Genes&Devel：科学家揭示如何阻断癌细胞的转录？
阐明介导子如何与TFIID串扰促进启动子-增强子之间的交流沟通对于揭示增强子功能的机制非常重要；近日，一篇发表在国际杂志Genes & Development上题为“The Pol II preinitiation complex (PIC) influences Mediator binding but not promoter–enhancer looping”的研究报告中，来自加利福尼亚大学医学院等机构的科学家们通过研究发现，名为转录因子TAF12的关键蛋白或在始发前复合体（preinitiation complex）的形成过程中扮演关键角色，这种始发前复合体包括了对蛋白编码基因转录所必需的100多个蛋白质，研究者还发现，通过消除TAF12蛋白就能破坏完整的始发前复合体，而且全基因组的转录也会被大幅下调。 本文研究结果或为靶向作用TAF12的癌症疗法的开发铺平了道路，并能潜在阻断癌细胞的转录以及降低癌变肿瘤的......阅读全文
RNA复制、转录与逆转录
转录是以DNA为模板合成RNA的过程，经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中，再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的，以RNA分子中的一条链为模板，在逆转录酶的作用下，以四种脱氧核苷酸为原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大
黄粉甲触角转录组测序及嗅觉基因鉴定鞘翅目嗅觉基因
最新一期《Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics》（SCI收录，IF=2.823）杂志报导了安徽农业大学植保学院的研究人员在昆虫转录组测序方面的研究论文，该课题组利用第二代高通量测序技术对黄粉
植物叶绿体基因组可以全部转录的新机制
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能、供给地球上的其它生物能量来源的重要细胞器，对叶绿体的功能和叶绿体基因组转录机制的研究一直以来是全球细胞生物学家、遗传学家和分子生物学家孜孜以求的研究热点。中国科学院昆明植物研究所研究员高立志带领的研究团队，历时五年，通过对三种高等植物（水稻、玉米和拟南芥
关于逆转录病毒介导的基因技术的介绍
是目前将外源基因导入细胞的最有效的方法。此系统包括重组逆转录病毒载体和包装细胞两个部分，广泛应用的逆病毒载体LNL6是以Moloney鼠白血病病毒（MO-MLV）改建的。该病毒为RNA病毒，感染细胞后，其基因组RNA经逆转产生双链DNA拷贝插入宿主染色体形成前病毒，前病毒转录产生正链即为病毒基因
Cell：武汉大学阐明真核基因中的转录调控机制
近日，来自武汉大学、加州大学圣地亚哥分校的研究人员在新研究中证实，SR蛋白与7SK和启动子相关新生(Nascent )RNA协同作用，促进了转录过程中停顿的聚合酶释放。这一研究发现为阐明真核基因中的转录调控机制，深入了解相关疾病提供了重要的理论依据。相关论文发表在5月9日的《细胞》(Cell
国家基因库发起国际“千种鱼转录组计划”
2013年11月19日，深圳国家基因库宣布一项具有重要开创性意义的国际“千种鱼转录组计划”(1, 000 Fish Transcriptome，Fish T1K)正式启动。该项目旨在解密鱼类的起源、进化、生殖、发育、性别调控和免疫等问题，助力科研人员开发出新的技术及策略，以更好地应对鱼类
研究证明乙酰化过程与基因转录有重要关联
最近，一个来自格拉德斯通研究所的科学团队对一个最基本的生物学过程——基因转录有了重要发现。 2013年，Gladstone的高级研究员Melanie Ott博士发现，在哺乳动物等复杂生物体的基因转录过程中，聚合酶的调控尾部也会发生另一种称为乙酰化的修饰。然而，到目前为止，没有人知道乙酰化是做什
牛津大学研发转基因病毒－可杀死癌细胞
据英国《每日邮报》11月19日报道，牛津大学的科学家研发出一种可以杀死癌细胞的转基因病毒。这种病毒可以同时攻击肿瘤细胞和成纤维细胞——一种被“欺骗”以保护癌细胞免受免疫系统攻击的健康细胞。 就目前来说，任何已经存在的杀死成纤维细胞的治疗方法，都可能破坏骨髓和皮肤中的成纤维细胞。牛津大学肿瘤科的
