circRNA在胃癌海绵调控机制的应用(一)
环状RNA (circRNA)作为新型非编码RNA,具有比线性RNA更加稳定的环状结构,可通过多种机制调控靶基因。近年来,circRNA被发现在多种肿瘤组织和细胞中异常表达,作为肿瘤的诊断生物标志物或治疗靶点,具有巨大的价值,受到广泛的关注。癌症新的证据表明,circRNAs在癌症的发生发展中起着重要的调控作用。云序用户山东大学刘志方课题组近期在Molecular Cancer杂志上发表的文章,通过全转录组测序、分子实验和细胞动物表型实验探讨了hsa_circ_0004872在胃癌(GC)中的作用及其调控机制。 发表杂志:Molecular Cancer影响因子:15.302发表时间:2020.11.10技术方法:全转录组测序、RIP-qPCR、pull down、双荧光素酶实验、ChIP文章链接:Circular RNA hsa_circ_0004872 inhibits gastric can......阅读全文
中国科技大学Nature子刊聚焦环状RNA
来自中国科技大学、华中师范大学等处的研究人员报告称,他们鉴别出了一类与RNA聚合酶Ⅱ相关的环状RNA(circRNAs),将之命名为外显子-内含子circRNAs(EIciRNAs)。并证实这些EIciRNAs调控了细胞核中的转录。这些研究成果在线发表在2月9日的《自然结构与分子生物学
影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析
在非编码RNA的大家族中,环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环,所以在生物体中具有稳定性高,不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控miRNA和靶基因参与海绵机制,现已有多篇文章报道该机制在疾病的发生发展过程中起至关重要的作用。另
lncRNA功能机制研究(一)
文章导读LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱和生物学功能
R1-在光辐射调控中的应用
▌R1 在光辐射调控中的应用 利用介电微腔阵列对柔性量子点薄膜进行高效荧光调控的空间辐射光谱表征 柔性显示 微球腔 光致发光增强 量子点 空间辐射光谱 回音壁模式 【概述】2019 年,一篇发表于 Advanced Opti
一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...1
一次RNA甲基化测序的多项成果-云序RNA甲基化测序技术大公开文章导读RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程,目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼,而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac
在RNA病毒聚合酶中发现一种独特的保真度调控机制
RNA病毒包括多种人类和动物致病病原,对人类健康构成严重威胁。这类病毒的基因组复制过程不涉及DNA形式,因此需要由病毒自身编码的依赖RNA的RNA聚合酶(RdRP)来主导完成。病毒RdRP可准确而高效地实现多达数万个核苷酸的合成,并将合成的出错率水平维持在万分之一上下。在其他生命形式中,长链核酸
海绵窦血栓形成的概述及发病机制
概述 海绵窦血栓形成(cavernous sinus thrombosis,CST)早在1821年由Duncan首先描述,是中枢神经系统(CNS)罕见的致死性的感染性疾病,在抗生素应用之前病死率可高达80%,目前因诊断延误等仍有13.6%患者死亡。因此,早期诊断及强化治疗非常重要。 海绵
环状RNAs帽独立的翻译蛋白及其在癌中的作用
环状RNA是一种共价封闭RNA,在真核生物中广泛表达。circRNA参与多种生理和病理过程,但其调控机制尚不完全清楚。随着RNA深度测序技术的发展和算法的改进,发现了一些circRNA通过cap-independent机制编码蛋白质,参与肿瘤发生发展的重要过程。本文在概述CircRNAs的基础上
为什么荧光素酶互补实验结果阴性也有
