PCR产物测序结果分析

pcr产物测序的最大风险是有在凝胶上看起来的一个条带,实际上有多个分子。也就是说长度相似的分子有可能在电泳的时候只有一条带。如果只是进行pcr产物回收,没有进行凝胶分离的过程的话,东西可能更多了。问题就在于,如果出现双峰或者多峰,这个样品就白送了,什么也结果也没有。特别你现在用的还是简并引物,本身目标就是为了能扩增出目标片段来,比较建议先做ta克隆,然后测序的时候,最好挑几个克隆去测,不要只送一个克隆。现在测序也不贵,这样一次测上几个克隆,也可以确认在扩增出来的片段中,是否只有一个分子,还是其实有多个不同序列的片段。另外,长度选择的问题,既然设计了简并引物,就是要钓取目前序列还未知的基因,可以选择从长片段开始测序,根据这个结果再考虑短的片段是否需要再继续测序。只有拿到目标序列了,才能决定下一步采用什么方式来获得全长的基因片段。......阅读全文

PCR产物的TA克隆

TA克隆 系统可以用于快速地、一步到位地把PCR 产物直接插入到质粒载体的多克隆 位点(MCS)中。实验方法原理PCR产物克隆大致分为两类,即平头连接和粘头连接。平头连接是将制备好的平头载体和补平或削平的PCR 产物直接进行连接。载体可用EcoR V或Sma I切成平头;PCR 产物纯化后,可以在2

PCR产物测序结果分析

pcr产物测序的最大风险是有在凝胶上看起来的一个条带,实际上有多个分子。也就是说长度相似的分子有可能在电泳的时候只有一条带。如果只是进行pcr产物回收,没有进行凝胶分离的过程的话,东西可能更多了。问题就在于,如果出现双峰或者多峰,这个样品就白送了,什么也结果也没有。特别你现在用的还是简并引物,本身目

PCR产物电泳结果分析

基因组样品的模板量摸一个浓度吧,这个模板浓度不太合适。PCR产物以smear的形式出现,要么是样本降解,要么就是完全没有特异的扩增。要通过PCR筛选基因敲除的小鼠,最基本的要求就是引物特异性好,扩增效率高。不然没法筛选的。如果这对引物之前筛选过,你可以换换模板,重新合成下引物就行,如果完全没有用于筛

PCR产物电泳结果分析

第一步我们先来看看第二泳道,我们能看见两条电泳带,一般的质粒在跑完电泳之后都会出现这种情况,因为质粒是很容易开的接着会变成线性或者是半线性和半环状的,环状的会比线性的跑的快。2第二步我们再看下电泳带上面那条浅的也就是开链的质粒,再它的下面就是环状的质粒,不过这也不打紧,一般情况都是这样的。3接着我们

PCR产物的检测PCRELISA法

在一个引物的5’端标记上生物素以便使其能与包被板上的亲合素结合而固定PCR产物,而在另一引物的5’端标记FITC,用HRP标记的抗FITC抗体与之结合显色,即可进行常规ELISA检测。如设立标准对照,此技术还可用于定量分析。 【试剂与配置】 包被液:4.3mmol/L Na2HPO4,

酶切后产物可以做pcr产物回收么

如果没有其他杂带就可以。单一条带的PCR产物,如果酶切后也只有一条带,就可以用产物回收试剂盒回收。但如果酶切后有杂带或多条带,就只能做胶回收。

PCR扩增产物的鉴定

实验原理生物大分子如蛋白质、核酸、多糖等常以颗粒分散在溶液中.它们的净电荷取决于介质的H 浓度或与其他大分子的相互作用。在电场中,带电颗粒向阴极或阳极迁移.迁移的方向取决于它们带电的符号.这种迁移现象即谓电泳。迁移的方式目前可以根据分子尺寸大小、分子所带的电荷或分子的生物学与化学特性分为三类

PCR扩增产物的克隆

 PCR扩增产物的克隆可以:(1)获得目的DNA片段;(2)用于原核表达的研究;(3)广泛应用于分子生物学相关研究。平端连接法实验方法原理平头连接是将制备好的平头载体和补平或削平的PCR产物直接进行连接。载体可用EcoR V或Sma I切成平头;PCR产物纯化后,可以在22℃用DNA聚合酶I作用30

