要组分,是重要的初级生产力和氧气的制造者、碳循环的
PNAS打开基因组生物学的黑盒子
最近,美国佛罗里达州立大学、贝勒医学院和哈佛大学-麻省理工学院Broad研究所的科学家们,开辟了人类遗传学中一个鲜为人知的领域。相关研究结果发表在7月18日的《PNAS》杂志。 在这项研究中,研究人员表明,一条不活跃的X染色体上的一段不寻常的DNA重复序列,实际上对于这种女性特有的遗传现象的整