叶绿体基因组树优化森林大样地群落构建获揭示

群落构建是生态学家广泛关注的核心问题之一。1月2日,记者从中国科学院华南植物园获悉,该园分子生态学团队及其合作者,基于中国森林监测网络(CForBio)平台,揭示了叶绿体基因组树优化我国森林大样地群落构建认知。相关研究发表于《分子生态资源》。 据悉,系统发育群落生态学将系统发育分析方法整合到群落生态学的分析中,为探究群落生物多样性的演化与维持机制提供了新视角。建立准确可靠的群落系统树是进行群落系统发育分析的前提和基础,分辨率较低的群落系统树可能导致对系统发育多样性指数的估计产生偏差,进而影响对特定群落的生态过程的推断。 目前群落系统树的构建主要是利用Phylomatic、V.PhyloMaker等软件生成名录合成树,或是基于一代DNA条形码片段构建分子系统树。合成树方法无需采样、测序等步骤,成本较低,但结果中往往会出现较多的多歧分枝;一代DNA条形码树的物种分辨率相对更......阅读全文

古基因组改写大象历史

  古基因组改写大象历史  灭绝大象DNA揭示物种间复杂关系  本报讯 一个神秘古化石的基因组已经动摇了大象的家族树。  现代大象被划分为3个种:亚洲象(Elephas maximus)和两种非洲象——森林象(Loxodonta cyclotis)以及那些生活在热带草原的草原象(Loxodonta

优化培养模式-构建合理的博士生考评机制

  博士研究生作为我国人才培养的最高层次,是教育、科技、人才的重要结合点。近年来,我国博士生招生规模继续呈扩张趋势,截至2023年在校博士生已达61.25万人。然而,与之相随的是博士生延期毕业率居高不下,诸多弊端也愈发凸显,影响了博士生培养质量。  有研究表明,学制长短、导学关系、院校培养机制等都是

优化培养模式-构建合理的博士生考评机制

博士研究生作为我国人才培养的最高层次,是教育、科技、人才的重要结合点。近年来,我国博士生招生规模继续呈扩张趋势,截至2023年在校博士生已达61.25万人。然而,与之相随的是博士生延期毕业率居高不下,诸多弊端也愈发凸显,影响了博士生培养质量。有研究表明,学制长短、导学关系、院校培养机制等都是博士生延

昆明植物所在马先蒿属斗叶组系统演化研究中获进展

  马先蒿属(Pedicularis)全球有600多种,是列当科中最大的属,其中有2/3以上的种类集中分布于喜马拉雅—横断山区,该地区是其物种多样化中心和特有中心之一。东喜马拉雅—横断山区特有的斗叶组(Sect. Cyathophora)仅有7个种(其中1个种存疑),却拥有马先蒿属全部四种基本花

成都生物所揭示亚高山森林次生演替过程中土壤微生物群落动态及驱动因素

原文地址:http://www.cas.cn/syky/202103/t20210324_4782242.shtml   西南亚高山森林是我国第二大林区,形成了“草-灌木-次生林-原生林”完整的连续次生演替序列。目前,未有关于该地区次生演替过程中土壤微生物群落动态及其驱动机制的研究。因此,探究西南

揭示亚热带森林植食性昆虫的共现机制

  在生态系统中,物种间是否共存的直接表现是物种共现,物种共现可用于检验两个或更多物种能否共存。剖析物种共现、共存的相关机制,既是生态学研究的热点又是挑战。此前研究表明,各种生物和非生物因素与物种生活史的生态位分配和权衡关系密切,或在物种共存中发挥重要作用。目前,尚不清楚物种自身的系统发生距离和功能

亚热带森林植食性昆虫共现机制

  在生态系统中,物种间是否共存的直接表现是物种共现,物种共现可用于检验两个或更多物种能否共存。剖析物种共现、共存的相关机制,既是生态学研究的热点又是挑战。此前研究表明,各种生物和非生物因素与物种生活史的生态位分配和权衡关系密切,或在物种共存中发挥重要作用。目前,尚不清楚物种自身的系统发生距离和功能

新研究揭示绿藻类肺衣演化“前世今生”

  与绿藻共生的肺衣类,是大型叶状地衣的代表,有悠久的食药用历史,但弄清其物种划分和系统演化过程的问题却并不容易。18日,记者从中国科学院昆明植物研究所获悉,该所王立松研究员与相关研究团队合作,首次较为清晰地揭示了绿藻类肺衣在喜马拉雅及横断山的演化过程。  与大自然各种争奇斗艳的植物相比,作为菌藻群

