使用高通量表型技术评估拟南芥中热应激诱导造成的变化

Plant Phenomics | 使用高通量表型技术评估拟南芥中热应激诱导造成的变化在全球范围内,最近十年是自19世纪以来最热的十年,并且多次发生了打破历史记录的高温天气。热胁迫会导致植物在所有生长阶段的性能和生产能力下降,这使得高温热浪成为了农业生产中的严重威胁。但是,目前对热应激现象的研究主要集中在评估种子早期发育阶段的存活率或下胚轴伸长情况,以及在高温使得花粉活力降低的生殖阶段。少数针对营养生长阶段热应激反应的研究表明,营养生长阶段的耐热性有助于生殖生长阶段的适应能力。因此,了解热应激反应造成的变化以及培育在所有生长阶段均有耐热性的种质资源,对于确保未来的食品可持续供应至关重要。 目前,拟南芥已被广泛用于耐热性筛选,主要侧重点在于分析在琼脂平板上的幼苗生存能力、下胚轴伸长情况或者种子发芽情况。由于耐热性的表达依赖于多个过程,因此通过统计由表型简易性而不是生理重要性决定的简单性状并不能很好地反映出耐热反应的复杂性......阅读全文

使用高通量表型技术评估拟南芥中热应激诱导造成的变化

Plant Phenomics | 使用高通量表型技术评估拟南芥中热应激诱导造成的变化在全球范围内,最近十年是自19世纪以来最热的十年,并且多次发生了打破历史记录的高温天气。热胁迫会导致植物在所有生长阶段的性能和生产能力下降,这使得高温热浪成为了农业生产中的严重威胁。但是,目前对热应激现象的研究主要

高通量表型分析平台可视化评估大麦病害程度

背景表型是新植物栽培品种发展的瓶颈,该研究引入了一种新的高光谱表型分析系统,此系统将冠层测量的高通量与高空间分辨率和可控测量环境的优势相结合。此外,测量的大麦生长在大容器(称为Mini-Plots)中,这使得植物能够在温室实验中形成田间表型,从而不受容器尺寸的影响。结果在接种白粉病后30天,通过Sp

模块式植物表型分析技术方案——拟南芥UV胁迫的响应机制

植物面对各种生物和非生物胁迫时,会调整它们的响应机制来优化发育和适应程序。UV辐射作为一种环境因子,会影响植物的光合过程并触发细胞死亡。华沙生命科学大学的Anna Rusaczonek评估了红/远红光感受器光敏色素A和光敏色素B在拟南芥UV胁迫响应中的作用。通过测量相关突变株的CO2同化、叶绿素荧光

评估气候变化造成的高温对人类健康的影响

  评估气候变化造成的高温对人类健康的影响报告。  截图来源:《自然·气候变化》在线版  英国《自然·气候变化》杂志5月31日发表了一篇气候学研究报告,评估了人为因素气候变化造成的高温与人类健康的关系。报告指出,全球37%与高温有关的人类死亡可归因于气候变化。这些发现表明,为减少气候变化对公众健康的

高通量小型植物光合表型测量系统的技术原理

  叶绿素a荧光作为光合作用研究的探针,是研究各种逆境胁迫(干旱、高温、低温、营养缺失、污染、病害等)对植物影响的强大工具,亦被广泛用于筛选同一植物品种的不同基因型。叶绿素a荧光不仅能反映光能吸收、激发能传递和光化学反应等光合作用的原初反应过程,而且与电子传递、质子梯度的建立及ATP合成和CO2固定

PlantScreen植物表型成像分析系统在衰老与防御途径对杂...

PlantScreen植物表型成像分析系统在衰老与防御途径对杂种优势的贡献杂交在促进作物生长与产量上效果显著,因而被广泛应用于农业生产。但杂交的分子机制仍然不是很清楚。最新的证据表明,水杨酸水平降低调节的相关基因表达,会造成某些杂交种基础防御能力降低,从而影响到这些杂交种的活力。澳大利亚联邦科学与工

研究揭示RNA结合蛋白相分离在植物热胁迫应答中重要作用

  2022年2月28日,Developmental Cell在线发表了中科院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心刘聪课题组与中科院分子植物科学卓越创新中心植物逆境生物学研究中心张蘅课题组合作的题为“Liquid-liquid phase separation of RBGD2/4 is req

研究揭示RNA结合蛋白相分离在植物热胁迫应答中重要作用

  2022年2月28日,Developmental Cell在线发表了中科院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心刘聪课题组与中科院分子植物科学卓越创新中心植物逆境生物学研究中心张蘅课题组合作的题为“Liquid-liquid phase separation of RBGD2/4 is req

PlantScreen植物表型成像分析系统气孔运动调节机制与相...

