Genes&Devel:科学家揭示如何阻断癌细胞的转录?
阐明介导子如何与TFIID串扰促进启动子-增强子之间的交流沟通对于揭示增强子功能的机制非常重要;近日,一篇发表在国际杂志Genes & Development上题为“The Pol II preinitiation complex (PIC) influences Mediator binding but not promoter–enhancer looping”的研究报告中,来自加利福尼亚大学医学院等机构的科学家们通过研究发现,名为转录因子TAF12的关键蛋白或在始发前复合体(preinitiation complex)的形成过程中扮演关键角色,这种始发前复合体包括了对蛋白编码基因转录所必需的100多个蛋白质,研究者还发现,通过消除TAF12蛋白就能破坏完整的始发前复合体,而且全基因组的转录也会被大幅下调。 本文研究结果或为靶向作用TAF12的癌症疗法的开发铺平了道路,并能潜在阻断癌细胞的转录以及降低癌变肿瘤的......阅读全文
tDEG(转录组差异表达基因深度分析)
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Hopx甲基化通过激活SNAIL转录而促进鼻咽癌细胞的迁移-二
4、HOPX抑制鼻咽癌细胞的EMT过程在N2-Tert,,NP69 和SH cells敲低HOPX后,细胞形态发生显著变化。SUNE1细胞系中过表达HOPX后,检测发现ECADHERIN显著上调。5、鼻咽癌细胞中HOPX抑制SNAIL转录由于EMT-TFs在EMT过程中起着重要的角色,研究者检测了H
Hopx甲基化通过激活SNAIL转录而促进鼻咽癌细胞的迁移-一
《Nature Communications》甲基化研究揭示鼻咽癌治疗新靶点研究背景在中国华南地区,鼻咽癌有较高的发病率。目前,鼻咽癌病人的治疗方案主要取决于病人的TNM分期。但是,约30%的鼻咽癌病人虽然处于相同的TNM分期,采用相同的治疗方案,其结果也不尽相同。表观层面的改变对于肿瘤起始和发展,
eLife:科学家发现调控癌细胞生长“基因开关”!
瑞典卡罗林斯卡学院(Karolinska Institute)的科学家指出:癌细胞和正常细胞使用不同的“基因开关”来调节控制生长的基因的表达。在小鼠中,不同类型癌症相关的基因调节区域的缺失使得小鼠具有抗肿瘤功能,但不影响小鼠正常细胞的生长。该研究成果日前发表在顶级科学杂志eLife上,研究结果提
“鹦鹉学舌”基因被解码亦有望解释癌细胞
据外媒报道,有科学家称,他们组合了一条更完整的基因链条,这个基因链条可以控制鹦鹉模仿主人和其他声音的能力。 研究者用一种新技术分解了鹦鹉的基因组中的某个区域,进行了单分子测序,并用来自较早的DNA解码设备的数据对其进行了纠错。研究者还解码了来自玉米和细菌的难以测序的基因物质,以此来证明他们
编辑HPV病毒基因-导致癌细胞自我毁灭
利用基因组编辑工具CRISPR,杜克大学研究人员们能够有选择性地破坏负责宫颈癌细胞生长和生存的两种乳头瘤病毒(HPV)基因,导致癌细胞的自我毁灭。 结果发表在病毒学Journal of Virology杂志上,新研究铺平了开发有针对性的抗病毒策略,来抵抗DNA病毒如B型肝炎病毒和单纯疱疹等的方
新DNA测序技术追踪单个癌细胞的基因错误
一种新的DNA测序技术可以让科学家追踪单个癌细胞的基因错误。这是史上第一次科学家们能够重建肿瘤的生命史,并了解细胞DNA中的一个错误是如何导致肿瘤无法控制的生长的。这项新技术将帮助医生了解特定癌症是如何演变的,并为每位患者量身定制治疗方案,使其更有效、更成功。 我们是由数十亿个细胞组成的,它们
新技术可直接干扰癌细胞基因以治疗癌症
英国《自然》杂志网站3月21日刊登研究报告说,美国研究人员成功利用纳米级别的微小载体将特定的RNA(核糖核酸)送达人体癌变部位,从而干扰了癌细胞的基因并起到治疗作用。 美国加州理工学院等机构的研究人员报告说,他们合成了一种直径仅为70纳米的微小载体。这种携带了特定RNA的载体进入血液后,不
