攻克多重PCR之难(下篇)
多重PCR能够在提高通量的同时节省样品降低成本,它需要耗费更多的时间和精力,同时也会给用户回报更丰富的数据。本文介绍了一些实验技巧和商业化工具,希望能帮您轻松获得好结果。 原则三、四、五:优化dNTP、MgCl2、聚合酶和盐的浓度 现在剩下的就是调整反应条件了。要一次进行这么多种反应,我们当然不想在反应中缺了哪个组分。一般多重PCR需要更多的dNTP、镁离子和聚合酶。 Nichols推荐使用0.3 mM dNTP(而非标准的0.2 mM)、2.5 mM Mg2+(而非1.2至2 mM)以及每50μL反应体系5 units聚合酶(而非1.25 units)。最后再试试盐浓度,“在优化的时候,增加盐总会有帮助,尤其能增加特异性。” PCR master mix含有缓冲液、盐、dNTP、Mg和聚合酶,如果我们使用常规1.25× 或1.5×的PCR master mix就已经差不多做到了上述原则的三至五......阅读全文
重组酶聚合酶扩增叙述
重组酶聚合酶扩增(RPA),被称为是可以替代PCR的核酸检测技术。RPA技术主要依赖于三种酶:能结合单链核酸(寡核苷酸引物)的重组酶、单链DNA结合蛋白(SSB)和链置换DNA聚合酶。这三种酶的混合物在常温下也有活性,最佳反应温度在37℃左右。重组酶与引物结合形成的蛋白-DNA复合物,能在双链D
聚合酶链式反应
一、材料1. 缓冲液与溶液10X 扩增缓冲液氯仿4 种 dNTP 贮存液(20 mmol/L,pH 8.0)2. 酶与缓冲液热稳定 DNA 聚合酶3. 凝胶聚丙烯酰胺凝胶或琼脂糖凝胶4. 核苷酸与寡聚核苷酸旁观者 DNA正向引物(20 μmol/L)及
RNA聚合酶的特点介绍
RNA聚合酶催化RNA的合成,其与DNA聚合酶有许多相同的催化特点: ①以DNA为模板; ②催化核苷酸通过聚合反应合成核酸; ③聚合反应是核苷酸形成3’,5’一磷酸二酯键的反应; ④以3’→5’方向阅读模板,5’→3’方向合成核酸; ⑤按照碱基配对原则忠实转录模板序列。
聚合酶的基本分类
可分为以下几个类群:(1)依赖DNA的DNA聚合酶;(2)依赖RNA的DNA聚合酶;(3)依赖DNA的RNA聚合酶;(4)依赖RNA的RNA聚合酶。前两者是DNA聚合酶,它使DNA复制链按模板顺序延长。如在原核生物中仅就大肠杆菌中已被发现的就有三种(分别简称为PolⅠ,PolⅡ和PolⅢ等);DNA
聚合酶链式反应
实验方法原理实验材料热稳定 DNA 聚合酶旁观者 DNA正向引物反向引物模板 DNA试剂、试剂盒扩增缓冲液氯仿dNTP 贮存液仪器、耗材聚丙烯酰胺凝胶或琼脂糖凝胶屏蔽型枪头离心管正向排液式移液器PCR仪实验步骤一、材料1. 缓冲液与溶液10X 扩增缓冲液氯仿4 种 dNTP 贮存液(20 mmol/
反向聚合酶链反应技术
我们描述一种大聚合酶链反应(PCR)应用的方法,使在已知序列的核心区边侧的未知 DNA成几何级数扩增。用适当的限制性内切裂解含核心区的DNA,以产生适合于PCR扩 增大小的片段,然后片段的末端再连接形成环状分子。PCR的引物同源于环上核心区 的末端序列,但其方向性,使链的延长经过环上的未知区而不是
关于聚合酶链反应引物的量和TaqDNA聚合酶的量的介绍
(一)引物的量 引物在PCR反应中的浓度一般在0.1~1μmol/L之间。浓度过高易形成引物二聚体且产生非特异性产物。一般来说用低浓度引物经济、特异,但浓度过低,不足以完成30个循环的扩增反应,则会降低PCR的产率。 (二)TaqDNA聚合酶的量 典型PCR反应混合物中,所用酶浓度为2.5
安捷伦HPLC维护
一、如何处理 HPLC 中的盐带来的问题? 很多问题是由于流动相含有盐成分造成的。建议在清洗时将水加热后再冲洗,这样既可以将盐溶解的更好,也可以溶解一些脂溶性物质,会减少很多问题的发生,包括管路堵塞,盐析出,基线噪音…… 二、安捷伦1100及1200液相泵的日常维护 泵是
安捷伦质谱软件平台支持所有安捷伦质谱仪器
