深圳先进院发表数据聚类挖掘技术最新研究成果
近日，中国科学院深圳先进技术研究院高性能计算研究中心客座研究生魏丹的研究成果A novel hierarchical clustering algorithm for gene sequences发表在BMC Bioinformatics期刊，并被SCI检索（006EI）。 数据聚类挖掘技术是处理生物信息强有力的工具，广泛应用于序列分析、基因识别及基因序列功能预测等课题。在先进院深圳市高性能数据挖掘重点实验室姜青山研究员和魏彦杰副研究员的指导下，魏丹定义了一个新的序列间相似性度量，并提出基因序列聚类新方法。该研究成果与传统的序列比对聚类方法相比，具有聚类精度高、时间开销低等特点，为处理大规模基因序列数据提供了有效的解决方案。 BMC Bioinformatics杂志是英国BMC（BioMed Central）杂志社出版的在线刊物，旨在发表高水准生物信息学领域的研究成果。 ......阅读全文
蛋白质数据+基因序列精准构建进化树
西班牙基因组调控研究中心的科学家们在最新一期《自然·通讯》上发表了一项创新研究，展示了如何利用蛋白质三维形状，解开生命中古老的“历史密码”，揭示了生命之树中最古老的进化关系。这项研究首次将蛋白质的形状数据与基因序列数据结合，提高了进化树的准确性。蛋白质结构解决“饱和问题”（艺术概念图）。图片来源：《
遗传发育所等解析盐芥全基因组序列
盐芥是十字花科盐芥属的一种盐生植物，与双子叶植物研究中所常用的模式植物拟南芥亲缘关系较近。盐芥具有作为模式植物的一系列良好特征，如个体较小、生活周期短、自花授粉、种子量大、基因组较小，而且易于转化。最重要的是，盐芥具有对高盐、干旱和低温等非生物胁迫极高的耐受能力，这使其成为研究植物耐受非生物胁迫
《自然》：2种疟疾寄生虫基因组序列测定
疟疾裂殖子 一个由美英等国科学家组成的国际研究小组近日测定了两种致命疟疾寄生虫的基因组序列。这两种疟疾寄生虫分别名为Plasmodium knowlesi和Plasmodium vivax，其中P. knowlesi最近被认为是感染人类的一个主要疟疾病原体，而P. vivax则会致人极度虚弱，
我国首获濒危物种白头叶猴全基因组序列
广西林业局11日提供的信息显示，中国首次获得濒危物种白头叶猴全基因组序列，揭示了白头叶猴能够在富含矿物离子的高碱性喀斯特山地长久生存的基因组遗传特征秘密。 白头叶猴是中国特有的生物物种，其体毛以黑色为主，与黑叶猴不同的是头部高耸着一撮直立的白毛。白头叶猴仅分布在广西崇左左江和明江间不足200平
台湾首例猴痘病人病情严重，基因序列出炉
据台湾“中央社”报道，台湾6月底出现首例境外移入的猴痘病例，台“疾病管制署”7日公布此个案病毒全基因序列，确认为死亡率较低的B.1西非株基因型。 台“疾病管制署”6月24日公布台湾地区出现首例猴痘境外移入病例，为20多岁台湾男性，自德国返台后出现发烧、喉咙痛、肌肉酸痛、身体出现红疹及鼠蹊部淋巴肿
我国完成世界首张－西瓜基因组序列图谱
由北京市农林科学院蔬菜平台牵头，联合了中国农业科学院、深圳华大基因科技有限公司、美国康奈尔大学、荷兰瑞克斯旺等优势单位，共同完成了世界首张西瓜基因组序列图谱绘制与破译，获得了高质量的西瓜基因组序列图谱，成为由中国主导完成的世界第一张西瓜基因组序列
我国科学家开发高效基因组序列分析工具
人类的疾病易感性和生理特征等常见性状的差异，往往由DNA序列变化造成，这些DNA片段缺失、增加、异位等变化被统称为遗传变异。全基因组关联研究（Genome-Wide Association Study，GWAS）是通过比对大量人群的遗传信息，利用统计学检测遗传变异和性状之间关联性的方法。西湖大学
我国自主完成首个果树作物基因组序列图谱
华中农业大学今天透露，该校科研人员经过一年多努力，已绘制完成甜橙的全基因组序列图谱。这是我国自主完成的第一个果树作物基因组序列图谱。这一农业科技基础研究成果，将对加快我国柑橘品种改良，改变柑橘品种大量依赖进口的状况，提升我国柑橘产业的核心竞争力起到重要作用。 据悉，柑橘是世界栽培面积
关于H7N9禽流感的基因序列介绍