揭示火灾生态学:不同环境条件下微生物群落响应

  中国科学院华南植物园研究员李跃林团队在国家自然科学基金项目的资助下,研究揭示了森林火灾与灾后不同管理方式下土壤微生物群落中细菌与真菌反应差异。近日,相关成果发表于《环境管理杂志》。  野火对森林生态系统具有重大且持久的影响,而火灾后的不同管理方式可以改变森林恢复方向。土壤微生物对环境变化极为敏感

森林可持续经营:给陆地碳汇扩容

森林储存的碳占陆地生态系统碳库的40%,是陆地上除永冻土之外的最大储碳库。“森林在减缓气候变化中具有双重作用:森林可吸收并固定大气中的二氧化碳;由于森林退化、毁林等,又使其成为大气二氧化碳的排放源。”中国工程院院士、中国林业科学研究院研究员刘世荣告诉《中国科学报》。川西米亚罗人工林样地。余振摄近日,

23名中国妇女早期宫颈癌抗原树被构建

  中国科学院深圳先进技术研究院陈志英团队与华大基因等合作的一项癌症研究成果日前发表于《癌症医学》杂志。该项目开发了电子计算机算法,利用癌症基因组学构建了23名中国妇女早期宫颈癌的“癌症抗原树”,目的是帮助找出最佳癌症免疫治疗靶点,以提高疗效。  科学家利用人类基因不断突变、突变可以遗传到后代两大特

基因组DNA文库构建必备实验技巧

基因组DNA文库用途十分广泛,如用于人类及动植物基因组学研究,基因表达调控研究,分析、分离特定的基因片段等。通常情况下,基因组文库构建的基本流程可以归为四大步骤:分离基因组DNA、对基因组DNA作相关的处理、将基因组DNA片段连接入载体、将重组载体转入宿主细胞。一、分离基因组DNA(gDNA) 毫无

构建小鼠基因组CRISPR导向RNAs文库

  研究人员开发出一种方法,构建出了一个可诱导小鼠基因组全基因靶向突变的CRISPR导向RNA(gRNAs)综合文库。人们可利用这一文库来调查不同细胞类型中每个基因的作用。这一突破性的研究成果在线发表在12月23日的《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上。   CR

基因组DNA文库构建的基本流程

基因组  DNA文库有十分广泛的用途,如用于分析、分离特定的基因片段,用以基因表达调控、人类及动植物基因组工程的研究。通常情况下,基因组文库构建的基本流程可以归为4大步骤:分离基因组DNA、对基因组DNA作相关的处理、将基因组DNA片段连接入载体、将重组载体转入宿主细胞。 一、分离基因组DN

生物监测方法在环境监测领域的发展趋势

生物监测方法在环境监测领域的发展趋势如下:技术创新:分子生物学技术应用深化:如 DNA 指纹技术、基因芯片技术等,能更精准地分析生物体内的基因信息,揭示污染物对生物基因层面的影响,用于检测基因突变、基因表达变化等,可更早期、灵敏地反映环境变化对生物的影响。例如,通过基因芯片分析水生生物基因表达变化,

生物监测方法在环境监测领域的发展趋势是怎样的?

生物监测方法在环境监测领域的发展趋势如下:技术创新:分子生物学技术应用深化:如 DNA 指纹技术、基因芯片技术等,能更精准地分析生物体内的基因信息,揭示污染物对生物基因层面的影响,用于检测基因突变、基因表达变化等,可更早期、灵敏地反映环境变化对生物的影响。例如,通过基因芯片分析水生生物基因表达变化,

高通量测序技术在破译亚热带森林生物多样性维持“密码..

高通量测序技术在破译亚热带森林生物多样性维持“密码”的应用森林生物多样性有着怎样的维持机制?来自中国科学院植物研究所的马克平研究团队首次结合亚热带森林幼苗更新动态监测数据、高通量测序技术和邻居效应模型,揭示了不同功能型土壤真菌驱动亚热带森林群落多样性的作用方式,提出了外生菌根真菌与病原真菌互作过程影

湖北房县发现国家一级保护植物珙桐原始群落

原标题:湖北房县发现国家一级保护植物珙桐原始群落近日,湖北十堰市房县林业局上龛工作站在野外森林资源调查中,发现国家一级保护植物——珙桐原始群落。其中,最大的珙桐胸径达76厘米。经初步估算,此次发现的珙桐原始群落约200余亩,50余株。这次发现珙桐的地方在房县上龛乡范家亚村三坪、黄龙村牛角湾,处在海拔

83.4米!中国巨树首次攀测综合科考完成

   2022年10月9日上午,由中国科学院植物研究所、国家重要野生植物种质资源库辰山中心-上海辰山植物园、中华环境保护基金会、“野性中国”工作室、西藏自治区林芝市察隅县林业和草原局等组成的中国巨树科考队发布了目前“中国第一高树”云南黄果冷杉(学名:Abies ernestii var. salou

