m5C高分m5C甲基化修饰技术研究方向汇总（二）
3. m5C——RNA测序提出对拟南芥转录组复杂性的新见解发表期刊：Nucleic Acids Research影响因子：11.5发表时间：2020.08.20文章链接：New insights into Arabidopsis transcriptome complexity revealed by direct sequencing of native RNAs拟南芥转录组在不同条件下得到了广泛的研究和鉴定。然而，目前大多数的“RNA测序”技术都产生了相对较短的阅读长度，并且需要一个反转录步骤，从而阻碍了对转录组复杂性的有效表征。本文，作者使用新的牛津纳米孔技术(ONT)进行了具有特殊读取长度的直接RNA测序(DRS)。证明了拟南芥转录组的复杂性被大大低估了。用ONT直接进行RNA测序在营养和生殖发育阶段鉴定了新的转录子亚型。作者使用TrackCluster软件确定了可变转录起始(ATI)、可变多聚腺苷酸化(APA)、可变剪......阅读全文
同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平
RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品，已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者，云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商，首发推出了非编码RNA甲基化测序研究，首发推出了超微量RNA甲基化测序技术，首发推出RNA甲基化研究一站式系统性解决方案，云
circRNA_104075在促进肝癌发生和进展的机制研究
在全球范围内原发性肝癌是造成癌症相关死亡的三大原因之一。肝细胞癌(HCC)是最常见的原发性肝脏癌症。由于缺乏高特异性和敏感性的早期诊断生物标志物，HCC患者往往得不到及时有效的治疗。相比于长链非编码RNA和miRNA，circRNA作为一种新型环状RNA，具有共价闭合环状结构，在组织和血液中具有
SUMO化修饰调控m6A－RNA甲基化酶METTL3及其催化功能分子机制
RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域，近3个月以来，该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析，感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号（2018国自然热点二：RNA甲基化研究深度剖析）。 近三个月高分文章部分列表： 2月28日
睾丸间质细胞（LCs）m6A修饰提供新治疗靶点在不育症...3
总结： 细胞的生长与分化依赖于基因的调控表达方式，越来越多的研究表明m6A 甲基化在更多领域发挥着关键作用，而本文作者正是利用多组学MeRIP, RIP, CoIP, CHIP（云序生物提供此服务）等多种技术联合分析，揭示了m6A修饰通过影响Camkk2转录的稳定性和Ppm1a的翻译效率调节LC
揭示Y染色体上LncRNA－TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖和迁移
前列腺癌（Prostate cancer，PCa）作为男性发病率第二的癌症，严重影响了患者生殖健康和生活质量。由于前列腺癌受多种基因调控，且目前缺乏相关机制方面的深入研究，治疗效果往往不甚理想。随着高通量技术的发展，使研究PCa相关分子标志物基因和作用机制成为可能。目前，已有报道指出许多明星Ln
杨运桂/杨莹开发新技术，首次获得m7G－mRNA高分辨率图谱
在RNA分子中鉴定出超过150种RNA修饰。转录组分析是解码这些化学修饰的潜在功能的关键步骤之一。N7-甲基鸟苷（m7G）是tRNA，rRNA和mRNA 5'cap中存在的最丰富的修饰之一，并且在调节RNA加工，代谢和功能中具有关键作用。除了其在mRNA中的帽位置外，还在内部mRNA区域
我国研究院揭示m6A修饰对AtoI－类RNA编辑的调控作用
A-to-I类型的RNA编辑是一种基本的生物学现象，广泛存在于哺乳动物中，目前被认为是一种能够产生分子多样性的转录后修饰机制，通过重新编码来调节蛋白质翻译，大大丰富了遗传信息。A-to-I类型的RNA编辑不仅对基因表达调控具有重要影响，而且还与很多疾病的发生发展过程密切相关。m6A 修饰对 A-
揭秘m6A修饰新功能－－－－调控染色质状态和转录活性
文章导读 m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日，美国芝加哥大学何川，中科院
表观新修饰6mA甲基化助力IF飙升（二）
3、数据分析标准分析：（1）DNA甲基化富集峰的识别通过高通量测序和生物信息分析，识别甲基化富集的基因组区域，默认p
揭秘m6A修饰新功能－－－－调控染色质状态和转录活性
m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日，美国芝加哥大学何川，中科院北京基因组研究所
SUMO化修饰调控m6A－RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种...
