解读“生命之书”新发现填补人类基因组图谱空白
美国加州大学圣地亚哥分校(UCSD)的研究人员制作了一份人类基因组的单细胞染色质图谱,确定了240种多基因特征和与疾病特征相关的细胞类型,并注释了非编码DNA变异的风险,有利于更好地理解遗传学与疾病之间的联系。这一发现发表在12日的《细胞》杂志在线版上。 此前,科学家在公布最新的被称为“生命之书”的人类基因组图谱时称,更为精确的计算表明,人类基因数量实际在2万到2.5万之间。然而,这个估计并不能真正解释蛋白质编码基因构建过程的确切工作方式,或者不适用于患有疾病的情况。 UCSD细胞和分子医学教授、路德维希癌症研究所成员、表观基因组学中心主任任兵(音译)博士是DNA元素百科全书项目成员之一。他表示,人类基因组在20年前就已被测序,但解读这本“生命之书”的意义仍然很有挑战性。一个主要原因是,人类DNA序列中超过98%是非蛋白质编码的,我们还没有遗传密码来“解锁”这些序列中嵌入的信息。 DNA携带细胞的遗传指令。染色质中的主......阅读全文
分子遗传学词汇丰余DNA
中文名称:丰余DNA英文名称:redundant DNA定 义:在真核生物基因组中具有多个拷贝数的重复DNA序列。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
分子遗传学词汇B型DNA
中文名称:B型DNA发表人:Watson和Crick时间:1953年Watson和Crick在nature上发表了DNA双螺旋模型首次简要阐明了复杂DNA分子的二级结构,明确提出特异碱基配对可能是遗传物质的复制机制。
分子遗传学词汇常居DNA
中文名称: 常居DNA英文名称: resident DNA中文解释:同一细胞内不同类型DNA的总称。包括细胞核DNA、质粒DNA和噬菌体DNA。
DNA甲基化——表现遗传学中DNA的修饰
DNA甲基化是哺乳动物DNA最常见的复制后调节方式之一,是正常发育、分化所必需的,具有重要的生物学意义。在DNA甲基转移酶 (DNAmethyltransferase,DNMT)的作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(SAM)为甲基供体,可以将甲基基团转移到基因组DNA胞嘧啶第 5位碳原子(C5)
续写十大科学突破-Science公布重要甲基化图谱
来自耶路撒冷希伯来大学的科学家们在一项最新研究中,重构了尼安德特人与丹尼索瓦人的DNA甲基化图谱,并将其进行了比对,这对于深入探索表观遗传学调控机制,以及表观遗传差异造成的形态学差异具有重要意义。 2010年,2012年Science十大科学突破接连聚焦于古人类的DNA基因组序列测定结果,
GenomeResearch:双生子表观基因组研究
基因决定了人生命中的方方面面,不过环境也能对基因产生强烈的影响,这种影响在人出生前就已产生,而且其造成的影响将会伴随人的一生。日前,研究人员首次展示了子宫内环境对新生儿表观遗传学图谱的影响,即我们出生时就带有的DNA化学修饰,这项研究将为人们提供宝贵的疾病风险信息。文章发表在7月16日的Geno
玉米基因组更详细图谱出炉
美国研究人员12日在《自然》杂志网络版上发表论文称,他们利用新一代测序技术对玉米自交系B73进行测序,得到了新的、更详细的基因组图谱。研究显示,玉米具有良好的表型可塑性,不同品系玉米的基因组差异明显。这意味着在全球气候环境变化不断加剧的情况下,玉米仍有巨大的发展空间。 玉米是生物学研究中的重要
小须鲸全基因组图谱获破译
11月25日,韩国海洋科学技术研究所、深圳华大基因研究院等宣布成功破译了小须鲸全基因组图谱,并对鲸类独特生理习性的遗传学机制进行了分析。相关成果在线发表于《自然—遗传学》杂志。 人们一直痴迷于海洋生物是如何演化为陆生生物的。鲸类的进化却反其道而行之,由陆生向水生演化,和陆生偶蹄动物如牛、猪等
玉米基因组更详细图谱出炉
