植物中独特双链RNA合成机制获解析

中科院分子植物科学卓越创新中心研究员张余团队和研究员王佳伟团队与浙江大学教授冯钰团队合作,首次解析了Pol IV-RDR2蛋白复合物的三维结构,并提出了Pol IV-RDR2以双链DNA为模板合成双链RNA的独特分子机制。该研究成果12月24日在线发表于《科学》。Pol IV-RDR2复合物三维结构 课题组供图 转座子最早由美国遗传学家芭芭拉·麦克林托克在玉米基因组中发现,它在高等生物基因组中广泛存在。转座子能够在宿主基因组中“复制和粘贴”自己的DNA,以达到自我“繁殖”的目的,该活动会对基因组的稳定性构成严重威胁。高等生物通过给转座子DNA打上一个甲基的化学烙印,抑制转座子的活动,从而维持基因组的稳定性。在高等植物中,两种执行不同功能的蛋白质机器Pol IV和RDR2,它们协作生产一段双链的向导RNA分子,帮助植物细胞精准地给转座子DNA打上甲基化烙印。虽然Pol IV和RDR2已经被发现多年,但这两种转录机器的内部构造......阅读全文

植物中独特双链RNA合成机制获解析

  中科院分子植物科学卓越创新中心研究员张余团队和研究员王佳伟团队与浙江大学教授冯钰团队合作,首次解析了Pol IV-RDR2蛋白复合物的三维结构,并提出了Pol IV-RDR2以双链DNA为模板合成双链RNA的独特分子机制。该研究成果12月24日在线发表于《科学》。Pol IV-RDR2复合物三维

双链RNA抑癌原理

双链RNA抑癌原理是通过构建对癌症细胞特异蛋白转录后得到的mRNA的反义RNA,从而通过碱基结合使得该蛋白表达被阻断而最终导致癌细胞正常代谢通路受阻等,绝非所谓的食用后能够起到抑癌作用;

双链RNA病毒的特点

双链RNA病毒有两个特点:一是它的基因组为10-12条双链RNA分子;二是它有双层衣壳,而没有囊膜。病毒的RNA-RNA 聚合酶存在于髓核中,在该聚合酶的作用下病毒基因组转录正链RNA,它们自髓核逸出。它们既能作为mRNA,又能作为病毒基因组的模板。MRNA翻译结构蛋白,装配内层衣壳后,正链RNA进

双链RNA病毒的复制

虽然同为双链核酸分子,但双链RNA的复制方式和双链DNA不同,双链RNA不是半保留复制,而是全保留复制,复制需要经过mRNA中间体。双链RNA病毒有两个特点,一是它的基因组为10-12条双链RNA分子;二是它有多层衣壳,而没有囊膜。病毒的RNA-RNA 聚合酶存在于髓核中,在该聚合酶的作用下病毒双链

​双链RNA病毒的特点

双链RNA病毒有两个特点:一是它的基因组为10-12条双链RNA分子;二是它有双层衣壳,而没有囊膜。病毒的RNA-RNA 聚合酶存在于髓核中,在该聚合酶的作用下病毒基因组转录正链RNA,它们自髓核逸出。它们既能作为mRNA,又能作为病毒基因组的模板。MRNA翻译结构蛋白,装配内层衣壳后,正链RNA进

果蝇RNAi的实验中双链短RNA的合成(dsRNA)方法

本文来自于哈佛大学医学院果蝇RNAi筛选中心的经典实验方法,专门用于果蝇RNAi实验方法。感谢哈佛大学医学院果蝇RNAi筛选中心的支持!Primer Designed dsRNATemplate SelectionPCRIn vitro RNA TranscriptiondsRNA Purifica

果蝇RNAi的实验中双链短RNA的合成(dsRNA)方法

实验概要We routinely produce dsRNA by in vitro transcription of a PCR generated DNA template containing the T7 promoter sequence on both ends (I. Prim

我国研究团队解析植物中独特的双链RNA合成机制

  转座子(transposon)最早由美国遗传学家Barbara McClintock在玉米中发现,在细菌、病毒以及真核生物的基因组中广泛分布。转座子类似内源性病毒,能够在宿主基因组中“复制和粘贴”自己的DNA,以达到其自我“繁殖”的目的。活跃的转座子对基因组的稳定构成严重威胁,高等生物通过对转座