森林系统中有机磷矿化相关细菌多样性分布特点

  森林生态系统作为“地球之肺”,孕育着丰富的生物多样性,具有调节气候、固定碳氮元素、储存水、提供木材和稳定土壤等功能。森林土壤通常表现为磷缺乏的现象,土壤里磷的输入主要来自含有机磷动植物残体的降解。磷脂和植酸作为主要的有机磷化合物能够分别被磷酸酶和植酸酶水解。植酸降解的中间产物能够进一步为磷酸酶所

望天树叶功能性状随不同树高垂直梯度而改变

近日,中国科学院西双版纳热带植物园西双版纳生态站依托林冠塔吊,对望天树个体尺度上不同树冠高度的形态结构、光合生理、水分生理和养分元素四类共计14个叶功能性状的变异性和相关性进行了研究,相关成果发表于《植物科学前沿》。热带森林生态系统具有非常复杂的群落结构、丰富的生物多样性和极其重要的生态意义。望天树

珍稀树蕨笔筒树保育研究获进展

笔筒树株形。课题组 供图  中国科学院华南植物园植物科学中心物种多样性保育研究组魏雪莹、AJ Harris和崔煜文等在珍稀树蕨笔筒树的保育研究取得新进展。相关研究近日发表于《园艺学》。  笔筒树是有“活化石”之称的孑遗植物,属于桫椤科白桫椤属,至今存在约有3亿年,原生长于中生代侏罗纪时期。在第四纪冰

我国学者发现沿海拔梯度的雀形目鸟类群落构建机制

  结合生物多样性的不同方面是探讨不同空间和时间尺度揭示群落构建机制的一个重要方法,但目前结合物种、功能性状和系统发育多样性对于鸟类群落构建机制的研究还鲜有报道,基于系统发育或者功能性状的研究也主要集中在部分类群。对于具有明显季节性物种组成变化的温带鸟类群落,不同季节间鸟类群落构建的主导生态过程是否

植物枝条支撑叶片面积全球格局及驱动因子获揭示

中国科学院华南植物园副研究员贺鹏程在国家自然科学基金项目和广东省重点实验室项目的资助下,研究揭示了植物枝条支撑叶片面积的全球格局及其驱动因子。相关成果近日在线发表于《植物、细胞与环境》(Plant,Cell & Environment)。不同降水条件下植物AL/AS变化的概念图。研究团队供图植物枝条

研究揭示叶绿体识别活性氧分子的分子机制

  6月27日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心Chanhong Kim研究组在《自然-通讯》(Nature Communications)发表了题为Oxidative post-translational modification of EXECUT

武汉植物园发现蕨类植物叶绿体基因组进化的过渡形态

  目前已知的蕨类植物叶绿体基因组在组织结构上表现为两种基本类型:一是核心型,高等核心薄囊蕨类水龙骨目和树蕨目具此类型;另一是基部型,见于其他蕨类基部类群。与基部型相比,核心型叶绿体基因组的反向重复区和大单拷贝区的rpoB-psbZ区(BZ区)发生过复杂的基因组重排,同时它们还丢失了5个相同的tRN

我国学者在温带天然森林生产力维持机制研究上获新展

  森林作为陆地生物圈的主体,不仅蕴藏着丰富的生物多样性,而且具有较高的生产力。森林生产力是森林生态系统维持与发展的根本动力,探讨维持森林生产力的内在生物学要素和外在生态条件,是当今生态学和林学研究的重要内容之一。鉴于乔木形成的生物生产力在森林生产力中占主体地位,且易于测定、量化和尺度推演,许多研究

新研究揭示热带珊瑚岛生态恢复的微生物途径

  在国家重点研发计划、国家自然基金等项目的资助下,中国科学院华南植物园研究员刘占锋团队研究揭示了热带珊瑚岛生态恢复过程中独特的微生物作用机制——真菌“先锋开路”,细菌“稳固后方”。相关成果近日发表于《土壤生态学快报》(Soil Ecology Letters)。  热带珊瑚岛人工植被向原生植被恢复

热带雨林动态演化历史研究取得进展

气候变化是加速物种灭绝和驱动物种适应性进化的重要环境因子,不同地质时期气候剧烈波动对地球生态系统塑造起到关键作用。生物群系作为具有自身独特外貌特征且受制于特定气候条件的自然群落,呈现为有形的生态进化单元,是从宏观尺度理解生命演化过程的重要载体。热带雨林是当今地球陆地生态系统中起源最为古老的生物群系,

细胞化学基础植物叶绿体基因组基因表达调控的研究

叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式。转