三大类的非编码RNA(ncRNA),miRNA/lncRNA/circRNA仍然是医学基础研究领域最为火热的研究热点,大部分的研究人员在立项之初,通过查阅文献或二代测序+生物信息学分析,获得了合适的研究对象,但在实验推进的过程中却遇到了重重困难。主要有以下几个原因:1. 找错了转录本;2. ncRN
揭示糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动...(一)
揭示糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复文章导读血管平滑肌细胞(VSMC)在健康状态下处于去分化表型,在其受损时,循环系统中的血小板快速激活,通过凝血反应为受伤部位止血,同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质,使VSMC切换为高分化表型,同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增
科学家揭示胃癌免疫逃逸机制
复旦大学基础医学院徐洁杰课题组和中山医院孙益红课题组合作,发现肿瘤相关巨噬细胞来源的趋化因子CXCL8通过诱导自身表达PD-L1介导胃癌免疫逃逸,阻断CXCL8信号可以重激活胃癌微环境抗肿瘤免疫反应。日前,相关研究在线发表于《肠病学》杂志。 胃癌患者的术后生存评估、化疗反应性预测、对化疗不敏感
microRNA-芯片联合应用探究胃癌细胞株原发性耐药分子机制
microRNA 芯片与表达谱芯片的联合应用——探究胃癌细胞株的原发性耐药的分子机制 药物耐受是肿瘤治疗领域的一大难题,一般分为两种类型:其一为原发性耐药,即先前未经治疗的肿瘤细胞天生就对某种药物不敏感;其二是获得性耐药,指经过治疗的肿瘤细胞再次接受该药物治疗时变得不敏感。 目前,
研究在水稻分蘖角度调控机制解析中获进展
分蘖角度是水稻株型的重要决定因素之一,与水稻产量密切相关。培育分蘖角度适中的水稻品种能够有效地提高群体产量;解析水稻分蘖角度的调控机制有助于为水稻株型的遗传改良提供理论指导和基因资源。目前,已经克隆了多个调控水稻分蘖角度形成的关键基因,但对这些基因的调控机制及它们之间的遗传关系仍然缺乏系统深入的
影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析
文章导读:在非编码RNA的大家族中,环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环,所以在生物体中具有稳定性高,不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控miRNA和靶基因参与海绵机制,现已有多篇文章报道该机制在疾病的发生发展过程中起至关重要的作
薛英威小组找到调控胃癌侵袭和转移的“枢纽”
该发现使早期诊断及准确预后判定成为可能,有助提高胃癌5年生存率 哈尔滨医科大学第三临床医学院胃肠外科主任薛英威在对胃癌形成的变化规律及早期信号的研究中,通过对四种胃癌细胞系Twist蛋白水平的筛选,发现Twist是调控胃癌侵袭和转移的“枢纽”,对胃癌恶性生物学行为的产生起到了“推波助澜”的作用
脑创伤外泌体环状RNA的鉴定功能及预测
近期,云序生物客户天津医科大学总医院张建宁教授带领的神经创伤团队针对大脑创伤的研究。该课题组集合了外泌体和环状RNA两大科研热点,应用云序生物提供的全转录组测序服务,仅通过大脑创伤外泌体中环状RNA表达谱研究就成功地于今年年初在《Journal of Neurotrauma》(影响因子5.19)
点将多个水质检测方案在海绵城市水量水质监控的应用
一、海绵城市的介绍海绵城市指通过加强城市规划建设管理,充分发挥建筑、道路、绿地和水系等生态系统对雨水的吸纳、蓄渗和缓释作用,有效控制雨水径流,实现自然积存、自然渗透和自然净化的城市发展方式。二、海绵城市建设中水循环如上图所示,海绵城市的建设中,水的主要来源为降雨,而海绵城市的目的是控制雨水径流,实现
雄激素受体通过上调ADAR1抑制circRNA表达,促进肝细胞癌
浙江大学医学院附属邵逸夫医院蔡秀军教授在腹部外科、肝胆胰外科、微创外科、移植外科等研究方面有丰富的经验,近期其团队利用Arraystar circRNA芯片研究了肝细胞癌(HCC)中雄激素受体(AR)对circRNA表达的影响。研究发现AR可以结合到RNA编辑酶ADAR1的启动子区上调ADAR1