双链RNA的基本信息

双链RNA是基因选择性表达一种常见方式。反义RNA与正链RNA结合可抑制正链翻译。此外双链RNA还存在于tRNA中。双链RNA抑癌原理是通过构建对癌症细胞特异蛋白转录后得到的mRNA的反义RNA,从而通过碱基结合使得该蛋白表达被阻断而最终导致癌细胞正常代谢通路受阻等,绝非所谓的食用后能够起到抑癌作用

双链RNA结合域的特点

中文名称双链RNA结合域英文名称dsRNA-binding domain定  义双链RNA或RNA中的双链区能被特异蛋白质所结合的区域。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

双链RNA病毒的复制介绍

  双链RNA病毒有两个特点,一是它的基因组为10-12条双链RNA分子;二是它有双层衣壳,而没有囊膜。病毒的RNA-RNA 聚合酶存在于髓核中,在该聚合酶的作用下病毒基因组转录正链RNA,它们自髓核逸出。它们既能作为mRNA,又能作为病毒基因组的模板。MRNA翻译结构蛋白,装配内层衣壳后,正链RN

体外转录合成单链RNA探针

            实验方法原理 制备特异性的单链 RNA 探针不仅比 DNA 探针更容易,在杂交反应中一般也比具相同比活性的 DNA 探针产生更强的信号,这可能是由于含有 RNA 的杂合链固有的更高稳定性的缘故(Casey and Davidson 197

体外转录合成单链RNA探针

实验方法原理 制备特异性的单链 RNA 探针不仅比 DNA 探针更容易,在杂交反应中一般也比具相同比活性的 DNA 探针产生更强的信号,这可能是由于含有 RNA 的杂合链固有的更高稳定性的缘故(Casey and Davidson 1977)。虽然 DNA 探针仍普遍地应用于 Norther

细胞化学词汇双链RNA结合域

中文名称;双链RNA结合域英文名称:dsRNA-binding domain定  义:双链RNA或RNA中的双链区能被特异蛋白质所结合的区域。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

双链DNA探针随机引物合成法

  随机引物合成双链探针是使寡核苷酸引物与DNA模板结合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探针。合成产物的大小、产量、比活性依赖于反应中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,产物平均长度为400-600个核苷酸。利用随机引物进行反应的优点是:(1)Klenow片段没有5'→3'外切

RNAi——双链RNA引起的基因敲除(2)

在构建双链RNA的表达载体时,使用RNA多聚酶Ⅲ来指导RNA的合成。这是因为RNA多聚酶Ⅲ有明确的启始和终止序列,而且合成出的RNA不会带有polyA尾。当RNA多聚酶Ⅲ遇到连续5个胸腺嘧啶时,它指导的转录就会终止,并且转录产物在第二个尿嘧啶处被切下来。U6启动子能被RNA多聚酶Ⅲ识别, 合

RNAi——双链RNA引起的基因敲除(1)

1995年,康奈尔大学的Su Guo博士用反义RNA阻断线虫基因表达的试验中发现,反义和正义RNA都阻断了基因的表达,他们对这个结果百思不得其解。直到1998年, Andrew Fire的研究证明,在正义RNA也阻断了基因表达的试验中,真正起作用的是双链RNA[1]。这些双链RNA是体外

RNAi实验中双链短RNA(dsRNA)制备过程

RNAi 实验中双链短RNA(dsRNA)制备过程,本实验方法来自于加州大学Jim教授实验,很权威!Procedure for the Generation of dsRNA for use in RNAi1. Design polymerase chain reaction (PCR ) prim

cDNA文库组标准流程三:cDNA双链合成

1. Superscipt II—RT合成第一链:1. 在一RNase-free的0.2ml PCR管中,加入         xul   mRNA(大约500ng)         1ul   Xho I Primer(1.4ug/ul)           (5’ GAGAGAGAGAGAGAG

随机引物合成法双链DNA探针标记法

随机引物合成双链探针是使寡核苷酸引物与DNA模板结合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探针。合成产物的大小、产量、比活性依赖于反应中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,产物平均长度为400-600个核苷酸。利用随机引物进行反应的优点是:(1)Klenow片段没有5'→3'外切酶活