科学家们说，一种此前从未在人体内发现的致命禽流感病毒的基因序列数据显示，这一病毒已经发生某些可能使之更易在人类中大流行的变异。 2013年4月3日，迄今没有证据显示，H7N9禽流感病毒正在人际间传播，也存在以下可能性：这种病毒可能会逐渐销声匿迹，不会完全变异为一种人流感。就在中国宣布已确诊多例
－克雷格·文特尔：组建基因序列公司改善人类寿命
本月，基因组学创业家克雷格·文特尔(Craig Venter，见上图)宣布了他的最新冒险：组建一家公司，来创造出关于人类健康的所谓最全面的数据集，以应对衰老带来的疾病。 这家位于美国圣迭戈的“人类寿命”(Human Longevity)公司表示，将使用Illumina公司新的高通量
我国完成世界首张西瓜基因组序列图谱
我国主导完成世界首张西瓜基因组序列图谱的绘制与破译，相关研究成果于北京时间11月26日凌晨在国际学术顶级刊物《自然·遗传学》上在线发表。 西瓜是全球重要的经济作物和夏季消暑水果，但就是这样一种常见的水果，人们却始终未能从内到外了解它。过去，各国科学家虽然知道栽培西瓜遗传多样性狭窄是制约西瓜
蚂蚁基因组序列被破译－有助探究人类衰老根源
美国科学家8月30日表示，他们首次绘制出了两种蚂蚁的全基因组序列图。此举可为科学家更好地了解人类衰老以及行为表现提供帮助。 该研究项目的负责人、纽约大学兰贡医疗中心的生化学教授丹尼·赖因伯格说：“蚂蚁是绝对的社会动物，蚂蚁个体的生存要依靠蚂蚁群体，这与我们人类非常相似。无论是工蚁、兵
美研究称基因序列预测长寿准确率高达77％
美国研究人员宣布，他们发现基因序列可以预测人能否长寿，预测准确率高达77%。研究论文7月1日由《科学》（Science）杂志发表。长寿老人多有长寿基因 波士顿大学一个研究小组调查1000多名百岁老人，根据收集数据开发出一个基因分析系统。使用这个系统，可以预测人们是否有相当大机会“格外
新算法TRFill解决生物基因组重复序列组装难题
近日，中国农业科学院农业基因组研究所农业基因组学技术研发与应用创新团队开发出了一种新算法——TRFill，解决了现有工具无法完全填补基因组间隙的难题，显著提升了基因组质量。相关研究成果发表在《基因组生物学》（Genome Biology）上。 动植物基因组的许多区域存在大量高度重复的DNA片段
加深癌症了解！新基因工具可按时序编辑DNA序列
据物理学家组织网23日报道，美国研究人员在最新一期《分子细胞》杂志撰文指出，他们发明了一种新基因编辑技术，可按时间顺序对切割点或编辑点进行编辑，有望促进癌症研究等领域的发展。 基因编辑领域的“当红炸子鸡”CRISPR使科学家能改变细胞内DNA的序列，或添加所需序列或基因。CRISPR使用名为C
关于真核基因组的高度重复序列的介绍
1、真核基因组的高度重复序列— 简介 高度重复序列在基因组中重复频率高，可达10^3以上，因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异，约占10-60%，在人基因组中约占20%。高度重复顺序又按其结构特点分为三种。 2、真核基因组的高度重复序列—倒位重复序列 这种重复顺序复性速度极快，即
益生乳酸菌全基因组序列测定完成
内蒙古农业大学正式公布,益生乳酸菌的全基因组序列测定分析全部完成,这是我国第一个完成的乳酸菌基因全序列测定。 由内蒙古农业大学“乳品生物技术与工程”教育部重点实验室主持进行的益生乳酸菌的全基因组序列测定Lb.casei Zhang科技项目是经过6年分离、筛选,并进行系统研究开发的具有完全自主知识产
深圳华大基因研究院完成大熊猫基因组序列图谱
揭开大熊猫黑眼圈的奥秘 深圳华大基因研究院十月十一日在深圳第十届“高交会”上宣布，大熊猫“晶晶”基因组框架图绘制完成，这是世界首例用短序列进行新物种测序与组装新技术完成的大型基因组序列图。 据深圳华大基因研究员王俊博士介绍，大熊猫有二十一对染色体，基因组大小与人相似，约为三十亿个碱基对，包含二到
Nature公布最大规模肥胖全基因组研究成果
一些时尚杂志总是在说，如果你不能控制好你的体重，那么更加就无法控制住自己的人生，但是肥胖真的是可以完全由人为意志控制的吗，为什么还会有一些人怎么吃也不胖，或者脂肪堆积的地方也不相同呢？近期一组研究人员在迄今为止最大规模的肥胖全基因组研究中追溯了其中的遗传成因，相关成果以两篇论文的形式发表在Nat