雄激素受体通过上调ADAR1抑制circRNA表达,促进肝细胞癌
浙江大学医学院附属邵逸夫医院蔡秀军教授在腹部外科、肝胆胰外科、微创外科、移植外科等研究方面有丰富的经验,近期其团队利用Arraystar circRNA芯片研究了肝细胞癌(HCC)中雄激素受体(AR)对circRNA表达的影响。研究发现AR可以结合到RNA编辑酶ADAR1的启动子区上调ADAR
雄激素受体通过上调ADAR1抑制circRNA表达,促进肝细胞癌
浙江大学医学院附属邵逸夫医院蔡秀军教授在腹部外科、肝胆胰外科、微创外科、移植外科等研究方面有丰富的经验,近期其团队利用Arraystar circRNA芯片研究了肝细胞癌(HCC)中雄激素受体(AR)对circRNA表达的影响。研究发现AR可以结合到RNA编辑酶ADAR1的启动子区上调ADAR1 p
circRNA研究新成果
研究背景放射治疗是肝癌治疗的有效手段之一,然而放射性肝纤维化是肝癌放射治疗的常见并发症,制约肝癌放疗效果。放射性肝纤维化的发病机制仍未明晰,有待进一步研究。环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类广泛参与多种生物学进程的非编码RNA,在人类多种疾病的发生和发展中发挥重要作
脑内LTCCs在药物成瘾形成过程中的调控机制
药物成瘾伴随中枢神经系统内钙离子通道数目及开放状态的适应性改变. 大量证据表明, L型电压依赖性钙通道(LTCCs)可通过调节神经递质的释放、神经兴奋性、基因的转录及突触可塑性等过程调控成瘾行为. 最新的研究还表明, LTCCs的不同亚型Cav1.2和Cav1.3对药物成瘾的调控分别依赖于D1及
揭示miRNA在肿瘤细胞糖代谢中的功能及调控机制
5月17日,国际学术期刊Journal of Biological Chemistry在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所季红斌研究组与刘新垣研究组合作的研究论文miR-143 regulates cancer glycolysis via targeting hexok
NKA在精子激活过程中极性分布的调控机制
2021年5月28日,Developmental Cell在线发表了中国科学院生物物理研究所苗龙课题组题为"Membrane-contact site-dependent cholesterol transport regulates Na+/K+-ATPase polarization and
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
LncRNA芯片应用于胃癌研究
上海交通大学附属仁济医院房静远教授主要从事消化系统肿瘤发生的分子机制、早期诊断和分子治疗等相关研究。近期,该课题组应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了胃癌组织的lncRNAs表达情况,筛选到可预测胃癌发生的分子标志物GClnc1,并且阐明了GClnc1在胃癌的发生和发展中是如何发挥
LncRNA芯片应用于胃癌研究
研究背景 在全世界分范围内,每年因肝癌死亡的病例超过50万人,是主要的致死恶性肿瘤之一。在过去的十年中,随着影像学的进步以及健康体检的普及,越来越多的肝癌病人在患病早期被发现。但由于肝脏捐赠者的短缺,外科肝脏切除术仍然是治疗早期肝癌病人的最主要方法。目前对于术后患者缺乏准确
云序生物环状RNA研究文章汇总
环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达
环状RNA,飞速发展的新前沿
生物学家们几十年前就知道存在一种不寻常的分子,环状RNA(circRNA)。与线性RNA相比,circRNA受到的关注比较少,也比较难于研究。举例来说,circRNA很难与其它RNA区分开,扩增或片段化会破坏RNA环,而且早期RNA测序的分析算法会过滤掉circRNA的标志性序列。因为技术和方法
科研人员搭建首个跨物种、跨组织的衰老相关环状RNA数据库
环状RNA(circRNA)是一类单链、闭合环状的RNA分子,由mRNA前体通过反向剪切环化产生。相较于常规的线性RNA,circRNA有着独特的结构特点,其不具备5'端帽和3'端poly(A)尾结构,也不存在游离末端,因此不易被核酸外切酶降解,从而比线性RNA更加稳定。circ