癌细胞增殖遇“克星”，基因修饰迫使其“集体自杀”！
即便是最常见的癌症治疗方案也会为患者带来难以避免的化疗伤害。对于胰腺癌和其他侵袭性癌症的患者来说，现状则显得更为严峻，目前尚不存在任何一种癌症疗法针对胰腺癌等恶性癌症具有疗效。 近日，一批来自以色列特拉维夫大学（TAU）的科学家发现了三种能够在癌细胞分裂时将其快速杀死的蛋白质。 这项由TAU萨
Cell：首次构建出人癌细胞依赖的基因图谱
在一项新的研究中，来自美国哈佛大学-麻省理工学院布罗德研究所（以下称布罗德研究所）和达纳-法伯癌症研究所的研究人员构建出肿瘤细胞存活所依赖的基因的综合图谱。相关研究结果发表在2017年7月27日的Cell期刊上，论文标题为“Defining a Cancer Dependency Map”。
脑癌细胞系全基因组测序首次完成
其所揭示的新分子靶标将有助于开发出更具效力和更少毒性的药物 美国加州大学洛杉矶分校琼森综合癌症研究中心的科学家在1月29日的《公共科学图书馆·遗传学》(PLoS Genetics)专刊上发表论文指出，他们首次完成了脑癌细胞系全基因组测序，这也是截至目前对单个癌症细胞系所做的最为彻底的测序分析。
关于体外转录的转录条件介绍
转录模板必须满足： 1. 在基因组全长克隆过程中，在正向引物5‘末端添加T7启动子序列； 2. 以T7启动子作为体外转录启动子，在启动子后面靶位序列连续带有3个G,转录效率最 高； 3. 在正向引物5/端添加一个帽子G,有利于提高体外转录RNA分子的侵染活性。
转录因子的转录调控区的介绍
同一家族的转录因子之间的区别主要在转录调控区。 转录调控区包括转录激活区（transcription activation domain）和转录抑制区（transcription repression domain）二种。近年来，转录的激活区被深入研究。它们一般包含DNA结合区之外的30-10
人血细胞中的所有蛋白编码基因进行全基因组转录组分析
在临床和研究环境中，血液都是对人类进行分子分析的主要来源，并且是许多治疗策略的目标，这突显了需要对构成人类血液的细胞进行全面的分子图谱构建。人类蛋白质图谱计划（www.proteinatlas.org）是一个开放式数据库，旨在通过整合各种组学技术（包括基于抗体的成像）来绘制所有人类蛋白的图谱。在
重启癌细胞凋亡的新分子开发，有望治疗大约50％的癌症
在一项新的研究中，来自美国斯坦福大学的研究人员发现了一种诱导癌细胞死亡的方法，这种方法对大约50%的癌症有效。他们描述了一类名为转录/表观遗传邻近化学诱导剂（transcriptional/epigenetic CIP, TCIP）的新分子，这类分子可以借助癌细胞内癌症生长基因的表达激活细胞凋亡
关于转录因子的转录抑制区的介绍
也是转录因子调控表达的重要位点，但是对其作用机理研究尚不深入。可能的作用方式有三种：1）与启动子的调控位点结合，阻止其它转录因子的结合；2）作用于其它转录因子，抑制其它因子的作用；3）通过改变DNA的高级结构阻止转录的发生。 转录因子必须在核内作用，才能起到调控表达的目的。因此，转录因子上的核
多阶段单细胞转录数据的基因识别统计方法问世
近日，西安交通大学公共卫生学院孙世权教授团队开发了一种高效灵活的非参数方法，用于检测多个时间点上的基因表达模式。该方法称为TDEseq，即时间序列scRNA-seq数据的时间差异表达基因，近日该成果发表于《基因组生物学》上。TDEseq采用线性可加混合模型（LAMM）来拟合单个基因表达值和时间点的关
基因组所小鼠组织新转录本鉴定研究取得进展
近日，中国科学院北京基因组研究所胡松年项目组利用新一代测序数据，运用生物信息学方法，在小鼠的几个组织中发现了几千个新的转录本。该研究成果的完成拓宽了转录组数据分析的思路，有利于更全面地认识小鼠的转录组组成，并进一步补充了其基因组的注释，相关成果论文在frontiers in genetics
转录体分析找到调控神经退化的基因和讯息传递路径
神经元大规模消失是正常神经系统发育中的一个重要过程，然而，神经退化性病变也有相同的特征，例如阿兹海默症，帕金森氏症，亨丁顿氏症和肌萎缩性侧索硬化症等。虽然在不同的神经退化性疾病中，触发这些神经死亡的分子机制是不同的，但这些疾病以及发育性调节神经元死亡所引起的下游神经细胞凋亡过程是共通的。为了理解
