Antpedia LOGO WIKI资讯

纳米孔直接RNA和cDNA长读长测序概述

RNA测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中,转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本,可以为疾病的诊断和治疗提供信息。RNA测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时,cDNA测序也极大地辅助了病毒性病原体的表征和及时检测。 毫无疑问,传统的测序技术使全面转录组分析成为可能,并带来了很多重要的科学发展。然而,这一领域仍有重要的局限性有待解决。 转录本的长度通常为几千碱基对,这使得现有的短读长序列仅能部分覆盖转录本的长度,因此依赖计算重构准确的异构体组装非常困难,短读长也表现出高比率的多重定位。 基于测序的RNA分析均需要将 RNA转化为互补DNA(cDNA)链,在这一过程中,逆转录或扩增可引入偏倚,产生GC偏好性。由于并非所有的转录物都以相同的效率扩增,会导致一些种类的RNA的中断以及其它种类RNA的过度扩增。......阅读全文

纳米孔直接RNA和cDNA长读长测序概述

  RNA测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中,转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本,可以为疾病的诊断和治疗提供信息。RNA测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时,cDNA测序也极大

关于三代基因测序,你所需要知道的都在这儿!

  一、导读:  在大部分投资者对“二代测序”(NGS)还没有搞清技术细节的情况下,“三代测序”(3GS)又火了。  6月17日,医药板块中基因测序相关标的在“三代测序技术获得重大突破”的新闻影响上出现明显涨幅,我们也接到较多投资者对相关新闻的背景及观点的询问。为此,我们结合各方面资料归纳总结了三代

三分钟了解4代基因测序技术

  基因检测技术是近年来伴随“精准医疗”概念的提出而迅速发展起来的一门科学技术,它可以从基因组机制上阐释遗传学、发育生物学、进化生物学等学科的经典概念,在全基因组水平延伸了染色体高级构象、细胞异质性、功能模块等新概念,为精准医学开辟了应用性新领域。  近年来,随着分子水平的基因检测技术平台不断发展和

1.39亿美元!全球测序巨头Oxford Nanopore获知名机构投资

  牛津纳米孔总部位于英国,公司研发、生产和销售世界上唯一的便携式、实时DNA/RNA测序仪。此次募得资金主要用于公司下一阶段的业务扩张,其中,包括在牛津建设一个全新的、高产能的生产基地,以满足市场对牛津纳米孔测序仪产品日益增长的需求;以及扩大服务位于全球70多个国家客户的市场和销售团队。  同时,

基因测序“摩尔定律”初现,“三代测序”要革“二代”的命?

  在“二代测序”(NGS)尚未迎来投资热潮的情况下,技术突破捷报连连的“三代测序”(3GS)又进入到了投资人的视野中。1986年,第一台商用基因测序设备正式出现,到第二代测序设备出现,期间间隔了19年时间。而第二代设备问世,到第三代设备的诞生,仅仅用了5年,基因测序设备的更新换代速度正在不断加快。

中国首发纳米孔RNA直接测序揭示其在全长转录本中的作用

  近日发表在RNA Biology上的研究中,来自中国科学院北京生命科学研究院、动物研究所及中国科学院大学等多家单位的科学家们首次通过5’-Cap捕获法对蝗虫的 RNA直接测序,揭示了Piwi 外显子化模式的广泛建立以及蝗虫转录组中的转座子(TEs)对RNA剪接的重要作用。  转座子(TEs)在后

于军:从人类基因组计划到精准医学

  基因产业正受到前所未有的重视。今年,精准医学不仅被纳入“十三五”规划,作为精准医学的“排头兵”,基因组学也被纳入“十三五”百大项目名单,要“加速推动基因组学等生物技术大规模应用”。  对著名基因组学专家、中国基因组学奠基人于军教授来说,基因组学引领的技术应用得到如此重视,既让他感到欣慰———20