SUMO化修饰调控m6A RNA甲基化酶METTL3及其催化功能的一种全新分子机制RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域，近3个月以来，该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析，感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号（2018国自然热点二：R
SUMO化修饰调控m6A－RNA甲基化酶METTL3及其催化功能
RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域，近3个月以来，该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析，感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号（2018国自然热点二：RNA甲基化研究深度剖析）。 近三个月高分文章部分列表： 2月28日
Cell：表观遗传新关注点—mRNA修饰
表观遗传学研究关键点是修饰DNA及其蛋白质支架的化学标记，越来越多的研究表明这些化学标记能告诉细胞，哪些基因是表达，哪些是沉默的，因而也决定了个体的表型性状。 mRNA即信使RNA，在中心法则中扮演了重要角色，但此前一些科学家们认为这种RNA只是完成传递的作用，把细胞核中编码的信息传递给蛋白翻
必备技能！云序生物教你巧用IGV轻松实现基因组的可视化
Itegrative Genomics Viewer (IGV)是由Broad研究院的研究人员开发的一款功能强大的综合性基因组学可视化工具，借助于此工具，从事生物信息的科研工作者就可以轻松的分析查看多种基因组数据。除了直观的查看序列信息及遗传密码中的序列变化或突变外，还可以查看拷贝数变化、染色质
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用（三）
总结本文作者通过RNA-seq, m6A-seq, MeRIP-qPCR, ChIP, CoIP,双荧光素酶实验等方法，研究发现去甲基化酶ALKBH5缺失会加重胰腺ai的发生和不良临床病理表现特征。ALKBH5的过度表达可降低了体外肿 瘤的增殖、迁移和侵袭活性，改善了体内肿 瘤生长，而ALK
Nature－|－m6A－RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成
目前来说，调控m6A修饰过程的阅读蛋白共有9种功能，今天不会大家一一来讲，而是主要讲参与蛋白编码过程的YTHDF1蛋白，它主要通过与mRNA的m6A位点结合，在脑神经发育[1]，多巴胺分泌[2]和突触形成[3]等过程中起重要作用。 文章导读： 2018年10月31日，美国芝加哥大学何
睾丸间质细胞（LCs）m6A修饰提供新治疗靶点在不育症治疗
m6A是真核生物中最常见的一类RNA修饰，目前已有的研究表明m6A在加速mRNA代谢和翻译，以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。这一次，研究重大发现m6A修饰在“人类繁衍”中也发挥着重大意义，该方向的发现将会吸引着更多的科研工作者探究在m6A与“不孕不育”的密切联系。云序生物一
m6A－RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用（四）
1）m6A修饰PCR芯片 new！云序生物提供m6A修饰PCR芯片检测，高效一次性检测m6A相关的Writer，Eraser，Reader的表达情况，m6A PCR 芯片基因列表（34 个基因）-human如图： 2）RNA修饰PCR芯片 new！云序生物提供多种RNA修饰PCR芯片检测，高效一次
云序RNA修饰技术在华南农大余义勋课题组植物m1A修饰...3
5. m6A修饰调控新生小鼠β细胞的成熟 发表期刊：Diabetes影响因子：7.2发表日期：2020.05.13实验方法：m6A-seq、mRNA-seq、MeRIP-PCR、整体m6A修饰水平等（云序提供） 近期Diabetes杂志（IF=7.2）发表了m6A修饰调控新生小鼠β细胞的成熟机制相关
南京大学在RNA表观遗传修饰鉴定方面取得进展
图 （a）高分辨工程化纳米孔检测RNA表观遗传修饰原理示意图;（b）RNA主要表观遗传修饰的结构及其单分子纳米孔指纹信号；（c）—（e）酵母苯丙氨酸tRNA（tRNAphe）修饰图谱检测 在国家自然科学基金项目（批准号：21675083、91753108、31972917）等资助下，南京大学化
m6A－RNA甲基化在发表多篇10+文章的运用
最近小编检索了关于m6A修饰的文章发表情况，发现目前2020年发表的关于m6A修饰的文章已经达到309篇，已经追平2019年整年度发表篇数，可以预见m6A RNA修饰下半年年发表文章会呈现出爆炸式增长。 图1. 近6年m6A RNA修饰相关文章发表情况（ data from PubMe
何川教授新发Nature综述：mRNA修饰介导的基因调控
在分子生物学的中心法则中，遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰，这些修饰可以调控基因的表达，并由此决定细胞的状态，影响细胞的分化和发育。近年来人们发现，mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 N6-methyladenosine（m6A）是真
全套病毒RNA－m6A甲基化修饰研究工具的使用（二）
那么，病毒RNA修饰的研究工作流程有哪些呢？ 首先，提取病毒RNA 无论您是从细胞，组织还是病毒等样品开始实验，高效而快速的RNA提取通常都是成功进行实验的第一步。工作流程的这一部分至关重要，因为足够的纯度和产量都是确保下游应用程序平稳准确运行的基本要求。
何川教授最新Nature文章：基因调控新领域的最新发现
N6-methyladenosine（m6A）是真核生物mRNA上最常见的一种转录后修饰，介导了超过80%的RNA碱基甲基化。这种可逆的mRNA甲基化修饰非常普遍，出现频率大约是3-5个残基/mRNA。m6A的研究发现开辟了真核生物转录后基因调控的新领域。 芝加哥大学的何川（Chuan He）
Nature子刊：遗传911，细胞的应急系统
有毒化学物质会对细胞造成严重破坏，损害DNA和其他重要的分子。来自麻省理工学院和纽约州立大学奥尔巴尼分校研究人员的一项新研究揭示了一个分子应急反应系统如何将细胞转换到损伤控制模式，帮助其快速生成抵抗这种损害从而生存下去的机制。 麻省理工学院的生物工程学教授Peter Dedon和同事们
组蛋白甲基化修饰研究再获突破
日前，复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展，相关成果发布在《分子细胞》上，该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。 组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰，参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是
跨学科合作将成为解码植物表观转录组的加速器
近日，中国热带农业科学院热带生物技术研究所教授吕培涛在《生物技术通报（英文）》（aBIOTECH）发表了综述论文。文章系统阐述了RNA修饰在植物生命活动中的调控作用，深入解析了N6—甲基腺苷（m6A）等修饰对植物发育及果实成熟的分子机制。 真核生物RNA上存在170多种化学修饰，形成动态可逆的
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用
表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成，还有文章探究过其在急性白血病中的作用，但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在Molecular
去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用
文章导读 表观遗传修饰如m6A甲基化在肿 瘤的发生和发展中起到重要作用。而甲基化酶对ai症的影响也受到广 泛关注。其中去甲基化酶ALKBH5已被报道过能通过维持乳腺ai细胞的干细胞性而促进肿 瘤的形成，还有文章探究过其在急性白血病中的作用，但其对胰腺ai的影响还缺乏研究。今年5月份发表在M
20分文章中的RNA甲基化，热度与实力并存
近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用，表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》（影响因子：23.3