Nature发表衰老研究成果：胚胎基因再激活导致肌肉衰老
生物通报道：发育基因和途径严格调控着胚胎的发育。这个过程是由所谓的Hox基因强烈驱动的。现在，来自德国Leibniz老化研究所（FLI）的研究人员发现，这些基因当中的一个——Hoxa9，在老年时期被重新激活。这限制了肌肉干细胞的功能，因此，限制了骨骼肌的再生能力。具有讽刺意味的是，这些研究结果表
核酸序列分析
【实验目的】1、 掌握已知或未知序列接受号的核酸序列检索的基本步骤；2、 掌握使用BioEdit软件进行核酸序列的基本分析；3、 熟悉基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析（内含子/外显子分析）；4、 了解基因的电子表达谱分析。【实验原理】针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因，找出基因的位置和
设计引物用cds序列和cdna序列的区别
cDNA和mRNA的序列是互补的，如果用两个引物，最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段。由于引物方向从5‘至3’，所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可。
冲激序列信号与阶跃序列信号各有什么特性
单位脉冲序列只在n=0 处有一个单位值1，其余点上皆为0；单位阶跃序列只有在n>=0时，才取非零值1，当n
升级了！CRISPR可在不改变DNA序列情况下开关基因
《细胞》杂志9日在线发表的一篇论文表示，美国怀特黑德研究所乔纳森·魏斯曼等人设计了一种名为CRISPRoff的新基因编辑技术，可以在不改变DNA序列的情况下使某些基因“沉默”，从而以高特异性控制基因表达。这种“升级版”的基因编辑技术为研究表观遗传机制、重大疾病治疗以及研发新冠病毒疫苗等提供了有力
安捷伦最新推出百万特征序列格式的基因表达微阵列芯片
2010 年 5 月 19 日，加利福尼亚州圣克拉拉市——安捷伦科技公司(纽约证交所：A) 今日发布了安捷伦 SurePrint G3 基因表达微阵列芯片，该产品在 1 英寸×3 英寸的单位标准芯片上提供的特征序列可多达一百万种，大幅提高了通量，有效节约了成本，并且具有独一无二
哈尔滨病毒基因序列确定为德尔塔－详细信息公开
9月24日，哈尔滨市召开疫情防控新闻发布会。会上通报，9月23日0时-24时，哈尔滨市新增新冠肺炎确诊病例15例，均在巴彦县 。根据目前已检出病例基因测序情况看，显示为德尔塔毒株 ，相关流调溯源工作正在国家、省疾控专家指导下，紧张有序开展，如果有结果将及时向社会公布。 上述新增确诊病例均是在集
昆明动物所发现白介素3基因序列变异影响人类大脑容量
神经系统是人类区别于其他物种最显著的特征之一。相对于其他物种，人类的大脑高度发达，主要体现在全脑容量的变化。如人类的大脑容量是旧大陆猴-如猕猴脑容量的20.6倍，长臂猿的14.4倍，与人类亲缘关系最近的灵长类-黑猩猩的4.3倍。 近年来，基于核磁共振（MRI）脑影像学研究表明
基因序列仪在感染性疾病诊断上的应用
测序技术可以精确的分析碱基序列，通过序列比对，对各种病原体直接进行鉴定、分型和溯源，明确某一感染性疾病对应病原体的基因序列，可以有针对性地用药和预防，提高用药的有效性和安全性。同时基因测序可以用于发现新型病原体，能更好地做好预防工作。
中科院等完成橡胶草基因组序列解析
中国科学院遗传与发育生物学研究所李家洋研究组与中国农业科学院、中国热带农业科学院等合作，在橡胶草基因组序列解析方面取得重要进展，标志着以橡胶草作为模式植物进行天然橡胶合成研究进入后基因组时代。研究成果近日在线发表在权威学术期刊《国家科学评论》（National Science Review）杂
英国拟为癌症病人绘基因序列图以研发新药
据英国路透社12月10日报道，英国拟为近10万癌症或其它罕见疾病的患者绘制基因序列图，以研发新的药物。 英国首相卡梅伦10日表示，他希望英国能够成为第一个将基因排序引入健康服务的国家。 据报道，卡梅伦政府计划在未来3至5年内投入1亿英镑(约合人民币10亿元)用于基因排序项目。绘制病人