张余课题组揭示细菌ClassIII转录激活机制

9月28日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心合成生物学重点实验室研究员张余课题组在Nature Chemical Biology上,在线发表题为CueR activates transcription through a DNA distortion mechanism的研究论文,主要研究细菌Class III转录因子CueR转录激活的分子机制。 大约50年前,法国科学家Jacob和Monod发现乳糖操纵子,首次提出基因表达受到蛋白调控。阻遏蛋白Lac I和代谢物激活蛋白CRP(cAMP receptor protein;也称catabolite activator protein,CAP)被证明能够直接结合乳糖操纵子,分别发挥转录抑制和转录激活的功能。因此,学界对转录因子如何抑制及激活转录产生研究兴趣。大约30年前,Thomas A. Steitz研究组解析出CAP/CRP与DNA的复合物晶体结构,该结构首次展示转录因......阅读全文

体外转录

·         In Vitro RNA Transcription (Promega)For in vitro preparation single-stranded RNA probes or microgram quantities of defined RNA transcripts f

核转录分析

实验材料 cDNA0.45um 硝酸纤维素 尼龙膜 酵母 tRNA试剂、试剂盒 PBS NP-40 裂解缓: 20XSSC LNaOH 甘油储存缓冲液 10X 转录缓冲液 核苷酸:ATPGTPCTP 200uCi「α32P]-UTP 10XSET 蛋占酶 K 无 RNase 的 DNase

RNA-反转录

 实验材料 poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶试剂、试剂盒 oligo(dT)12-18 lmol LTris-Cl 1mol LTris-Cl lmol LKC1 25 mmol LMgCl2 dNTP 混合物 0.lmol LDTT RNasin实验步骤 一材料与设备1)p

转录组测序与转录表达谱测序的异同

转录组测序可以得到特定条件下所有mRNA转录本的丰度信息,从而发现新的转录本和可变剪接体基因表达谱(gene expression profile):指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特

转录组测序和全转录组测序的区别

全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术,可以全面获取样本中转录产物信息,结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制, 进行联合分析,深入挖掘转录水平调控网络。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有

RNA的转录与逆转录相关介绍

转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大

陈鹏博士PNAS基因的表达调控

  魔法师的学徒开启了一个输水系统,但是却不能够停止它,很快水浸没到了他的脖子,他陷入到困境中。不同于这个无能的学徒,活细胞具有更好的设计:当它们激活一种基因时,它们就会将一种系统留作备用来关闭基因。细胞不想浪费能源来生成它们不再需要的蛋白。康奈尔大学的研究人员在新研究中确定了细胞利用的两种机制,并

信使RNA的反转录酶与反转录过程

  定义:以反义RNA为模版,通过反转录酶,进行的RNA转录  1.概念反转录是以RNA为模板合成DNA的过程,也称逆转录。这是DNA生物合成的一种特殊方式。  2.反转录酶与反转录过程  反转录过程由反转录酶催化,该酶也称依赖RNA的DNA聚合酶(RDDP),即以RNA为模板催化DNA链的合成。合

RNA复制的转录与逆转录的过程介绍

  转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成

两项研究:肝病防护转录因子FOXO3

  来自堪萨斯大学的研究者在最新一期American Journal of Pathology杂志上分别发表了两项研究成果,表明转录因子FOXO3能够预防丙型肝炎和酒精引起的肝脏损伤。他们认为,对FOXO3通路的调整,能够为由HCV-酒精引起的肝脏损伤提供一种潜在的治疗方法。   最新一期的A

研究揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制

9月25日,中国科学院上海免疫与感染研究所王程远研究组联合美国罗格斯大学Richard Ebright团队、美国科罗拉多州立大学Thomas Santangelo团队,在《自然》(Nature)上发表了题为Structural basis of archaeal FttA-dependent tra

研究揭示古菌因子依赖型转录终止分子机制

9月25日,中国科学院上海免疫与感染研究所王程远研究组联合美国罗格斯大学Richard Ebright团队、美国科罗拉多州立大学Thomas Santangelo团队,在《自然》(Nature)上发表了题为Structural basis of archaeal FttA-dependent tra

胚胎干细胞转录因子NANOG的新发现

  在胚胎干细胞的自我更新中,转录因子Nanog 具有关键性的作用,这一因子也一直是近年来研究的热点。最近,西班牙国家癌症研究中心(CNIO)的科学家们发现,NANOG也调控成体生物分层上皮细胞的细胞分裂,分层上皮细胞是皮肤表皮的组成部分,或者覆盖在食管和阴道表面。相关研究结果发表在最近的《自然通讯

人核转录因子elisa试剂盒使用说明

检测范围                                                     80 ng/L -2000 ng/L 使用目的本试剂盒用于测定人血清、血浆及相关液体样本中核转录因子(NF-kB )含量。实验原理本试剂盒应用双抗体夹心法测定标本中人核转录因子(NF-k

探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究

  ESC在体外可无限自我更新和分化为机体内任何种类的细胞,在器官再生和细胞替代治疗中具有广阔的应用前景。然而,hESC维持自我更新及发育多能性的分子调控机制还有很多问题尚不清楚,妨碍了将其分化的细胞安全有效地应用于临床。因此,对人ESC如何维持其自身特性的机制进行深入的研究尤为重要。   研究思

研究揭示GRAS转录因子调控香蕉果实后熟机制

  在国家自然科学基金等项目资助下,广东省农业科学院果树研究所研究员易干军/毕方铖团队,成功揭示GRAS转录因子调控香蕉果实后熟机制。相关成果近日发表于《高级研究杂志》(Journal of Advanced Research)。MaEIL9-MaZIP5-MaSCL8分子模块调控香蕉后熟模式。研究