Illumina收购PacBio恐受阻!曾提出向三方授权相关知识产权

  2018年11月,基因测序巨头Illumina拟对PacBio的12亿美元收购案一度引发全球基因测序行业的广泛关注。通过将Illumina的短读长测序技术和PacBio的长读长测序技术相结合,这项交易势必将进一步巩固Illumina在基因测序领域的优势地位。  但消息发布后,该交易迅速引起了英国

纳米孔测序技术用于快速的病毒病原体的鉴定及进化研究

  2014-2016年,西非暴发埃博拉疫情流行期间,进行了大量ELISA和基于RT-PCR的检测,这些方法的检测虽然简易、便携、快速,但由于病原体不断进化,这些方法很快变得过时,并且还缺乏能在症状出现前检测出病毒的方法。  使用传统的测序技术虽然可以克服病原体不断进化的问题,但这一技术只有在将样品

DNA测序技术的现状和发展(七)

3. 新一代测序技术的前景在2007年6月,James Watson的基因组序列登录到了GenBank数据库当中,这是第一次使用非Sanger测序法获得了人类个体基因组序列,并且第一次将个人基因组序列公之于众。整个测序过程在两个月之内就完成了,花费不到100万美元,这只占耗时10年之久的人类

PacBio测序有望掀起下一场遗传诊断的革命

  从一代到二代再到三代,近年来测序技术的发展势不可挡。单分子测序也逐渐表现出它的优势,在测序舞台上发挥着举足轻重的作用。近日,比利时鲁汶大学和瑞典乌普萨拉大学的研究人员在《Nucleic Acids Research》发表综述文章,介绍了PacBio SMRT测序技术在临床中的应用。  文章简单回

INC-Seq:提高纳米孔测序准确性的新方法

  新加坡基因组研究院(GIS)的研究人员开发了一种方法,称为INC-Seq,能够提高牛津纳米孔技术公司掌上测序仪MinIon的测序准确性。目前他们正努力改进该方法,将它应用到复杂样本的16S测序、RNA测序以及基因组复杂区域测序等中。  研究人员在近日发表于《Giga Science》的文章中描述

2018TOP10基因测序公司 Illumina雄踞榜首 华大基因位列第三

  在成功实现1000美元基因组测序的5年后,测序行业正在朝着新的目标前进:将基因组测序的成本进一步降低至100美元,甚至10美元。  在2018年,最接近100美元目标的是Veritas Genetics公司,该公司去年11月将其999美元的myGenome Standard全基因组测序服务(包括

一文读懂分子诊断技术、PCR技术、基因测序技术

  分子诊断技术是指以DNA和RNA为诊断材料,用分子生物学技术通过检测基因的存在、缺陷或表达异常,从而对人体状态和疾病作出诊断的技术。其基本原理是检测DNA或RNA的结构是否变化、量的多少及表达功能是否异常,以确定受检者有无基因水平的异常变化,对疾病的预防、预测、诊断、治疗和预后具有重要意义。通俗

一文读懂分子诊断常用技术

  分子诊断技术是指以DNA和RNA为诊断材料,用分子生物学技术通过检测基因的存在、缺陷或表达异常,从而对人体状态和疾病作出诊断的技术。其基本原理是检测DNA或RNA的结构是否变化、量的多少及表达功能是否异常,以确定受检者有无基因水平的异常变化,对疾病的预防、预测、诊断、治疗和预后具有重要意义。通俗

《科学》公布2016十大进展

  每年12月,《科学》杂志都会公布年度突破及入围成果。以下为今年的10大突破和赢家,排名不分先后。  1.时空涟漪撼动科学界  今年发现时空涟漪(即引力波)撼动了科学界。它完成了阿尔伯特·爱因斯坦在100年前完成的一项预测,为40年来寻找这种无穷小的涟漪画上了句号。但这个故事并未结束,科学家将此次

纳米孔测序搞定超级难搞的基因

  Brenton Graveley是在2014年4月收到他的第一台MinION测序仪的。他所在的康涅狄格大学实验室是首批获得Oxford Nanopore Technologies测序仪的客户。尽管准确性不稳定,通量也不高,但Graveley和他的同事决定立刻就试试。  对于MinION,众多讨论

