circRNA在胃癌海绵调控机制的应用(一)

环状RNA (circRNA)作为新型非编码RNA,具有比线性RNA更加稳定的环状结构,可通过多种机制调控靶基因。近年来,circRNA被发现在多种肿瘤组织和细胞中异常表达,作为肿瘤的诊断生物标志物或治疗靶点,具有巨大的价值,受到广泛的关注。癌症新的证据表明,circRNAs在癌症的发生发展中起着重要的调控作用。云序用户山东大学刘志方课题组近期在Molecular Cancer杂志上发表的文章,通过全转录组测序、分子实验和细胞动物表型实验探讨了hsa_circ_0004872在胃癌(GC)中的作用及其调控机制。 发表杂志:Molecular Cancer影响因子:15.302发表时间:2020.11.10技术方法:全转录组测序、RIP-qPCR、pull down、双荧光素酶实验、ChIP文章链接:Circular RNA hsa_circ_0004872 inhibits gastric can......阅读全文

伯豪客户《EMBO-reports》上阐述circRNA在膀胱癌中的作用机制

  研究背景   膀胱癌(Bladder cancer)是一种常见的泌尿系统肿瘤,由于易转移,死亡率高,5年生存率只有8.1%。因此,研究膀胱癌的发病机制,有助于对膀胱癌的诊断和治疗。circRNA是一类具有闭合环形结构的非编码RNA,是现阶段转录组学研究的新星。本研究从circRNA的角度出发,

lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析(一)

近日,南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果,以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinogenesis by epigenetically silencing EphB3 throu

外泌体circRNA-PDE8A促进胰腺导管癌细胞侵袭研究

第三军医大学西南医院李晓武教授团队长期从事肝胆外科研究,近期,其实验室对利用Arraystar circRNA芯片研究发现了在胰腺导管癌细胞中高表达的circ-PDE8A可以通过miR-338调控MACC/MET/ERK通路,促进癌细胞侵袭。进一步研究发现,病人血浆外泌体中circ-PDE8A显著高

《自然—方法学》:一种分子海绵可吞食调控性RNA

研究人员在8月在线出版的《自然—方法学》上报告,通过基因工程合成的一种抑制剂能够吞食哺乳类动物细胞中的小分子RNA。抑制小分子RNA的活性有助于深入认识它们在正常发育和疾病中的功能。 与更长的信使RNA不一样,小分子RNA没有含有制造蛋白质的信息,它只拥有21个核苷酸,但这种序列却能调控信使RNA的

【客户成果】外泌体circRNA-PDE8A促进胰腺导管癌细胞侵袭

   第三军医大学西南医院李晓武教授团队长期从事肝胆外科研究,近期,其实验室对利用Arraystar circRNA芯片研究发现了在胰腺导管癌细胞中高表达的circ-PDE8A可以通过miR-338调控MACC/MET/ERK通路,促进癌细胞侵袭。进一步研究发现,病人血浆外泌体中circ-PDE8A

线性泛素化在调控IFN抗病毒信号的新机制的应用

近年来,蛋白质泛素化成为基因表达调控研究的热点,泛素化在各类细胞信号通路中发挥重要的调节作用。泛素分子通常含有7种内部赖氨酸残基,通过这些残基可与其他泛素分子的甘氨酸C端相连产生分支,形成多聚泛素化修饰。 近年来又鉴定了一种新的多聚泛素链——线性泛素链,由两个泛素N、C端首尾相接而成。已有研究鉴定线

环状RNA结合功能蛋白

环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转录前

复旦大学Nature子刊发布环状RNA重要发现

  来自复旦大学、上海交通大学医学院的研究人员借助分析环状RNA,揭示出了丰富的circHIPK3通过像海绵般结合多种miRNAs调控了细胞生长。这一重要的研究发现发布在4月6日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。  复旦大学的黄胜林(Shenglin Huang)研

海绵窦血栓形成的发病机制

   海绵窦血栓形成常由于耳源性、鼻窦和眶面部化脓性感染(如中耳炎、乳突炎、鼻窦炎)以及全身性感染所致,极少 因肿瘤、外伤、动静脉畸形阻塞等非感染性病因导致。一侧或两侧CST也可由其他硬脑膜窦感染扩散而来。化脓性血栓形成在病初常累及一侧海绵窦,可通过环窦迅速波及对侧。

环状RNA通过与蛋白PDK1和Akt互作促进心肌修复

作者所在课题组主要从事microRNA和circRNA在心脏疾病发生发展过程中的分子机制研究。近期,其实验室用Arraystar circRNA芯片对不同年龄段的心肌病组织样本进行筛查,发现在新生儿心肌病组织中高表达的circ-Amotl1通过与蛋白PDK1和Akt的互作在心肌修复过程中发挥积极作用

影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析

  云序客户发表首篇直肠癌转移肝癌环状RNA文章,影响因子高达7.8分!​   文章导读:   在非编码RNA的大家族中,环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环,所以在生物体中具有稳定性高,不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控m

分子细胞卓越中心发表关于环形RNA的综述文章

  5月17日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲团队在Cell上,在线发表了题为Circular RNAs: characterization, cellular roles and applications的综述论文。该论文系统梳理了针对环形RNA研究的生物学技术手段,总结了其以非编码RN

全转录组测序的“一箭三雕”:circRNA,lncRNA,mRNA

1. 文章主题:环状RNA通过靶向miRNA调控的信号传导促进结直肠癌的转移发表期刊:Journal of pathology影响因子:5.942发表时间:201906实验方法:全转录组测序实验样本:结直肠癌组织肝转移是结直肠癌(CRC)患者的主要死亡原因。作者使用全转录组测序在CRC肝转移的小鼠模

