张余课题组揭示细菌ClassIII转录激活机制

9月28日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心合成生物学重点实验室研究员张余课题组在Nature Chemical Biology上,在线发表题为CueR activates transcription through a DNA distortion mechanism的研究论文,主要研究细菌Class III转录因子CueR转录激活的分子机制。 大约50年前,法国科学家Jacob和Monod发现乳糖操纵子,首次提出基因表达受到蛋白调控。阻遏蛋白Lac I和代谢物激活蛋白CRP(cAMP receptor protein;也称catabolite activator protein,CAP)被证明能够直接结合乳糖操纵子,分别发挥转录抑制和转录激活的功能。因此,学界对转录因子如何抑制及激活转录产生研究兴趣。大约30年前,Thomas A. Steitz研究组解析出CAP/CRP与DNA的复合物晶体结构,该结构首次展示转录因......阅读全文

信号转导及转录激活蛋白的功能介绍

中文名称信号转导及转录激活蛋白英文名称signal transducer and activator of transcription;STAT定  义一组含有SH2和/或SH3功能域,具有信号转导和转录因子作用的DNA结合蛋白。其SH2域可与细胞因子受体的磷酸化酪氨酸结合,随后其本身被JAK酪氨酸

信号转导及转录激活蛋白的功能特点

中文名称信号转导及转录激活蛋白英文名称signal transducer and activator of transcription;STAT定  义一组含有SH2和/或SH3功能域,具有信号转导和转录因子作用的DNA结合蛋白。其SH2域可与细胞因子受体的磷酸化酪氨酸结合,随后其本身被JAK酪氨酸

转录图谱的转录图谱的意义

在于它能有效地反应在正常或受控条件中表达的全基因的时空图。通过这张图可以了解某一基因在不同时间不同组织、不同水平的表达;也可以了解一种组织中不同时间、不同基因中不同水平的表达,还可以了解某一特定时间、不同组织中的不同基因不同水平的表达。人类基因组是一个国际合作项目:表征人类基因组,选择的模式生物的D

RNA的转录和逆转录

转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大

RNA复制、转录与逆转录

转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大

测量任一细胞因子转录因子的其他技术

虽然其他技术可以测量任一细胞因子,转录因子,或另外的磷酸化蛋白质,细胞内流式细胞仪可以测量多个细胞内标记同时上面的singlecell电平。这种方法提供了数据信号反应,分化状态,和其他细胞活动。特定的细胞表面和细胞内标记物的荧光抗体的结合使用使高分辨率的样本之间的多种细胞类型内的表型和功能的差异比较

Nature:T细胞功能调控的关键转录因子

  T细胞是适应性免疫系统的主要组成部分, 它们在病菌感染中被功能活化, 参与宿主防御, 但是遇到自身抗原或者在慢性感染和肿瘤微环境中, 它们会发生命运改变, 进入功能失能命运, 但是调控T细胞功能失能的分子机制会不清楚。  来自清华大学医学院,陆军军医大学全军临床病理学研究所的研究人员发表了题为“

信使RNA的启动子和转录因子

  一定义:酶识别、结合、开始转录的一段DNA序列。强启动子2秒钟启动一次转录,弱启动子10分钟一次。  二原核生物:大肠杆菌在起点上游约-10碱基对处有保守序列TATAAT,称为pribnow box,有助于局部解链。在其上游还有TTGACA,称为-35序列,提供RNA聚合酶识别的信号。  三真核

人工转录因子的部件——人类锌指结构2

Table 2: Binding sites and identity of ZFPs used in VEGF activationWe then generated artificial transcription factors by fusing the three-finger domai

Nature:缺失重要转录因子让血管“疯长”

  血管在动物整个生命过程中都扮演着重要角色。血管生长决定着器官是否能够在胚胎发育阶段及时得到营养供应,到了成年阶段,新血管的发育在血管修复和再生过程中发挥重要作用,血管生长过程的紊乱是癌症,糖尿病以及眼部疾病发展的重要因素。  最近来自德国的科学家发现血管内皮细胞的生长能够通过代谢机制进行调控,这

亮氨酸拉链的转录因子的介绍

  酵母转录因子GCN4是通过亮氨酸拉链(bZIP)结构结合DNA的蛋白质之一,当GCN4二聚体与DNA结合时,亮氨酸拉链区的2个单体结合为平行的卷曲螺旋结构,而其基区由无规线团结构变为α螺旋.为探讨亮氨酸拉链蛋白与DNA的结合机理,设计了含有GCN4亮氨酸拉链蛋白基区结合DNA的必需氨基酸的折叠片

转录因子的结合位点的相关介绍

  转录因子的结合位点(transcription factor binding site,TFBS)是转录因子调节基因表达时,与基因模板链结合的区域。按照常识,转录因子(transcription factor)的结合位点一般应该分布在基因的前端,但是,新的研究发现,人21和22号染色体上,只有2

分子遗传学词汇转录起始因子

中文名称:转录起始因子英文名称:transcription initiation factor定  义:参与转录起始作用的因子。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

人工转录因子的部件——人类锌指结构1

Human zinc fingers as building blocks in the construction of artificial transcription factorsKwang-Hee Bae1, 4, Young Do Kwon1, 2, 4, Hyun-Chul Shin1,

转录因子和调节蛋白是包含关系吗

调节蛋白是个很大的概念,其调节对象可以包括DNA、RNA以及蛋白质,而转录因子特指对基因转录水平进行调节的蛋白质,从这一角度上说,”调节蛋白“概念涵盖转录因子。调节蛋白还包括:各种修饰蛋白(例如对DNA进行甲基化乙酰化修饰的蛋白、蛋白磷酸化甲基化蛋白),RNA剪接蛋白、蛋白辅助蛋白(分子伴侣)等等。

