美科学家绘制人脑3D透视图涵盖所有基因组

网易探索9月24日报道 科学家们已经制作出了显示整个大脑部位基因活动的完整的成人大脑地图集。 这一地图集是通过对两个临床上不显著的大脑和来自于第三个人的半个大脑的900个具体部位的基因分析制作而成的。这两个大脑分别属于一位24岁和39岁的人。 西雅图的艾伦脑科研究所的研究人员称该图集可作为基线。科学家可以通过对比该基线和患病脑部的基因活动,然后发现引起病变的一些神经学和精神学方面因素。 研究该图集的爱丁堡大学分子神经学家赛斯.格兰特称:“人脑是人类所知的最复杂的结构,现代生物学一个最大的挑战即是弄清楚它的组成结构。” 这使得我们首次能够将将人类的大脑与基因组联系起来,为我们提供了厘清基因组和大脑之间联系的必要线索,并且提供了一条解释基因失调将如何影响和引起脑部疾病的途径。 大脑的能量源自神经线路,不同的细胞和结构,以及在何处何时在310亿片碎片中开启和关闭。 通过对1亿多大脑切片的测量,有......阅读全文

科学家搭建草莓基因组数据库

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓为蔷薇科草莓属,因芳香多汁、营养丰富受到喜爱,在全国各地均可种植。栽培草莓为异源多倍体,基因组复杂,杂合度高。 2019年,《自然—遗传学》发表了利用三代测序数据组装的高

中国科学家NatureGenetics发布西瓜基因组草图

  来自北京农林科学院、康奈尔大学、深圳华大基因研究院、复旦大学等10多家机构的研究人员组成的一个国际研究小组成功破译了西瓜的遗传密码,绘制出世界上第一张西瓜(watermelon)基因组序列草图。相关论文发表在11月25日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上   北京农林

科学家构建鹰嘴豆属超级泛基因组

  鹰嘴豆是世界第三大豆类作物,具有重要的经济价值和营养价值,其固氮能力能改善土壤肥力,具有独特的生态价值。但鹰嘴豆的遗传背景相对狭窄、抵抗生物或非生物胁迫的能力不足,限制了它的育种改良。  5月29日,华大生命科学研究院联合国际半干旱热带作物研究中心、西澳大学、莫道克大学等单位的研究成果发表于《自

科学家构建鹰嘴豆属超级泛基因组

鹰嘴豆是世界第三大豆类作物,具有重要的经济价值和营养价值,其固氮能力能改善土壤肥力,具有独特的生态价值。但鹰嘴豆的遗传背景相对狭窄、抵抗生物或非生物胁迫的能力不足,限制了它的育种改良。5月29日,华大生命科学研究院联合国际半干旱热带作物研究中心、西澳大学、莫道克大学等单位的研究成果发表于《自然—遗传

科学家揭示德保苏铁叶绿体基因组特征

  广西大学植物生理生态与进化课题组在苏铁植物的基因组学研究方面取得新进展,首次用苏铁的叶绿体全基因组重建了苏铁植物的系统进化树,揭示托叶铁科为非单系起源,该研究成果近日发表在《科学报告》上。  据介绍,研究人员通过对德保苏铁展开二代测序,获得了德保苏铁基因组几百万条的短片段,用先进的算法进行组装,

我国科学家完成柞蚕全基因组测序

  由辽宁省蚕业科学研究所牵头,辽宁省农科院大连生物技术研究所、吉林省蚕业科学研究院、沈阳农业大学生物科学技术学院、河南省蚕业科学研究院、黑龙江省蚕业研究所组成的柞蚕基因组研究联合攻关项目组(简称柞蚕项目组)与深圳华大基因科技服务有限公司(简称华大科技)携手,经过两年的不懈努力,日前完成了柞蚕全基因

中国科学家成功绘制人参基因组图谱

  3月4日,在钓鱼台国宾馆中国人参基因组图谱新闻发布会上,中科院基因组所副所长、世界知名基因组学专家于军向媒体公布:经过吉林省通化市政府、中科院北京基因组研究所、吉林紫鑫药业的共同努力,于2月底成功绘制出人参基因组图谱,揭开了人参的神秘面纱,为人参的种植、防病、开发与人参产业发展振兴提供

