通过突变特征分析发现新冠病毒的起源与自然过程相符

目前,与新冠病毒基因组序列最相似是从菊头蝠分离得到的RaTG13,其与新冠病毒的进化分歧大约发生在50年前。此后,直到疫情暴发前,新冠病毒已经积累了500多个突变。 中国科学院遗传与发育生物学研究所钱文峰研究组提出一种新的溯源策略——通过鉴定新冠病毒这500多个突变的频谱特征推测新冠病毒的历史宿主。作者首先确认了这一策略运用所需要满足的三个前提假设:第一,细胞环境在不同宿主之间存在差异,会在其携带的病毒基因组上产生宿主特异性的突变;第二,病毒基因组的新生突变主要是由宿主细胞内环境造成的;第三,病毒在进化中积累的突变特征主要是由新生突变决定的。 作者们在建立了该策略的理论基础后,构建了非典病毒、中东呼吸综合征病毒、新冠病毒以及与其相关的16种冠状病毒的进化树。这些病毒是前人从人、蝙蝠、骆驼、果子狸、穿山甲和刺猬等不同物种中分离得到并测序的。作者们鉴定了病毒进化历史上不同时期积累的突变,发现来源于不同宿主的病毒带有不同的突变......阅读全文

一文读懂如何破解新冠病毒基因组全长序列

随着疫情进入攻坚阶段,基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而,若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究,需获取完整的病毒基因组信息,这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性,华大智造可为新型冠状病毒高通量测序、序列

一文读懂如何破解新冠病毒基因组全长序列

随着疫情进入攻坚阶段,基于实时荧光RT-PCR法的核酸检测技术在新冠病毒快速鉴定及确诊中发挥了重要作用。然而,若要对新冠病毒来源、变异进化及致病机理等进行研究,需获取完整的病毒基因组信息,这离不开高通量测序和病毒序列组装。 为全面深入地揭示新冠病毒的相关特性,华大智造可为新型冠状病毒高通量测序、序列

通过突变特征分析发现新冠病毒的起源与自然过程相符

  目前,与新冠病毒基因组序列最相似是从菊头蝠分离得到的RaTG13,其与新冠病毒的进化分歧大约发生在50年前。此后,直到疫情暴发前,新冠病毒已经积累了500多个突变。  中国科学院遗传与发育生物学研究所钱文峰研究组提出一种新的溯源策略——通过鉴定新冠病毒这500多个突变的频谱特征推测新冠病毒的历史

新冠病毒已突变

  新冠病毒是否已经发生突变?如何突变?这是目前学界研究的焦点之一。中国科研团队最新发现显示:新冠病毒已于近期产生了149个突变点,并演化出了两个亚型,分别是L亚型和S亚型。研究发现,在地域分布及人群中的比例,这两个亚型表现出了很大测差异。其中S型是相对更古老的版本,而L亚型更具侵略性传染力更强。对

新冠病毒疾病临床特征研究

  2 月 28 日,由国家卫健委高级别专家组组长、中国工程院院士钟南山领衔,国家卫健委高级别专家组成员、中国工程院院士李兰娟等参与的新冠病毒疾病临床特征研究,在《新英格兰医学杂志》正式发表。  分析发现,过半患者入院时无发热表现;初次就诊时,有2.9%的重症患者和17.9%的非重症患者未发现影像学

无需PCR,这项技术半小时就能获得新冠病毒基因序列

   当前,针对新型冠状病毒的主要检测技术有免疫、PCR和高通量测序(NGS)三类,其中免疫和PCR方法是一种定向检测,可以对病毒进行筛查,适合对患者标本中是否存在病毒进行诊断。图片来源于网络  高通量测序作为一种全面的基因组检测技术,虽然它可以有效防止病毒变异产生的漏检,但因实验流程耗时长,操作繁

新冠病毒全基因组大小和序列的研究进展

  2月3日,《自然》在线发表论文介绍了上海公共卫生临床中心和复旦大学公共卫生学院教授张永振等人对2019-nCov的基因组序列的分析。该病毒基因组从就职于出现首批患者的海鲜市场的一名病人身上获得。基因组分析显示,该病毒与此前在中国蝙蝠体内找到的一组SARS样冠状病毒密切相关。  通过对从患者收集的

分析变异毒株突变-新冠病毒精确完整基因注释图谱完成

  美国麻省理工学院的科学家在11日出版的《自然·通讯》杂志撰文称,在进行了广泛的比较基因组学研究之后,他们绘制出了新冠病毒迄今最精确完整的基因注释图谱,确认了几种蛋白质编码基因,也发现有些基因并不编码任何蛋白质。此外,他们还分析了新冠病毒不同毒株产生的近2000个突变,从而能更好地评估这些突变的重

一文解读新冠病毒和流感病毒的异同!

