对猪进行比较分析，揭示转录的进化差异
对猪进行全面的转录组调查，可以从机理上了解经济上有价值的性状背后的组织特化过程，并加速其作为生物医学模型的使用。 2021年6月17日，四川农业大学李明洲及唐茜子共同通讯在Nature Communications上在线发表了题为“Apig Body Map transcriptome reveals diverse tissue physiologies and evolutionary dynamics of transcription”的研究论文，对31个成年猪组织和两个细胞系中的四种转录物类型（lncRNAs、TUCPs、miRNAs和circRNAs）和蛋白质编码基因进行了描述，并且揭示了47个骨骼肌和6个脂肪库之间的转录组变异性，这与它们不同的起源、代谢、细胞组成、身体活动和线粒体途径有关。 猪在世界范围内具有巨大的农业价值，并越来越多地被用作人类疾病的模型和异种移植的细胞和组织来源。转录组的系统分析对猪......阅读全文
对猪进行比较分析，揭示转录的进化差异
对猪进行全面的转录组调查，可以从机理上了解经济上有价值的性状背后的组织特化过程，并加速其作为生物医学模型的使用。 2021年6月17日，四川农业大学李明洲及唐茜子共同通讯在Nature Communications上在线发表了题为“Apig Body Map transcriptome rev
平行进化和趋同进化差异分析
平行进化和趋同进化有些类似，二者的主要区别是：平行进化一般指亲缘关系较近的植物种或植物类群，经过平行进化产生相似的特征；而趋同进化是指亲缘关系较远的植物种或
研究揭示内源性逆转录病毒序列和功能在物种间的差异进化
近日，中国科学院上海药物研究所研究员陈勋团队联合日本京都大学、加拿大麦吉尔大学科研人员，通过开发基于进化的转座子注释新方法，并结合系统发育分析、大规模平行报告系统及多组学等技术，在单碱基水平上揭示了内源性逆转录病毒序列和功能在不同物种间的差异进化。人体内病毒组包括感染性病毒、整合到人基因组中的外源病
研究揭示内源性逆转录病毒序列和功能在物种间的差异进化
近日，中国科学院上海药物研究所研究员陈勋团队联合日本京都大学、加拿大麦吉尔大学科研人员，通过开发基于进化的转座子注释新方法，并结合系统发育分析、大规模平行报告系统及多组学等技术，在单碱基水平上揭示了内源性逆转录病毒序列和功能在不同物种间的差异进化。人体内病毒组包括感染性病毒、整合到人基因组中的外源病
差示反转录PCR[mRNA差异显示技术
mRNA差异显示技术是由美国波斯顿Dena-Farber癌症研究所的Liang Peng博士和Arthur Pardee博士在1992年创立的。它也称为差示反转录PCR（differential display of reverse transcriptional PCR）简称DDRT-PCR。mR
差示反转录PCR[mRNA差异显示技术]
mRNA差异显示技术是由美国波斯顿Dena-Farber癌症研究所的Liang Peng博士和Arthur Pardee博士在1992年创立的。它也称为差示反转录PCR（differential display of reverse transcriptional PCR）简称DDRT-PCR。mR
蛋白质进化的相关介绍
可以用免疫学方法测定各种生物的蛋白质的亲缘关系，例如用人的清蛋白注射家兔，从家兔取得抗血清，把抗血清分别和人、大猩猩、黑猩猩等的清蛋白进行沉淀反应测定，可以看到愈是亲缘关系相近的清蛋白沉淀反应愈强。同工酶的电泳测定是70年代发展起来的可以用来比较生物蛋白质的亲缘关系的方法。同工酶是功能相同而一级结构
差示反转录PCR实验——mRNA差异显示法
实验方法原理几乎所有的真核基因mRNA分子的3’-末端，都带有一个多聚的腺苷酸结构，即通常所说的poly(A)尾巴。因此，在RNA聚合酶的作用下，可按mRNA为模板，以oligo(dT)为引物合成出cDNA拷贝。根据mRNA分子3’-末端序列末端结构的分析可以看到，在这段poly(A)序列起点碱基之
tDEG（转录组差异表达基因深度分析）