中国科学家成功破译飞蝗基因组图谱

  1月14日,由中国科学院动物研究所康乐院士领衔, 深圳华大基因研究院和中科院北京生命科学研究院等单位参与的一项研究,成功破译了飞蝗(Locusta migratoria)的全基因组序列图谱,这是迄今人类破译的最大动物基因组。基于基因组信息,这项研究还揭示了飞蝗食性、迁飞和群聚的奥秘。研究成果

Nature:科学家完成云杉超大基因组草图

  在超过两亿年的历史中,极具生态重要性的松柏类植物在森林中占据着统治地位。   现在,瑞典斯德哥尔摩大学生命科学实验室(Science for Life Laboratory)和于默奥植物科学中心(Umeå Plant Science Centre)的科学家完成了对挪威云杉(Picea

Science:中国科学家领衔“破译”绵羊基因组

      由中国科学家领衔的一个国际科研小组 5 日宣布,历经 5 年时间,他们完成了对绵羊基因组的测序、组装及分析工作。这项成果使人们对反刍动物生物学有了崭新认识。更重要的是,中国是绵羊和山羊饲养及羊肉消费大国,新研究将促进选育出更优秀的肉羊新品种。  绵羊基因组的测序工作在 2009 年正式启

美科学家绘制出瓜类基因组图谱

  炎炎夏日,以西瓜为代表的各种瓜类成为人们最爱。美国科研人员最新报告说,他们绘制出了西瓜等瓜类的基因组图谱,将来有望利用基因技术开发出更甜、更可口、更健康的瓜类新品种。   得克萨斯农机大学科研人员在新一期《美国园艺科学协会杂志》上报告说,此前法国和西班牙研究人员曾经完成了瓜类某些DNA(脱氧核

研究人员发布全基因组单核苷酸变异数据库

  10月22日,国际学术期刊Genome Biology 以PGG.SNV: understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse popul

研究人员从从基因组水平揭示食肉目染色体进化规律

  染色体进化是物种形成和演化的重要驱动因素。具有显着核型差异的食肉目动物为染色体进化研究提供了很好的研究素材。虽然前人通过比较染色体涂色法建立了食肉目内许多物种的染色体比较图谱,但这些研究的分辨率比较低,尚没有深入到精细的核苷酸水平,也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物种间的共线性区块、染色体重排以

Illumina与美研究所开发基因组二级分析工具-助力变异检测

  Illumina公司和麻省理工学院及哈佛大学Broad研究所近日宣布,他们已经开始共同开发基因组二级分析算法和软件。两家机构的顶级数据科学家即将展开合作,将业界领先的开源GATK算法与Illumina DRAGEN™(Dynamic Read Analysis for GENomics)Bio-

曾为华人科学家发声-美顶尖研究所所长屡次遭停职

今年4月以来,瑞娜·迪索萨(Rena D'Souza)一直处于带薪休假状态。她是美国国立卫生研究院(NIH)下属牙科和颅面研究所(NIDCR)的所长。事实上,这是NIH第三次对她采取行动。去年,瑞娜受到了两次处分,分别是2022年12月被停职2天、2023年7月底到8月初被停职2周。2023

美森林惊现“外星”巨型病毒

  据生物预印本网站bioRxiv刊载的一项最新研究,科学家在美国马萨诸塞州哈佛森林的土壤中发现了一组巨型病毒。这些巨型病毒具有“仿佛来自外星的”附属物和前所未见的内部结构。  尽管新发现的这些病毒样颗粒尚未经过基因组分析,但研究人员认为,由于其独特的衣壳结构,它们属于巨型病毒。  早在2018年,

我国科学家率先完成枣全基因组测序

  日前,河北农业大学教授刘孟军团队与深圳华大基因科技服务有限公司合作,在世界上率先完成枣树的高质量全基因组测序,使枣树成为世界鼠李科植物和我国干果树种中第一个完成基因组测序的物种。《自然—通讯》10月29日在线发表了该成果。  刘孟军说,其团队自2010年启动枣基因组计划,从枣基因组大小

科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱

  近日,中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作,破译了褐牙鲆全基因组序列,通过与半滑舌鳎全基因组比较分析,初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。  通过与半滑舌鳎全基因组