eLife绘制最完整癌细胞周期基因表达图
失控性的细胞生长与分裂是癌症的一个标志。现在由邓迪大学领导的一项研究对人类细胞分裂时的基因活性进行了迄今为止最完整的描述。 研究人员设法收集了当癌细胞通过细胞周期时,6000多种基因编码的蛋白质分子的行为细节数据。研究小组采用先进的技术和数据分析研究了癌细胞中的基因随时间推移运作的机制。并
《自然》:阻断Skp2基因可致癌细胞“老死”
美国科学家3月17日说,通过阻断一种名为Skp2的基因,能够使癌细胞老化并死亡。这一发现或许能为治疗癌症提供一种新方法。 美国哈佛大学医学院基因学家皮耶尔·保罗·潘多尔菲介绍,阻断癌细胞中的Skp2基因能够触发“衰老进程”,迫使癌细胞像体细胞暴露在阳光下那样“干死”,无法无限分裂、在人体内
烟草转录调控因子WRKY基因家族基因功能分析取得进展
大量研究工作证实,植物WRKY基因家族的主要生物学功能是调控植物抗病反应及其信号转导途径的建立。WRKY转录调控因子在植物的抗病性方面,如抗病毒、抗细菌、抗机械伤害等方面参与了植物对逆境的应答反应,对高盐、干旱、高温、低温等非生物逆境因子的抗性也具有重要作用,这些对于一生保持原地不
科学家构建首个油菜基因转录数据库
近日,中国农业科学院油料作物研究所油料作物基因组学与抗病性改良创新团队破译了油菜基因组的全转录信息密码,构建了油菜十万余个基因的转录全景图,使得油菜基因功能研究第一次有了标准的可参考的基因转录数据库,将有力支撑油菜功能基因的相关研究。该项研究成果在线发表在《植物学报(The Plant Jou
克隆化基因的体外转录和翻译实验
DNA的克隆是指在体外将含有目的基因或其它有意义的DNA片段同能够自我复制的载体DNA连接,然后将其转入宿主细胞或受体生物进行表达或进一步研究的分子操作的过程,因此DNA克隆又称分子克隆,基因操作或重组DNA技术。实验材料DNA试剂、试剂盒TE核苷三磷酸混合液RNA聚合酶缓冲液异丁醇NaOHTCA仪
Nature-Genetics:基因组其实是这样转录的
在人类基因组中大约储存着两万个基因和数千个调控元件。基因编码蛋白质合成的信息,其他基因组元件负责调节基因活性和执行其他功能。所有这些DNA编码信息都需要被复杂的分子机器读取,并转换为细胞能使用的信息。 人们一般认为,读取基因就和读一个语句差不多。读取机器被多种序列引导到基因的起始位置,然后从左
中国科学家揭示基因转录终止的分子机制
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519911.shtm3月28日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心/中国科学院合成生物学重点实验室研究员张余课题组成功解析了酵母细胞mRNA转录终止状态的复合物结构,揭示了核酸外切酶介导mRNA转录终止的
逆转录PCR(RTPCR)扩增基因特异片段
逆转录PCR(RT-PCR)扩增基因特异片段 一、实验原理RT-PCR是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平,细胞中R
克隆化基因的体外转录和翻译实验
实验材料 DNA试剂、试剂盒 TE核苷三磷酸混合液RNA聚合酶缓冲液异丁醇NaOHTCA仪器、耗材 离心机摇床实验步骤 1. 亚克隆编码蛋白质的目的DNA片段于质粒载体的SP6或T7启动子的下游。 2. 通过CsCl/溴化乙锭离心或PEG沉淀制备质粒DNA。 3. 用位点在终止密码子的立即下游
通过转录组分析鉴定风筝果种子油脂代谢基因
蓖麻油酸的脂肪酸链上含有一个羟基官能团,是一种特殊脂肪酸,具有粘度高、酸度低、耐高温、不易氧化、不易凝固等特点,在500~600℃高温下不变质、不燃烧,零下18℃ 的低温下不凝固等特殊性能。利用蓖麻油生成的化学衍生物已达3000多种,广泛应用于国防、航空、航天、化工医药和机械制造等,是目前能替代