本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了专业高效的生物信息分析流程，对您获得的海量RNA-seq序列的质量、特征等重要信息进行图形可视化；对两个以上生物学样本之间的差异表达基因进行可信分析；对差异表达所揭示出的重要科学问题进行中肯分析；让您快速“发现”所关注生物学问题，医学问题和农业问题
最新模型定义蛇毒进化－剧毒蛋白质进化于无毒基因
据科学日报报道，目前描绘蛇或者蜥蜴嘴巴内部主要基因的科技改变了科学家们将动物定义为有毒的方式。如果口腔腺体能够表达与“毒素”相关的20个基因家族中的一些基因，那么这个物种就被定义为有毒。然而，美国德克萨斯大学阿灵顿分校的一项最新研究挑战了这一定义，这些研究还建立了一个描述蛇毒是如何产生的新模型。
真核生物RNA的转录与原核生物RNA的转录过程差异
⒈ 真核生物RNA的转录有的是在细胞核内进行的，而蛋白质的合成则是在细胞质内进行的。且真核生物线粒体和叶绿体的遗传信息系统被称为真核细胞的第二遗传信息系统，或核外基因及其表达体系。这是因为研究发现，线粒体和叶绿体中除有DNA外，还有RNA（mRNA、tRNA、 RNA）、核糖体、氨基酸活化酶等。说明
研究显示蛋白质进化难以逆转
新华网伦敦9月24日电(记者黄堃)生物进化是否可逆一直是人们感兴趣的问题。最新一期英国《自然》杂志刊登的研究报告说，分子水平的实验显示，蛋白质一旦向前进化，便难以原路返回过去的状态。 美国俄勒冈大学等机构的研究人员发表报告说，他们研究了一种被称为“糖皮质激素受体”的蛋白质进化路线。它存在于
关于抗冻蛋白质的进化介绍
APF显著的多样性和分布提示进化成不同类型是相应1-2百万年前在北半球发生和1千万－3千万年前在南极发生的海平面冰川作用的结果。这种独立发展的相似的适应化叫做趋同演化（进化）。为什么许多类型的AFP尽管它们具有多样性，但是却能执行相同的功能。这有两个原因： 1、尽管冰是统一由氧和氢构成的，它有
加速蛋白质进化的新技术
所有的生物都需要蛋白质，蛋白质这个巨大的分子家族，是大自然根据基因中的蓝图定制而来的。 通过自然的进化过程，DNA突变会产生新的或更有效的蛋白质。人类已经发现了这些分子有那么多的替代用途——作为食品、工业酶、抗癌药物，因此，科学家们渴望更好地了解如何设计用于特定用途的蛋白质变体。 现在，斯坦
昆明动物所人类大脑转录组进化研究获进展
人类在进化过程中，脑的大小和复杂程度得到了极大得增加。脑的结构使得人类有着区别于其他物种的极高的认知能力，比如语言能力、抽象思考能力等等。转录后修饰，如RNA编辑、可变剪切等能够由相同的DNA序列生成不同的RNA，进而翻译成不同的蛋白质构体，是扩大蛋白质多样性的重要机制。随着二代测序发展，转录后
能控制转录终止的蛋白质ρ因子
能控制转录终止的蛋白质ρ因子(ρ factor)是一种与转录终止相关的蛋白质。1969年,Roberts J在T4噬菌体感染的大肠杆菌中发现了能控制转录终止的蛋白质,命名为ρ因子。ρ因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量为46kD 。ρ因子能结合RNA,又以对poly C的结合能力最强
蛋白质印迹技术30年“进化”史
在发明蛋白质印迹法(Western Blot)出现了30多年之后，这项技术仍然是获取特定蛋白可靠鉴定的关键。许多近期涌现的产品利用各种方法来提高蛋白质印迹实验的可重复性、敏感性、定量性以及速度。 有三个人都被认为发展了蛋白质的免疫印迹方法，但其中只有一人才算得上是“Western
关于基因转录的蛋白质的分类介绍
真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录机构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所必须的。一般可将这些转录所需的蛋白质分为三大类： (1)RNA聚合酶的亚基，它们是转录必须的，但并不对某一启动子有特异性。 (2)某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复合物
张亚平院士JMCB获人类大脑转录组进化研究进展
人类在进化过程中，脑的大小和复杂程度得到了极大得增加。脑的结构使得人类有着区别于其他物种的极高的认知能力，比如语言能力、抽象思考能力等等。转录后修饰，如RNA编辑、可变剪切等能够由相同的DNA序列生成不同的RNA，进而翻译成不同的蛋白质构体，是扩大蛋白质多样性的重要机制。随着二代测序发展，转录后
