PCR产物测序结果分析

pcr产物测序的最大风险是有在凝胶上看起来的一个条带,实际上有多个分子。也就是说长度相似的分子有可能在电泳的时候只有一条带。如果只是进行pcr产物回收,没有进行凝胶分离的过程的话,东西可能更多了。问题就在于,如果出现双峰或者多峰,这个样品就白送了,什么也结果也没有。特别你现在用的还是简并引物,本身目标就是为了能扩增出目标片段来,比较建议先做ta克隆,然后测序的时候,最好挑几个克隆去测,不要只送一个克隆。现在测序也不贵,这样一次测上几个克隆,也可以确认在扩增出来的片段中,是否只有一个分子,还是其实有多个不同序列的片段。另外,长度选择的问题,既然设计了简并引物,就是要钓取目前序列还未知的基因,可以选择从长片段开始测序,根据这个结果再考虑短的片段是否需要再继续测序。只有拿到目标序列了,才能决定下一步采用什么方式来获得全长的基因片段。......阅读全文

PCR产物克隆

PCR克隆主要有TA克隆法, 限制性酶切与连接法,杂交法和近期开发出来的特异性重组法等。但因为TA克隆法操作最简单,快速和高效的原因,成为Taq聚合酶PCR产物的最佳克隆方法。TA克隆法由Invitrogen发明,并拥有全球TA Cloning商标的ZL权。TA克隆方法(Original TA Cl

PCR产物克隆

克隆方法:1. 平端连接   通常情况下,PCR产物可直接与平端载体DNA进行连接,但其连接效率效低。因为TaqDNA聚合酶具有非模板依赖性末端转移酶活性,能在两6条DNA链的3''''末端加上一个多余的碱基,使合成的PCR产物成为3'''&#

PCR产物克隆

克隆方法:1. 平端连接   通常情况下,PCR产物可直接与平端载体DNA进行连接,但其连接效率效低。因为TaqDNA聚合酶具有非模板依赖性末端转移酶活性,能在两6条DNA链的3''末端加上一个多余的碱基,使合成的PCR产物成为3''突出一个碱基的DNA分子。这种DN

PCR技术(十六):PCR产物测序

PCR技术代替了为测序而反复进行的分子克隆和模板制备步骤。PCR技术与自动测 序技术相结合后,它将成为一种最快、最有效的测定核苷权序列的方法。本章主要综 述各种测模板的制备以及如何完成PCR产物的直接测序。与传统的将PCR片段克隆入质 粒或病毒基因组相比,直接序列分析有两个主要的优点:1)由于它是一

PCR产物的克隆

PCR产物克隆大致分为两类,即平头连接和粘头连接。平头连接是将制备好的平头载体和补平或削平的PCR 产物直接进行连接。载体可用EcoR V或Sma I切成平头;PCR 产物纯化后,可以在22℃用DNA聚合酶I作用30min(利用该酶所具有的3’→5’外切酶活性和5’→3’的聚合酶活性)。如果要求

PCR-产物纯化实验

试剂、试剂盒 TE 或去离子水PCR 产物仪器、耗材 离心机和转子PCR 滤 件微量离心管实验步骤 一、材料1. 缓冲液和溶液TE(lOmmol/L Tris-HCl,lmmol/L EDTA,pH7.5) 或去离子水2. 核酸和寡核苷酸待测序的 PCR 产物3. 离心机和转子带有固定倾角转子的小型

PCR-产物纯化实验

            试剂、试剂盒 TE 或去离子水 PCR 产物 仪器、耗材 离心机和转子 PCR 滤 件

PCR-产物定量实验

测序之前对模板精确定量至关重要。根据 DNA 用量的多少,有几种不同的方法可供选择。下面介绍另外两种方法:荧光测定法和比较溴化物染色法。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒DNA 标准TEPCR 产物仪器、耗材荧光计金属箔纸微量离心管实验步骤方法 A: 荧光测定

