一种全新的高精度纳米孔蛋白测序法
长期以来，直接读取蛋白质的一级结构存在许多困难。科学家通常会根据基因序列和氨基酸密码子表来“破译”蛋白质的氨基酸序列。由于转录后修饰和翻译后修饰等生命活动的存在，氨基酸序列破译结果并非完全正确，甚至与真实序列有很大差异。近期，荷兰科学家开发出高精度纳米孔蛋白测序法，该技术能够读取蛋白质信息内容，直接对蛋白质的氨基酸序列进行测序。研究成果发表在《Science》期刊，标题为“Multiple rereads of single proteins at single–amino acid resolution using nanopores”。 研究人员开发出基于纳米孔技术的单分子肽“阅读器”。在Hel308 DNA解旋酶的作用下，将DNA-肽偶联物拉过MspA纳米孔，此时纳米孔会在离子流中产生独特的阶梯状电流信号。通过配套的识别软件，可以准确识别电流信号，并对电流中值进行分析，从而回溯确认序列的信息。进一步研究显示，在构建的......阅读全文
国内首个菊花脑基因组测序纳米孔测序再发高分论文
菊属植物种类繁多，又含多种栽培种，兼具观赏和药用价值，且染色体组结构从2n=18到8n=72之间，十分复杂，多年来难以攻破。 中药所所长陈士林研究员、副研究员宋驰博士等利用ONT平台解析了可能代表栽培菊属祖先基因组的二倍体菊花脑基因组，分析表明其演化受重复序列爆发和近期WGD事件的驱动，该基因
GEN：纳米孔测序——传染病诊断的新“前锋”
假设你是Doctors Without Borders组织中在西非工作的一名医生，一个发热、头疼、疲劳的小孩被带进你的诊所。根据当地的环境和季节，最可能被诊断出的就是疟疾或埃博拉。然而，这两种疾病都不能给病人一个积极的预后。埃博拉病毒能够快速传播给其他人，需要将患者尽快隔离。 这种情况下，确诊
170万！复旦大学纳米孔测序仪招标项目
项目概况 复旦大学纳米孔测序仪 招标项目的潜在投标人应在复旦大学采购与招标管理系统（网址为：https://czzx.fudan.edu.cn）获取招标文件，并于2023年12月21日 09点30分（北京时间）前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号：1069-234Z20234618
纳米孔直接RNA和cDNA长读长测序概述
RNA测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中，转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本，可以为疾病的诊断和治疗提供信息。RNA测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时，cDNA测序也极大
美国批准“纳米孔测序”新冠检测试剂EUA
纽约 -美国食品药品监督管理局上周授予美国实验室公司紧急使用授权，用于基于纳米孔测序的检测SARS-CoV-2的试剂。 该试剂被称为Clear Dx SARS-CoV-2 WGS v3.0测试，使用牛津纳米孔技术的MinIon测序仪和Clear Labs Clear Dx自动样品制备和分析流
纳米孔直接RNA和cDNA长读长测序概述
RNA测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中，转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本，可以为疾病的诊断和治疗提供信息。RNA测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时，cDNA测序也极大
新型纳米孔器件有望用于表观遗传学快捷测序
新华社布鲁塞尔５月９日电（记者潘革平）比利时校际微电子中心（ＩＭＥＣ）９日发表公报说，该中心成功开发出一种能直接读取单分子ＤＮＡ（脱氧核糖核酸）碱基的新型光学纳米孔器件，有望用于遗传学研究快捷测序。 据介绍，新型器件结合了表面增强拉曼光谱和纳米孔流体技术，能以超高分辨率，实现无标记检测ＤＮ
纳米孔测序联合光学测绘揭示转基因植物细节
索尔克的研究人员利用最新的DNA测序技术，在分子水平上研究植物插入新基因后会发生什么。 索尔克的研究人员绘制了具有最高分辨率的转基因植物系基因组和表观基因组图，为了精确地揭示插入一段外源DNA后，在分子水平上会发生什么。他们的研究结果发表在2019年1月15日的PLOS Genetics，阐明