植物所在大豆种子大小驯化转录组进化研究中取得进展
栽培大豆（Glycine max）是由其近缘种野大豆（Glycine soja）驯化而来。栽培大豆和野大豆果实发育过程中基因的差异表达可能影响种子大小，参与大豆种子的驯化。然而，大豆驯化的遗传变异基础尚不清楚。 中国科学院植物研究所贺超英研究组针对大豆种子大小驯化开展了转录组比较研究。研究人员
从预测进化－AI能“构想”新蛋白质结构
半个世纪以来，科学家一直在寻找解决“蛋白质折叠问题”的方法。这是生物学领域的一项重大挑战，难倒了几代科学家。但现在，人工智能（AI）解决了这一问题。据《自然》杂志1日发表的论文，包括美国华盛顿大学、伦斯勒理工学院和哈佛大学的研究人员在内的研究小组描述了一种升级的阿尔法折叠系统，该系统由深度思维（
《Cell》新文章：无差异“盘查”蛋白质的酶
来自约翰霍普金斯大学的研究人员第一次阐明了，定位在细胞膜内的一类重要酶的内部运作机制。他们报告说，令他们非常感到惊讶的是，这些称作为扁菱形蛋白酶(rhomboid protease)的蛋白切割器，完全不同于研究的几乎所有其他类型的酶，它们对于所切割的蛋白质没有吸引力，极其缓慢地完成它们的切割
李春波博士：差异蛋白质组学研究的利器
2013年12月8日，第四十期质谱沙龙活动在北京朝阳医院顺利举办，来自北京师范大学、北京朝阳医院、中科院微生物所、空军总医院的百余名专家学者齐聚一堂共同参加了此次沙龙活动。AB SCIEX公司市场部 李春波
最新进展：胰岛素基因转录调控通路进化取得进展
5月25日，Nature Communications以Evidence from oyster suggests an ancient role for pdx in regulating insulin gene expression in animals为题，在线报道了中国科学院海洋研究所
动物所等关于洞穴金线鲃眼睛转录组进化研究获进展
洞穴鱼类在黑暗条件下长期生存，演化出许多独特的适应性特征，如眼睛和色素缺失。近年来，科学家利用洞穴鱼类墨西哥丽脂鲤(Astyanax mexicanus)作为模式物种，开展了大量的针对洞穴动物特征进化发育的实验研究。相对于地表生活的丽脂鲤，洞穴丽脂鲤的Shh基因及其信号通路其他成员在胚胎发育
转录组和蛋白质组有何异同之处
转录组是RNA转录后的全部产物,而转录后的产物经过加工修饰（例如甲基化、拼接、加尾等）后才变成蛋白质.相同之处就是他们的大部分结构相同.不同之处就是一个有加工过程,一个没有.
蛋白质数据+基因序列精准构建进化树
西班牙基因组调控研究中心的科学家们在最新一期《自然·通讯》上发表了一项创新研究，展示了如何利用蛋白质三维形状，解开生命中古老的“历史密码”，揭示了生命之树中最古老的进化关系。这项研究首次将蛋白质的形状数据与基因序列数据结合，提高了进化树的准确性。蛋白质结构解决“饱和问题”（艺术概念图）。图片来源：《
昆明动物所揭示人群进化历史差异对复杂病遗传分析的影响
目前，复杂疾病（如双向情感障碍、抑郁症等）的遗传学分析已在世界范围人群中广泛开展。然而，即使是大样本量和高密度SNP的分析，在不同样本尤其是遗传背景差异很大的人群中往往不能重复出疾病易感基因的相关性。人群生活的环境因素，如气候、饮食和生活方式等可能是造成这种差异的原因，但更重要的原因可能是由于易
Science新文章：复杂的基因调控
由于人类和黑猩猩很大程度上共享相同的DNA，因此一直以来研究人员都采用基因调控变化来研究两者之间的进化分歧。然而现在来自芝加哥大学的科学家们发现，长期以来被视作是基因调控差异标志的mRNA表达水平，通常不能反映人类和黑猩猩之间蛋白质表达以及生物学功能差异。这项工作发表在《科学》(Science)
遗传发育所发现两个WRKY转录因子差异调控小麦耐逆性
WRKY类转录因子调控植物生长发育的多个方面，其基因表达也受到多种非生物胁迫的影响。但这类转录因子在植物尤其是农作物耐受非生物胁迫方面的作用研究较少。 中科院遗传与发育生物学研究所陈受宜、张劲松和张正斌3个实验室合作分析了小麦中WRKY转录因子基因家族的成员，鉴定了胁迫应答基因，并研究了相