测序平台多样化成为发展障碍
2016年1月12日,奥巴马提出了癌症“登月计划”,将精准医疗、个性化医学或癌症医学推向了另一高度。事实上,精准医疗是一个美好的愿景:即能详细读取肿瘤患者的缺陷,并开发出靶向缺陷的新一代药物,医生给患者最有效的治疗方案。使用新型靶向药物如厄洛替尼(erlotinib)和西妥昔单抗(cetuximab)治疗携带特定遗传缺陷的肿瘤患者已慢慢成为现实。因而从某种意义上说,精准医疗不再是什么革命性的概念:长期以来医生能够给患者提供各种测试,并使用测试结果来指导如何治疗。但受癌症影响的人都知道,我们今天使用的各种测试与治疗都远称不上完美。尽管平均存活率持续上升,但医生也不能保证病人一定会对给定的药物起反应或保证能完全治疗癌症。因而,仍然还有太多的“碰巧”和太多的“观望”。也许精准医疗是一场更细化的革命——逐步走向更有效、更有针对性的药物时代;更少的不确定,有更准确的治疗,最终更好地照顾患者。那么我们要如何走向精准医疗?日前,英国癌症研究中......阅读全文
测序平台多样化成为发展障碍
2016年1月12日,奥巴马提出了癌症“登月计划”,将精准医疗、个性化医学或癌症医学推向了另一高度。事实上,精准医疗是一个美好的愿景:即能详细读取肿瘤患者的缺陷,并开发出靶向缺陷的新一代药物,医生给患者最有效的治疗方案。使用新型靶向药物如厄洛替尼(erlotinib)和西妥昔单抗(cetuximab
直击精准医疗四大挑战:测序平台多样化成为发展障碍
2016年1月12日,奥巴马提出了癌症“登月计划”,将精准医疗、个性化医学或癌症医学推向了另一高度。事实上,精准医疗是一个美好的愿景:即能详细读取肿瘤患者的缺陷,并开发出靶向缺陷的新一代药物,医生给患者最有效的治疗方案。 使用新型靶向药物如厄洛替尼(erlotinib)和西妥昔单抗(cetux
高通量测序平台发展及在临床分子诊断中的应用
自2000年人类基因组计划完成,测序技术得到了快速的发展。在美国ABI公司基于末端终止法的第一代测序基础上,各大公司相继推出了不同的NGS测序平台。核酸(DNA和RNA)测序技术的发展推动了医学对遗传病分子特征的认识。以揭示疾病分子特征为目的的高通量测序,即下一代测序(next generati
九大测序平台对比(一)
1.sanger企业:Life Technology推出时间:1977年发明,1986年第一台商业化测序仪主流型号:3730XL样品要求:PCR产物:浓度≥50ng/ul 体积≥10ul;质粒:含量≥5ug;菌液:体积≥1ml。测序原理:双脱氧链终止法:Sanger法测序的原理就是,每个反应含有所有
九大测序平台对比(二)
2.454企业: Roche推出时间: 2005年主流型号: Genome Sequencer FLX Titanium(2008年推出)样品要求: 5 μg of DNA,浓度≥300 ng/μL测序原理:焦磷酸测序在测序时,使用了一种叫做“Pico TiterPlate”(PTP)的平板,它
九大测序平台对比(二)
Helicos企业: Helicos Biosciences推出时间: 2008年主流型号: HeliScope™ Single Molecule Sequencer(2008年推出)样品要求: 1-3 μg,起始DNA体积不超过100 μL.测序原理: 边合成边测序,可逆阻断测序待测DNA被随机打
九大测序平台对比(四)
5.Helicos企业: Helicos Biosciences推出时间: 2008年主流型号: HeliScope™ Single Molecule Sequencer(2008年推出)样品要求: 1-3 μg,起始DNA体积不超过100 μL.测序原理: 边合成边测序,可逆阻断测序待测DNA被随
九大测序平台对比(六)