PCR-产物定量实验

试剂、试剂盒 DNA 标准TEPCR 产物仪器、耗材 荧光计金属箔纸微量离心管实验步骤 方法 A: 荧光测定法荧光测定法可以在纳克级范围精确定量。荧光计和 DNA 定量试剂盒许多公司都有出售。确定荧光计是否安装了适合于特定染料的激发和发射的部件至关重要。该方法在设计上适用于配有带蓝色 LED

PCR产物克隆方法

平端连接 通常情况下,PCR产物可直接与平端载体DNA进行连接,但其连接效率效低。因为TaqDNA聚合酶具有非模板依赖性末端转移酶活性,能在两6条 DNA链的3'末端加上一个多余的碱基,使合成的PCR产物成为3'突出一个碱基的DNA分子。这种DNA分子的连接效率很低。由

PCR产物污染诱因

PCR反应的zui大特点是不仅具有较大扩增能力而且还有着极高的灵敏性,但令人头痛的问题是易污染,极其微量的污染即可造成假阳性的产生。污染原因(1)标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本的容器被污染,或标本放置时,由于密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;标本核酸模板在提取过程中,

PCR产物的克隆

 PCR产物克隆大致分为两类,即平头连接和粘头连接。   平头连接是将制备好的平头载体和补平或削平的PCR产物直接进行连接。载体可用EcoR V或Sma I切成平头;PCR产物纯化后,可以在22℃用DNA聚合酶I作用30min(利用该酶所具有的3’→5’外切酶活性和5’→3’的聚合酶活性)。如果要求

PCR-产物定量实验

            试剂、试剂盒 DNA 标准 TE PCR 产物 仪器、耗材 荧光计 金属箔纸

PCR-产物纯化实验

介绍一个采用 AmiconMicrocon-PCR 滤件(Millipore) 的方法,有效地去除冗余dNTP 和引物的方法纯化 PCR 产物。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒TE 或去离子水PCR 产物仪器、耗材离心机和转子PCR 滤 件微量离心管实验步骤

PCR产物保存时间

未纯化的PCR产物-20℃放上一周没有什么问题。纯化后若以干粉状态可在-20℃保存好几个月,若溶于Tris可保存一两个月。注意不要用纯水溶解。

PCR产物的克隆

PCR 产物的克隆 PCR 产物克隆大致分为两类,即平头连接和粘头连接。    平头连接是将制备好的平头载体和补平或削平的 PCR 产物直接进行连接。载体可用EcoR V 或 Sma I 切成平头; PCR 产物纯化后,可以在 22 ℃用DNA聚合酶I作用30min(利用该酶所具有的3’→5’外切酶

PCR产物纯化方法

Purification of PCR Products in Preparation for CloningJoseph SambrookPeter Maccallum Cancer Institute and The University of Melbourne, AustraliaDavid

简述PCR-产物纯化

PCR 反应完成目标 DNA 的扩增后,PCR 产物可以用于进一步的研究,例如用于 DNA 测序、克隆、分析基因的功能和表达等。然而,通过 PCR 反应后体系中仍然存在具有活性的 DNA 聚合酶,剩余的 dNTP、引物以及反应缓冲体系中的各种金属离子等。因此,我们必须通过一定的方法从反应体系中提纯

PCR技术(十):PCR产物克隆方法

平端连接  通常情况下,PCR产物可直接与平端载体DNA进行连接,但其连接效 率效低。因为TaqDNA聚合酶具有非模板依赖性末端转移酶活性,能 在两6条DNA链的3'末端加上一个多余的碱基,使合成的PCR产物成为 3'突出一个碱基的DNA分子。这种DNA分子的连接效率很低。由于PCR

PCR产物电泳结果分析

基因组样品的模板量摸一个浓度吧,这个模板浓度不太合适。PCR产物以smear的形式出现,要么是样本降解,要么就是完全没有特异的扩增。要通过PCR筛选基因敲除的小鼠,最基本的要求就是引物特异性好,扩增效率高。不然没法筛选的。如果这对引物之前筛选过,你可以换换模板,重新合成下引物就行,如果完全没有用于筛