美国研究人员12日在《自然》杂志网络版上发表论文称,他们利用新一代测序技术对玉米自交系B73进行测序,得到了新的、更详细的基因组图谱。研究显示,玉米具有良好的表型可塑性,不同品系玉米的基因组差异明显。这意味着在全球气候环境变化不断加剧的情况下,玉米仍有巨大的发展空间。 玉米是生物学研究中的重要
老鼠基因组单体型图谱出炉
美国的研究人员希望通过对15只常用于生物医药研究的小鼠的DNA进行研究来帮助科研人员确定出与环境疾病敏感性相关的基因。目前这些数据被存放在了基因变异数据目录之下,即小鼠基因组单体型图谱(将染色体分隔成许多小的片段),从而帮助研究人员找出小鼠中影响健康和疾病的基因和遗传变异。这个单体型图谱公布在7月2
铁树“开花”:苏铁喜获完整基因组图谱
苏铁基因组图谱研究由来自22个科研机构的65位科学家联合完成。 苏铁目系统发育树支持现存苏铁是在经历大量灭绝以后,几次辐射演化的后代。如今苏铁有2科10属。(刘阳供图) 也许你不熟悉苏铁类植物,但你一定听说过“铁树开花”这个成语,比喻事情很难实现。相传因受苏东坡青睐,铁树得名“苏铁”。作为现存最
基因组物理图谱的主要构架途径
基因组物理图谱的构建不需要经过减数分裂的世代群体,可直接利用DNA分子分析,主要有以下三种构建途径:限制性酶图谱。利用限制性内切酶构建图谱,对于DNA分子长度在50kb以下的片段,一般没有什么困难。而对于大于50kb的DNA分子,可选用稀有切点的内切酶酶切DNA。(1)用识别较多核苷酸的内切酶,如N
Scientific-Reports:创建首个全面基因组图谱
近日,澳大利亚加文医学研究所的研究人揭示身体不同部位脂肪积聚所造成的伤害的驱动因素。他们的一项新研究比较了皮肤下的脂肪细胞和腹部内的有害脂肪,创建了第一个全面的基因组图谱。该图谱揭示了在细胞发育早期独特的特征,不同类型的脂肪似乎“硬捆绑”(hard-wire)在一起。该研究发表于Scientif
细胞遗传学——比较基因组杂交(CGH)
· Comparative Genomic Hybridization (CGH) CGH is a molecular Cytogenetic method of screening a tumor for genetic changes. The alterations are
基因组DNA的提取
第一节 概 述DNA的提取通常用于构建文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中,可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部,
基因组DNA的提取
基因组DNA的提取概 述 基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分
基因组DNA的定义
中文名称基因组DNA英文名称genomic DNA定 义组成生物基因组的所有DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
OPGEN全基因组图谱应用系列——鞭虫全基因组测序
鞭虫是一种常见的土壤传播寄生虫,地理分布广,感染率高,寄生于人体盲肠,导致人体慢性感染,对人类危害巨大。鞭虫的全基因组测序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,发表在世界顶级期刊《Nature Genetics》上。该研究通过对2种不同
Nature子刊发布大脑表观遗传学重要图谱
表观遗传修饰的重要性越来越被人们所认识,但在人类大脑中的作用并不是很清楚,实际上在胚胎和成人大脑中,神经干细胞增殖并通过一些受到高度调控的过程生成神经元和神经胶质,包括DNA和组蛋白修饰以及非编码RNAs调控在内的表观遗传学机制在神经发生的不同阶段发挥至关重要的作用。另一方面异常的表观遗传调控也
DNA-指纹的图谱相关内容