8.PGM企业: Ion Torrent推出时间: 2010年主流型号: Ion Personal Genome Machine™(2010年)样品要求: 5 μg DNA,起始DNA体积不超过130μL测序原理: 半导体芯片测序该测序仪使用了一种高密度半导体小孔芯片。该芯片置于一个离子敏感层和离子
九大测序平台对比(三)
4.HiSeq2000企业: Illumina推出时间: 2010/1/1主流型号: Illumina HiSeq2000样品要求: 6ug/sample,无RNA、蛋白污染,无降解,OD260/OD280=1.8-2.0测序原理: 边合成边测序这种测序技术通过将基因组DNA的随机片断附着到光学透明
九大测序平台对比(五)
7.The PacBio RS system企业: Pacific Biosciences推出时间: 2010年2月开始早期试用主流型号: PacBio RS样品要求: 1kb以下500ng,纯化的基因组 DNA, BACs, cDNA 文库 或PCR 产物测序原理: 边合成边测序,single m
九大测序平台对比(一)
1.Sanger2.4543.Solid 4.HiSeq20005.Helicos6.DNA Nanoball array7.The PacBio RS system8.PGM9.MiSeq sanger企业:Life Technology推出时间:1977年发明,1986年第一台商业化测序仪主流
基因测序的云计算平台
自二代测序的技术问世以来,就一直是研究和临床领域关注的重点。随着整个行业的技术发展,二代测序也带动了整个基因研究的产业链。在二代测序的产业链中,上游做检测,中游做分析,下游做应用。在测序价格持续下降的情况下,中游测序数据的生物信息学分析成为了提高效率最大的瓶颈。 传统的测序数据分析依赖于本地
基因测序的发展
DNA测序技术正以惊人的速度向前发展。在过去十年中,高通量测序技术使数据生成呈指数级增长态势。 由此产生的大量数据在基础生物学领域的应用已经产生了变革性的影响,从考古学、刑事调查到产前诊断、癌症预后,DNA测序与数据分析已经渗透到了生物相关的多个行业。 测序技术的瓶颈是分析和解释所有的DNA序
《科学》文章:中国已经成为测序强国
2月3日出版的《科学》杂志发表文章,以华大基因为例,介绍了中国测序事业的发展。 文章说,随着欧洲和美国测序中心的成立,华大基因已成为唯一一个足迹遍布全球的基因组学公司;华大基因期望其日益增长的影响力为社会带来更多好处。 从成立以来,华大基因完成了许多重大国内项目,如SARS
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
升降平台的简史发展
升降平台随着人们对垂直运送的需求而出现,与人类的文明一样久远。原始的升降平台使用基本的动力方式如人力、畜力和水力来提升重量。在工业革命之前,这些动力方式一直被升降装置所广泛使用。 古希腊时,阿基米德开发了经过改进的用绳子和滑轮操作的升降装置,它用绞盘和杠杆把提升绳缠绕在绕线柱上。 公元80年
发展历史/DNA测序仪
70年代末,WalterGilbert发明化学法、FrederickSanger发明双脱氧终止法手动测序,同位素标记80年代中期,出现自动测序仪(应用双脱氧终止法原理)、荧光代替同位素,计算机图象识别90年代中期,测序仪重大改进、集束化的毛细管电泳代替凝胶电泳2001年完成人类基因组框架图
基因测序发展前景
2015年3月9日,罗氏、基础医学以及其他很多癌症研究人员都认为从数据角度分析癌症是最终战胜这种可怕疾病的理想方式。根据罗氏和基础医学签署的协议,罗氏可以访问基础医学的数据库。他们的数据库收录了3.5万名癌症患者的肿瘤DNA序列,以及这些患者服用的药物和药物在遏制癌症方面产生的功效等信息。 [1
基因测序的发展状况