三代测序的前奏：Illumina再诉牛津纳米孔
Illumina今天正式宣布起诉Oxford Nanopore，诉讼涉及后者在纳米孔测序相关领域涉嫌侵犯Illumina两项ZL。 Illumina同时向美国国际贸易委员会和美国南加州地方法院提出此次诉讼，起诉Oxford Nanopore侵犯其美国ZL局第8673550号和9170230号Z
哪些因素影响纳米孔测序仪的重复性？
掌上测序仪好不好？用过才知道。最近，五个试用了Oxford Nanopore MinION测序仪的实验室评估了仪器的重复性，并在开发标准操作和参考数据。这些实验室属于MinION分析和参考联盟（MARC），该联盟由MinION早期试用计划的参与者组成。目前，第一阶段的结果已经发表在开放获取期刊
英一公司称研发出纳米孔基因测序技术
早上起来刷个牙，就能顺便检测自己有没有患癌症或者老年痴呆的危险。这种便利方式离我们不远了。英国一家公司首席技术官克莱夫·布朗24日在一次医学会议上说，借助纳米孔基因测序技术，有望很快实现测序仪微型化，从而使它们“无处不在”，持续监测我们的健康状况。 纳米孔基因测序技术采用微
新型纳米孔器件有望用于表观遗传学快捷测序
比利时校际微电子中心（ＩＭＥＣ）９日发表公报说，该中心成功开发出一种能直接读取单分子ＤＮＡ（脱氧核糖核酸）碱基的新型光学纳米孔器件，有望用于遗传学研究快捷测序。 据介绍，新型器件结合了表面增强拉曼光谱和纳米孔流体技术，能以超高分辨率，实现无标记检测ＤＮＡ中的遗传编码以及表观遗传变异。研究近期发
第三代高通量测序技术简介——纳米孔
第一代Sanger法为DNA测序打开了大门，但它高昂的费用限制了在大规模测序工程上的使用。当今发展迅猛的第二代高通量测序设备，包括Illumina的Solexa、Roche 454系列以及ABI的SOLiD系统等，使测序费用大幅降低到60-1美元/megabase。 它们共同的缺点是
用纳米孔检测蛋白质获重要突破
对通过纳米孔的DNA进行测序，可提供长的读长，单分子的读数，并且能够避免昂贵的荧光标记和费时的扩增步骤。那么，纳米孔方法能为蛋白质研究做什么呢？ 虽然肉眼看不见，但是这种最新的分子生物学技术是强大的。纳米孔的直径约4纳米，是一层人造膜上产生的一个纳米孔，使研究人员能够收集一系列测量，对通过这些
纳米孔技术检测蛋白质获重要突破
对通过纳米孔的DNA进行测序，可提供长的读长，单分子的读数，并且能够避免昂贵的荧光标记和费时的扩增步骤。那么，纳米孔方法能为蛋白质研究做什么呢？ 虽然肉眼看不见，但是这种最新的分子生物学技术是强大的。纳米孔的直径约4纳米，是一层人造膜上产生的一个纳米孔，使研究人员能够收集一
拉曼光谱应用：新型光学纳米孔器件有望用于快捷测序
比利时校际微电子中心（IMEC）9日发表公报说，该中心成功开发出一种能直接读取单分子DNA（脱氧核糖核酸）碱基的新型光学纳米孔器件，有望用于遗传学研究快捷测序。 据介绍，新型器件结合了表面增强拉曼光谱和纳米孔流体技术，能以超高分辨率，实现无标记检测DNA中的遗传编码以及表观遗传变异。研究近期发
武大联合团队开发纳米孔靶向测序－快速“捕获”新冠病毒
武汉大学联合团队创新性开发了纳米孔靶向测序检测方法（NTS），能大幅提升病毒阳性检出率，并能实现当天同时检测新冠和其他10大类、40种常见呼吸道病毒并监测病毒突变。 3月7日，该团队在预印版平台medRxiv发表题为《纳米孔靶向测序精准全面检测新冠病毒以及其他呼吸道病毒》的研究论文。 既往
2016国家自然科学基金：纳米孔测序技术
来自国家自然科学基金委员会的消息，8月17日国家自然科学基金委员会公布了2016年国家自然科学基金申请项目评审结果，其中面上项目16934项、重点项目612项、创新研究群体项目38项、优秀青年科学基金项目400项、青年科学基金项目16112项、地区科学基金项目2872项、海外及港澳学者合作研究基
首次！纳米孔测序让流感病毒终于“无所遁形”|－Nature
4月12日，这项研究的领导者、美国疾病控制和预防中心（CDC）的微生物学家John Barnes在给bioRxiv服务器（生命科学领域专有的预印本文献库）的预印本（a preprint posted）中介绍了这项工作，他说：“我们第一次可以真正开始观察基因组在其原始状态的本质，这确实开始开辟了很
纳米孔测序重大升级，超高准确度，向临床诊断迈进！
