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抗生素抗性元件的时间变化控制着噬菌体与病原体的冲突

在自然界中,细菌要与丰富多样的病毒(噬菌体)作斗争,因此需要有广泛的防御系统。抗噬菌体系统与移动基因组(mobilome,基因组中所有可移动遗传因子的总和)中的基因簇集在一起,这表明噬菌体攻击可以通过可移动遗传因子(mobile genetic element, MGE)的流动来推动细菌的进化。 尽管不断发现新的防御系统,但是科学们缺乏相关的生物学系统来研究正在进行的噬菌体-宿主相互作用,特别是在临床环境中。使用异源宿主和模型噬菌体的方法限制了人们对适应性权衡和噬菌体编码的反适应的理解,而这些反适应驱动了自然界中噬菌体防御的多样化。对腹泻病原体霍乱弧菌及其裂解性噬菌体的纵向取样是深入了解噬菌体-宿主共同进化的一种有希望的模型系统。在霍乱流行的地区,这些裂解性噬菌体经常从临床标本中共同分离出来。 针对此,来自美国和孟加拉国的研究人员在一项新的研究中进行了时间变化测定,用直接来自过去、现在和未来的患者粪便的噬菌体挑战霍乱弧菌......阅读全文

噬菌体展示技术研究RNA结合蛋白实验

实验方法原理噬菌体展示技术是将外源基因与噬菌体的表面蛋白基因融合,在融合了外源基因的噬菌体颗粒的表面就会表达相应的外源蛋白,即外源基因编码的蛋白被展示在噬菌体颗粒的表面。实验材料载体tRNA抗体寡核苷酸试剂、试剂盒抗生素储存液BCIP葡萄糖储存液X-Gal磁珠洗液蛋白酶抑制剂RNase 抑制剂TEN

抗生素无效时:古老病毒大战超级细菌

  静脉注射噬菌体后的 48 个小时之内,加州大学圣地亚哥医学院教授托马斯·帕特森缓缓睁开了眼睛。由于细菌感染,他已经昏迷了两个月。他从枕头上抬起头来,认出了自己的女儿并吻了吻她的手。很快,帕特森的血压开始稳定,白血球计数也开始下降。  噬菌体正通过他的血管,抵达他被感染的脏器,然后,干掉那些差点杀

噬菌体展示技术

1985年,Smith G P第一次将外源基因插入丝状噬菌体f1的基因Ⅲ,使目的基因编码的多肽以融合蛋白的形式展示在噬菌体表面,从而创建了噬菌体展示技术。该技术的主要特点是将特定分子的基因型和表型统一在同一病毒颗粒内,即在噬菌体表面展示特定蛋白质,而在噬菌体核心DNA中则含有该蛋白的结构基因。另

噬菌体: 开启生物宇宙暗物质研究大门

  20世纪初,大多数研究者认为DNA是一种“愚蠢的分子”,因为太简单而对于生命传输没有任何价值。相反地,科学家们更加拥护蛋白质,它们拥有很强的可变性和复杂性,是遗传的关键组成部分。然后到了20世纪50年代初,遗传学家Alfred Hershey 和 Martha Chase在对噬菌体的研究

噬菌体展示技术研究RNA结合蛋白实验(三)

4. 免疫印迹检测外源蛋白的展示情况pDTSPLAY-B 空载体生成的噬菌体表面不含外源基因,仅有带有 6 个组氨酸标签和 Myc 标签的锚定蛋白(基因 Ⅲ 编码),此蛋白 SDS-PAGE 中的条带在 65 kDa 的位置(实际 Mr 为 45 kDa)。pDISPLAY-B 载体中插入外

曾经的杀手病毒,能拯救这位年轻女性的生命吗?

  超级细菌  这种细菌会充满像Mallory这样的囊性纤维化病人的肺部,在粘液中生存,但并不妨碍她的生活。于是13年期间,细菌伴随着她读完高中,伴随她参加学校的水球、排球和游泳队;又随她进入斯坦福大学(Stanford University),在她学习生物学或是打排球时和平共处。她甚至还写完了一本

M13 噬菌体衣壳蛋白改造在改良噬菌体展示技术中的应

M13 噬菌体衣壳蛋白改造在改良噬菌体展示技术中的应用实验 实验材料 羧苄青霉素氯霉素大肠杆菌 CJ236 试剂、试剂盒 生理磷酸缓冲液超纯甘油PBS-T 缓冲液PBS-T-BSA 缓冲液 仪器、耗材 2YT 培养基SOC 培养基 实验步骤 下述方法描述了 P8 库

一种靶向控制噬菌体来对抗细菌的方法:噬菌体疗法

  有人的地方就有江湖?微观世界其实也一样残酷。研究人员发现:假单胞菌会利用自己产生的信号分子,选择性操纵竞争菌株中的噬菌体来击败敌人。这个结果或许提示了一种靶向控制噬菌体来对抗细菌的方法:噬菌体疗法。    噬菌体仍然是人类微生物群中一个相对未知的组成部分。然而,它们可以在细菌的生命周期中发挥强大

M13 噬菌体衣壳蛋白改造在改良噬菌体展示技术中的应...