国外 美国由多个财团共同投资组建的某生物高科技产业公司,一直专注于生物高科技领域的研发与服务。集团拥有非常雄厚的实力,同时在全美涉足多个领域的发展。其中一家财团拥有3家电子芯片高科技公司,拥有60多位全美一流的科研人员,拥有13个博士,并有3个诺贝尔奖获得者;另外的财团一家拥有的能源公司在美国落基
基因测序仪发展历史
1. 第一代DNA测序技术 1977年,Sanger等提出了经典的双脱氧核苷酸末端终止测序法。此后,在Sanger法的基础上,20世纪80年代中期出现了以荧光标记代替放射性同位素标记、以荧光信号接收器和计算机信号分析系统代替放射性自显影的自动测序仪。另外,90年代中期出现的毛细管电泳技术使得测序的通
DNA测序仪发展历史
70年代末,WalterGilbert发明化学法、FrederickSanger发明双脱氧终止法手动测序,同位素标记 80年代中期,出现自动测序仪(应用双脱氧终止法原理)、荧光代替同位素,计算机图象识别 90年代中期,测序仪重大改进、集束化的毛细管电泳代替凝胶电泳 2001年完成人类基因组
基因测序国外发展状况
美国由多个财团共同投资组建的某生物高科技产业公司,一直专注于生物高科技领域的研发与服务。集团拥有非常雄厚的实力,同时在全美涉足多个领域的发展。其中一家财团拥有3家电子芯片高科技公司,拥有60多位全美一流的科研人员,拥有13个博士,并有3个诺贝尔奖获得者;另外的财团一家拥有的能源公司在美国落基山脉
DNA测序的发展历史
70年代末,WalterGilbert发明化学法、FrederickSanger发明双脱氧终止法手动测序,同位素标记80年代中期,出现自动测序仪(应用双脱氧终止法原理)、荧光代替同位素,计算机图象识别90年代中期,测序仪重大改进、集束化的毛细管电泳代替凝胶电泳2001年完成人类基因组框架图
基因测序-发展前景
2015年3月9日,罗氏、基础医学以及其他很多癌症研究人员都认为从数据角度分析癌症是最终战胜这种可怕疾病的理想方式。根据罗氏和基础医学签署的协议,罗氏可以访问基础医学的数据库。他们的数据库收录了3.5万名癌症患者的肿瘤DNA序列,以及这些患者服用的药物和药物在遏制癌症方面产生的功效等信息。[13]
不同平台的二代测序技术
二代测序技术基于大规模平行测序技术(massive parallel analysis,MPS),它能同时完成测序模板互补链的合成和序列数据的获取。主要可以分成Roche 454焦磷酸测序、Illumina Solexa合成测序和ABI SOLiD连接法测序。 (1)Roche 454焦磷酸测
llumina高通量测序平台的应用(二)
3、可逆化学阻断技术测序 利用边合成边测序(Sequencing by synthesis)的原理,加入改造过的DNA聚合酶和带有4种荧光标记的dNTP。这些核苷酸是“可逆终止子”,因为3’羟基末端带有可化学切割的部分,每个循环它只容许掺入单个碱基。去除其他多余的dNTP后,用激光扫描
llumina高通量测序平台的应用(一)
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收购了
绿色农业发展如何成为新常态
“四十年来’三农’发展虽然取得很大成绩。但要真正达到强富美,还必须从几大陷阱中拔出腿来与时俱进。”日前,在由中国管理科学研究院农业经济技术研究所主办的“纪念中国农村改革四十周年座谈会暨农业经济技术研究所年会”上,中国系统工程学会专委会名誉主任李毓堂如是表示。 而如何真正解决大家吃的安全和放心的
让创新成为驱动发展新引擎
今天,国家科学技术奖励大会隆重举行,一批为经济社会发展和现代化建设做出杰出贡献的科技工作者受到表彰,充分体现了党中央、国务院对科技事业的高度重视和殷切希望。科技日报代表全国科技界和广大读者向大会的召开表示热烈祝贺!向获奖的科技工作者致以诚挚的敬意! 过去一年是全面深化改革的开局之年,也是科技