研究发现简单重复序列对虾适应性进化的关键作用

3月9日,记者从中国科学院海洋研究所获悉,由该所李富花课题组主导完成的科研论文《简单重复序列促进对虾基因组可塑性和适应性进化》在Nature子刊《通讯-生物学》(《Communications Biology》)在线发表。该研究成果为阐明生物体内SSR的功能和甲壳动物对环境的适应进化研究提供了新的线索,也为对虾基因组育种和分子改良提供了重要的理论基础和数据支撑。 中科院海洋所袁剑波副研究员和张晓军研究员、南开大学王敏教授为文章共同第一作者。中科院海洋所李富花研究员和相建海研究员、南开大学冯露教授为文章通讯作者。 该研究针对简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)在对虾基因组内呈爆发式扩张的现象,首次提出SSR在基因组内急速扩张的新机制,揭示了SSR在对虾基因组的可塑性和适应性进化过程中的关键作用。李富花介绍,SSR是由1-6个碱基串联重复多次形成,在所有已测基因组物种......阅读全文

印度科学家调查对虾白斑综合征病毒

  据Intrfish 7月4日报道:印度中部咸水养殖研究所的科学家们正在调查白斑综合征病毒对安德拉邦克里希纳地区虾类死亡率的影响。  CIBA-Chennai实验室的土壤测试仍在继续,但科学家们已经与农民们分享了他们的发现。他们还建议了作物假期和微观层面的关注水的参数。

国际水产种业科技创新论坛热议对虾养殖

  “全球60亿人口的动物蛋白摄入,15%以上来源于水产品。全球水产品贸易中最大的物种是对虾。”近日,在华夏对虾种业创新联盟在北京举办的“2018国际水产种业科技创新论坛”上,世界水产学会前主席、比利时根特大学教授帕垂克·索格罗斯说。  而中国是世界水产养殖第一大国,养殖产量超过世界水产养殖总量的6

RFLP技术和RAPD技术2

第三节 RAPD技术一、 材料不同来源的DNA(50ng/ul)。二、设备PCR仪,PCR管或硅化的0.5ml eppendorf管,电泳装置。三、试剂1、随机引物(10mer) (5umol/L):购买成品。2、Taq酶:购买成品。3、10xPCR 缓冲液:配方见第八章。4、MgCl2 :25mm

南海海洋所凡纳滨对虾“中科1号”新品种通过审定

    近日,从全国水产原良种审定委员会秘书处获悉,由中科院南海海洋研究所胡超群研究员带领的研发团队与企业合作选育的凡纳滨对虾“中科1号”新品种,通过了全国水产原种和良种审定委员会的新品种审定。  该新品种是在国家“863”课题、支撑计划课题、广东省科技计划、广东省海洋渔业重大专项、

重要海水养殖动物病害及免疫研究项目通过验收

  “973”计划项目“重要海水养殖动物病害发生和免疫防治的基础研究”近日在京通过验收。承担单位包括中科院海洋所、中科院南海所、国家海洋局第三研究所、中山大学、厦门大学、浙江大学等国内一流科研院所。中科院海洋所研究员相建海为首席科学家,课题负责人中科院海洋所研究员宋林生和中山大学教授彭宣宪分别汇报了

中科院任命吴仲义为北京基因组研究所所长

2008年6月20日,中国科学院北京基因组研究所所长聘任、任命仪式在基因组所2楼报告厅举行。会议由中科院北京分院党组副书记刘松林主持,中科院副秘书长何岩,人事教育局局长李和风,基因组所党委书记杨卫平,副所长于军,所长助理胡松年研究员、王彩平研究员以及所党委、纪委委员,中层管理干部,副研以上科研人员等

中科院“细菌全基因组测序及分析”取得阶段性成果

中科院北京基因组研究所的胡松年研究员和浙江大学医学院附属二院的胡讯教授合作研究的项目“细菌Phenylobacterium zucineum全基因组测序及分析”取得阶段性成果,相关论文发表在今年第9期的BMC Genomics上。 P.zucineum是合作方从K562细胞系中分离到的兼性细菌。系

对虾虹彩病毒核酸检测试剂盒使用说明

对虾虹彩病毒(IRDO)核酸检测试剂盒(一管式恒温荧光法)◆ 产品说明动物疫病检测系列基于独特的恒温荧光检测技术,可针对水样、饵料、活禽、水生动物及相关加工品等样品中病毒的特异核酸片段进行扩增,通过实时扩增曲线判定结果。本产品用于对虾虹彩病毒(IRDO)的检测,检出限为103copies/μl基因组

凡纳滨对虾“渤海1号”通过国家新品种审定

  18日,记者从中国科学院海洋研究所获悉,农业农村部日前发布了2022年审定的26个水产新品种,其中中国科学院海洋研究所参与培育的凡纳滨对虾“渤海1号”榜上有名,品种登记号为GS-02-006-2022,这是海洋所继凡纳滨对虾“科海1号”和“广泰1号”后,又一通过全国水产原种和良种审定委员会审定的

