中科院昆明动物所成功揭示实验大鼠起源驯化遗传机制
近日，中国科学院昆明动物研究所张亚平课题组与吴东东课题组合作，通过比较野生褐家鼠和实验大鼠的基因组和转录组数据，解析了实验大鼠的起源和驯化遗传机制。相关研究成果发表在Molecular Biology and Evolution上。 实验大鼠作为一种广泛使用的模式动物，由野生褐家鼠驯化而来，也是一种家养动物。与其野生祖先褐家鼠相比，实验大鼠在形态、行为及生理方面发生很大变化，但实验大鼠的起源以及导致其被驯化成功的机制尚不清楚。 研究人员利用群体遗传学方法，FST与cross-population extended haplotype homozygosity (XP-EHH)等，在全基因范围内扫描了野生褐家鼠与实验大鼠群体之间出现分化的区域，发现大量神经系统基因在大鼠驯化过程中受到人工选择作用，例如，在学习记忆方面起重要作用的FOXP2和B3GAT1，以及节律相关基因CLOCK。这些基因在实验大鼠的神经组织中的表......阅读全文
昆明动物所等在藏族高原适应遗传机制研究中取得进展
近日，中国科学院昆明动物研究所宿兵课题组与西藏大学、青海省高原医学科学研究院开展合作，在藏族高原适应遗传机制研究中取得进展。相关研究成果发表在《分子生物学与进化》（Molecular Biology and Evolution）上，昆明动物所副研究员彭忆，西藏大学教授崔超英，昆明动物所博士生和耀
昆明动物所揭示两栖动物防御高原紫外辐射的分子机制
太阳光谱中的紫外线不仅使人体皮肤晒伤老化，产生炎症、黑色素和色斑，更严重的还会诱发癌变，危害人类健康。目前动物适应高海拔环境的策略和生理生化机理研究主要集中于低氧低温适应，对动物如何抵御高原强紫外线辐射的认识非常有限。 中国科学院昆明动物研究所动物模型与人类疾病机理重点实验室生物毒素与人类疾病
中科院Science公布最新基因组
继2012年中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院等单位合作完成了首个山羊全基因组图谱之后，6月昆明动物研究所，华大基因等处的研究人员又公布了绵羊基因组序列，并且将这一基因组与其它哺乳动物基因组进行了比对，构建了相关的系统发育树。这一研究成果公布在6月6日Science杂志上。 参与这项
研究揭示结构变异和新基因在家犬驯化中的作用
近日，中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室、动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心张亚平团队与中国农业科学院农业基因组研究所开展合作，第一次系统地构建了家犬在驯化中的结构变异（Structural Variations）图谱、探讨了新基因在驯化中的作用、并指出了大尺度基因组变异在驯化
昆明动物所等揭示朱鹮群体演化历程
1月11日，《当代生物学》以The Genomic Footprints of the Fall and Recovery of the Crested ibis为题，在线发表了中国科学院昆明动物研究所张国捷课题组、西班牙庞培法布拉大学、丹麦哥本哈根大学等单位合作的研究成果。该工作将57份博物馆
遗传发育所揭示DNA甲基化在大豆驯化改良中的变异机制
作物驯化是农业发展中最重要的事件之一。通过对野生作物的不断驯化改良，人类才得以获得符合生产生活需要的现代作物。驯化改良过程就是对作物群体基因组多样性进行选择的过程。目前对作物驯化改良的研究主要集中在对遗传变异的选择，在DNA水平鉴定到了大量的驯化选择区间。然而，除了遗传变异，表观遗传也在植物的生
昆明动物所揭示干扰素信号通路的调控新机制
干扰素（IFN）信号通路是天然免疫的主要组成部分，在宿主抵抗病原体中发挥重要作用；IFN的产生和下游通路的激活受到精密的调控。转录因子STAT1是IFN通路的关键效应因子，IFN信号通路激活时，STAT1蛋白被其激酶JAK1磷酸化修饰，进而形成异源或同源二聚体，并转移入核调控下游靶基因的转录激活
昆明动物所揭示家鸡视觉退化的无意识选择作用机制
经过长期的驯化和人工选择作用，家鸡与其野生祖先红原鸡除了在行为、体型、生殖周期和生长速度等存在显著差异外，其视觉功能也显著衰退。目前研究理论认为这种视觉退化是由于选择压力放松导致，但是至今这种视觉退化的遗传机制并不清楚。 中国科学院昆明动物研究所张亚平研究团队基于家鸡和红原鸡的群体基因组数据，
