“拉曼组内关联分析”揭示代谢物转化网络
细胞内代谢物之间是否正在发生相互转化,是细胞代谢活动最重要的动态特征之一,但其检测方法繁琐。为此,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心提出名为“拉曼组内关联分析”(Intra-Ramanome Correlation Analysis; IRCA)的理论框架与算法,并示范了细胞工厂功能测试等方面的应用。在无需标记或破坏细胞的前提下,IRCA仅需基于一个拉曼组数据点(即一个样品的一个状态),利用其中不同单细胞拉曼光谱的差异,就能推测该状态下的代谢物相互转化网络。相关研究成果于8月31日发表在mBio上。 传统上,代谢物相互转化网络的构建基于质谱或色谱等代谢组学方法,其通常破坏细胞,每次分析需要大量细胞,且要求基于一系列不同代谢状态的实验样品进行关联比较,导致整个过程十分繁琐。单细胞中心提出了基于“拉曼组”(ramanome)的原创解决方案。拉曼组是一个细胞群体在特定状态下单细胞拉曼光谱的集合,这些单细胞尽管遗传背景与......阅读全文
“拉曼组内关联分析”揭示代谢物转化网络
细胞内代谢物之间是否正在发生相互转化,是细胞代谢活动最重要的动态特征之一,但其检测方法繁琐。为此,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心提出名为“拉曼组内关联分析”(Intra-Ramanome Correlation Analysis; IRCA)的理论框架与算法,并示范了细胞工厂功能测
拉曼分析
当一束激发光的光子与作为散射中心的分子发生相互作用时,大部分光子仅是改变了方向,发生散射,而光的频率仍与激发光源一致,这中散射称为瑞利散射。但也存在很微量的光子不仅改变了光的传播方向,而且也改变了光波的频率,这种散射称为拉曼散射。其散射光的强度约占总散射光强度的10-6~10-10。拉曼散射的产生原
拉曼光谱结合人工智能无损表征微生物研究取得进展
近日,中科院微生物研究团队在微生物表征研究上取得进展,在线发表两项研究成果,利用拉曼光谱结合人工智能技术实现了微生物单细胞水平的快速准确鉴定并证明了使用拉曼光谱表征基因转录的可行性。 拉曼光谱作为化学分子的“指纹图谱”,可以对生物样品在溶液中进行无损、非标记、非接触的原位检测分析。在微生物研究
拉曼技术正在坐等临床转化
拉曼技术正在坐等临床转化 “拉曼技术正在坐等临床转化。这项研究只需要有针对性地打破障碍,以拉曼作为临床工具向前迈进。” Mahadevan Jansen说。一旦这样,内外科医生将可以更加准确有效地诊断多种疾病。 一项正在进行的研究表明,基于拉曼的设备可以广泛应用在临床诊断中。此外,该技术可以用于
首创拉曼云平台!轻松分析复杂数据!
成千上万条拉曼光谱数据,到底蕴含了哪些生物学意义?代码不熟、理论知识不足、终端算力不够,也想轻松徜徉拉曼数据瀚海?人工智能时代,一切皆有可能!在刚刚落幕的2024中国生命科学大会上,青岛星赛生物科技有限公司(以下简称“星赛生物”)正式发布了一站式拉曼组智能云专家系统——拉曼智云(RamanAI;ww
单细胞拉曼光谱助力揭示持留菌的代谢特征
近期,中国科学院青岛生物能源与过程研究所与香港大学合作,利用单细胞拉曼光谱技术在单菌体精度揭示了持留菌的代谢特征,为研究微生物持留现象的产生和持留菌复苏的机制提供了进一步的线索,有助于开发针对慢性感染复发的新治疗策略和方法。 面对恶劣的生存条件和巨大的生存压力,微生物开发了多种策略,“持留”(
《分析化学》:基于拉曼组的肿瘤单细胞药敏检测新方法
肿瘤药敏性检测方法学是抗癌药物评价和筛选的前提,也是临床化疗方案设计的基础。青岛能源所单细胞中心开发了基于拉曼组的肿瘤单细胞药敏检测新方法D2O-CANST-R,具有快速、低成本、单细胞器精度、识别耐药细胞、体现抗癌机制、可对接单细胞分选和测序等特色,为癌细胞-药物互作研究、抗癌药物筛选等提供
拉曼光谱的分析