Sox2:从转录因子到免疫卫士

  近日著名的免疫学杂志《自然免疫》发表了中科院生物物理所关于转录因子Sox2在固有免疫中的重要作用:Sox2在中性粒细胞中能够充当胞内DNA传感器的作用,当Sox2结合了细菌DNA后,Sox2会通过激酶TAK1和转接蛋白TAB2介导下游信号通路,开始转录翻译一系列的促炎因子。  检测到细胞中的外源

能控制转录终止的蛋白质ρ因子

能控制转录终止的蛋白质ρ因子(ρ factor)是一种与转录终止相关的蛋白质。1969年,Roberts J在T4噬菌体感染的大肠杆菌中发现了能控制转录终止的蛋白质,命名为ρ因子。ρ因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量为46kD  。ρ因子能结合RNA,又以对poly C的结合能力最强 

关于体外转录的转录条件介绍

  转录模板必须满足:  1. 在基因组全长克隆过程中,在正向引物5‘末端添加T7启动子序列;  2. 以T7启动子作为体外转录启动子,在启动子后面靶位序列连续带有3个G,转录效率最 高;  3. 在正向引物5/端添加一个帽子G,有利于提高体外转录RNA分子的侵染活性。

信号转导及转录激活蛋白的定义和作用

中文名称信号转导及转录激活蛋白英文名称signal transducer and activator of transcription;STAT定  义一组含有SH2和/或SH3功能域,具有信号转导和转录因子作用的DNA结合蛋白。其SH2域可与细胞因子受体的磷酸化酪氨酸结合,随后其本身被JAK酪氨酸

高效的基于相分离蛋白辅助的CRISPR转录激活工具

  CRISPR-Cas9(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats-CRISPR-associated proteins)系统已被广泛用于许多不同生物体的基因组工程和转录调控,一系列报道证明基于转录激活因子与CRISPR-C

Cell:揭秘转录因子如何相互作用制造心脏

  刊登于Cell杂志上的一项研究报告中,来自格莱斯顿研究所(Gladstone Institutes)的科学家们近日通过研究发现三种转录因子可以彼此相互作用,并且同基因组相互作用从而影响胚胎心脏的形成,如果没有这些蛋白质(转录因子)的相互作用就会引发新生儿出现严重的先天性心脏缺损;通过理解心脏发育

Cell子刊发布首个植物转录因子文库

  近日科学家们借助自动化平台,建立了首个植物遗传学开关的综合性文库,以帮助全球学者更好的理解植物对环境改变的适应,培育更好的植物品种。相关论文于七月十七日发表在Cell旗下的Cell Reports杂志上。  该文库的建立耗时八年,包含大约两千个植物转录因子的克隆。转录因子是天然的遗传学开关,研究

大鼠核转录因子(NFkB-)ELISA检测法

大鼠核转录因子(NF-kB )ELISA试剂盒 原理本实验采用双抗体夹心 ABC-ELISA法。用抗大鼠 NF-kB 单抗包被于酶标板上,标准品和样品中的 NF-kB 与单抗结合,加入生物素化的抗大鼠NF-kB ,形成免疫复合物连接在板上,辣根过氧化物酶标记的Streptavidin与生物素结合,加

PIL家族转录因子抑制植物分蘖机制获解析

近日,山东省农业科学院水稻研究所研究员谢先芝、中国农业科学院作物科学研究所研究员孙加强和孔秀英等合作,报道了PIL家族转录因子直接与SPLs互作,并在抑制小麦、水稻和拟南芥分蘖/分枝方面发挥重要作用。相关论文在线发表于《新植物学家》。株高、分蘖数、分蘖角等结构是小麦、水稻等作物株型的重要决定因素之一

转录因子MdERF2调控苹果表皮蜡质合成

近日,山东理工大学农业工程与食品科学学院教授李富军团队完成的研究在《农业科学学报(英文)》 (Journal of Integrative Agriculture,JIA)正式发表。该研究发现了转录因子MdERF2调控苹果表皮蜡质合成的分子机制。表皮蜡质是影响果蔬品质形成与保持的重要因子。植物激素乙

启动子与转录因子/基因表达调控蛋白

目的基因的表达调控生命活动丰富多彩、千变万化。但是万变不离其宗,不管如何变化都围绕着中心法则展开。核酸作为遗传物质指导蛋白质的表达,表达产生的一些特殊蛋白(如转录因子、调控蛋白)反过来又对DNA指导合成蛋白质的过程进行调控。对基因表达调控的研究一直是生物学研究热点,涉及到生命活动的各个过程,也是各类

Pol-II转录暂停因子NELF促进抗肿瘤免疫

多个转录因子在调控记忆T细胞分化中发挥重要作用,包括TCF1、FOXO1和MYB等。特别是,由TCF7基因编码的TCF1蛋白在T细胞发育、分化和耗竭(T cell exhaustion)时效应功能的保留中发挥着至关重要的作用。在免疫检查点阻断免疫疗法中,TCF1+ T细胞群的响应同样很关键。尽管目前

核转录分析

            实验材料 cDNA 0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA 试剂、试剂盒 PBS

转录的特点

转录时,细胞通过碱基互补的原则来生成一条带有互补碱基的mRNA,通过它携带密码子到核糖体中可以实现蛋白质的合成。与DNA的复制相比,转录有很多相同或相似之处,亦有其自己的特点。转录中,一个基因会被读取并复制为mRNA。就是说,以特定的DNA片段作为模板,以DNA依赖的RNA聚合酶作为催化剂,合成前体

RNA-反转录

            实验材料 poly(A)+RNA 反转录酶 鼠源反转酶  或禽源反转录酶 试剂、试剂盒 oligo