取决于所用探针的核心序列(即重复序列中的重复单位)。目前所用的探针有两种,即探针33.15 。其核心序列为AGAGGTGGGCAGGTGG, 和33.6 ,即AGGGCTGGAGG 。这就是说这两种序列在人体基因组中不同的位置上分别重复不同的次数,而在不同个体的基因组中,对应位置上这两种核心序列
世界首份个人DNA图谱出炉
57年前,美国生物学家詹姆斯·沃森与弗朗西斯·克里克共同发现了脱氧核糖核酸(DNA)分子结构的双螺旋模型,并因这项基因研究领域的重大突破获得诺贝尔奖。今天,沃森成为自己研究的受益者——他将成为世界第一份完全破译的“个人版”基因组图谱的拥有者。 据英国《独立报》5月27日报道,位于美国
牧草DNA指纹图谱应用前景看好
牧草品种的真假和种子质量的优劣直接关系到草业生产安全、农民增收和农(牧)区社会稳定。随着农牧业生产对优良牧草品种需求的提高,每年进入市场的育成牧草新品种数量也在快速增加,各种优良牧草品种越来越受到青睐,种植面积越来越大。而一些不法商家在利益驱动下,在种子生产经营过程中以假乱真、以次充好,坑农害农
DNA指纹图谱分析(图)(二)
DNA指纹图谱法的基本操作:从生物样品中提取DNA(DNA一般都有部分的降解),可运用PCR技术扩增出高可变位点(如VNTR系统,串联重复的小卫星DNA等)或者完整的基因组DNA,然后将扩增出的DNA酶切成DNA片断,经琼脂糖凝胶电泳,按分子量大小分离后,转移至尼龙滤膜上,然后将已标记的小卫星DNA
DNA修饰图谱揭示人脑发育过程
由美国加州大学洛杉矶分校牵头的一项研究,揭示了人类大脑发育过程中基因调控的演变方式,并展示了染色质的3D结构在其中发挥的关键作用。研究人员绘制了海马体和前额叶皮质中DNA修饰的首张图谱,这两个大脑区域对学习、记忆和情绪调节至关重要,也常与自闭症和精神分裂症等疾病相关。这项研究为早期大脑发育如何影响身
JCB:“流放”DNA的表观遗传学修饰
皮肤细胞在发挥作用时启动的基因与肝细胞完全不同,而其他基因需要保持关闭。将基因“流放”到细胞核边缘,是能够一举关闭大量基因的重要途径。Johns Hopkins大学的一项新研究揭示了DNA被发配到细胞核边疆的具体机制,这一过程对于控制基因表达和决定细胞命运至关重要。相关论文发表在近期的Journ
分子遗传学词汇染色体外DNA
中文名称:染色体外DNA英文名称:extrachromosomal DNA定 义:存在于染色体外的DNA。包括线粒体DNA、叶绿体DNA和质粒DNA等。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
分子遗传学词汇DNA多态性
中文名称:DNA多态性外文名称:polymorphism定 义:DNA多态性是指群体内某个基因座存在2个或多个等位基因形成而造成的同种DNA分子的多样性,是单一基因座等位基因变异性在群体水平的体现。凡在群体中出现频率大于1%的变异体,不论其是正常还是致病性,称多态性;频率低于1%的变异体,
Nature遗传学:生孩子由DNA决定?
什么时候生孩子、生几个孩子,这些问题似乎纯粹是个人选择。牛津大学和格罗宁根大学的研究人员首次揭示了这些生殖行为的生物学基础。他们十月三十一日在Nature Genetics杂志发表文章指出,人类生殖行为与12个DNA区域密切相关。 研究人员对62个数据集进行了深入研究,分析了238,064名男
Nature遗传学:生孩子由DNA决定?
什么时候生孩子、生几个孩子,这些问题似乎纯粹是个人选择。牛津大学和格罗宁根大学的研究人员首次揭示了这些生殖行为的生物学基础。他们十月三十一日在Nature Genetics杂志发表文章指出,人类生殖行为与12个DNA区域密切相关。研究人员对62个数据集进行了深入研究,分析了238,064名男女首次生
分子遗传学词汇核糖体DNA
中文名称:核糖体DNA外文名称:Ribosomal DNA,rDNA定义:核糖体DNA(Ribosomal DNA,rDNA)是一种DNA序列,该序列用于rRNA编码。核糖体是蛋白质和rRNA分子的组合,翻译mRNA分子以产生蛋白质的组件。真核生物的rDNA包括一个单元段,一个操纵子,以及由NTS、