PCR产物的电泳鉴定

一、准备工作1、实验器具与材料:(1)移液枪:10ul(2)吸头:20ul(3)吸头台:放置200ul和20ul的吸头一个(4)三角烧瓶:50ml一个(5)琼脂糖2、实验器具的处理与准备(1) 塑料制品:(包括吸头等)送至高压3次,试验前将枪头放入吸头台。(2)电泳板及电泳槽:用自来水冲洗干净备用3

PCR产物的电泳鉴定

一、准备工作1、实验器具与材料:(1)移液枪:10ul(2)吸头:20ul(3)吸头台:放置200ul和20ul的吸头一个(4)三角烧瓶:50ml一个(5)琼脂糖2、实验器具的处理与准备(1) 塑料制品:(包括吸头等)送至高压3次,试验前将枪头放入吸头台。(2)电泳板及电泳槽:用自来水冲洗干净备用3

PCR产物电泳结果分析

基因组样品的模板量摸一个浓度吧,这个模板浓度不太合适。PCR产物以smear的形式出现,要么是样本降解,要么就是完全没有特异的扩增。要通过PCR筛选基因敲除的小鼠,最基本的要求就是引物特异性好,扩增效率高。不然没法筛选的。如果这对引物之前筛选过,你可以换换模板,重新合成下引物就行,如果完全没有用于筛

PCR产物的回收纯化

PCR产物的回收纯化的目的是:高质量DNA;除去蛋白(如酶等),RNA,无机盐(NaCl超过150 mM对T4连接酶有抑制作用),小于100 bp的短片段(如引物DNA),有机小分子(如dNTP、Agrose、EB、甘油、矿物油)。

PCR产物的TA克隆

实验概要本实验介绍了DNA回收和连接的基本原理,PCR产物的T-vector克隆。实验原理1. DNA片段回收方法:DNA片段在适当浓度的琼脂糖凝胶中,通上一定电压进行电泳,不同大小的DNA分子由于迁移率的不同而分离开。切下带有所需DNA片段的凝胶,用冻融法、玻璃奶回收法或商品化胶回收试剂盒将目的片

PCR产物的TA克隆

TA克隆 系统可以用于快速地、一步到位地把PCR 产物直接插入到质粒载体的多克隆 位点(MCS)中。实验方法原理PCR产物克隆大致分为两类,即平头连接和粘头连接。平头连接是将制备好的平头载体和补平或削平的PCR 产物直接进行连接。载体可用EcoR V或Sma I切成平头;PCR 产物纯化后,可以在2

PCR产物电泳严重拖带

有可能是你的胶点样孔不整齐,就是你做胶的时候胶没有凝固好,你可以试试重新做块胶。PCR拖带产生原因有很多,不知道楼主属于哪一种:1、退火温度较低,可以提高2到3度2、Mg离子浓度一般的PCR在1.5mM就可以了,不知楼主用的多少3、模板浓度较高或者含有其他PCR抑制剂,建议稀释下模板4、延伸时间一般

PCR产物的TA克隆

实验原理DNA片段回收方法:DNA片段在适当浓度的琼脂糖凝胶中,通上一定电压进行电泳,不同大小的DNA分子由于迁移率的不同而分离开。切下带有所需DNA片段的凝胶,用冻融法、玻璃奶回收法或商品化胶回收试剂盒将目的片段回收纯化。2. 利用Taq酶能够在PCR产物的3’末端加上一个非模板依赖的A,而T载体

PCR产物测序结果分析

pcr产物测序的最大风险是有在凝胶上看起来的一个条带,实际上有多个分子。也就是说长度相似的分子有可能在电泳的时候只有一条带。如果只是进行pcr产物回收,没有进行凝胶分离的过程的话,东西可能更多了。问题就在于,如果出现双峰或者多峰,这个样品就白送了,什么也结果也没有。特别你现在用的还是简并引物,本身目

PCR产物电泳结果分析

第一步我们先来看看第二泳道,我们能看见两条电泳带,一般的质粒在跑完电泳之后都会出现这种情况,因为质粒是很容易开的接着会变成线性或者是半线性和半环状的,环状的会比线性的跑的快。2第二步我们再看下电泳带上面那条浅的也就是开链的质粒,再它的下面就是环状的质粒,不过这也不打紧,一般情况都是这样的。3接着我们