环状RNA结合功能蛋白!找对方向20分文章水到渠成

  环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转

云序环状RNA研究策略在环状RNA研究的应用(二)

4.对年龄相关性白内障circRNA的分析显示,circZNF292可以通过海绵机制调节miR-23b-3p功能发表期刊:Aging-us影响因子:4.831发表时间:2020.9.10研究方法:全转录组测序、qRT-PCR、RIP、RNA pull down、双荧光素酶实验等云序提供文章链接:Pr

结直肠癌中的CircRNA:潜在的生物标志物和治疗靶点

  在全球范围内,结直肠癌(CRC)是第三大最常见的癌症,也是癌症相关死亡的第二大原因。最近的估计表明,2020年发生了超过190万新病例和93,000例与CRC相关的死亡,约占所有癌症病例的10%,占与癌症相关的死亡的9.4%。  早期发现结直肠癌有助于将发病率和死亡率降至最低;然而,由于缺乏明显

医用胶原蛋白海绵在牙槽外科中的应用研究

  医用胶原蛋白海绵是一种新型的生物材料,在止血、软组织修复、硬组织修复、感染控制和创口处理等方面发挥着巨大作用。医用胶原蛋白取自动物的I型胶原,通过专业的分离、纯化技术、交联技术、冻干等工艺,最终被制成稳定的网状多孔海绵状生物材料。从健康动物组织中提取的有活性的胶原蛋白,其结构类似于人类胶原蛋白,

细胞防御系统:毒素“海绵”的诱饵机制

  科学家们在人和动物细胞中发现了一种“诱饵”机制,能保护它们免受细菌等外来入侵者释放的潜在危险毒素的伤害。  纽约大学格罗斯曼医学院的科学家们发现,接触细菌的细胞会释放出微小的,蛋白包裹的外泌体,它们像诱饵一样与细菌毒素结合,包括由超级细菌MRSA(耐甲氧西林金黄色葡萄球菌)产生的毒素。研究人员说

EB病毒阳性弥漫性大B细胞淋巴瘤进展

  EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)是淋巴瘤的重要致病因子,与弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的临床转归密切相关。环状RNA(CircRNAs)在淋巴瘤的发展过程中起着重要作用。然而,CircRNA在与EBV相关的DLBCL进展中的潜在机制仍然很大程度上是未知的。  本研究

非编码RNA调控的新的胃癌促癌基因

   近日,重庆医科大学药学院肖斌教授团队与陆军军医大学(原第三军医大学)国家免疫生物制品工程技术研究中心邹全明教授团队在肿瘤学领域权威杂志《Oncogene》(JCR 1区)在线发表了题为“The miR-29c-KIAA1199 axis regulates gastric cancer mig

幽门螺杆菌诱发胃癌机制阐明

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505084.shtm

幽门螺杆菌诱发胃癌机制阐明

  癌蛋白CagA对Wnt/PCP信号传导的破坏似乎会促进胃癌的发生  据最新一期《科学信号》杂志报道,日本顺天堂大学研究人员阐明了幽门螺杆菌诱导胃癌发生的分子机制,揭示了癌蛋白CagA是如何破坏Wnt/PCP信号传导并促进胃癌发生的。深入了解Wnt/PCP通路在癌变过程中的作用,并将其作为潜在的靶

环状RNA结合功能蛋白!找对方向20分文章水到渠成

  环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转

RIP测序解析RNA结合蛋白SORBS2在卵巢癌细胞转移中作用机制

  环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转

教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究(一)

从表达谱至海绵机制完美进阶,教你轻松玩转环状RNA测序加机制研究文章导读:禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属,慢病毒亚科的家族成员,可引起禽类多种肿瘤性疾病,如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症,以及禽类骨髓白血病,导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛

GOLM1调控肝癌转移机制研究(一)

癌症的转移机制一直是科学家们关注的热点。来自复旦大学钦伦秀课题组的研究人员发现一个和HCC转移密切相关的基因——GOLM1。深入的分子机制研究显示,GOLM1作为一个致癌基因促进了肝癌的生长和转移,而这个过程是通过选择性地与表皮生长因子受体EGFR结合,介导EGFR/RTK 锚定到trans-G

一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...2

(二)云序客户m6A RNA甲基化修饰表达谱,一次测序两篇文章疾病:胃癌样品:胃癌组织vs癌旁组织(6 vs 6)研究方法:m6A-MeRIP-Seq,RNA-seq4. m6A修饰对其修饰基因在胃癌中的异常表达及预后的潜在影响发表杂志:Frontiers in Genetics影响因子:3.258

中国科技大学Nature子刊聚焦环状RNA

  来自中国科技大学、华中师范大学等处的研究人员报告称,他们鉴别出了一类与RNA聚合酶Ⅱ相关的环状RNA(circRNAs),将之命名为外显子-内含子circRNAs(EIciRNAs)。并证实这些EIciRNAs调控了细胞核中的转录。这些研究成果在线发表在2月9日的《自然结构与分子生物学

一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...1

一次RNA甲基化测序的多项成果-云序RNA甲基化测序技术大公开文章导读RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程,目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼,而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac

影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析

  在非编码RNA的大家族中,环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环,所以在生物体中具有稳定性高,不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控miRNA和靶基因参与海绵机制,现已有多篇文章报道该机制在疾病的发生发展过程中起至关重要的作用。另