中科院昆明动物所成功揭示实验大鼠起源驯化遗传机制
近日，中国科学院昆明动物研究所张亚平课题组与吴东东课题组合作，通过比较野生褐家鼠和实验大鼠的基因组和转录组数据，解析了实验大鼠的起源和驯化遗传机制。相关研究成果发表在Molecular Biology and Evolution上。 实验大鼠作为一种广泛使用的模式动物，由野生褐家鼠驯化而来，也是一种家养动物。与其野生祖先褐家鼠相比，实验大鼠在形态、行为及生理方面发生很大变化，但实验大鼠的起源以及导致其被驯化成功的机制尚不清楚。 研究人员利用群体遗传学方法，FST与cross-population extended haplotype homozygosity (XP-EHH)等，在全基因范围内扫描了野生褐家鼠与实验大鼠群体之间出现分化的区域，发现大量神经系统基因在大鼠驯化过程中受到人工选择作用，例如，在学习记忆方面起重要作用的FOXP2和B3GAT1，以及节律相关基因CLOCK。这些基因在实验大鼠的神经组织中的表......阅读全文
中科院昆明动物所成功揭示实验大鼠起源驯化遗传机制
近日，中国科学院昆明动物研究所张亚平课题组与吴东东课题组合作，通过比较野生褐家鼠和实验大鼠的基因组和转录组数据，解析了实验大鼠的起源和驯化遗传机制。相关研究成果发表在Molecular Biology and Evolution上。 实验大鼠作为一种广泛使用的模式动物，由野生褐家鼠驯化而来
昆明动物所揭示家养动物高原适应遗传机制
青藏高原低氧低压、寒冷、强紫外线等极端环境塑造了其独特的生物多样性资源。家养动物高原适应性状遗传机制的解析，不仅能够研究环境与遗传发育的相互作用机制，也有助于青藏高原动物遗传资源的保护和长远开发利用，为高原家畜育种、提高家畜的生产性能和品种改良提供重要信息和理论指导，进一步促进青藏高原地区生态文
昆明动物所等揭示澳洲野犬群体起源机制
澳洲野犬（Canis lupus dingo）英文名dingo，分类学上属于犬属，灰狼种，澳洲野犬亚种，是澳大利亚特有的一种野生动物。它也是一种非常有趣的动物，首先，它生活在与外界孤立的澳大利亚，却不是澳洲的原生物种，由于澳洲的特殊地理位置，澳洲野犬只会是人类迁移澳洲携带过去的，因此研究澳洲野犬
昆明动物所与哈佛大学合作揭示社会性起源的遗传机制
生活中常常遇到这样的情况：冰箱里还剩下一块蛋糕，而你的舍友都不在，你是独吞这块蛋糕，还是留着和大家分享呢?中国科学院昆明动物研究所Douglas Yu研究组与美国哈佛大学共同提出了一套揭示合作行为如何出现及何时出现的研究计划。 蜜蜂，是人们最为熟悉的一种高度社会化的物种。一只脱离了蜂群
昆明动物所从能量代谢角度揭示蝙蝠飞行起源的机制
蝙蝠是翼手目动物的通称，是唯一演化出具有真正飞行能力的哺乳动物。跟鸟类进化出飞行能力一样，蝙蝠飞行能力的进化需要一系列十分复杂的形态和生理变化，因此达尔文在《物种起源》中感叹“从不能飞的原始哺乳动物进化为能飞的蝙蝠是不可思议的”。 中国科学院昆明动物研究所张亚平院士及其指导的博士生沈永
昆明动物所等揭示家犬适应欧洲牛奶饮食的遗传机制
家犬大约在1万五千年前到4万年前从欧亚大陆的灰狼驯化而来，现已遍布世界大部分有人类居住的地方。家犬与人类生活在相同的环境中，在很多方面存在趋同进化，家犬对环境的适应性进化遗传机制一直是进化生物学家的研究热点。经历长时间的人工选择和自然选择，欧亚大陆家犬分成欧洲家犬和东南亚两个群体，其背后的遗传机
昆明动物所等揭示金丝猴属物种高海拔适应遗传机制
金丝猴属(Rhinopithecus)属于灵长目，猴科，疣猴亚科，包括5个近缘物种：滇金丝猴（R.bieti）、怒江金丝猴(R.strykeri )、川金丝猴(R. roxellana)、黔金丝猴(R. brelichia)和越南金丝猴(R. avunculus)。所有物种均被列为红色物种名录濒
昆明动物所揭示肺癌侵袭转移新机制
肺癌是一种常见的恶性肿瘤。随着吸烟和环境因素影响的增加，肺癌发病率和病死率均迅速上升。肺癌已成为我国恶性肿瘤首位死亡原因。肿瘤细胞分子水平的改变，如染色体、基因改变，已被认为是恶性肿瘤发生的最主要机理。寻找新的肺癌相关基因——癌基因和抑癌基因——对深入研究肺癌发生、发展的病理机制，发现新的诊断标
昆明动物所揭示rRNA加工机器的进化机制
核糖体是蛋白质合成的分子机器。核糖体RNA的加工成熟及其与核糖体蛋白的结合是核糖体亚基装配的基本过程。真核生物的该过程是在核仁中进行的。在酵母上已有报道核糖体小亚基rRNA(SSU rRNA)的加工成熟，是由一个被称为SSU Processome(小亚基rRNA加工体)的核酸蛋白复合体所
