叶绿体基因组树优化森林大样地群落构建获揭示
群落构建是生态学家广泛关注的核心问题之一。1月2日，记者从中国科学院华南植物园获悉，该园分子生态学团队及其合作者，基于中国森林监测网络（CForBio）平台，揭示了叶绿体基因组树优化我国森林大样地群落构建认知。相关研究发表于《分子生态资源》。 据悉，系统发育群落生态学将系统发育分析方法整合到群落生态学的分析中，为探究群落生物多样性的演化与维持机制提供了新视角。建立准确可靠的群落系统树是进行群落系统发育分析的前提和基础，分辨率较低的群落系统树可能导致对系统发育多样性指数的估计产生偏差，进而影响对特定群落的生态过程的推断。 目前群落系统树的构建主要是利用Phylomatic、V.PhyloMaker等软件生成名录合成树，或是基于一代DNA条形码片段构建分子系统树。合成树方法无需采样、测序等步骤，成本较低，但结果中往往会出现较多的多歧分枝；一代DNA条形码树的物种分辨率相对更......阅读全文
我国学者阐述重楼叶绿体基因组结构特征与进化
重楼属植物主要生物活性物质为甾体皂苷，具有消炎、止血、抗肿瘤等功效，是云南白药、宫血宁等86种著名中成药的重要原料。重楼属花叶组包括花叶重楼与禄劝花叶重楼两种，与属内其它植物相比，叶具斑块，植株矮小，果实很小且产量低。花叶组重楼植物含有中国药典规定的四种重楼皂苷。然而，花叶组重楼生长十分缓慢，对
关于植物叶绿体基因组基因表达调控的研究的介绍
叶绿体基因组的特点是具相同或相关功能的基因组成复合操纵子结构。这一特点有利于叶绿体基因的表达与调控，例如rpoB-rpoC-rpoC 2操纵子是由编码RNA聚合酶各个亚基的基因聚合在一起而形成的，而psbI-psbK-psbD-psbC操纵子则编码PSⅡ的部分蛋白质。叶绿体基因组基因表达调控方式
我国学者破解冬青属系统发育及生物地理特性
为何有些植物分支的物种广泛分布并演化出许多物种而有些则不然？冬青属植物的进化研究，可能为回答这一进化生物学关键问题提供有力证据。 冬青属（Ilex）是木本雌雄异株植物中最大的属（至少664种）。该属植物大多喜好温暖湿润的生境，无法存活于土壤长期干旱或寒冬较长的生境，暗示该属植物可能存在较强的生
法揭示一种蚂蚁与树共生原理
在自然界，植物和动物共生的现象比比皆是。法国科研人员通过长期观察，最新揭示了阿兹特克蚂蚁和西哥罗佩树的共生原理。 西哥罗佩树是法属圭亚那常见的一个树种，它与一种名为阿兹特克的树蚁保持着“相依为命”的关系，前者为后者提供居所和部分食物，而后者则帮助前者抵御“强敌”。 法
不同类型菌根树种对全球树木β多样性纬度格局的影响
生物多样性纬度梯度格局及其形成机制一直是生物地理学和宏观生态学的核心科学问题之一。树木β多样性描述了树木群落间的物种组成差异，联系着局域尺度的α多样性和区域尺度的γ多样性，能反映树木群落构建和多样性维持的潜在机制。因此，树木β多样性纬度梯度格局研究受到广泛关注。然而，前人对树木β多样性纬度梯度格
壳斗科锥属物种间相似基因组变异模式获揭示
中国科学院华南植物园研究员王宝生团队在广东省基础与应用基础研究旗舰项目和广东省重点实验室项目资助下，研究揭示了壳斗科锥属物种间相似基因组变异模式形成的进化机制。相关成果发表于《分子生物学与进化》（Molecular Biology and Evolution）。遗传变异的形成与维持机制是进化生物学研
濒危植物报春苣苔交配系统转变基因组效应获揭示
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/10/488438.shtm 近日，中国科学院华南植物园植物科学研究中心研究员康明团队以苦苣苔科报春苣苔（Primulina tabacum）为对象，研究揭示了濒危植物报春苣苔交配系统由异交向自交转变的基因