对虾杆状病毒病(BP)核酸检测试剂盒使用说明

对虾杆状病毒病(BP)核酸检测试剂盒(一管式恒温荧光法)◆ 产品说明动物疫病检测系列基于独特的恒温荧光检测技术,可针对食品、动物组织等样品中病害的特异核酸片段进行扩增,通过实时扩增曲线判定结果。本产品用于对虾杆状病毒病(BP)的检测,检出限为103copies/μl基因组DNA。◆ 产品组成(96测

RFLP技术和RAPD技术3

一个较为详细的遗传连锁图谱不仅对该物种的遗传学基础研究有重要意义,同时对该物种的育种研究也很有帮助。Potlethwait和Stephen 等用RAPD技术进行斑马鱼遗传连锁图谱的制作。Liu把RAPD技术应用到鲶鱼基因图谱研究中。孙效文等建立了鲤鱼的遗传连锁图谱。图谱有RAPD分子标记56个,

对虾黄头病毒(YHV)-核酸检测试剂盒使用说明

对虾黄头病毒(YHV) 核酸检测试剂盒(一管式恒温荧光法)◆ 产品说明动物疫病检测系列基于独特的恒温荧光检测技术,可针对食品、动物组织等样品中病毒的特异核酸片段进行扩增,通过实时扩增曲线判定结果。本产品用于对对虾黄头病毒(YHV)的检测,检出限为103copies/μl基因组RNA。◆ 产品组成(9

对虾偷死野田村病毒(CMNV)-核酸检测试剂盒使用说明

对虾偷死野田村病毒(CMNV) 核酸检测试剂盒(一管式恒温荧光法)◆ 产品说明动物疫病检测系列基于独特的恒温荧光检测技术,可针对食品、动物组织等样品中病毒的特异核酸片段进行扩增,通过实时扩增曲线判定结果。本产品用于对对虾偷死野田村病毒(CMNV)的检测,检出限为103copies/μl基因组RNA。

中科院深圳先进院开发出人工基因组高效简化策略

最小真核基因组的构建是基因组学中的重要议题,被称为该领域的“圣杯”。通过基因组的精简,去除冗余基因,可为认识生命的起源和进化提供重要线索,有助于深化对基因组功能组成和运转方式的认识。2016年,最小原核基因组已由J. Craig Venter团队构建出来。面对更为复杂的真核生物基因组,如何构建其最小

中科院植物所等揭秘构树基因组组成及根系菌群

  大约3100万年前,构树与桑树分开,进化出了独特的纤维内皮。构树低木质素、高纤维素的独特比例,使其营养丰富,易被牲畜消化吸收,这也可能是它可以与土壤微生物共生的原因。中国植物学家首次破译了构树的基因组,通过对基因组的解析发现了这种联系,并于2月27日在《分子植物》上发表了该成果。构树用于造纸、饲

中科院微生物所在细菌耐药基因组学研究获进展

   中科院微生物所朱宝利课题组在细菌耐药基因组学研究中的最新进展,研究首次以基因组学大数据为依托,深入解析了耐药基因在细菌间的传播网络和规律,对深入认识细菌耐药性的进化、细菌耐药的形成机制等具有重要意义。成果近日在线发表于《应用与环境微生物学》,并将于第82卷22期以“封面故事”形式发表。副研究员

中科院开发基于内源CRISPR系统植物病原菌基因组编辑方法

高效便捷的基因组操纵技术可推动病原菌致病机理的研究。水稻是世界上主要的粮食作物,由水稻白叶枯菌(Xanthomonas oryzae pv. oryzae,Xoo)引起的水稻白叶枯病是威胁水稻生产的主要病害之一。近日,中国科学院微生物研究所邱金龙团队利用水稻白叶枯菌内源CRISPR-Cas系统,建立

中科院遗传发育所水稻基因组编辑研究取得重要新进展

  水稻突变体是进行水稻功能基因组学基础研究和水稻分子设计育种的重要材料。常规的水稻突变体来源于自发突变或化学、物理及生物的诱变,具有很大的随机性和局限性,不能满足大规模的水稻功能基因组学研究和水稻分子设计育种的需求。利用高效便捷的CRISPR/Cas9基因组编辑技术和高通量的寡核苷酸芯片合成技术可

学者首次鉴定甲壳类甲基法尼酯结合蛋白

近日,中国科学院南海海洋研究所研究员胡超群团队与河北大学教授张继泉团队、上海海洋大学教授吴旭干团队合作,首次鉴定甲壳动物的甲基法尼酯结合蛋白(MFBP)基因,并阐明其在甲基法尼酯保护和对虾蜕皮调控中的关键作用。相关成果发表于《生物化学杂志》(Journal of Biological Chemist