丹佛,ASMS,2008年6月2日 安捷伦科技在ASMS上宣布,它扩展了MassHunter工作站软件,增加了许多新功能、新模块,并支持所有安捷伦的质谱仪器。 安捷伦的质谱产品线现在包括:四款单级四极杆液质联用仪(LC/MS),两款精确质量测定的飞行时间LC/MS,三款精确质量测定的Q-TOF
安捷伦发布AffinityScript一步法RTPCR试剂盒
安捷伦科技公司发布用于克隆、基因表达和定量的一步法RT-PCR试剂盒 2010年1月6日,北京安捷伦科技公司(NYSE:A)今天宣布推出了AffinityScript 一步法 RT-PCR试剂盒。这一试剂盒的问世意味着安捷伦Stratagene 产品部又一次携市场领先的高性能解决方案挺进一
关于基因扩增技术—聚合酶链反应的影响因素耐热DNA聚合酶的介绍
基因扩增技术—聚合酶链反应之所以能得到广泛应用,主要是因为Taq DNA聚合酶取代了大肠杆菌DNA聚合酶I大片段。Taq DNA聚合酶是从水生栖热菌Thermus Aquaticus(Taq)中分离出的热稳定性DNA聚合酶,使用Taq DNA聚合酶不仅简化了PCR程序,也极大地增加了基因扩增技术
RNA聚合酶的基本信息
RNA聚合酶(RNA polymerase)是以一条DNA链或RNA为模板,三磷酸核糖核苷为底物、通过磷酸二酯键而聚合的合成RNA的酶,因为在细胞内与基因DNA的遗传信息转录为RNA有关,所以也称转录酶。
修复聚合酶的基本信息
中文名称修复聚合酶英文名称repair polymerase定 义参与DNA修复过程,依赖于DNA的DNA聚合酶。该酶以双链DNA中未损坏的链为模板,合成新片段置换因损坏而被切除的片段。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)
RNA聚合酶的基本信息
RNA聚合酶(RNA polymerase)是以一条DNA链或RNA为模板,三磷酸核糖核苷为底物、通过磷酸二酯键而聚合的合成RNA的酶,因为在细胞内与基因DNA的遗传信息转录为RNA有关,所以也称转录酶。
聚合酶链式反应(PCR)
PCR技术可用于:(1)检验感染性疾病是否处于隐性或亚临床状态;(2)有效检测癌基因的突变,准确检测癌基因的表达量;(3)临床应用于检测地中海贫血的基因突变。实验方法原理基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成
耐热DNA聚合酶的应用介绍
DNA序列测定中应用的耐热DNA聚合酶 1.Promega公司测序级TaqDNA聚合酶 是在TaqDNA聚合酶的基础上对它进行修饰,去除5'-3'外切酶活性,保证测序记过的高度准确性,可产生强度均一的测序条带,背景清晰。 2.Bca Best DNA 聚合酶 从Bacil
聚合酶链[式]反应的定义
中文名称聚合酶链[式]反应英文名称polymerase chain reaction;PCR定 义通过DNA互补双链解链、退火和聚合延伸的多次循环来扩增DNA特定序列的方法。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞生物学技术(二级学科)
反向聚合酶链反应的定义
中文名称反向聚合酶链反应英文名称inverse PCR;iPCR定 义用于扩增已知序列的DNA旁侧未知序列的方法。即先用在已知DNA序列上没有识别位点的限制内切酶,切出包含已知DNA、而两端带有未知序列的区段,将切出的DNA区段环化,然后再按已知的DNA序列设计一对引物进行扩增。应用学科细胞生物学
逆转录聚合酶链反应
逆转录-聚合酶链反应 (Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)的原理是:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得
RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子
RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子转录因子分子量(kD)功能TBP30与TATA盒结合TFⅡ-B33介导RNA聚合酶Ⅱ的结合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35稳定TFⅡ-D的结合TFⅡ-I120促进TFⅡ-D的结合
RNA聚合酶的基本信息
RNA聚合酶(RNA polymerase)是以一条DNA链或RNA为模板,三磷酸核糖核苷为底物、通过磷酸二酯键而聚合的合成RNA的酶,因为在细胞内与基因DNA的遗传信息转录为RNA有关,所以也称转录酶。
聚合酶链反应的基本步骤
主要分为三大步骤:高温变性、低温退火、适温延伸。分别添加引物、模板、Taq酶、dNTP和缓冲液等反应物混合,在约为95℃环境下,双链DNA氢键断裂解旋为单链;单链与人工设计的引物在约为60℃温度下,按照碱基互补配对的原则相结合;并升温到72℃左右,利用Taq酶延伸合成一条新的与模板DNA链互补的半保
聚合酶链式反应(PCR)
聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,为最常用的分子生物学技术之一。典型的PCR由(1)高温变性模板;(2)引物与模板退火;(3)引物沿模板延伸三步反应组成一个循环,通过多次循环反应,使目的DNA得以迅速扩增。其主要步骤是
关于聚合酶链反应的概述
PCR技术是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技术。 它具有特异、敏感、产率高、 快速、 简便、重复性好、易自动化等突出优点。 PCR技术最早由美国Cetus公司人类遗传研究室Kary Mullis及同事于1985年发现并研制成功的;最早的应用报道是Saiki等1985年将PCR技术应用于β-
聚合酶链反应克隆的原理
中文名称聚合酶链反应克隆英文名称PCR cloning定 义应用聚合酶链反应的技术获得DNA分子克隆的方法。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
PCR)聚合酶链式反应
PCR技术可用于:(1)检验感染性疾病是否处于隐性或亚临床状态;(2)有效检测癌基因的突变,准确检测癌基因的表达量;(3)临床应用于检测地中海贫血的基因突变。 实验方法原理 PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。 PCR由变性--退火--
聚合酶链式反应(PCR)
实验概要聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,为最常用的分子生物学技术之一。典型的PCR由(1)高温变性模板;(2)引物与模板退火;(3)引物沿模板延伸三步反应组成一个循环,通过多次循环反应,使目的DNA得以迅速扩增。
RNA聚合酶的基本信息
RNA聚合酶(RNA polymerase)是以一条DNA链或RNA为模板,三磷酸核糖核苷为底物、通过磷酸二酯键而聚合的合成RNA的酶,因为在细胞内与基因DNA的遗传信息转录为RNA有关,所以也称转录酶。
聚合酶链反应的污染来源
1、标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本的容器被污染,或标本放置时,由于密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;标本核酸模板在提取过程中,由于吸样枪污染导致标本间污染;有些微生物标本尤其是病毒可随气溶胶或形成气溶胶而扩散,导致彼此间的污染。2、PCR试剂的污染:主要是由于在PCR
聚合酶链反应构建重组DNA
基本方案 实验方法原理 利用聚合酶链式反应(PCR),任何两个DNA片段可连接成一个新的重组DNA分子。通过在PCR引物中引入的额外非同源的核苷酸,可在连接处