M13 噬菌体衣壳蛋白改造在改良噬菌体展示技术中的应用实验实验材料 羧苄青霉素氯霉素大肠杆菌 CJ236试剂、试剂盒 生理磷酸缓冲液超纯甘油PBS-T 缓冲液PBS-T-BSA 缓冲液仪器、耗材 2YT 培养基SOC 培养基实验步骤 下述方法描述了 P8 库的设计(见 12.3.1)、构建(见

噬菌体检查

  病原体是许多疾病的主要诱因,对人类健康构成了严重威胁。近年来,食品、水源和环境中致病微生物已造成世界上许多流行病的爆发。因此,为了控制病原体的传播并减少流行病的发生,检测致病微生物的技术的成熟可行性显得尤为重要。  培养物细菌分离和鉴定是实验室检测病原体的“金标准”方法。该检测方法虽然足够灵敏,

M13噬菌体衣壳蛋白改造在改良噬菌体展示技术的应用实验

本章描述了改进融合蛋白在 M13 噬菌体颗粒表面展示水平的一个方法。向 M13 衣壳锚定蛋白引入突变后,蛋白质展示水平约能增加两个数量级。本实验来源「现代蛋白质工程实验指南」〔德〕K.M.阿恩特、K.M.米勒编著。实验材料羧苄青霉素氯霉素大肠杆菌 CJ236试剂、试剂盒生理磷酸缓冲液超纯甘油PBS-

DNA重组(DNA recombination)技术:DNA重组的载体-2

二、噬菌体载体作为细菌寄生物的噬菌体,大多数具有编码多种蛋白质的基因,能利用宿主细胞的蛋白质合成体系,进行生长和增殖。构建的噬菌体载体,以λ噬菌体、M13和粘粒最为常用。㈠ λ噬菌体载体野生型λDNA是一种基因组为4.8 kb的线性双链DNA,全部序列已知,共编码50多个基因。其中约一半基因参与

新发现!Cell:噬菌体抱团抑制细菌CRISPR免疫系统

   在2018年7月19日同时在线发表在Cell期刊上的两篇论文中,来自两个研究团队的研究人员提供了当入侵含有CRISPR的细菌时,噬菌体彼此间进行合作的证据。他们发现为了压制CRISPR的破坏,噬菌体通过联合起来快速地感染细菌来加以适应,而且有时一个噬菌体还会为此作为引火噬菌体(primer p

CDNA文库筛选

CDNA文库筛选(一)λgt11 cDNA文库铺平板宿主细菌制备1.用一个E.coli宿主菌株单菌落分别接种2×5ml LB培养基(Y1088用于噬菌斑杂交,Y1090用于免疫筛选),于37℃振荡培养过夜。2.将过夜培养物以3000×g离心5min。3.分别用2ml λ-dil(10 mm

噬菌体的检查及效价测定

1、目的:1.1 了解噬菌体效价的含义及其测定原理。1.2 学会检查噬菌体的方法。1.3 掌握用双层琼脂平板法测定噬菌体效价的操作技能。2、原理:噬菌体是一类专性寄生于细菌和放线菌等微生物的病毒,其个体形态极其微小,用常规微生物计数法无法测得其数量。当烈性噬菌体侵染细菌后会迅速引起敏感细菌 裂解,释

噬菌体的检查及效价测定

实验方法原理噬菌体是一类专性寄生于细菌和放线菌等微生物的病毒,其个体形态极其微小,用常规微生物计数法无法测得其数量。当烈性噬菌体侵染细菌后会迅速引起敏感细菌裂解,释放出大量子代噬菌体,然后它们再扩散和侵染周围细胞,最终使含有敏感菌的悬液由混浊逐渐变清,或在含有敏感细菌的平板上出现肉眼可见的空斑──噬

建立随机重叠DNA插入文库实验

下面的方案描述了鸟枪法测序的起始步骤,从靶 DNA 的剪切到用 M13 噬菌体载体构建 DNA 片段文库,也包括断裂靶 DNA 的两种方法--超声法和喷雾法,以及用 DNA 聚合酶修复片段末端的技术要点。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W.拉塞尔。试剂、

微生物学技术:噬菌体的检查及效价测定

一、目的:1. 了解噬菌体效价的含义及其测定原理。2. 学会检查噬菌体的方法。3. 掌握用双层琼脂平板法测定噬菌体效价的操作技能。二、原理:噬菌体是一类专性寄生于细菌和放线菌等微生物的病毒,其个体形态极其微小,用常规微生物计数法无法测得其数量。当烈性噬菌体侵染细菌后会迅速引起敏感细菌裂解,释放出大量