动物所等揭示小鼠行为和神经基因的驯化机制
实验小鼠是生物学和医学研究中最常用的哺乳动物模型之一，由野生小家鼠长期驯化而来。实验小鼠和野生小家鼠在体型、生理及行为方面存在很大差异。特别是，实验室驯化下小鼠攻击行为减弱、温顺行为增强。已知实验小鼠的基因组来自Mus musculus domesticus (M. m. domesticus)
动物所等揭示小鼠行为和神经基因的驯化机制
实验小鼠是生物学和医学研究中最常用的哺乳动物模型之一，由野生小家鼠长期驯化而来。实验小鼠和野生小家鼠在体型、生理及行为方面存在很大差异。特别是，实验室驯化下小鼠攻击行为减弱、温顺行为增强。已知实验小鼠的基因组来自Mus musculus domesticus (M. m. domesticus)
昆明动物所揭示两个重要光合作用酶的起源及其进化机制
光合作用是地球上最重要的生物化学反应。通过光合作用，光合生物吸收太阳光能，将CO2固定，转变成化学能，成为地球上几乎所有有机物和能量的源头。其中CO2固定任务是由卡尔文循环途径来完成的。果糖-1,6-二磷酸酶（FBPase）和景天庚酮糖-1,7-二磷酸酶（SBPase）是真核光合生
中科院昆明动物所揭示新型肺癌肿瘤靶标
记者3月25日从中科院昆明动物研究所获悉，在国家自然科学基金委和科技部项目的支持下，该所李功华博士在黄京飞研究员的指导下，建立了新的系统生物学模型，并发现可能是新型的针对肺癌的肿瘤靶标。该研究成果已发表在《生物信息学》上。 据悉，肿瘤已是世界人口死亡的首要原因，我国每年因肿瘤死亡的人数超过
昆明动物所等揭示普洱茶减肥降脂机制
云南普洱茶是由云南大叶种晒青毛茶经后发酵，包括自然发酵（非酶性氧化）和渥堆发酵（微生物酶促氧化）制成的发酵茶。普洱茶不仅具有悠久的发展历史和丰富的文化内涵，而且广受海内外的欢迎。其广受海内外欢迎的一个重要原因是：传统上认为它具有减肥、降脂、防止心血管疾病等多种保健功效。然而，对普洱茶诸多保健功能
昆明动物所等揭示心境障碍易感机制
心境障碍是一类遗传力较高的精神疾病，主要包括双相情感障碍和抑郁症。然而，其表型的复杂性及参与因素的异质性导致心境障碍的神经生物学机制仍不特别明确，缺少明确的生物标记物。越来越多的基础和临床研究指出，参与情绪控制和认知功能的脑区（比如前额叶，海马和杏仁核等）的结构和功能在心境障碍病人中出现异常，而
动物所揭示反刍动物气候适应性遗传机制
绵羊作为人类驯养的动物之一，是人类的重要食物来源。其广泛分布于世界不同的区域特异性气候环境中。经过数以千百年的自然与人工选择，形成了适应于区域气候环境且具有独特表型的地方品种。 中国科学院动物研究所李孟华研究组利用绵羊全基因组的约5万个单核苷酸多态性位点（SNPs）和分布于全世界的32个地方绵
成都生物所揭示蛇类起源及表型演化的遗传机制
中国科学院成都生物研究所李家堂研究团队选取了全球极具代表性的蛇类物种，整合谱系基因组学、大规模比较转录组学分析方法及基因编辑等实验技术，综合探讨了蛇类起源及表型演化的遗传机制。相关论文6月19日发表于国际学术期刊《细胞》（Cell）。全球蛇类约4000种，广泛分布于除南极洲外的各大洲陆地和海洋，在进
成都生物所揭示蛇类起源及表型演化的遗传机制
中国科学院成都生物研究所李家堂研究团队选取了全球极具代表性的蛇类物种，整合谱系基因组学、大规模比较转录组学分析方法及基因编辑等实验技术，综合探讨了蛇类起源及表型演化的遗传机制。相关论文6月19日发表于国际学术期刊《细胞》（Cell）。 全球蛇类约4000种，广泛分布于除南极洲外的各大洲陆地和海
昆明动物所揭示肿瘤细胞分子病理新机制
蛋白酶激活受体1 (protease-activated receptor 1, PAR1) 属于G蛋白偶联受体家族，是凝血酶、金属蛋白酶等的受体，在血液循环系统、免疫系统中发挥重要的生理作用，并参与多种人类疾病的病理发生。目前研究表明PAR1信号通路激活的失调与慢性炎症以及肿瘤的发生和肿瘤转移
昆明动物所揭示翼手目暗视觉适应性机制
翼手目（蝙蝠）是夜行性动物，在不同的蝙蝠种类中存在着显著的感觉分化：食虫蝙蝠主要依赖回声定位来导航、捕食，其眼睛退化，而旧大陆果蝠没有回声定位能力，其眼睛很发达，主要依赖视觉和嗅觉来寻找食物。前期研究中，中国科学院副院长、中国科学院院士、中国科学院昆明动物研究所研究员张亚平课题组发现视觉通路中C
