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“拉曼组内关联分析”揭示代谢物转化网络

细胞内代谢物之间是否正在发生相互转化,是细胞代谢活动最重要的动态特征之一,但其检测方法繁琐。为此,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心提出名为“拉曼组内关联分析”(Intra-Ramanome Correlation Analysis; IRCA)的理论框架与算法,并示范了细胞工厂功能测试等方面的应用。在无需标记或破坏细胞的前提下,IRCA仅需基于一个拉曼组数据点(即一个样品的一个状态),利用其中不同单细胞拉曼光谱的差异,就能推测该状态下的代谢物相互转化网络。相关研究成果于8月31日发表在mBio上。 传统上,代谢物相互转化网络的构建基于质谱或色谱等代谢组学方法,其通常破坏细胞,每次分析需要大量细胞,且要求基于一系列不同代谢状态的实验样品进行关联比较,导致整个过程十分繁琐。单细胞中心提出了基于“拉曼组”(ramanome)的原创解决方案。拉曼组是一个细胞群体在特定状态下单细胞拉曼光谱的集合,这些单细胞尽管遗传背景与......阅读全文

“拉曼组内关联分析”揭示代谢物转化网络

  细胞内代谢物之间是否正在发生相互转化,是细胞代谢活动最重要的动态特征之一,但其检测方法繁琐。为此,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心提出名为“拉曼组内关联分析”(Intra-Ramanome Correlation Analysis; IRCA)的理论框架与算法,并示范了细胞工厂功能测

拉曼技术正在坐等临床转化

拉曼技术正在坐等临床转化  “拉曼技术正在坐等临床转化。这项研究只需要有针对性地打破障碍,以拉曼作为临床工具向前迈进。” Mahadevan Jansen说。一旦这样,内外科医生将可以更加准确有效地诊断多种疾病。  一项正在进行的研究表明,基于拉曼的设备可以广泛应用在临床诊断中。此外,该技术可以用于

拉曼分析

当一束激发光的光子与作为散射中心的分子发生相互作用时,大部分光子仅是改变了方向,发生散射,而光的频率仍与激发光源一致,这中散射称为瑞利散射。但也存在很微量的光子不仅改变了光的传播方向,而且也改变了光波的频率,这种散射称为拉曼散射。其散射光的强度约占总散射光强度的10-6~10-10。拉曼散射的产生原

单细胞拉曼光谱助力揭示持留菌的代谢特征

  近期,中国科学院青岛生物能源与过程研究所与香港大学合作,利用单细胞拉曼光谱技术在单菌体精度揭示了持留菌的代谢特征,为研究微生物持留现象的产生和持留菌复苏的机制提供了进一步的线索,有助于开发针对慢性感染复发的新治疗策略和方法。  面对恶劣的生存条件和巨大的生存压力,微生物开发了多种策略,“持留”(

《分析化学》:基于拉曼组的肿瘤单细胞药敏检测新方法

   肿瘤药敏性检测方法学是抗癌药物评价和筛选的前提,也是临床化疗方案设计的基础。青岛能源所单细胞中心开发了基于拉曼组的肿瘤单细胞药敏检测新方法D2O-CANST-R,具有快速、低成本、单细胞器精度、识别耐药细胞、体现抗癌机制、可对接单细胞分选和测序等特色,为癌细胞-药物互作研究、抗癌药物筛选等提供

拉曼光谱的分析

  通过的结构分析解释光谱:  分子为四面体结构,一个碳原子在中心,四个氯原子在四面体的四个顶点。当四面体绕其自身的一轴旋转一定角度,或记性反演(r—-r)、或旋转加反演之后,分子的几何构形不变的操作称为对称操作,其旋转轴成为对称轴。CCI4有13个对称轴,有案可查4个对称操作。我们知道,N个原子构

基于拉曼组与机器学习的微藻种质挖掘新技术

  微藻是地球上代谢功能较为多样化的生物类群,在全球碳循环中发挥关键作用,也是生物技术产业中重要的一类光合细胞工厂。但微藻的种质鉴定和代谢功能检测繁琐,且自然界大部分微藻难以培养。近日,中国科学院青岛能源研究所单细胞中心发表了首个微藻拉曼组数据库,并结合机器学习示范了单细胞精度、快速的微藻种类鉴定和

药物成分的拉曼分析

进行拉曼分析的仪器品类丰富,包括适合手持式、实验室和教育用途的拉曼系统。 拉曼分析系统一般包括光谱仪、激光光源、操作软件和采样配件,客户可以根据自身要求选择模块化组件进行配置,也可以选择不同波长范围和分辨率要求的拉曼光谱仪。前言对检验和表征而言,拉曼光谱具有多种优势。它检测速度快,对样品

拉曼光谱的分析技术

几种重要的拉曼光谱分析技术1、单道检测的拉曼光谱分析技术2、以CCD为代表的多通道探测器的拉曼光谱分析技术3、采用傅立叶变换技术的FT-Raman光谱分析技术4、共振拉曼光谱分析技术5、表面增强拉曼效应分析技术拉曼光谱用于分析的优点和缺点 1、拉曼光谱用于分析的优点拉曼光谱的分析方法不需要对样品进行