甲基化——肿瘤检测治疗的又一靶标?
前言在测序和相关技术不断进步的今天,研究人员不仅能够获得DNA、RNA的碱基序列,更能够获得碱基修饰的复杂信息。目前已经证明DNA甲基化能够导至的肿瘤产生,而Ribomed、基准医疗和鹍远基因等公司作为该领域的先行者,已经开发出相关产品。RNA作为中心法则的下游分子,也有多种多样的修饰,特别是m6A甲基化目前也愈发受到关注。今天,小编就和大家梳理一下甲基化修饰与检测的来龙去脉。 一、什么是甲基化?甲基化是指碱基上引入甲基的过程,DNA,RNA均存在甲基化现象。DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基在DNA甲基转移酶的催化作用下,使得碱基获得甲基的过程。这种DNA甲基化修饰可以发生在胞嘧啶、腺嘌呤及鸟嘌呤。一般研究中所涉及的DNA甲基化主要是指CpG岛上胞嘧啶的甲基化过程,其产物为5-甲基胞嘧啶(5mC)。CpG岛(CpG island)是指基因组某些区域CpG序列的密度比平均密度高10~20倍,CpG岛的功能是......阅读全文
甲基化——肿瘤检测治疗的又一靶标?
前言在测序和相关技术不断进步的今天,研究人员不仅能够获得DNA、RNA的碱基序列,更能够获得碱基修饰的复杂信息。目前已经证明DNA甲基化能够导至的肿瘤产生,而Ribomed、基准医疗和鹍远基因等公司作为该领域的先行者,已经开发出相关产品。RNA作为中心法则的下游分子,也有多种多样的修饰,特别是m6A
ctDNA甲基化检测在肿瘤诊疗中的价值
循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)来源于肿瘤细胞的凋亡、坏死或分泌产生的DNA片段,是循环游离DNA(circulatingcell-free DNA,cfDNA)的一部分。健康人群中大部分cfDNA的长度在70~200 bp,但肿瘤患者的ctDNA长度
华大基因应用粪便DNA甲基化检测技术,赋能肿瘤检测
在浙江宁波,一家庭父子三人接连查出肠癌,其接诊医生团队通过分析他们的家族史和基因检测结果,最终确认致病原因为林奇综合征,即遗传性非息肉病性结直肠癌。医生解释称,大多数林奇综合征患者是从父母遗传而来的,在该病的遗传模式下,即使只有一个基因突变也可能增加患此病的风险。如果夫妻一方携带突变基因,则每个
DNA“甲基化指纹”鉴定出91种肿瘤
英国《自然》杂志近日在线发表了一项癌症研究成果,欧洲科学家研发了一种全新机器学习程序,通过DNA甲基化数据——“甲基化指纹”技术可以改善脑肿瘤的诊断。正确诊断肿瘤,对于癌症的治疗至关重要。但是,在已知的约100种肿瘤中,中枢神经系统肿瘤尤其难以准确鉴定出来。为了解决这个问题,德国癌症研究中心科学
DNA“甲基化指纹”鉴定出91种肿瘤
科技日报北京3月18日电 英国《自然》杂志近日在线发表了一项癌症研究成果,欧洲科学家研发了一种全新机器学习程序,通过DNA甲基化数据——“甲基化指纹”技术可以改善脑肿瘤的诊断。 正确诊断肿瘤,对于癌症的治疗至关重要。但是,在已知的约100种肿瘤中,中枢神经系统肿瘤尤其难以准确鉴定出来。
DNA“甲基化指纹”鉴定出91种肿瘤
英国《自然》杂志近日在线发表了一项癌症研究成果,欧洲科学家研发了一种全新机器学习程序,通过DNA甲基化数据——“甲基化指纹”技术可以改善脑肿瘤的诊断。 正确诊断肿瘤,对于癌症的治疗至关重要。但是,在已知的约100种肿瘤中,中枢神经系统肿瘤尤其难以准确鉴定出来。 为了解决这个问题,德
甲基化荧光PCR检测
甲基化荧光检测(methylight)是利用荧光定量性PCR检测亚硫酸氢钠处理后的序列改变。在TaqManR技术中,可以使用3种不同的单核苷酸(正义引物、反义引物和荧光杂交探针),进行不同序列的检测。与已存在的技术相比,甲基化荧光检测zui明显的优点就是能同时对几百甚至几千例样品迅速检
甲基化的检测方法
(1) 甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到
甲基化荧光PCR检测
甲基化荧光检测(methylight)是利用荧光定量性PCR检测亚硫酸氢钠处理后的序列改变。在TaqManR技术中,可以使用3种不同的单核苷酸(正义引物、反义引物和荧光杂交探针),进行不同序列的检测。与已存在的技术相比,甲基化荧光检测最明显的优点就是能同时对几百甚至几千例样品迅速检测。 高
甲基化检测方法介绍
(1) 甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到
关于甲基化检测的检测程序介绍
1.甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP) 用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能
DNA甲基化在肿瘤发生中的作用
越来越多的研究表明,在肿瘤形成过程中包含两大类机制。一个是通过DNA核苷酸序列改变而形成突变,即遗传学机制。肿瘤作为一种遗传学疾病在分子生物学领域已经得到证实。另外一个就是表观遗传学(epigenetics)机制,即不依赖DNA序列改变导致基因表达水平的变化,它在肿瘤形成过程中的作用越来越受到重视。
科学家发现DNA甲基化物可用于肿瘤的敏感检测和分类鉴定
近日,加拿大大学健康网络公司和多伦多大学等科学家在Nature杂志上发表了题为“Sensitive tumour detection and classification using plasma cell-free DNA methylomes”的文章,报道了一种基于免疫沉淀的可以敏感地检测低
甲基化试验有助于区分原发肿瘤类型
未知性癌症(CUP)在转移性肿瘤患者中占比10%,然而这些癌症的原发肿瘤位置通常无法确定。由于无法分辨究竟是哪种肿瘤类型,这些患者的生存率很低。 “传统方法只能鉴定30%不明病灶的转移性肿瘤的原发肿瘤位置,一些分子生物学方法可以提高这一比例,但往往造价昂贵,并且,所使用的RNA样本比较脆弱容易