PCR扩增产物的克隆

实验方法原理 平头连接是将制备好的平头载体和补平或削平的PCR产物直接进行连接。载体可用EcoR V或Sma I切成平头;PCR产物纯化后,可以在22℃用DNA聚合酶I作用30min(利用该酶所具有的3’→5’外切酶活性和5’→3’的聚合酶活性)。如果要求不高,PCR产物也可不加处理。如果使用Str

PCR-产物电泳银染实验

实验方法原理 聚丙烯酰胺凝胶(PAG)是由丙烯酰胺单体和交联剂亚甲基双丙烯酰胺,在引发剂过硫酸胺(AP)提供自由基和催化剂四甲基乙二胺(TEMED)的作用下聚合而成。丙烯酰胺可由天然光线诱发聚合,所以其水溶液应贮藏在棕色瓶中,置低温 4℃ 更佳。由于其水溶液稳定性较差,通常 2 个月内用完为好。

克隆PCR产物的最优条件

最佳插入片段: 载体比需实验确定,4:1(插入片段:载体)常为最佳比,摩尔数比1:8 或8:1也行。应测定比值范围。连接用5μL2X连接液,50ng质粒DNA,1Weiss单位的T4连接酶,插入片段共10μL。室温保温1h,或4℃过夜。在这2种温度下,缺T-凸出端的载体会自连,产生蓝斑。室温

PCR-产物电泳银染实验

            实验方法原理聚丙烯酰胺凝胶(PAG)是由丙烯酰胺单体和交联剂亚甲基双丙烯酰胺,在引发剂过硫酸胺(AP)提供自由基和催化剂四甲基乙二胺(TEMED)的作用下聚合而成。丙烯酰胺可由天然光线诱发聚合,所以其水溶液应贮藏在棕色瓶中,置低温 4℃ 更佳。由于其水溶液稳定性

PCR扩增产物的克隆

平端连接法 TA克隆法             实验方法原理 平头连接是将制备好的平头载体和补平或削平的PCR产物直接进行连接。载体可用EcoR V或Sma I切成平头;P

PCR-产物电泳银染实验

常用的核酸电泳法有两种。①水平电泳:琼脂糖凝胶,紫外光下判断条带。此法经济省时,但分辨率较低。②垂直电泳:聚丙烯酰胺凝胶,可见光下判断条带。此法相对费力,但分辨率较高。分辨率高是聚丙烯酰胺电泳法被优先用于克隆性基因重排条带判断的关键。在聚丙烯酰胺凝胶上较宽弥散被判断为假阳性(阴性)的条带,在琼脂糖胶

PCR产物的平末端克隆

常规采用的技术路线,实验一般利用噬菌体 T4 DNA 聚合酶等补平扩增 DNA 片段的末端(Weiner 1993; Chuang et al. 1995)。Liu 与 Schwartz (1992) 发现在连接反应的温育过程中,当反应液中存在过量的限制性内切核酸酶能显著地增加重组质粒的产率

PCR扩增产物的鉴定

实验原理生物大分子如蛋白质、核酸、多糖等常以颗粒分散在溶液中.它们的净电荷取决于介质的H 浓度或与其他大分子的相互作用。在电场中,带电颗粒向阴极或阳极迁移.迁移的方向取决于它们带电的符号.这种迁移现象即谓电泳。迁移的方式目前可以根据分子尺寸大小、分子所带的电荷或分子的生物学与化学特性分为三类。如

详细介绍PCR产物克隆方法

  克隆方法:  1. 平端连接  通常情况下,PCR产物可直接与平端载体DNA进行连接,但其连接效率效低。因为TaqDNA聚合酶具有非模板依赖性末端转移酶活性,能在两6条DNA链的3''末端加上一个多余的碱基,使合成的PCR产物成为3''突出一个碱基的DNA分子。这

PCR产物的平末端克隆

            实验方法原理 靶基因经 PCR 扩增,样品进行必要的纯化回收后,接下来用平末端进行连接克隆也是分子生物学实验中常规采用的技术路线,实验一般利用噬菌体 T4 DNA 聚合酶等补平扩增 DNA 片段的末端(Weiner 1993; Chuan

PCR产物的平末端克隆

靶基因经 PCR 扩增,样品进行必要的纯化回收后,接下来用平末端进行连接克隆也是分子生物学实验中常规采用的技术路线,实验一般利用噬菌体 T4 DNA 聚合酶等补平扩增 DNA 片段的末端(Weiner 1993; Chuang et al. 1995)。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译