探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究

  ESC在体外可无限自我更新和分化为机体内任何种类的细胞,在器官再生和细胞替代治疗中具有广阔的应用前景。然而,hESC维持自我更新及发育多能性的分子调控机制还有很多问题尚不清楚,妨碍了将其分化的细胞安全有效地应用于临床。因此,对人ESC如何维持其自身特性的机制进行深入的研究尤为重要。   研究思

人核转录因子(NFkB-)ELISA试剂盒

人核转录因子(NF-kB )ELISA试剂盒原理本实验采用双抗体夹心 ABC-ELISA法。用抗人 NF-kB 单抗包被于酶标板上,标准品和样品中的 NF-kB 与单抗结合,加入生物素化的抗人NF-kB ,形成免疫复合物连接在板上,辣根过氧化物酶标记的Streptavidin与生物素结合,加入底物工

小鼠核转录因子(NFkB-)ELISA试剂盒

小鼠核转录因子(NF-kB )ELISA试剂盒 原理本实验采用双抗体夹心 ABC-ELISA法。用抗小鼠 NF-kB 单抗包被于酶标板上,标准品和样品中的 NF-kB 与单抗结合,加入生物素化的抗小鼠NF-kB ,形成免疫复合物连接在板上,辣根过氧化物酶标记的Streptavidin与生物素结合,加

转录因子MEF2:认知功能的护身符?

  人类寿命的延长伴随着痴呆症发病率的上升,良好的认知功能可保障老年人群自身的生活自理能力,减轻社会医疗负担。我国老龄人口众多,始终对于长寿有着美好追求,比如人们到环境优美的巴马长寿乡旅居,以期望外部环境的优化实现长寿。但有时不得不承认,在长寿方面,自身遗传因素也是不容小觑。SCIENCE TRAN

科学家揭示水稻转录因子高产抗病调控机制

  近日,《科学》在线发表了四川农业大学陈学伟团队、中科院遗传与发育生物学研究所李家洋院士团队及美国加州大学戴维斯分校Pamela Ronald团队合作在水稻产量与抗病协同调控机制研究领域取得的最新进展,揭示了水稻理想株型建成的关键基因IPA1既能提高产量又能提高稻瘟病抗性的调控新机制。  高产抗病

研究揭示纤维小体转录调控因子的结构功能机制

  纤维小体是一类可以高效降解木质纤维素生物质的多酶复合体,在生物质能源与合成生物学中具有广泛的应用价值。产纤维小体细菌根据底物种类调控纤维小体组分的表达,从而实现对特定底物类型的高效降解。在典型的产纤维小体细菌热纤梭菌中,一类特殊的σ和anti-σ因子SigI-RsgI负责感应底物并调控纤维小体基

EMBO-Reports:果蝇揭示肠癌中关键性转录因子

  近日,西班牙研究人员弄清楚了一种称为Mirror的转录因子是如何调节果蝇肠道中肿瘤样生长的。相关研究结果发表在EMBO Reports杂志上。  每年在全球范围内,大肠癌导致超过五十万人死亡。该疾病起源于胃肠道的上皮细胞,主要是由于肠道细胞中的分子信号活动异常导致的。  研究人员已经能够利用果蝇

共转录的定义

中文名称共转录英文名称cotranscription定  义(1)原核生物的基因以多顺反子或操纵子形式存在,被转录为一个共同的信使核糖核酸(mRNA)。(2)通过基因操作使不同的基因同时在细胞或组织中一起转录。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

什么是转录作图?

中文名称转录作图英文名称transcription mapping定  义标明转录物序列在基因组上的位置。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

转录图谱的原理

所有生物性状和疾病都是由结构或功能蛋白质决定的,而已知的所有蛋白质都是由mRNA编码的,这样可以把mRNA通过反转录酶合成cDNA或称作EST的部分的cDNA片段,也可根据mRNA的信息人工合成cDNA或cDNA片段,然后,再用这种稳定的cDNA或EST作为“探针”进行分子杂交,鉴别出与转录有关的基

3.5-RNA-反转录

利用 RNA 模板通过反转录获得 DNA,进而复制和感染细胞实验材料poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶试剂、试剂盒oligo(dT)12-18lmol LTris-Cl1mol LTris-Cllmol LKC125 mmol LMgCl2dNTP 混合物0.lmol LDTT

mRNA转录加工过程

加帽即在mRNA的5'-端加上m7GTP的结构。此过程发生在细胞核内,即对HnRNA进行加帽。加工过程首先是在磷酸酶的作用下,将5'-端的磷酸基水解,然后再加上鸟苷三磷酸,形成GpppN的结构,再对G进行甲基化。加尾这一过程也是细胞核内完成,首先由核酸外切酶切去3'-端一些过

转录水平的调控

该模型认为在整合基因的5’端连接着一段具有高度专一性的DNA序列,称之为传感基因。在传感基因上有该基因编码的传感蛋白。外来信号分子和传感蛋白结合相互作用形成复合物。该复合物作用于和它相邻的综合基因组,亦称受体基因,而转录产生mRNA,后者翻译成激活蛋白。这些激活蛋白能识别位于结构基因(SG) 前面的

tRNA转录加工过程

主要加工方式是切断和碱基修饰。真核生物tRNA前体一般无生物学特性,需要进行加工修饰。加工过程包括:(1)剪切和拼接tRNA前体在tRNA剪切酶作用下,切成一定大小的分子。大肠杆菌RnaseP特异切割tRNA前体5′旁侧序列,3′-核酸内切酶如RnaseF可将tRNA前体3′端一段序列切下来。Rna