通过的结构分析解释光谱: 分子为四面体结构,一个碳原子在中心,四个氯原子在四面体的四个顶点。当四面体绕其自身的一轴旋转一定角度,或记性反演(r—-r)、或旋转加反演之后,分子的几何构形不变的操作称为对称操作,其旋转轴成为对称轴。CCI4有13个对称轴,有案可查4个对称操作。我们知道,N个原子构
基于拉曼组与机器学习的微藻种质挖掘新技术
微藻是地球上代谢功能较为多样化的生物类群,在全球碳循环中发挥关键作用,也是生物技术产业中重要的一类光合细胞工厂。但微藻的种质鉴定和代谢功能检测繁琐,且自然界大部分微藻难以培养。近日,中国科学院青岛能源研究所单细胞中心发表了首个微藻拉曼组数据库,并结合机器学习示范了单细胞精度、快速的微藻种类鉴定和
科学家开发出物种代谢双靶向的微生物细胞及酶资源挖掘新技术
微生物及其合成的各种酶支撑着生物圈中较多关键的生态过程。在环境中高效识别与挖掘具有特定原位代谢功能的细胞和酶是微生物组科学与产业的热点。近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所联合自然资源部第一海洋研究所、山东大学等,开发了荧光原位杂交介导的拉曼激活单细胞分选与测序(FISH-scRACS-seq)
拉曼光谱的分析技术
几种重要的拉曼光谱分析技术1、单道检测的拉曼光谱分析技术2、以CCD为代表的多通道探测器的拉曼光谱分析技术3、采用傅立叶变换技术的FT-Raman光谱分析技术4、共振拉曼光谱分析技术5、表面增强拉曼效应分析技术拉曼光谱用于分析的优点和缺点1、拉曼光谱用于分析的优点拉曼光谱的分析方法不需要对样品进行前
拉曼光谱的分析技术
几种重要的拉曼光谱分析技术1、单道检测的拉曼光谱分析技术2、以CCD为代表的多通道探测器的拉曼光谱分析技术3、采用傅立叶变换技术的FT-Raman光谱分析技术4、共振拉曼光谱分析技术5、表面增强拉曼效应分析技术拉曼光谱用于分析的优点和缺点 1、拉曼光谱用于分析的优点拉曼光谱的分析方法不需要对样品进行
分析·拉曼光谱应用浅谈
01、拉曼光谱的发现和产生 光和介质分子相互作用时会引起介质分子作受迫振动从而产生散射光,其中大部分散射光的频率和入射光的频率相同,这种散射被称为瑞利散射,英国物理学家瑞利于1899年曾对其进行了详细的研究。在散射光中,还有一部分散射光的频率和入射光的频率不同。印度科学家Raman在1928
药物成分的拉曼分析
进行拉曼分析的仪器品类丰富,包括适合手持式、实验室和教育用途的拉曼系统。 拉曼分析系统一般包括光谱仪、激光光源、操作软件和采样配件,客户可以根据自身要求选择模块化组件进行配置,也可以选择不同波长范围和分辨率要求的拉曼光谱仪。前言对检验和表征而言,拉曼光谱具有多种优势。它检测速度快,对样品
拉曼光谱图怎么分析
拉曼光谱图分析:是基于印度科学家C.V.拉曼(Raman)所发现的拉曼散射效应,对与入射光频率不同的散射光谱进行分析以得到分子振动、转动方面信息,并应用于分子结构研究的一种分析方法。拉曼光谱(Raman spectra),是一种散射光谱。拉曼光谱分析法是基于印度科学家C.V.拉曼(Raman)所发现
拉曼光谱的分析技术
几种重要的拉曼光谱分析技术1、单道检测的拉曼光谱分析技术2、以CCD为代表的多通道探测器的拉曼光谱分析技术3、采用傅立叶变换技术的FT-Raman光谱分析技术4、共振拉曼光谱分析技术5、表面增强拉曼效应分析技术拉曼光谱用于分析的优点和缺点 1、拉曼光谱用于分析的优点拉曼光谱的分析方法不需要对样品进行
拉曼光谱图怎么分析
拉曼光谱图分析:是基于印度科学家C.V.拉曼(Raman)所发现的拉曼散射效应,对与入射光频率不同的散射光谱进行分析以得到分子振动、转动方面信息,并应用于分子结构研究的一种分析方法。拉曼光谱(Raman spectra),是一种散射光谱。拉曼光谱分析法是基于印度科学家C.V.拉曼(Raman)所发现
拉曼光谱图怎么分析