如何知道PCR产物的大小

如果你的模板序列已知的话,直接将引物序列和模板进行匹配,两条引物之间的DNA片段长度即为目的PCR产物的大小;如果你是想知道PCR仪反应后的产物大小,可以跑琼脂糖凝聚电泳,照胶仪下根据Marker的指示条带读取产物的大小,或者可以用照胶仪自带的软件直接读出所有pcr产物条带的大小

PCR扩增产物的鉴定

实验概要PCR扩增产物可以通过酶切分析、凝胶电泳(琼脂糖电泳、聚丙烯酰胺电泳、毛细管电泳等)、Southern杂交、克隆、测序等方法分析,电泳前还可以应用紫外分光光度计定量DNA。当采用凝胶电泳时也有溴化乙锭显色、银染法、荧光显色等不同的显色方法。本实验室采用的是非变性连续缓冲系统聚丙烯酰胺凝胶垂直

PCR产物的T载体克隆

(一)重组T质粒的构建一.原理外源DNA与载体分子的连接就是DNA重组,这样重新组合的DNA叫做重组体或重组子。重组的 DNA分子是在DNA连接酶的作用下,有Mg2+、ATP存在的连接缓冲系统中,将分别经酶切的载体分子与外源DNA分子进行连接。DNA连接酶有两种:T4噬菌体DNA连接酶和大肠杆菌

PCR扩增产物的鉴定

PCR扩增产物的鉴定实验原理生物大分子如蛋白质、核酸、多糖等常以颗粒分散在溶液中.它们的净电荷取决于介质的H 浓度或与其他大分子的相互作用。在电场中,带电颗粒向阴极或阳极迁移.迁移的方向取决于它们带电的符号.这种迁移现象即谓电泳。迁移的方式目前可以根据分子尺寸大小、分子所带的电荷或分子的生物学与化学

如何知道PCR产物的大小

电泳,加Marker对照着估计

免疫PCR(ImmunoPCR)概念、组成和免疫PCR产物的检测

(一) 免疫PCR技术的概念免疫PCR是一种抗原检测系统,将一段已知序列的DNA片段标记到抗原抗体复合物上,再用PCR方法将这段DNA扩增,然后用常规方法检测PCR产物。免疫PCR集PCR的高灵敏度与抗体和抗原反应的特异性于一体。其突出的特点是指数级的扩增效率带来了极高的敏感度,能检出浓度低至2ng

PCR产物的电泳检测时间

 一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚致消失。 假阴性,不出现扩增条带  PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及, ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。  模板:①模板中含有杂蛋白质,②模板中含有Taq酶抑制剂,③

制备克隆用PCR产物的纯化

实验方法原理 PCR 产物经酚:氯仿抽提、乙醇沉淀及其他一些常用方法纯化后,DNA 样品内还往往残留了一些具有酶活性的 Taq DNA 酶与另外一些热稳定 DNA 聚合酶(Cioweetal. 1991; Bamesl992)。这些残余的 DNA 聚合酶连同一些残余的 dNTP 的持续存

PCR扩增产物鉴定与纯化

实验原理琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR扩增产物。(原理参照琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验)本实验使用了TaKaRa公司的胶纯化试剂盒(Agarose Gel DNA Purification Kit),该试剂盒是从琼脂糖凝胶中回收并纯化DNA片段的试剂盒。试剂盒采用了独特的凝胶融解系统,结合DNA制

制备克隆用PCR产物的纯化

            实验方法原理 PCR 产物经酚:氯仿抽提、乙醇沉淀及其他一些常用方法纯化后,DNA 样品内还往往残留了一些具有酶活性的 Taq DNA 酶与另外一些热稳定 DNA 聚合酶(Cioweetal. 1991; Bamesl992)。这些残余的

用-dUTP-净化-PCR-产物的实验

试剂、试剂盒 dNTP 溶液 MgCl2 溶液PCR 缓冲液引物尿嘧啶-DNA-糖基酶 Taq DNA 聚合酶仪器、耗材 PCR 仪离心管实验步骤 一、材料1. 试剂(1)dNTP溶液(含有dATP、dCTP、dGTP和dUTP,每种浓度10 mmol/L)多数情况下,直接替换dUTP就可以