P1 噬菌体普遍性转导实验

实验方法原理细菌病毒(噬菌体)分为烈性噬菌体和温和噬菌体。烈性噬菌体感染细胞后,伴随着细胞裂解会释放出新的子代噬菌体颗粒。被温和噬菌体感染的细胞或是裂解,释放出新的子代噬菌体颗粒,或是成为溶源状态,噬菌体的基因组整合到细菌染色体上,与细菌染色体一起复制,这时的噬菌体基因组称为原噬菌体(prophag

噬菌体的检查及效价测定(一)

一、目的:1. 了解噬菌体效价的含义及其测定原理。2. 学会检查噬菌体的方法。3. 掌握用双层琼脂平板法测定噬菌体效价的操作技能。二、原理:噬菌体是一类专性寄生于细菌和放线菌等微生物的病毒,其个体形态极其微小,用常规微生物计数法无法测得其数量。当烈性噬菌体侵染细菌后会迅速引起敏感细菌裂解,释放出大量

P1 噬菌体普遍性转导实验

实验方法原理 细菌病毒(噬菌体)分为烈性噬菌体和温和噬菌体。烈性噬菌体感染细胞后,伴随着细胞裂解会释放出新的子代噬菌体颗粒。被温和噬菌体感染的细胞或是裂解,释放出新的子代噬菌体颗粒,或是成为溶源状态,噬菌体的基因组整合到细菌染色体上,与细菌染色体一起复制,这时的噬菌体基因组称为原噬菌体(propha

建立随机重叠DNA插入文库实验

            试剂、试剂盒 乙酸铵 ATP 乙醇 甘油 蒸馏水 IPTG Mg

Nature子刊:制服“超级细菌”抗药性的妙药,来自动物粪便

  一类能专门杀死细菌的病毒——噬菌体,将来也许有一天会解决日益增长的超级细菌”感染问题。最近,贝勒医学院(BCM)等机构的科学家们发现,噬菌体可以有效地减少小鼠体内的细菌水平,包括对多种抗生素抗性的“超级细菌”,从而显著改善小鼠的健康。这一结果发表在《自然》子刊《Scientific Report

噬菌体竟然可以保护自身基因组免受CRISPR核酸酶切割

  细菌和感染它们的病毒正在进行一场与生命本身一样古老的分子军备竞赛。进化为细菌配备了一系列可靶向并破坏病毒DNA的免疫酶,包括CRISPR-Cas系统。但是,杀死细菌的病毒(也称为噬菌体)已设计出了它们自己的工具来帮助它们战胜这些最强大的细菌防御。  如今,在一项新的研究中,来自美国加州大学旧金山

Nature首次揭示噬菌体保护自身基因组免受CRISPR核酸酶切割

  细菌和感染它们的病毒正在进行一场与生命本身一样古老的分子军备竞赛。进化为细菌配备了一系列可靶向并破坏病毒DNA的免疫酶,包括CRISPR-Cas系统。但是,杀死细菌的病毒(也称为噬菌体)已设计出了它们自己的工具来帮助它们战胜这些最强大的细菌防御。  如今,在一项新的研究中,来自美国加州大学旧金山

真核表达文库的构建与筛选实验

实验材料 宿主细胞质粒或λ噬菌体表达载体包装提取物电转化感受态大肠杆菌试剂、试剂盒 限制性内切核酸酶缓冲液限制性内切核酸酶通过 poly(A)+富集的 mRNAcDNA 文库含适当抗生素的 Terrific 球脂平板含适当抗生素的 Terrific 肉汤培养基仪器、耗材 cDNA 合成试剂盒实验步骤

肠道噬菌体群或可作为RA出现临床症状前的生物标志物

  类风湿性关节炎(RA)是一种系统性自身免疫疾病,全球发病率为1%。罹患RA的危险因素包括遗传因素、流行病学因素和全身免疫失调,其中RA的遗传率估计为40%-60%,在确诊的RA患者的一级亲属(FDR)中,家族风险明显增加。在具有RA风险的FDRs中,即使血清中没有RA相关自身抗体,部分个体也会出

真核表达文库的构建与筛选实验

类似方案 1、方案 2 描述了在真核表达载体上进行 cDNA 文库构建与筛选的方法, 流程分为以下两个阶段:1. 在真核表达载体上构建 cDNA 文库;2. 在真核表达载体上构建的 cDNA 文库的筛选。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:黄培堂。实验材料宿主细胞质粒或λ噬菌体表达载体

有史以来最大噬菌体被发现了

  病毒感染细菌,就像流感病毒感染人类一样。  据加州大学伯克利分校的科学家们领导的一项最新研究显示,在人体肠道中发现了一些所谓的最大噬菌体,它们周期性地破坏细菌,就像季节性流感爆发使人体处于低谷一样。  这些“巨噬菌体”的基因组比普通噬菌体大10倍,比人类先前发现的任何噬菌体大两倍,它们只存在于食

真核表达文库的构建与筛选实验

            实验材料 宿主细胞 质粒或λ噬菌体表达载体 包装提取物 电转化感受态大肠杆菌