关于甲基化检测的内容介绍
DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,真核生物中的甲基化仅发生于胞嘧啶,即在DNA甲基化转移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5’-端的胞嘧啶转变为5’-甲基胞嘧啶。DNA甲基化通常抑制基因表达,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。这种DNA修饰方式在不改变基因序列前提下实现对基
甲基化检测——MSHRM技术
DNA甲基化是发生在DNA碱基序列上的一种共价修饰。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在5'-CpG-3'双核苷酸序列的胞嘧啶上。在人类基因组中,大约有60%~70%的CpG胞嘧啶是甲基化的,其程度因不同的物种和细胞类型而异。DNA甲基化状态在基因组中呈现出一定的分布模式,90%的甲
甲基化检测——MSHRM技术
HRM技术服务之甲基化检测(MS-HRM技术) DNA甲基化是发生在DNA碱基序列上的一种共价修饰。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在5'-CpG-3'双核苷酸序列的胞嘧啶上。在人类基因组中,大约有60%~70%的CpG胞嘧啶是甲基化的,其程度因不同的物种和细胞类型而异。DNA甲基化状
肿瘤检测糖脂类肿瘤标志物检测介绍
糖脂类肿瘤标志物检测介绍: 糖脂类肿瘤标志物检测:包括癌抗原-50(CA-50)、癌抗原72-4(CA72-4)、癌抗原242(CA242)、糖链抗原19-9(CA19-9)的检测等。CA-50增高见于大部分恶性肿瘤,动态观察其水平变化对癌肿疗效、预后判断、复发检测颇有价值。CA72-4是卵巢肿瘤
检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗? 上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B
检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(上)
云序生物解析如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(上) RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测
快速检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平
占领C位!云序生物解析如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平 RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA
同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平
RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测序研究,首发推出了超微量RNA甲基化测序技术,首发推出RNA甲基化研究一站式系统性解决方案,云
肿瘤标志物检测不等于肿瘤基因检测
随着肿瘤的发病率逐年升高,人们对自身健康与疾病预防越来越重视。几乎所有的体检机构,已经把肿瘤筛查项目放进体检套餐。那么,这些筛查项目对我们有哪些作用?肿瘤标志物的检测与肿瘤基因检测有什么区别?本文将为您来回答这2个问题。什么是肿瘤标志物检测?肿瘤标志物通常是一些与肿瘤的发生发展相关的蛋白、酶或者糖抗
DNA甲基化检测技术全攻略
近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。一、特异位点的甲基化检测1. 甲基化特异性PCR(MS-PCR)这种方法经济实用,
关于DNA甲基化检测的结果分析
在进行甲基化和非甲基化PCR扩增时,均设立空白对照和阳性对照。如果只扩增出非甲基化条带,判断为非甲基化;相反,如果只扩增出甲基化条带,则判断为甲基化;如果既能扩增出甲基化条带又能扩增出非甲基化条带,说明是半甲基化状态,在统计结果时也计为甲基化阳性。肿瘤细胞DNA总体甲基化的程度越低,癌症的恶性程
甲基化特异性的PCR检测
用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到扩增片段,则说明该位点存在甲基化;反之,说明被检测的位点不存在甲基化。
DNA甲基化检测技术全攻略
近年来涌现出不少 DNA 甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析 (methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。 特异位点的甲基化检测 甲基化特异性 PCR (MS-PCR)
DNA甲基化检测技术全攻略
近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。一、特异位点的甲基化检测1. 甲基化特异性PCR(MS-PCR)这种方法经济实用,
关于DNA甲基化检测的基本介绍
DNA甲基化是基因表达调控的一种重要机制,DNA甲基化检测是指利用各种方法对肿瘤细胞DNA甲基化程度进行测定。在恶性肿瘤的发展中,甲基化的状态并不是一成不变,肿瘤细胞内全基因组的低甲基化程度与疾病进展、肿瘤大小和恶性程度都有密切的关系,DNA甲基化检测对肿瘤恶性程度的判断有重要意义。
快速检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗? 上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B