逆转录病毒介导的基因技术的缺陷
①载体的滴度较低;②是辅助病毒与载体病毒重组重新获得包装信号使病人面临感染辅助病毒的危险性;③此载体只能整合至分裂相细胞;④此载体容纳的外源基因量较少,不利于较大的基因的插入。
克隆化基因的体外转录和翻译实验
基本方案 实验材料 DNA 试剂、试剂盒
基因转录的起始过程发生了什么?最新研究揭示
2023年12月22日,复旦大学上海医学院徐彦辉团队在《科学》(Science)杂志上在线发表题为“Structural visualization of transcription initiation in action”的研究长文。从复旦上医获悉,该项研究首次用结构重现出了转录从头起始的1
中国科学家揭示基因转录终止的分子机制
3月28日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心/中国科学院合成生物学重点实验室研究员张余课题组成功解析了酵母细胞mRNA转录终止状态的复合物结构,揭示了核酸外切酶介导mRNA转录终止的分子机制,对进一步理解基因转录的工作机制具有重要意义。相关研究发表于《自然》。准确高效的转录终止对于基因的正常表达和
Science:相分离与基因转录间存在怎样的关联?
DNA结合转录因子(TF)是真核基因表达的典型调节因子。针对转录因子的早期研究揭示出它们的结构良好的DNA结合结构域(DNA binding domain, DBD)并鉴定出转录所需的功能上至关重要的激活结构域(activation domain, AD)。后来很明显的是,许多激活结构域包含着固
RNA测序技术如何绘制全基因组转录终止?
近日,南方科技大学生命科学学院翟继先团队利用纳米孔单分子RNA测序技术绘制了拟南芥全基因组水平转录终止图谱。该方法能同时捕获包括已转录过polyA位点的 readthrough转录本、完成3’末端切割的5’或3’切割产物、以及已完成或正在进行多腺苷酸化(polyadenylation)的转录本在
转录图谱的转录图谱的意义
在于它能有效地反应在正常或受控条件中表达的全基因的时空图。通过这张图可以了解某一基因在不同时间不同组织、不同水平的表达;也可以了解一种组织中不同时间、不同基因中不同水平的表达,还可以了解某一特定时间、不同组织中的不同基因不同水平的表达。人类基因组是一个国际合作项目:表征人类基因组,选择的模式生物的D
RNA复制、转录与逆转录
转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大
RNA的转录和逆转录
转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大
黄粉甲触角转录组测序及嗅觉基因鉴定鞘翅目嗅觉基因
最新一期《Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics》(SCI收录,IF=2.823)杂志报导了安徽农业大学植保学院的研究人员在昆虫转录组测序方面的研究论文,该课题组利用第二代高通量测序技术对黄粉
牛津大学研发转基因病毒-可杀死癌细胞
据英国《每日邮报》11月19日报道,牛津大学的科学家研发出一种可以杀死癌细胞的转基因病毒。这种病毒可以同时攻击肿瘤细胞和成纤维细胞——一种被“欺骗”以保护癌细胞免受免疫系统攻击的健康细胞。 就目前来说,任何已经存在的杀死成纤维细胞的治疗方法,都可能破坏骨髓和皮肤中的成纤维细胞。牛津大学肿瘤科的
脑癌细胞系全基因组测序首次完成
其所揭示的新分子靶标将有助于开发出更具效力和更少毒性的药物 美国加州大学洛杉矶分校琼森综合癌症研究中心的科学家在1月29日的《公共科学图书馆·遗传学》(PLoS Genetics)专刊上发表论文指出,他们首次完成了脑癌细胞系全基因组测序,这也是截至目前对单个癌症细胞系所做的最为彻底的测序分析。