昆明植物所等揭示八倍体草莓的起源和遗传分化特征
草莓（Fragaria）具有重要的经济和营养价值。现代八倍体栽培草莓（F. × ananassa）起源于两个八倍体野生种弗州草莓（F. virginiana）和智利草莓（F. chiloensis）的种间杂交。然而，由于草莓属系统发育解析涉及未知的祖先，同源染色体交换和不完全谱系分选等问题，学术
昆明动物所金鱼起源研究取得新进展
金鱼是一种珍贵而独特的观赏鱼类，由于其颜色五彩缤纷，体形婀娜优美，深受人们的喜爱。以观赏为目的的长期人工选择，使得金鱼的外部形态(眼、背鳍、尾鳍、体型、鳞片等)同其野生鲫鱼相比存在着显著的变异，这在动植物的变异中是相当罕见的，也引起了研究者的关注。 中国科学院昆明动物研究所分子进化与进化基
昆明动物所成功揭示泛肿瘤存在基因表达紊乱共有模式
挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而，肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题，而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感，容易产生假阴性结果。针对此，中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法
昆明动物所成功揭示泛肿瘤存在基因表达紊乱共有模式
挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而，肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题，而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感，容易产生假阴性结果。针对此，中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法
昆明动物所揭示多能干细胞维持遗传物质稳定性的调控机制
4月30日，Cell Stem Cell 期刊在线发表了中国科学院昆明动物研究所郑萍课题组的最新研究成果Filia is an ESC-specific regulator of DNA damage response and safeguards genomic stability。该研究首次揭
基因组所与昆明动物所在家犬起源进化研究中取得新进展
5月14日，中科院北京基因组研究所与中科院昆明动物研究所在家犬起源进化合作研究中取得重要进展，相关论文在最新一期《自然·通讯》在线发表。该研究成果从全基因组层面上阐述了狗的起源进化，并首次将其进化历史和人类的近期演化联系了起来。 在昆明动物所张亚平教授和基因组所吴仲义教授的带领下，昆明动物
昆明动物所揭示新的肿瘤靶标
肿瘤目前是世界人口死亡的第一原因。中国每年因肿瘤死亡的人数超过200万。除了传统的放化疗等方法外，靶向治疗是肿瘤临床的研究热点及发展趋势。该治疗方法是通过药物选择性抑制肿瘤细胞特异的分子靶标的功能，来抑制肿瘤生长，而不杀伤或较少损伤正常细胞。相比传统放化疗方法，靶向治疗具有耐受性好、毒副作用轻微
昆明动物所揭示乳腺癌细胞增殖的分子机制
乳腺癌是一种严重危害女性身心健康的常见肿瘤，其中以ER/PR/HER2三阴性的乳腺癌恶性程度最高，至今缺乏靶向治疗的药物。 中国科学院昆明动物研究所陈策实研究员领导的肿瘤生物学实验室通过多年研究证实，KLF5在三阴性乳腺癌中高表达并促进肿瘤的增殖，是三阴性乳腺癌一个潜在治疗靶点。一般认为，
昆明动物所揭示自噬参与帕金森疾病发生的作用机制
帕金森疾病（Parkinson’s disease，PD）是一种常见的神经退行性疾病，患者主要表现出运动障碍，包括运动迟缓、肌强直、姿势异常与静止性震颤等。其病理特征表现为黑质致密区多巴胺神经元丢失和路易小体的形成。目前，全球有六百多万人正遭受帕金森病的折磨，随着我国人口老龄化的加剧，PD带来的
昆明动物所等在人类大脑进化遗传机制研究中取得进展
表观遗传修饰的重要性越来越被人所认识，但是表观遗传的变化如何对表型的进化产生影响，特别是表观遗传调控在人类大脑进化中的作用仍然不是很清楚。美国乔治亚理工大学教授Soojin V.Yi 曾经对人和黑猩猩大脑进行了全基因组甲基化测序，发现了很多物种间甲基化差异区域，但这些甲基化差异区域是否属于人类特