多阶段单细胞转录数据的基因识别统计方法问世
近日，西安交通大学公共卫生学院孙世权教授团队开发了一种高效灵活的非参数方法，用于检测多个时间点上的基因表达模式。该方法称为TDEseq，即时间序列scRNA-seq数据的时间差异表达基因，近日该成果发表于《基因组生物学》上。TDEseq采用线性可加混合模型（LAMM）来拟合单个基因表达值和时间点的关
连接非编码突变和肿瘤基因表达的转录组全网络
肿瘤基因组中充满了非编码突变，这些突变对肿瘤的影响研究还不是很清晰。加州大学圣地亚戈分校的科学家Wei Zhang and Ana Bojorquez-Gomez，Trey Ideker，在最近国际顶级期刊Nature Genetics发表文章 A global transcriptiona
基因组所发布全转录组关联研究知识库
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心（NGDC）开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”为题在
乳腺癌全转录组关联分析发现新的风险基因
美国范德堡大学和澳大利亚昆士兰医学研究所（QIMR Berghofer）领导的研究团队利用全转录组关联分析方法，找到与乳腺癌存在明显关联的48个基因。这项成果于6月18日发表在《Nature Genetics》上。 研究人员利用近12.3万名乳腺癌患者和近10.6万名对照的遗传预测基因表达谱
科学家成功解析叶绿体基因转录蛋白质机器构造
叶绿体中的光合作用将光能转化为化学能，吸收二氧化碳，释放氧气，是地球生物圈的重要塑造者。叶绿体约在15亿年前通过蓝藻内共生进化而来。在进化过程中，叶绿体基因要么被废弃，要么逐渐转移到细胞核染色体中，导致多数陆地植物叶绿体基因组只保留了110-130个基因。其中，大部分基因编码基因转录、蛋白翻译和光合
Nat－Commun：揭秘转录因子“勘察”细胞基因组的分子机制
转录因子（TFs）是一种能调节基因表达的特殊蛋白，其能在完整的基因组中搜索并结合特殊区域来调节基因的表达；我们都知道，转录因子不仅能结合特殊的DNA序列，还能非特异性结合任何DNA链。这些非特异性的关联就能够明显增加转录因子寻找特殊靶点的能力，然而目前研究人员并不清楚在扫描大量基因组、定位以及结
刘勋成等研究揭示植物光响应基因转录调控机理
近日，中科院华南植物园的一项研究揭示了植物光响应基因转录调控新机理，为农作物高产育种提供了重要的理论基础。相关研究发表在《植物细胞》上。 在高等植物中，光敏色素通过与一类bHLH转录因子——光敏色素互作蛋白(PIFs)相互作用、传递光的信号从而影响植物的生长发育。然而，对光敏色素互作蛋白如
花生转录组denovo测序揭示果针发育相关的功能基因
近日，由广东省农业科学院作物研究所梁炫强研究员、陈小平博士，山东省农业科学院花生研究所所长禹山林研究员及国际半干旱热带作物研究所(ICRISAT)基因组中心负责人Rajeev Kumar Varshney等完成的花生转录组de novo测序的结果发表于Plant Biotechnology
《癌细胞》：科学家发现诱发恶性皮肤癌的基因
研究显示BRAF的遗传损伤是皮肤癌发展的第一步 英国科学家近日研究发现，大约70%的皮肤癌(黑素瘤)可能都是由同一种突变基因所诱发，在过多的日晒情况下，该基因会导致细胞癌变。这一发现将导致对于恶性皮肤癌更好的疗法。相关论文4月7日发表在《癌细胞》(Cancer Cell)上。
Nature:基因编辑+CART强强联手－癌细胞定向清除
CAR-T细胞疗法一直广为人知，CAR-T细胞在肿瘤免疫治疗方面拥有诸多优势，它可以利用非限制性的形式特异识别和杀伤表达特定抗原的癌细胞，以单链抗体（single chain antibody fragment，scFv）作为抗原识别区段的CAR能够识别不同种类的抗原，包括糖类和脂类等非蛋白抗原
日本发现某特定基因可使癌干细胞变普通癌细胞
成胶质细胞瘤是脑癌中常见的一种，经常导致患者在短时间内死亡，手术切除肿瘤组织后容易复发。此前研究发现，癌干细胞是癌症复发和转移的原因之一，这类细胞与普通癌细胞不同，能够不断自我复制，并能分化成多种癌细胞。 日本山形国立大学和国立癌症研究中心的研究小组报告说，他们对成