布鲁克:利用CCS检测和深度学习研究4D蛋白质组学

近日,Matthias Mann教授团队和Fabian Theis教授组*共同在《Nature Communication》上发表开创性成果,标题为“Deep learning the collisional cross sections of the peptide universe from a million experiment alvalues”。(doi.org/10.1038/s41467-021-21352-8)1。 * Matthias Mann教授在德国马克斯·普朗克生物化学研究所和丹麦哥本哈根大学Novo-Nordisk基金会蛋白质研究中心担任双重职务。Fabian Theis教授在慕尼黑亥姆霍兹中心的德国环境卫生研究中心和德国慕尼黑大学数学系担任双重职务。 研究亮点 * 在timsTOF Pro系统上,通过捕集离子淌度(TIMS)和平行累积连续碎裂(PASEF)技术,获得了5种生物体蛋白质组全裂......阅读全文

离子淌度

在外电场作用下,溶液中的正离子向阴极迁移,负离子向阳极迁移。离子在电场中迁移速度,除了与离子本性(离子半径和电荷等)和溶剂性质有关外,还与电位梯度有关。因此,它们的关系可表达为:地电化学成晕机制、方法技术及找矿研究式中:u+(u-)——离子迁移速度;——电位梯度;υ+(υ-)——比例常数,称为离子淌

什么是离子淌度

又称离子迁移率。某种离子在一定的溶剂中,当电位梯度为每米1伏特时的迁移速率称为此种离子的淌度,单位是米2•秒-1•伏特-1。离子淌度是代表离子迁移速率特征的物理量。

朱正江:基于离子淌度质谱的非靶向代谢组学研究

  分析测试百科网讯 2020年9月14日,由中国质谱学会(中国物理学会质谱分会)主办,分析测试百科网和中国质谱学会网承办的2020年中国质谱学会质谱网络研讨会(2020 CMSS)正式开幕。本届质谱网络研讨会正值中国质谱学会成立40周年,按报告内容涉及领域包括生命科学与组学、药物药理毒理分析、元素

近800万中标蛋白质组质谱离子淌度分析系统

近日,上海同霖进出口有限公司发布《国科大杭州高等研究院蛋白质组质谱离子淌度分析系统中标(成交)结果公告》,花费7999000.00元采购蛋白质组质谱离子淌度分析系统。详细信息如下:一、项目编号:ZJ-2362483二、项目名称:国科大杭州高等研究院蛋白质组质谱离子淌度分析系统三、中标(成交)信息1.

Analytical-Chemistry|朱正江课题组基于神经网络构建的离子淌度质谱CCS值数据库

  中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心朱正江研究员团队在Analytical Chemistry杂志在线发表了题为“AllCCS2: Curation of Ion Mobility Collision Cross-Section Atlas for Small Molecules

捕集离子淌度质谱带来磷酸化蛋白质组研究新的深度

  Yasushi Ishihama 教授  京都大学分子与细胞生物分析实验室  2021年1月发表于www.ddw-online.com  目前,在蛋白质生物化学和蛋白质组学相关研究中,质谱(MS)已广泛应用于鉴定和表征蛋白质。且随着技术的不断发展,质谱已经实现了更高的覆盖深度、更快的分析速度和更

影响离子淌度大小的原因

溶液的电导率κ与溶液中各种离子的浓度ci(摩尔/升)、离子的价数Zi

探索蛋白质组学的“第四维度”分析

  就在几年前,蛋白质组学研究人员成功在单个或少量样本中识别出蛋白质、肽段和蛋白质的翻译修饰。十年过去了,这个领域已经发生了翻天覆地的变化。  如今,科学家们希望对蛋白质进行更大范围的分析,使样本数量从数百个扩展到数千个。然而,考虑到蛋白质组学在个性化医学和生物标志物检测领域的应用,这种分析必须具有

布鲁克推出基于timsTOF-Pro的突破性diaPASEF工作流程

  分析测试百科网讯 2019年9月16日 在第18届人类蛋白质组组织世界大会上(HUPO 2019),布鲁克发布了全新diaPASEF工作流程,这是一种基于timsTOF Pro质谱平台的新型数据非依赖性采集(DIA)方法。拥有捕集离子淌度(TIMS)和平行累积连续碎裂(PASEF)技术的tims

