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Illumina与美研究所开发基因组二级分析工具助力变异检测

Illumina公司和麻省理工学院及哈佛大学Broad研究所近日宣布,他们已经开始共同开发基因组二级分析算法和软件。两家机构的顶级数据科学家即将展开合作,将业界领先的开源GATK算法与Illumina DRAGEN™(Dynamic Read Analysis for GENomics)Bio-IT平台的速度和高准确性结合起来,并应用于小变异(SNV)和大变异(CNV/SV)检测等常用方法。 麻省理工学院及哈佛大学Broad研究所首席数据官、医学博士Anthony Philippakis表示:“Broad和Illumina致力于让各种规模和各个学科的实验室都能使用最好的算法。我们可以通过综合运用我们的专业知识来改进开源工具包,提供最先进而全面的分析流程,同时确保全球基因组学界都能广泛地使用和获取这些开源的分析流程。这是一个长期的合作伙伴关系——我们将共同创新,推动新型变异检出的前沿发展,促进基因组学的进步。” 合作开发的......阅读全文

新一代测序技术之三国时代(上):Illumina

【摘要】2005年454公司首推划时代的新一代测序仪,从而引发了测序市场上454、Illumina、ABI等公司在新一代测序技术上的比拼高潮。也正是这种你追我赶,让绘制人类全基因组图谱由过去的耗费4.37亿美元和13年时间,骤然缩短到如今SOLiD 3运行一次即获得50GB可定位测序数据。新一代测序

如何揭开长非编码RNA的神秘面纱

  长非编码RNA(lncRNA)长达两百个核苷酸以上的转录本,但并不编码任何蛋白质。尽管如此,长非编码RNA在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,说明lncRNA的调控具有重要的生物学意义。细胞中绝大多数lncRNA(也称lincRNA)位于细胞核,它们对应的DNA区域有的与蛋白编码基因重叠,

Nature新技术:CRISPR+单细胞测序=?

CRISPR-Cas9“基因剪刀”的基因组编辑技术是生物研究和新型靶向药物研发的有力工具。比如利用CRISPR筛选基因(pooled CRISPR screens),可以通过CRISPR gRNAs靶向成百上千个不同的基因,同时编辑许多细胞,然后实验筛选编辑细胞,gRNA可以帮助确定哪些基因对于生物

液相序列捕获系统与高通量测序

Nature Biotechnology 2009年2月封面文章:基于安捷伦寡核苷酸序列合成技术的液相序列捕获系统 – 高通量平行靶向测序的最佳解决方案来自美国麻省理工学院和哈佛大学Broad研究院的研究人员,利用安捷伦(Agilent Technologies)卓越的寡核苷酸序列合成技术,合成

安捷伦推出最新人全外显子靶向序列富集工具

安捷伦科技公司与维康信托基金会桑格研究院和 Gencode 研究团队合作开发了用于新一代测序的最新人全外显子靶向序列富集工具        2010 年 8 月 4 日,加利福尼亚州圣克拉拉市和英国剑桥市 — 安捷伦科技公司(NYSE:A)

iPad大小的DNA测序工具即将问世?

  一家由Facebook亿万富豪尤里.米尔纳(Yuri Milner)支持的小型企业正在寻求进入DNA测序的热门领域,其所研发的产品是一款和笔记本电脑相同尺寸和重量——可能也会是相同价格——的设备。   “我们所谈论的DNA测序工具是一款类似于iPad的设备,使用起来非常简便,成本也相当低廉

Illumina让“1000美元基因组”成为现实

  Illumina公司称新的测序仪将是公司利润增长的引擎。   1000美元的全基因组测序标语在行业内已流传好几年了。尽管这个口号很多公司都喊过,但目前似乎没有哪个公司能兑现。昨天, Illumina公司称将推出两款新的测序平台:HiSeq X Ten和NextSeq 500。这两款测序仪的