PlantScreen植物表型成像分析系统-气孔运动调节机制与相关表型分析叶片表面的保卫细胞能够调节气孔开放,从而使植物与大气间进行气体交换,让植物的光合作用与蒸腾作用之间达到平衡。保卫细胞的新陈代谢活性又主要依赖来源于叶肉的糖分。而参与到这一过程中的转运蛋白及其对保卫细胞功能的贡献还不清楚。   

高通量植物表型平台简介

  高通量植物表型平台是植物表型组学、植物功能基因组学、现代遗传育种研究的强大工具。利用高通量植物表型平台可以快速获取大量植株的各种信息。现代农业育种的一个主要方向就是性状改良,获得更大的果实/种子,更高的含油量(油料作物),更发达的根系等等。通过高通量植物表型平台可以快速获取大量植物表型信息。

高通量小型植物光合表型测量系统的技术参数

  成像面积:24 cm x 24 cm  光照面积:30 cm x 30 cm  相机传感器类型:CCD  相机分辨率:600万像素,即2440 x 2440像素  光谱范围:350-950 nm  镜头类型:高质量百万像素镜头  光纤滤光片轮:6种高质量光学干涉滤光片,步进电机驱动  直角坐标机

基于LED光源的科研级植物培养方案(五)

植物培养是生物实验室最重要的常规基础实验之一。以前的研究中,只要求培养系统能够使种子萌发、基本满足植物的生长即可。但在真正严格的植物生理生态研究中,传统培养箱由于种种原因是远远不能达到要求的。本文将系统介绍一系列基于LED光源的科研级植物培养方案,包括SL3500植物培养LED光源、FytoScop

PlantScreen植物表型应用——高通量种子萌发活力与表型监测

种子活力是种子发芽和出苗率、幼苗生长的潜势、植株抗逆能力和生产潜力的总和(发芽和出苗期间的活性水平与行为),是种子品质的重要指标,具体包括吸涨后旺盛的代谢强度、出苗能力、抗逆性、发芽速度及同步性、幼苗发育与产量潜力。     种子萌发实验无疑是最为直接有效的种子活力检测方法。但一般的传统方法需要人工

种子萌发率高通量检测与活力评估

种子活力是种子发芽和出苗率、幼苗生长的潜势、植株抗逆能力和生产潜力的总和(发芽和出苗期间的活性水平与行为),是种子品质的重要指标,具体包括吸涨后旺盛的代谢强度、出苗能力、抗逆性、发芽速度及同步性、幼苗发育与产量潜力。种子萌发实验无疑是最为直接有效的种子活力检测方法。但一般的传统方法需要人工计数来测量

温室型高通量植物表型平台概述

  温室型高通量植物表型平台可以全自动、高通量对大量植株(从幼苗到成熟植株即可)进行成像的系统,可以选择配置可见光(VIS)成像、近红外(NIR)成像、红外(IR)成像、荧光成像、根系近红外成像、高光谱成像中的一种或多种,每个成像模块包括顶部和侧面两个摄像头,结合样品旋转装置,就可以对植株进行3D形

高通量小型植物光合表型测量系统

  高通量小型植物光合表型测量系统是一款对小型植物自动进行顶部高通量光合表型高清成像(600万像素)测量的系统,配备6种滤光片进行叶绿素荧光成像和反射光谱成像。能够获得用于表型分析的可见光成像、用于光合作用分析的叶绿素荧光成像、在近红外区的NIR反射成像RNIR、反映叶绿素含量的叶绿素指数成像RCh

野外型高通量植物表型平台简介

  野外型高通量植物表型平台可以高通量对大田中的农作物进行自动表型成像的系统。它可以在长40 m、宽10 m、高6 m的范围内对植物进行表型分析。该系统可以配置可见光(VIS)成像、近红外(NIR)成像、红外(IR)成像、高光谱成像和激光3D成像,在田间对植物进行三维形态学分析。

植物表型研究文章TOP10(三)

TOP 4● 高通量表型和全基因组关联分析:研究揭示水稻的自然遗传变异(Nat Commun,2014)通过使用高通量测序技术对植物基因组学的研究迅速发展,传统的植物表型测试已远远落后。此文的作者开发了一个高通量水稻表型测定设施(HRPF),用于监测水稻生育期的13个传统农艺性状和2个新定义的性状。

EcoTech植物表型成像分析全面解决方案(二)

高光谱成像技术方案太阳光辐射照射到植物上,一部分被反射回大气中,一部分被吸收进行光合作用,一部分产生热散失。通过FluorCam叶绿素荧光成像技术可以成像测量分析植物吸收太阳能的光合利用效率等,通过红外热成像技术可以成像测量植物热时空分布进而分析气孔导度及水分利用效率等,而利用高光谱技术对植物反射光

PlantScreen表型助力转录组水平amiRNA筛选鉴定拟南芥激素...