中科院昆明动物所摸清云南鱼类“家底”
记者8月15日从中科院昆明动物研究所获悉，该所副研究员陈小勇在《动物学研究》杂志 2013年第4期上发表了云南鱼类名录，种数达620种。该研究进一步印证了云南是中国淡水鱼类多样性最丰富的地区，并刷新了《云南鱼类志》的纪录，为全面摸清云南鱼类的“家底”、厘清相互关系奠定了基础。 陈小勇介
昆明动物所人类从头起源新基因研究取得重要进展
基因的起源在生物界是一个普遍而又不断延续的过程，是生物由简单到复杂演化的基础。新基因产生的机制主要有基因重复、外显子重排、逆转录、基因水平转移、可移动元件、基因断裂融合和从头起源等。其中，从头起源的基因（指基因起源于没有功能的非编码区域DNA）研究甚少，主要是因为人们一直认为此机
中国科学家Nature子刊发布藏羚羊基因组草图
来自青海大学、深圳华大基因研究院和中科院昆明动物研究所等处的研究人员成功绘制出了藏羚羊(Tibetan antelope)的基因组序列草图，揭示出了高原适应的遗传机制。相关论文“Draft genome sequence of the Tibetan antelope”发表在5月14日的
昆明动物所在高原适应遗传机制方面取得进展
中国青藏高原是世界上海拔最高的高原，被誉为地球的“第三极”，以低氧、强辐射、气温低等著称。随着人类的迁徙定居，一批家养动物也在这样恶劣的生存环境中世代繁衍，各自形成了鲜明独特的高原适应特征，为科学家解析物种对高原快速适应进化的遗传机制提供了丰富的素材。 中国科学院昆明动物研究所张亚平、吴东东研
昆明动物所揭示人群进化历史差异对复杂病遗传分析的影响
目前，复杂疾病（如双向情感障碍、抑郁症等）的遗传学分析已在世界范围人群中广泛开展。然而，即使是大样本量和高密度SNP的分析，在不同样本尤其是遗传背景差异很大的人群中往往不能重复出疾病易感基因的相关性。人群生活的环境因素，如气候、饮食和生活方式等可能是造成这种差异的原因，但更重要的原因可能是由于易
昆明动物所等揭示吗啡诱导自噬导致毒品成瘾的分子机制
7月19日，自噬研究领域期刊Autophagy在线发表了中国科学院昆明动物研究所题为Atg5 -and Atg7-dependent autophagy in dopaminergic neurons regulates cellular and behavioral responses to
昆明动物所揭示毒素受体博弈对食物链结构影响的机制
食物链的结构，即由捕食者与被捕食者形成的连锁关系，通常由动物的体重、力量、速度以及智力决定。生物毒素是产毒动物的一大进化创新，产毒动物的出现对食物链的结构产生了影响，决定食物链结构的传统因素在产毒动物存在的生境中变得不再具有决定性(PNAS 2018)。生物毒素是产毒动物捕食猎物(PNAS 20
昆明动物所揭示海豚水生适应的分子基础
随着基因组数据的迅速增加，通过比较基因组学及生物信息学的方法探讨物种适应性进化的遗传基础是目前分子进化的研究热点。 中科院昆明动物研究所张亚平院士课题组针对已公布的海豚基因组，通过与其他近缘物种的基因组进行比较，系统地鉴定出海豚中经历正选择的基因及位点，为理解海豚等鲸目动物的
昆明动物所揭示非洲家犬复杂的源流历史
近日，《遗传学和基因组学杂志》（Journal of Genetics and Genomics）发表了中国科学院昆明动物研究所张亚平课题组题为A Cryptic Mitochondrial DNA Link between North European and West African Dog
昆明动物所新基因的功能起源和进化研究取得进展
基因复制是新基因和新功能产生的最主要的方式之一。然而，在分子水平，新产生的复制基因如何通过通路整合而获得生物学功能以及产生适应性性状却并不清楚。 为了回答以上问题，中科院昆明动物研究所中德马普进化基因组学青年科学家小组的博士生丁昀等在导师王文研究员的指导下，对黑腹果蝇亚群(Drosophi
昆明动物研究所通过实验动物饲料生产认证
11月29日，昆明市科学技术局为昆明动物研究所颁发实验动物饲料生产许可证，许可生产的七种饲料包括：实验猴繁殖、维持饲料，树鼩繁殖、维持饲料，大小鼠繁殖、维持饲料，实验兔维持饲料。 根据实验动物饲料生产许可证的认证程序，首先七种饲料要通过实验动物饲料检测部门的抽样检测，且各项营