科学家解析大豆灰斑病菌基因组信息

  大豆灰斑病又称褐斑病、蛙眼病,由真菌Cercospora sojina Hara引起,是世界性的病害,同时也是我国大豆主产区的一个主要病害,尤其在东北三省的发病最重。大豆灰斑病菌引起的病害在东北地区造成的产量损失在10%至30%之间。在阿根廷和巴西等国,据报道损失可达60%以上。灰斑病可在大豆的

我国科学家开发高效基因组序列分析工具

  人类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异,往往由DNA序列变化造成,这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是通过比对大量人群的遗传信息,利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学

科学家绘制高精度类人猿基因组图谱

一个国际科研团队宣布,他们新近绘制出红毛猩猩和黑猩猩这两种类人猿的高精度基因组图谱。与过去类似研究不同的是,这次没有参照人类基因组图谱,因此更准确地揭示了人类与类人猿的基因差异。 利用第三代基因测序技术和先进的拼接方法,美国华盛顿大学等机构研究人员绘制出的这个高精度基因组图谱,对人与类人猿基因组

我科学家完成棘球绦虫基因组解析

  包虫病威胁着我国约5000万人口,其元凶――细粒棘球绦虫的遗传密码最近被科学家“破译”。昨天,记者从国家人类基因组南方研究中心获悉,经过中外科学家长达三年的协同努力,解析出了细粒棘球绦虫的基因组合转录组,英国《自然・遗传学》杂志前天在线发布了这一成果。   由棘球绦虫所引起的包虫病是人和家畜

科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱

  近日,中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作,破译了褐牙鲆全基因组序列,通过与半滑舌鳎全基因组比较分析,初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。  通过与半滑舌鳎全基因组

科学家绘制出橡胶树基因组草图

  日本和马来西亚研究人员合作成功绘制出橡胶树基因组草图,这将有助于培育更加高产的橡胶树,提高天然橡胶的产量。  日本理化学研究所日前发布一份公报说,该研究所和马来西亚理科大学的研究人员对东南亚广泛栽种的橡胶树品种“PRIM600”进行了基因组测序,绘制出的基因组草图包含了超过93.7%的橡胶树基因

中国科学家主导完成盐芥基因组研究

  由中科院遗传与发育生物学研究所、深圳华大基因研究院等多家单位共同完成的盐芥(Thellungiella salsuginea)基因组研究成果在《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表(http://www.pnas.org/content/early/2012/07/05/12099541

我国科学家完成扇贝基因组精细图谱绘制

日前,中国海洋大学教授包振民团队完成了扇贝基因组精细图谱绘制,探究原始动物祖先染色体核型进化、躯体结构多样性产生、眼睛起源及其调控机制等,在动物宏观进化研究领域取得重要进展。相关成果日前发布于《自然.生态学与进化》。 动物界99%的物种隶属于双侧对称动物,进化学家推测这些双侧对称动物可能起

我科学家参与完成非洲稻基因组测序

  最近,美国亚利桑那大学(UA)研究人员带领的一个国际研究小组,完成了非洲稻(Oryza glaberrima)的全基因组测序。中科院遗传与发育生物学研究所的陈明生(Mingsheng Chen)和Jinfeng Chen也参与了此项研究工作。相关研究结果,以“The genome sequenc

我国科学家开发高效基因组序列分析工具

  类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异,往往由DNA序列变化造成,这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study,GWAS)是通过比对大量人群的遗传信息,利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学的

科学家构建高质量金粟兰基因组图谱

11月26日,《自然—通讯》以背靠背的形式在线发表了两项由中国科研团队主导的研究,这两项研究填补了核心被子植物最后一个主要分枝——金粟兰目的基因组信息,为破解被子植物的早期演化历程提供了更翔实的证据。被子植物是地球上数量最多、种类最丰富的植物类群。还原植物清晰的间亲缘关系系统发育树,对了解被子植物的

中外科学家成功解析西瓜基因组

  2012年11月26日,由北京市农林科学院、深圳华大基因研究院和康奈尔大学等多家单位合作完成的西瓜基因组相关研究成果在《自然•遗传学》(Nature Genetics)杂志发表。这项研究为西瓜基础生物学研究及其种质资源培育、抗病及遗传改良提供了宝贵资源,同时,也为葫芦科植物的进化和比较基因组