PlantScreen表型助力转录组水平amiRNA筛选鉴定拟南芥激素运输功能基因研究信号分子的运输在调节植物生长、发育和环境应答方面起到非常重要的作用。最显著的例子就是植物激素的空间分布控制植物发育模式。以色列特拉维夫大学Eilon Shani研究团队使用amiRNA进行转录组多目标正向遗传筛

基于LED光源的科研级植物培养方案(二)

2)光强白炽灯、卤钨灯光效为12-24lm/W,荧光灯50-70lm/W,钠灯90-140lm/W,大部分的耗电变成热量损耗。而理论上LED发光源光效可达到300lm/W。FytoScope LED光源植物培养箱可以在30-50cm的距离上实现最大2000µmol(photons)/m².s的光

植物表型分析技术快讯—西红柿表型与代谢组学研究案例

植物源蛋白水解物(PHs)是一类重要的生长刺激素,影响植物表型组及代谢组特征,进而促进植物生长和作物产量,尤其在缺水、盐胁迫、重金属等逆境条件下,这种促进作用更加突出。PSI植物表型组学研究中心首席科学家Klara Panzarova等,利用PlantScreen高通量表型分析平台,就一种PH对

高通量测序技术-中的“高通量”-是什么意思

高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。在2000年的时候,3700、MegaBace等仪器上的测序也是高通量测序,是相对手工测序或者跑平板胶来说的。不过到2005年以后,高通

藻类表型研究全面解决方案

藻类是蓝藻门、眼虫藻门、金藻门、甲藻门、绿藻门、褐藻门、红藻门等一系列水生生物的总称。其形态种类众多,小至微米级的单细胞微藻,大至长达几米乃至几十米的大型褐藻。藻类作为水体中最重要的初级生产者,对整个生态系统乃至地球圈的稳定都起着极为重要的作用。莱茵衣藻、蓝藻等模式藻类为功能基因、生物进化、光合作用

PlantScreen高通量表型组学平台研究叶片衰老

韩国大邱基础科学研究所Jeongsik Kim、Pyung Ok Lim等,利用PlantScreen大型高通量表型组学研究平台,对植物叶片衰老进行了系列研究(参见论文:Jae IL Lyu etc. 2017. High-throughput and computational study

FluorCam多光谱荧光成像技术应用案例——植物干旱响应表...

FluorCam多光谱荧光成像技术应用案例——植物干旱响应表型研究植物对干旱的响应过程非常复杂,同时植物也有多样的应答机制来回避和耐受干旱胁迫并维持生长。光合系统被认为是对干旱极为敏感的,因此FluorCam叶绿素荧光成像系统从问世起就被广泛应用于植物干旱胁迫的研究。美国怀俄明大学将芜菁Brassi

高通量研究脊椎动物多维表型的方法(二)

  3.颅面畸形三维重建与评估:每条斑马鱼幼体,记录高达320帧的图像,通过三维重构技术,形象化展示了斑马鱼幼体软骨复杂表型。图像显示的层析效果图充分显示了三种不同药物处理后的5dpf斑马鱼幼体的颅面骨骼变化。三种药物是:retinoic acid(视黄酸)、cyclopamine(环巴胺)和flu

高通量研究脊椎动物多维表型的方法(一)

Nature Communications 4, February 12, 2013, Article number:1467, doi:10.1038/ncomms2475 Carlos Pardo-Martin, Amin Allalou, Jaime Medina, Peter M. Eimo

解密植物对环境变化的应激反应

  近日,山东建筑大学市政与环境工程学院副教授侯书国团队联合美国得州农工大学、杜克大学,法国图卢兹大学、日本冈山大学等知名大学的研究团队,通过对植物如何感受环境变化作出应激反应的研究,揭示了植物对病虫害、干旱等环境胁迫因素的应激机理,国际期刊《自然》在线发表这一研究成果。这一重要发现改变了人们以往对

实验室型高通量植物表型平台简介

  实验室型高通量植物表型平台可以全自动、高通量对大量小植株进行成像的系统,可以选择配置可见光(VIS)成像、近红外(NIR)成像、红外(IR)成像、荧光成像或激光扫描3D成像(只适合高度15 cm以下的小植株)中的一种或多种。成像系统带程控移动装置,可以在X轴和Y轴上进行移动,并配有射频或条形码读