拉曼光谱图分析:是基于印度科学家C.V.拉曼(Raman)所发现的拉曼散射效应,对与入射光频率不同的散射光谱进行分析以得到分子振动、转动方面信息,并应用于分子结构研究的一种分析方法。拉曼光谱(Raman spectra),是一种散射光谱。拉曼光谱分析法是基于印度科学家C.V.拉曼(Raman)所发现
基于拉曼组的单细胞快检技术可同时定量检测
通过光合作用固定的二氧化碳与太阳能在生物体内有三种主要的存储形式:多糖、油脂和蛋白质,共同构成了生物碳存储与生物能源产业的物质基础。目前,对细胞中这三类高含能储碳分子的识别、表征和定量极为繁琐,通常难以在单个细胞精度测量,这限制了光合固碳细胞工厂的筛选与改造效率。中国科学院青岛生物能源与过程研究
拉曼介导靶向单细胞基因组原创技术研发成功
单细胞精度的海洋微生物组功能靶向性拉曼分选与测序技术(scRACS-Seq) 刘阳供图 海洋是地球上最大的活跃碳库,海洋微生物在全球碳循环中起着至关重要的作用,然而由于大部分海洋微生物尚难以培养、原位代谢功能难以测量等技术瓶颈,业界对于海洋微生物光合固碳的原位功能机制等重要
拉曼介导靶向单细胞基因组原创技术研发成功
单细胞精度的海洋微生物组功能靶向性拉曼分选与测序技术(scRACS-Seq) 刘阳供图 海洋是地球上最大的活跃碳库,海洋微生物在全球碳循环中起着至关重要的作用,然而由于大部分海洋微生物尚难以培养、原位代谢功能难以测量等技术瓶颈,业界对于海洋微生物光合固碳的原位功能机制等重要问题,仍然存在争议
单细胞拉曼结合靶向宏基因组揭示土壤活性抗生素耐药组
抗生素耐药性(AMR)在人类、环境和动植物间的传播,加剧全球“One Health”的负担。土壤是“One Health”的关键环节之一,所携带的抗生素耐药性可通过食物链等方式转移至人类而带来健康威胁。土壤中栖息着地球上最丰富多样的微生物,其中活性耐药菌在驱动土壤耐药性传播中具有关键作用。然而,
“拉曼光谱在药学方面的应用”网络讲座已开始
赛默飞世尔科技“拉曼光谱在药学方面的应用”网络讲座已经开始,点击下面的链接即可参加: http://www.antpedia.com:81/ant_video/thermo/thermo6/raman-spectra-drugs.html 然后输入您的用户名、邮
紫外拉曼与共振拉曼原理
荧光干扰问题和灵敏度较低严重阻碍了常规拉曼光谱的广泛应用。但近年来发展起来的紫外拉曼光谱技术有效地解决了上述问题。紫外拉曼光谱技术的出现和发展大大地扩展了拉曼光谱的应用范围。右图是紫外拉曼光谱避开荧光干扰的原理图。荧光往往出现在300nm-700nm区域,或者更长波长区域。而在紫外区的某个波 紫外
紫外拉曼与共振拉曼原理
荧光干扰问题和灵敏度较低严重阻碍了常规拉曼光谱的广泛应用。但近年来发展起来的紫外拉曼光谱技术有效地解决了上述问题。紫外拉曼光谱技术的出现和发展大大地扩展了拉曼光谱的应用范围。右图是紫外拉曼光谱避开荧光干扰的原理图。荧光往往出现在300nm-700nm区域,或者更长波长区域。而在紫外区
紫外拉曼与共振拉曼原理
荧光干扰问题和灵敏度较低严重阻碍了常规拉曼光谱的广泛应用。但近年来发展起来的紫外拉曼光谱技术有效地解决了上述问题。紫外拉曼光谱技术的出现和发展大大地扩展了拉曼光谱的应用范围。右图是紫外拉曼光谱避开荧光干扰的原理图。荧光往往出现在300nm-700nm区域,或者更长波长区域。而在紫外区的某个波
拉曼光谱的分析与应用
拉曼光谱仪原理是当一束频率为v0的单色光照射到样品上后,分子可以使入射光发生散射。大部分光只是改变光的传播方向,从而发生散射,而穿过分子的透射光的频率,仍与入射光的频率相同。在拉曼散射中,散射光频率相对入射光频率减少的,称之为斯托克斯散射,因此相反的情况,频率增加的散射,称为反斯托克斯散射,斯托克斯
拉曼光谱能分析出什么
1、单道检测的拉曼光谱分析技术。2、以CCD为代表的多通道探测器的拉曼光谱分析技术。3、采用傅立叶变换技术的FT-Raman光谱分析技术。4、共振拉曼光谱分析技术。5、表面增强拉曼效应分析技术。