对虾桃拉综合症病毒(TSV)核酸检测试剂盒使用

对虾桃拉综合症病毒(TSV)核酸检测试剂盒(一管式PCR-荧光探针法)◆ 产品说明 动物病害检测系列可针对食品、动物组织等样品中病原的特异核酸片段进行扩增,通过实时扩增曲线判定结果。本产品用于对对虾桃拉综合症病毒(TSV)的检测,检出限为103copies/μL基因组DNA。产品组成(96测试)03

对虾传染性肌肉坏死病毒核酸检测试剂盒使用说明

对虾传染性肌肉坏死病毒(IMNV) 核酸检测试剂盒(一管式恒温荧光法)◆ 产品说明动物疫病检测系列基于独特的恒温荧光检测技术,可针对食品、动物组织等样品中病毒的特异核酸片段进行扩增,通过实时扩增曲线判定结果。本产品用于对对虾传染性肌肉坏死病毒(IMNV)的检测,检出限为103copies/μl病毒基

中科院发表Cell-Res文章:三维基因组组装重要新机制

  来自上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学中心,中科院北京生物物理所的研究人员发表了题为“Molecular mechanism of directional CTCF recognition of a diverse range of genomic sites”的文章,阐明了染色质架构蛋

中科院微生物所等在油棕基因组学研究获进展

   中科院微生物所叶健课题组与中科院外籍院士、美国洛克菲勒大学教授蔡南海和新加坡淡马锡生命科学研究院教授岳根华等人合作,完成了高产母本厚壳Dura基因组的高质量的序列测定和多个种质资源的基因组重测序以及进化分析。研究为油棕分子辅助育种和基因组编辑抗性育种工作奠定了坚实基础,对日趋竞争激烈的全球食用

澳大利亚CSIRO机构与中科院将在植物基因组学进行合作

  据GenomeWeb记者报道,2011年3月10日—澳大利亚联邦科学与工业研究组织(CSIRO)今天宣布,将在下周与中科院共同探索在植物基因组研究上的合作计划。  这项研究合作,将重点放在水稻和小麦农作物上。水稻和小麦将同玉米一并成为在世界上种植最广泛的三大农作物;来自两个研

中科院阿德莱德大学基因组学研讨会在京召开

  6月8日,在中科院国际合作局和生命科学与生物技术局的支持下,中科院-阿德莱德大学基因组学研讨会(CAS-Adelaide Seminar on Plant/Animal/Human Genomics)在中科院北京基因组研究所(下称:基因组所)召开。阿德莱德大学、阿德莱德癌症生物学

不同冻结方式对南美白对虾品质的影响美国FTC质构仪

  本研究选取新鲜的南美白对虾,通过 4 种不同冻结方式( 静止空气冻结、液体浸渍冻结、真空包装联用静止空气冻结和真空包装联用液体浸渍冻结) 处理,研究不同冻结方式对南美白对虾品质的影响,探索适合南美白对虾的冻结工艺。   实验样品:南美白对虾购于浙江宁波象山某海水养殖场,选取体表无损伤,长( 1

南海所对冷冻斑节对虾品质变化研究取得新进展

近日,中国水产科学研究院南海水产研究所院级海水产品品质评价与调控创新团队在冷冻斑节对虾品质变化方面研究取得新进展,首次阐明了冷冻贮藏期间斑节对虾中水分迁移与蛋白质品质和挥发性成分之间的关系。相关研究成果以“Effect of water migration on changes of quality

中国完成海带等7种海洋生物全基因组测序

  中国科学家10月30日在青岛首次披露了海带、栉孔扇贝和南美白对虾全基因组测序的部分成果,至此中国已完成7种大型海洋生物的全基因组测序,为改良这些海洋生物品质、提高产量奠定了科学基础。   中国的海洋生物基因组学研究虽然起步较晚,但现在一些研究成果已达到国际前沿水准。目前,人类完成全基因组测序的

浙江一家企业被列入FDA红名单,涉及产品有虾和对虾

   近日,美国FDA网站更新了进口预警措施(import alert),其中,对我国一家企业的相关产品实施了自动扣留,详情如下:  进口预警是FDA对于存在潜在风险的进口食品在通关时采取的一项处理措施,对于符合进口预警要求的企业/产品,FDA会在未检验的情况下对企业/产品实施自动扣留(DWPE)。

对虾杆状病毒(BP)核酸检测试剂盒实验反应五要素原则

引物:引物是PCR特异性反应的关键,PCR 产物的特异性取决于引物与模板DNA互补的程度。理论上,只要知道任何一段模板DNA序列, 就能按其设计互补的寡核苷酸链做引物,利用PCR就可将模板DNA在体外大量扩增。①引物长度: 15-30bp,常用为20bp左右。②引物扩增跨度: 以200-500bp为