近年来，第三代基因测序技术发展迅速，在基因组学研究以及临床疾病诊断领域备受青睐。该领域上游企业英国Oxford Nanopore Technologies（以下简称“ONT”）因其测序技术在样本处理以及成本等方面占据较大优势，而受到国内基因测序服务企业的钟爱。相较于二代测序，三代测序技术拥有单分子无
nanoporetech－使用纳米孔测序技术的微生物学
完整的细菌，真菌和病毒（DNA或RNA）基因组，可进行长时间的纳米孔测序。通过快速的病原体检测方法（无论是在实验室还是在野外），从环境或单一生物样品中鉴定并鉴定微生物。如果需要，还应附有抗菌素耐药性分析。使用直接RNA或cDNA方法对全长转录本进行测序，以进行准确的基因表达和转录本亚型分析。 通过长
中国科学家提出纳米孔糖测序技术路线图
基于在纳米孔糖测序这一前沿方向的率先探索和重要进展，中国科学院上海药物研究所研究员高召兵、副研究员夏冰清团队应邀对纳米孔糖测序的发展和应用前景进行展望，给出了纳米孔糖测序仪器的设计方案，并首次系统性提出了可能的纳米孔糖测序路线。相关综述发表于《化学科学》。糖类结构的精准解析是研究糖类在生命过程中的作
INCSeq：提高纳米孔测序准确性的新方法
新加坡基因组研究院（GIS）的研究人员开发了一种方法，称为INC-Seq，能够提高牛津纳米孔技术公司掌上测序仪MinIon的测序准确性。目前他们正努力改进该方法，将它应用到复杂样本的16S测序、RNA测序以及基因组复杂区域测序等中。 研究人员在近日发表于《Giga Science》的文章中描述
利用纳米孔测序技术揭示基因表达的染色质调控基础
作为染色质的基本单元，核小体由大约147 bp的DNA和组蛋白八聚体（H2A, H2B, H3和H4）组成。核小体的动态定位和折叠组织会产生两种不同的染色质状态：“开放”（open）和“闭合”（closed）。核小体的定位和染色质状态的动态变化对以DNA为模板的生物学过程（比如，转录、DNA复制
国产纳米孔测序仪市场化加速，这家企业做对了什么？
“目前，已有超过100个机构使用齐碳QNome测序平台。” 在6月28日举行的新品发布会上，齐碳科技联合创始人谢丹博士回顾了公司商业化探索的第一项成绩单。QNome-3841是齐碳科技研发的国内首款商业化纳米孔测序仪，在2021年12月正式面市，随后被迅速应用到疾病控制与预防、病原体研究、动物疫病防
牛津纳米孔收购加拿大Northern－Nanopore－扩张固态纳米孔领域
近日，牛津纳米孔技术公司（Oxford Nanopore）表示收购加拿大生物技术初创公司Northern Nanopore Instruments（NNi），这家公司开发了一种固态纳米孔制造技术。 本次收购没有披露财务条款。 据Oxford Nanopore介绍，NNi专门从事低成本、精确的
固态纳米孔：下一代DNA测序技术原理、工艺与挑战
科学通报，中国科学C辑:生命科学，这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的，我国学术期刊中的知名品牌，被国内外各主要检索系统收录，如国内的《中国科学论文与引文数据库》（CSTPCD）、《中国科学引文数据库》（CSCD）等；美国的SCI、CA、EI，英国的SA，日本的《科技文献
纳米孔测序企业「今是科技」完成近亿元B++轮融资
3月3日消息，近日，国内纳米孔测序技术领军企业今是科技宣布完成近亿元B++轮融资。本轮融资由国生资本（成都天府国际生物城投资公司）领投，川创投跟投，募集资金将用于加速全球首个“单碱基纳米孔测序”（SNS）技术平台的商业化落地，推动其在临床诊断、科研服务及公共卫生领域的规模化应用。 今是科技成立
基于纳米孔的第三代测序技术：每个人支付得起的基因测序
典型的纳米孔测序过程示意图 最近的一项研究发现，在低NaCl浓度下长链DNA更利于纳米孔测序，这为纳米孔测序技术的发展提供了线索。 这篇名为“链长对DNA构象及摩擦行为的影响”的研究论文发表于《中国科学：技术科学》英文版2013年第12期，从摩擦学角度初步探讨了不同链长DNA在纳米孔测序
两篇PNAS：蛋白纳米孔检测DNA甲基化
两个独立的研究团队利用通道蛋白实现纳米孔测序，成功鉴别了5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶。这两篇文章发表在同一期的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 基因组所蕴含的编码信息，包括DNA序列和核苷酸修饰两个部分。其中，动态的DNA甲基化模式，是基因表达的重要调控者，与细胞分化、胚胎发育和癌症