  最近几周,新型冠状病毒的爆发成为了新闻头条,但还有另一种病毒在世界各国肆虐:流感病毒。但是这些病毒差异大么,哪一种更令人担忧呢?  到目前为止,这种新型冠状病毒已经导致全球超过89000人患病,3000人死亡。但这和流感比起来就不值一提了。根据美国疾病控制与预防中心(CDC)的数据,仅在美国,这

新冠病毒密码子演化规律揭示,疫苗优化成为可能

2023年6月2日,北京大学生命科学学院陆剑教授课题组与中国医学科学院病原生物学研究所钱朝晖研究员课题组合作,在Advanced Science杂志在线发表了题为“Optimization and deoptimization of codons in SARS-CoV-2 and related

三种突变协同产生新冠病毒新变体

就像一轮轮暴风雨袭击船只一样,新冠病毒变体一个接一个地冲击着世界。最近,密切关注病毒变异的科学家注意到了一个趋势:许多变异携带相同的3个突变。在《ACS生物化学》杂志上发表的一项新研究中,研究人员检查了这些突变怎样改变病毒关键部分的功能,以及这个三元组合如何改变导致和维持新冠感染所需的特征。在过去的

专家:奥密克戎是否会成为新的主要流行株还难以判断

  中国医学科学院病原生物学研究所研究员钱朝晖30日在北京表示,根据南非最近报道的流调数据,奥密克戎变异株的传播速率确实非常快,但奥密克戎是否会超越德尔塔成为新的主要流行株,基于目前的数据还难以判断。  中国国务院联防联控机制当天召开新闻发布会。针对奥密克戎变异株流行状况及其病毒传播性,中国疾控中心

专家:奥密克戎是否会成为新主要流行株还难判断

(抗击新冠肺炎)专家:奥密克戎是否会成为新的主要流行株还难以判断 中新社北京11月30日电 (记者 李纯)中国医学科学院病原生物学研究所研究员钱朝晖30日在北京表示,根据南非最近报道的流调数据,奥密克戎变异株的传播速率确实非常快,但奥密克戎是否会超越德尔塔成为新的主要流行株,基于目前的数据

联合研究评估儿童新冠病毒感染特征

   广州医科大学和澳门科技大学医学院的张康、广州医科大学的夏慧敏和合作者对745名中国儿童进行了新冠病毒感染的筛查,其中十名确诊感染新冠病毒新冠病毒的儿童出现了与感染新冠呼吸道疾病相关的轻微症状。研究还指出,粪便样本中能检测到新冠病毒的时间比鼻咽拭子更长。不过,仍需开展样本量更大的研究,以进一步明

专家:中国主流核酸检测试剂可以应对奥密克戎变异株

  中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所所长许文波30日在北京表示,中国主流的核酸检测试剂可以应对奥密克戎变异株的输入。  中国国务院联防联控机制当日就进一步做好新冠病毒疫苗接种有关情况举行新闻发布会。许文波在发布会上作上述表示。  针对目前使用核酸检测试剂是否可以有效检测出奥密克戎变异株,许文波指

中国主流核酸检测试剂可以应对奥密克戎变异株

(抗击新冠肺炎)中疾控专家:中国主流核酸检测试剂可以应对奥密克戎变异株 中新社北京11月30日电 (记者 李纯)中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所所长许文波30日在北京表示,中国主流的核酸检测试剂可以应对奥密克戎变异株的输入。 中国国务院联防联控机制当日就进一步做好新冠病毒疫苗接种有关情况

科学新发现|基因突变揭示为什么有人不会感染新冠病毒

  有这么一群人,反复暴露于新冠病毒但看似未曾感染,或感染后始终无症状,即所谓的“超级躲避者”。  美国研究人员19日在《自然》杂志上发表的一篇论文,首次证明这群人存在遗传基础,“秘诀”就在于人类白细胞抗原(HLA),即向免疫系统发出信号的蛋白质标记物。HLA的变异基因HLA-B*15:01,似乎有

新冠病毒会发生突变而逃避抗体识别吗

新冠肺炎康复患者体内的中和抗体被认为能够在新冠病毒再次入侵时,识别出病毒的刺突蛋白,并阻止病毒感染。而在一项最新研究中,美国洛克菲勒大学的研究团队通过基因工程让水疱性口炎病毒(一种感染牲畜的病毒)拥有新冠病毒的刺突蛋白。他们发现,当中和抗体存在时,病毒的刺突蛋白可以获得突变,逃避抗体的识别。而在少数

免疫系统识别新冠突变病毒的“双保险”

  逃得过中和抗体,逃不过T细胞,免疫系统识别新冠突变病毒的“双保险”  上周,Novavax公司和强生(Johnson & Johnson)公司相继公布了各自开发的新冠疫苗在3期临床试验中获得的积极结果。这两项临床试验结果也都指出,两款疫苗在南非进行的临床试验中产生的保护效力都显著低于其它地区。对