纳米孔测序搞定超级难搞的基因

  Brenton Graveley是在2014年4月收到他的第一台MinION测序仪的。他所在的康涅狄格大学实验室是首批获得Oxford Nanopore Technologies测序仪的客户。尽管准确性不稳定,通量也不高,但Graveley和他的同事决定立刻就试试。  对于MinION,众多讨论

全球测序行业的10大巨头,中国占2席

近日,GEN网站推出“Top 10 Sequencing Companies”榜单,盘点了全球测序行业10大巨头。其中,Illumina拔得头筹,中国企业占得2个席位,分别是华大基因(排名第3)、金唯智(排名第8)。图片来源:16sucaiwang近年来,随着“精准医疗”的深入布局,基因测序行业市场

全球测序行业10大巨头:Illumina第一Thermo第二 中国占2席

  近日,GEN网站推出“Top 10 Sequencing Companies”榜单,盘点了全球测序行业10大巨头。其中,Illumina拔得头筹,中国企业占得2个席位,分别是华大基因(排名第3)、金唯智(排名第8)。图片来源:16sucaiwang  近年来,随着“精准医疗”的深入布局,基因测序

中国精准医疗无人区,有人护!

——访伯科创始人郭诚博士  日前一则“打破国外垄断!伯科生物推出自主知识产权的生物液相芯片杂交捕获与探针原位合成技术”引起了业界广泛关注,细细阅读后,我好奇地开始探究“伯科”了。伯科创始人是谁?这一探针合成技术优势在哪里?能为中国精准医疗带来什么变化?  ……全球有机化学殿堂—美国哥伦比亚大学Hav

盘点:分子诊断常用技术50年的沿革与进步

  一、基于分子杂交的分子诊断技术  上世纪60年代至80年代是分子杂交技术发展最为迅猛的20年,由于当时尚无法对样本中靶基因进行人为扩增,人们只能通过已知基因序列的探针对靶序列进行捕获检测。其中液相和固相杂交基础理论、探针固定包被技术与cDNA探针人工合成的出现,为基于分子杂交的体外诊断方法进行了

临床检验科常见设备和主要供应商大全

临床检验常见设备包括:一、临检设备:血细胞分析仪、流式细胞仪、血凝分析仪、尿液干化学分析仪、尿液有形成分分析仪、粪便分析仪二、生化免疫设备:生化分析仪、化学发光免疫分析仪、酶免疫分析仪、荧光免疫分析仪三、分子诊断设备:核酸提取仪、实时荧光PCR仪、基因测序仪、质谱仪四、微生物检验设备:微生物鉴定药敏

纳米孔测序仪真机现身ASHG

  英国Oxford Nanopore Technologies公司在年初的基因组生物学技术进展年会(AGBT)上发布了一款便携式的基因组测序仪MinION,性能强劲,价格给力,引发市场轰动。然而,大半年过去了,纳米孔测序仪却迟迟不见踪影,连更早发布的GridION也未上市。于是,生物界开始议论

干货丨新冠病毒Nanopore测序标准操作流程

2019新型冠状病毒Nanopore测序标准操作流程-PCR扩增测序版简介  新近在武汉出现的新型冠状病毒引发的肺炎疫情引起了社会各界的极大关注。对新型冠状病毒进行测序不仅能够为病原鉴定、病毒溯源与变异、传播力和传播机理等研究提供切实可靠的基因组信息,还能够为识别病毒传播方式和确定暴发范围提供重要的

Science杂志最受关注的文章(2月)

  美国的《Science》杂志由爱迪生投资创办,是国际上著名的自然科学综合类学术期刊,与英国的《Nature》杂志被誉为世界上两大自然科学顶级杂志。Science杂志主要发表原始性科学成果、新闻和评论,许多世界上重要的科学报道都是首先出现在Science杂志上的,比如艾滋病与人类免疫缺陷病毒之间的