昆明动物所揭示动物高原适应在分子水平的趋同性
探讨动物的高原适应是研究物种对极端环境适应机制的理想模型。以往研究中通过比较高海拔物种与低海拔近缘种，在分子及表型层面鉴定了很多高原物种的适应特征。然而，已有研究多侧重于高、低两物种的比较，而高原环境存在很大的异质性，高海拔是个较宽泛的范围，不同海拔地区（2000米、3000米、4000米、50
中科院昆明动物所精神分裂症遗传学研究取得进展
中青在线讯 日前，中国科学院昆明动物研究所罗雄剑课题组，首次在基因组范围内系统性地筛选出精神分裂症可能的致病基因。该研究为深入解析复杂精神疾病的遗传机制提供了新思路，为阐明精神分裂症致病机理提供重要的生物学数据。 精神分裂症是一种病因未明的重性精神疾病，主要表现为感知觉、思维、情感和行为等
中科院昆明动物所精神分裂症遗传学研究取得进展
中青在线讯 日前，中国科学院昆明动物研究所罗雄剑课题组，首次在基因组范围内系统性地筛选出精神分裂症可能的致病基因。该研究为深入解析复杂精神疾病的遗传机制提供了新思路，为阐明精神分裂症致病机理提供重要的生物学数据。 精神分裂症是一种病因未明的重性精神疾病，主要表现为感知觉、思维、情感和行为等
中科院动物所揭示大熊猫维持异常低能量机制
a) 大熊猫的热图像（聂永刚摄）b) 大熊猫的热图像（聂永刚摄） 中国科学院动物研究所魏辅文研究员所领导的研究团队与北京动物园和阿伯丁大学的学者合作，发现大熊猫每日能量消耗异常的低，几乎与树獭相似；并进一步从形态、行为、生理、遗传和基因组等方面系统揭示了大熊猫维持异常低能量代谢的机制。大熊猫维持异
研究揭示果实风味驯化机制
西北农林科技大学李新岗研究团队从基因组研究入手，揭开从酸枣到枣的风味驯化秘密，其成果近日刊登在期刊《科学公共图书馆—遗传学》上。 果树由野生到栽培的驯化，提升了果实风味，例如酸枣为野生灌木，果实小、酸味浓；而枣为栽培乔木，果实大、甜度高。但是在果树驯化过程中，果实风味的提升是由什么因素决定的，
昆明动物所哺乳动物回声定位分子机制研究获进展
回声定位是一种基于听觉能力的特殊感觉机制。具有回声定位能力的动物利用回声定位进行导航、搜索食物和躲避障碍物等，从而对它们的生存和繁殖具有非常重要的作用。尽管人们已经在动物行为学和生理学等方面对回声定位进行了研究，但是对其产生的分子机制却知之甚少。 中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重
遗传发育所揭示脊髓损伤纤维瘢痕细胞的起源
脊髓损伤导致病变部位产生纤维瘢痕，被认为是神经再生的障碍。关于纤维化瘢痕的来源是领域内长久争论的问题。一般认为，在非穿透性脊髓损伤中，纤维瘢痕细胞主要来源于血管周围成纤维细胞；而在穿透性脊髓损伤中，瘢痕主要来源于脊膜成纤维细胞。有研究认为，在穿透性和非穿透性脊髓损伤中，纤维瘢痕细胞主要源于周细胞。亦
遗传发育所揭示脊髓损伤纤维瘢痕细胞的起源
脊髓损伤导致病变部位产生纤维瘢痕，被认为是神经再生的障碍。关于纤维化瘢痕的来源是领域内长久争论的问题。一般认为，在非穿透性脊髓损伤中，纤维瘢痕细胞主要来源于血管周围成纤维细胞；而在穿透性脊髓损伤中，瘢痕主要来源于脊膜成纤维细胞。有研究认为，在穿透性和非穿透性脊髓损伤中，纤维瘢痕细胞主要源于周细胞。亦
南京古生物所等揭示螯肢类动物起源
螯（音：áo）肢动物是包括蝎子、蜘蛛、蜱螨和鲎（音：hòu）等在内的超过11.5万个物种的庞大节肢动物类群，对于寒武纪大爆发期间该类群动物是否已经起源一直不是很清楚。近日，中国科学院南京地质古生物研究所朱茂炎课题组法国籍博士后塞德里克·阿里亚（Cedric Aria）和加拿大安大略皇家博物馆同行
中科院昆明动物所：系统挖掘中草药抗癌潜力
中科院昆明动物所黄京飞课题组在从传统中草药中发掘抗癌植物和化合物研究中取得进展。相关成果日前在线发表于《科学报告》杂志。 我国传统中药数据库记录了2000多种药用植物。但在传统中草药中，只有小部分药用植物被充分系统地研究过。 针对这一现状，黄京飞课题组首先建立了一个抗肿瘤药物预测平台。基于该
中科院昆明动物所等发布新款基因测序软件
中科院昆明动物研究所研究员马占山与美国马里兰大学叶承曦博士在基因测序领域的合作再次取得重要突破。合作团队近日正式发布了一款代号为 Sparc 的软件。 针对第三代基因测序仪硬件错误率高达15%~40%的问题，该团队研发出了一套“线性复杂度”（复杂性最低）的算法，Sparc软件即基于该新算法完成