布鲁克携手timsTOF-Pro、PASEF推动蛋白质组学高精度分析

  分析测试百科网讯 2018年11月15日,第十届中国蛋白质组学大会(CNHUPO)在广州召开。布鲁克携捕获型离子淌度质谱timsTOF Pro、超高分辨磁共振质谱scimaX等众多明星产品参加了本次盛会。会后,分析测试百科网讯采访到了布鲁克董事总经理兼执行副总裁Dr. Rohan Thakur,

应用四极杆离子淌度飞行时间质谱进行蛋白质组学分析二

在该实验中,每次调查扫描执行15次并行MS/MS实验。如图3所示,结果表明将DDA与HD-DDA对比时,MS/MS总离子流(TIC)的增加与MS/MS通道数呈函数关系。每次运行的平均增加量为420%,与图2中所示结果一致。插图是15次MS/MS通道的示例,证明了可从样品中存在的较低丰度的肽中轻松获取

应用四极杆离子淌度飞行时间质谱进行蛋白质组学分析一

1沃特世公司 (英国曼彻斯特) 2慕尼黑理工大学 (德国弗赖辛)应用优势   ■ 改善蛋白质识别,增加蛋白质组覆盖范围  ■ 即使在极低浓度下也能实现可靠鉴定  ■ 更有效地进行LC/MS/MS分析从而加快决策过程简介随着自下而上(bottom-up)蛋白质组学分析的复杂性不断增加,对于质谱仪的能力

布鲁克:利用CCS检测和深度学习研究4D蛋白质组学

  近日,Matthias Mann教授团队和Fabian Theis教授组*共同在《Nature Communication》上发表开创性成果,标题为“Deep learning the collisional cross sections of the peptide universe from

如何打开waters离子淌度谱图

如何打开waters离子质谱没用过,液相是保存在一个文件夹里的,然后拷贝出来在另台电脑上用工作站打开就行了。看你是用的什么工作站,waters和安捷伦的仪器软件里都可以导出asciii数据的。液相,谱图可以导出为bmp文件,也可以导出为txt文件再用其他软件处理。

北京大学第一医院780万采购离子淌度4D组学质谱系统

项目概况 北京大学第一医院科研平台建设项目离子淌度4D组学质谱系统 招标项目的潜在投标人应在北京市丰台区金泽东路通用时代中心C座获取招标文件,并于2023年11月01日 09点30分(北京时间)前递交投标文件。一、项目基本情况项目编号:B0708-CMC23N7625项目名称:北京大学第一医院科研平

电解质溶液离子淌度的概念

二电极间电位梯度为1V/cm时离子的移动速度,又称离子绝对移动速度。离子淌度随溶液浓度增大而减小,随温度升高而增大。电解质的离子淌度越大,其当量电导也越大。

毛细管电泳仪淌度、绝对淌度和有效淌度

  带电粒子在直流电场作用下于一定介质(溶剂)中所发生的定向运动称为电泳。单位电场下的电泳速度称为淌度。在无限稀释溶液中(稀溶液数据外推)测得的淌度称为绝对淌度。  电场中带电离子运动除了受到电场力的作用外,还会受到溶剂阻力的作用。一定时间后,两种力的作用就会达到平衡,此时离子作匀速运动,电泳进入稳

离子淌度质谱仪器的技术特点等介绍

  技术特点:Waters是第一个将淌度技术商品化的公司,无论是在硬件还是在软件,在使用淌度技术方面都积累了丰富的经验,同时,Waters的客户也使用淌度技术发表了大量的文章。近年来,Waters新推出的带离子淌度的高分辨质谱Vion IMS QTof,可以说是淌度质谱里程碑式的产品,它将复杂的淌度

更快更灵敏的timsTOF-Pro:为蛋白质组学而生

  分析测试百科网讯,今年9月国际人类蛋白质组学大会(HUPO)上,布鲁克公司发布timsTOF Pro捕集离子淌度飞行时间质谱,该产品获得了由分析测试百科网组织评选的2017 ANTOP大奖,奖项名称为“蛋白质组学创新质谱技术奖” 。BCEIA展会上,分析测试百科网编辑采访到布鲁克道尔顿中国区高级

布鲁克携timsMetabo、timsOmni两款质谱产品亮相BCEIA-2025

  2025年9月10日-12日,第二十一届北京分析测试学术报告会暨展览会(BCEIA 2025)在北京·中国国际展览中心(顺义馆)盛大召开。值BCEIA创办40周年之际,本届大会以“辉煌四十载 再谱新篇章”为主题,再次汇聚全球分析测试领域的顶尖专家与前沿成果,为业内人士呈现了一场无与伦比的学术科技

timsTOF-Pro和PASEF一双慧眼-探究更多组学奥秘

  离子淌度技术发展几十年,布鲁克这个致力于挑战极限的公司,2016年一出手就推出业界最高淌度分辨的timsTOF质谱,在完成硬件的挑战后,布鲁克同德国马普研究所的Matthias Mann合作PASEF技术,于去年HUPO推出了timsTOF Pro,在蛋白质组学领域刷新了“鸟枪”法鉴定的速度、灵