纳米介导双链RNA可防治番茄潜叶蛾

近日,针对新发重大入侵害虫番茄潜叶蛾,中国农业科学院植物保护研究所农业入侵生物预防与监控创新团队研发了纳米介导双链RNA的应用体系,为后续利用RNA干扰技术防治番茄潜叶蛾奠定了基础。纳米载体递送dsRNA防控番茄潜叶蛾示意图。中国农科院供图番茄潜叶蛾是世界检疫性害虫,主要以幼虫潜食危害番茄、马铃薯等

体外转录合成单链RNA探针:体外转录法

体外转录法l        体外转录合成单链RNA探针1.      用适当的限制酶消化超螺旋质粒DNA制备5 pmol的线性模板DNA。取一小份消化的DNA(100ng)进行琼脂糖凝胶电泳分析。如有必要,再补加限制性酶进行温育,直至不再残存痕量的未消化DNA。2.      如必须用产生3’突出端

依赖双链RNA的蛋白激酶的基本信息

中文名称依赖双链RNA的蛋白激酶英文名称doublestranded RNA-dependent protein kinase;PKR定  义对干扰素敏感的细胞经干扰素处理后能诱导产生的一种蛋白激酶。在双链RNA的激活下可使蛋白质合成起始因子eIF-2磷酸化而失活,从而阻止蛋白质合成,抑制病毒的复制

依赖双链RNA的蛋白激酶的基本信息

中文名称依赖双链RNA的蛋白激酶英文名称doublestranded RNA-dependent protein kinase;PKR定  义对干扰素敏感的细胞经干扰素处理后能诱导产生的一种蛋白激酶。在双链RNA的激活下可使蛋白质合成起始因子eIF-2磷酸化而失活,从而阻止蛋白质合成,抑制病毒的复制

用RNase-Ⅲ-消化长片断双链RNA制备siRNA的方法特点

其他制备siRNA的方法的缺陷是需要设计和检验多个siRNA序列以便找到一个有效的siRNA。而用这种方法——制备一份混合有各种siRNAs “混合鸡尾酒” 就可以避免这个缺陷。选择通常是200—1000碱基的靶mRNA模版,用体外转录的方法制备长片断双链dsRNA ,然后用RNase Ⅲ (or

用RNase-Ⅲ-消化长片断双链RNA制备siRNA的技术特点

其他制备siRNA的方法的缺陷是需要设计和检验多个siRNA序列以便找到一个有效的siRNA。而用这种方法——制备一份混合有各种siRNAs “混合鸡尾酒” 就可以避免这个缺陷。选择通常是200—1000碱基的靶mRNA模版,用体外转录的方法制备长片断双链dsRNA ,然后用RNase Ⅲ (or

果蝇Dicer2结合双链RNA加工生成siRNA的分子机制

RNA干扰(RNAi)是许多真核生物中一种保守的RNA沉默机制, 小干扰RNA是RNA干扰的关键组成部分。在小RNA的加工过程中,Dicer家族蛋白起到了重要的作用,它们发挥作用的过程中常需要双链结合蛋白(dsRBP)作为辅因子来帮助它们发挥功能。在果蝇中,siRNA的产生是由ATP依赖型的Dice

RNA-大量转录合成

实验材料 模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒 TE TE 饱和酚 氯仿异内醇 3mol LNaAc 无水乙醇 5X 转录缓冲液 lOOmmoL LDTT RNasin rATPrGTPrUTPrCTP SF6T3 或 T7RNA 聚合酶 异戊醇 DNase 7.5mol L 乙酸铵 无水乙醇 乙醇实验

RNA-大量转录合成

            实验材料 模板 DNA 或质粒 试剂、试剂盒 TE   TE 饱和酚   氯仿

单链RNA的结构特点

中文名称单链RNA英文名称single-stranded RNA;ssRNA定  义只含有一条链的RNA分子。生物体中绝大部分RNA是单链RNA,形成二级结构时,是既有单链、又有双链结构域的RNA分子;只有某些RNA病毒是由两条链互补而成的双链RNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与