新冠突变病毒株将使用希腊字母标识

  今日,世界卫生组织(WHO)宣布,将使用希腊字母来标识重要的新冠突变病毒株。这些标签更容易读写,也更容易记忆。  此前,对新冠突变病毒株有不同的科学命名,它们携带着病毒谱系的重要信息,以后也将被继续使用。然而,这些科学命名通常比较难读或者难于记忆,也容易写错。因此,人们经常会用病毒最先发现的地点

突变率惊人!新冠患者病毒存在快速进化风险

  国际学术期刊《临床传染病》(Clinical Infectious Diseases)日前刊发来自中国研究团队的一篇名为《新冠病毒在患者体内的基因多样性(Genomic diversity of SARS-CoV-2 in Coronavirus Disease 2019 patients)》论

新冠病毒会发生突变而逃避抗体识别吗

新冠肺炎康复患者体内的中和抗体被认为能够在新冠病毒再次入侵时,识别出病毒的刺突蛋白,并阻止病毒感染。而在一项最新研究中,美国洛克菲勒大学的研究团队通过基因工程让水疱性口炎病毒(一种感染牲畜的病毒)拥有新冠病毒的刺突蛋白。他们发现,当中和抗体存在时,病毒的刺突蛋白可以获得突变,逃避抗体的识别。而在少数

日本首相岸田文雄确诊感染新冠病毒

日本内阁官房21日下午发布消息说,日本首相岸田文雄确诊感染新冠病毒。内阁官房相关人士说,岸田20日晚出现低烧、咳嗽等症状,21日上午10时在首相官邸接受新冠病毒检测,下午4时确诊感染新冠病毒。目前岸田正在官邸疗养,其夫人及长子被确认为密接者。岸田自本月15日开始暑期休假,原定于22日恢复工作,目前正

最新研究成果揭示新冠病毒的传播特征

   国际学术期刊《自然》近日正式刊印了华中科技大学公共卫生学院团队的最新研究成果,这一研究是在前期总结武汉市公共卫生干预措施与疫情流行趋势关联性的论文基础上,进一步通过数学模型评估了防控效果,揭示了新冠病毒的传播特征。  记者25日从华中科技大学获悉,该研究考虑了人口流动和干预强度在不同阶段的变化

最新研究——新冠病毒装配蛋白速度可能越来越慢

  “在利用人类细胞资源合成病毒蛋白方面,新冠病毒没有朝着效率最高、机制最优的方向演化,而是呈现‘去优化’的演化趋势。”6月25日,北京大学教授陆剑在接受科技日报记者采访时介绍,这一结论来自其与中国医学科学院钱朝晖课题组的合作研究,他们对900多万条高质量新冠病毒测序序列进行了分析。  “新冠病毒和

新冠病毒胶体金试剂:快速检测新冠病毒

   23日下午,中国工程院院士钟南山在广州医科大学附属第一医院首次与广东对口支援湖北荆州医疗队进行远程会诊。会上,他带来了一个“好消息”:国家批准了两个抗体试剂盒。  “这两种试剂盒都是采用胶体金法,能够测出患者体内的lgM抗体,在患者感染的第7天或发病的第3天就能够检测出lgM抗体,对患者进一步

一文详解新冠病毒检测中的咽拭子

  正常人咽峡部培养应有口腔正常菌群,而无致病菌生长。咽部的细菌均来自外界,正常情况下不致病,但在机体全身或局部抵抗力下降和其他外部因素下可以出现感染等而导致疾病。因此,咽部拭子细菌培养能分离出致病菌,有助于白喉、化脓性扁桃体炎、急性咽喉炎等的诊断。  由于呼吸和食物都通过口腔,因此口腔中会有形形色

一文告诉你新冠病毒检测方法是什么?

  在卫健委发布的《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第六版)》中,诊断标准描述为:确诊病例需有病原学证据阳性结果(实时荧光RT-PCR检测新型冠状病毒核酸阳性;或病毒基因测序,与已知的新型冠状病毒高度同源)。  问题来了,核酸检测是怎么做到的呢?  首先医护人员要先采集患者的咽拭子样本,样本采集完成后

北京昨日新增22例本土病例-又一地区升至高风险

  6月19日0—24时,31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例27例,其中境外输入病例4例(广东3例,上海1例),本土病例23例(北京22例,河北1例);无新增死亡病例;新增疑似病例4例,均为本土病例(均在北京)。   6月19日0时至24时,北京新增报告本地确诊病例22例、

新冠病毒与菊头蝠冠状病毒共同特征新进展

  英国《自然》杂志的预印本平台“研究广场”日前登载的一项研究显示,在老挝北部某些洞穴中栖息的菊头蝠所携带的冠状病毒与新冠病毒具有共同关键特征,这表明自然界存在与新冠病毒密切相关的病毒。  在这项新研究中,法国巴斯德研究所和老挝大学的研究人员于2020年7月至2021年1月间在老挝北部石灰岩“岩溶地