布鲁克总裁专访:科学大咖灵感加磅-timsTOF创新广泛开花

  分析测试百科网讯 东方人的思维更偏向于实用主义,比如大家常认为创新来自于应用驱动;世界上还有一种创新首先来自于技术或理论的突破,然后再去寻找应用的方向,布鲁克的timsTOF便是后者。2016年发布Trapped Ion Mobility捕集离子淌度质谱后,引起了组学和临床领域科学大咖们的广泛兴

timsTOF-Pro最新4D高通量超高灵敏度蛋白组学研究技术

  分析测试百科网讯 近日在第15届美国人类蛋白质组学年会上,布鲁克宣布了Evosep One低流速色谱与timsTOF Pro液质联用系统在高灵敏度、高通量血浆蛋白质组学方面取得的进展。布鲁克还重点介绍了PEAKS,Protein Metrics和MaxQuant 4D蛋白质组学软件的进展,这些软

【ASMS新品】timsMetabo™质谱仪:四维破界,代谢革新!

核心特点·   超高灵敏度:TIMS重新定义小分子分析的灵敏度基准·   高通量TIMS分离技术与CCS测量:实现特异性与注释可信度的技术革新·   数字代谢组档案库:人工智能与机器学习(AI/ML)规模化应用新范式·   MoRE (离子淌度范围增强技术) 扫描模式:扩展质荷比分析范围·   QS

离子淌度技术不同领域新应用,等你来pick

  离子淌度技术作为一种质谱技术,“提供多一维的分离,提高峰容量”、“选择性好”、“分离结构类似物或同分异构体”、“碰撞横截面积CCS”等都成为IMS技术的标签,被越来越多的科学家运用到不同的科学研究领域,如制药、组学研究和临床前研究、食品环境、化工领域等,都开始逐渐体现出它无可比拟的价值。  为了

布鲁克亮相-ASMS-2020-引领-MALDI-和-4D蛋白质组学技术发展

   全新MALDI-2离子源大幅提高小分子检测灵敏度;CCS值加持让4D-蛋白质组学技术更加强大MALDI-2离子源将小分子分析灵敏度提升1-2个数量级新的prm-PASEF方法增强4D-蛋白质组学分析大规模高精度CCS值测量用于机器深度学习短梯度dia-PASEF方法进一步提高4D-蛋白质组学通

布鲁克PASEF技术荣膺EuPA-2019最佳技术奖

  分析测试百科网讯 近日,在德国波兹坦举办的PROTEOMIC FORUM 2019 上,布鲁克在EupPA2019上发布timsTOF Pro 最新功能。布鲁克PASEF技术因其在蛋白组学研究技术上的杰出表现,荣膺EuPA最佳技术奖。  ·最新的DIA-PASEF技术具有出色的肽和蛋白质定量分析

乌得勒支大学和布鲁克合作开发4D结构蛋白组学方法

Albert Heck 和Richard Scheltema团队与布鲁克共同推进PhoX交联剂和TIMS/PASEF技术联合增强交联质谱(XL-MS)研究  近日,布鲁克宣布与乌得勒支大学合作,共同推进质谱在蛋白质3D结构与相互作用方面的研究工作。在蛋白质组学、用质谱研究蛋白质结构和相互作用方面,合

北京大学第一医院花费780万成功采购离子淌度4D组学质谱系统

2023年11月1日,北京大学第一医院发布《北京大学第一医院科研平台建设项目离子淌度4D组学质谱系统中标公告》,7766000.00元中标离子淌度4D组学质谱系统。详细信息如下:一、项目编号:B0708-CMC23N7625(招标文件编号:B0708-CMC23N7625)  二、项目名称:北京大学

布鲁克和Radboudumc-TML成立转化组学联合卓越中心

  分析测试百科网讯 2019年4月16日,在荷兰X-omics计划的开幕活动中,布鲁克和拉德堡德大学医学中心(UMC)转化代谢实验室(TML)宣布为转化组学成立联合卓越中心(CoE)。 在Alain van Gool教授的领导下,联合卓越中心将专注于使用各种组学方法进行创新代谢分析的临床转化。该合