Soil－Biology－－Biochemistry：土壤微生物群落定量研究优化策略
近日，中国农业科学院农业资源与农业区划研究所植物营养团队研究提出土壤微生物群落定量研究优化策略。相关成果发表在《土壤生物学与生物化学（Soil Biology & Biochemistry）》上。 微生物群落的组成和功能在人类健康、全球元素循环、作物生长和植物抗病中发挥关键作用。随着高通量测序
玉米根际土壤细菌群落的演替研究获进展
植物根际微生物类群对植物的营养吸收和健康生长意义重大。玉米是一种重要的经济作物，传统的研究方法由于分辨率较低，使得我们很难真正了解根际细菌群落的结构及其动态变化。 中国科学院成都生物研究所应用与环境微生物中心的研究人员与美国伊利诺伊大学Mackie研究团队合作，使用高通量测序方法分析了玉米
科学家绘制出橡胶树基因组草图
日本和马来西亚研究人员合作成功绘制出橡胶树基因组草图，这将有助于培育更加高产的橡胶树，提高天然橡胶的产量。 日本理化学研究所日前发布一份公报说，该研究所和马来西亚理科大学的研究人员对东南亚广泛栽种的橡胶树品种“PRIM600”进行了基因组测序，绘制出的基因组草图包含了超过93.7%的橡胶树基因
第六届海峡两岸森林动态样区研讨会在广西召开
11月5日至9日，第六届海峡两岸森林动态样区研讨会在广西召开。会议由中科院生物多样性委员会主办，中科院广西植物研究所承办，并得到了中科院2012年海峡两岸会议资助。本次会议共有来自海峡两岸20家科研院所和高校的80名学者参会，其中台湾代表7人。中科院港澳台事务办公室张兴根主任，韩国生态学会前任理
版纳园等自主开发出叶绿体全基因组分析比较基因组程序包
高通量测序(High-throughput sequencing)，又称“下一代”测序(Next-generation sequencing)，是近年来在测序技术发展史中具有革命性改变的新突破，能一次并行对几十万到几百万条DNA分子同时测序，因此能对物种的转录组和基因组进行比以往较细致全貌的
研究揭示壳斗目形态多样性演化
有花植物类群生活史与形态特征展现出丰富的多样性，而理解表型多样性或差异性如何在地质时间尺度上形成和演化，是进化生物学的核心目标之一。尽管已有研究聚焦被子植物物种多样化的宏观模式，探讨植物类群性状差异的时间动态规律，但性状差异的驱动过程及其与基因组演化的关联性仍存在认知空白。 前期有研究认为形态
浙大团队绘制土壤基因组基因相关性网络－解码土壤“黑箱”
土壤微生物是元素生物地球化学循环过程及其他土壤生态过程的关键驱动因子。由于土壤结构和组成的复杂性，土壤微生物生态过程在研究中一直以来都被作为“黑箱”看待，要清楚阐明土壤生态功能是土壤生态学研究当前面临的一个重大挑战。 近日，浙江大学环境与资源学院徐建明教授团队在微生物学顶级期刊《国际微生物生态
新研究揭示微生物群落组装机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511972.shtm中山大学中山医学院教授丁涛团队研究揭示了人类口腔生物被膜（OBM）菌群过程中的纵向时序群体感应网络，并通过实验验证了细菌群体感应网络在预测和操纵菌群装配过程中的有效性。近日，相关成果
揭示了气候变暖和树木基因如何影响真菌群落动态
在影响橡树叶上真菌物种的数量和特性方面，气候变暖比植物基因发挥的作用更大，尤其是在秋季。近日，权威学术期刊New Phytologist发表了瑞典斯德哥尔摩大学Maria Faticov团队的最新相关研究成果，题为Climate warming dominates over plant geno
地化所等在宏基因组揭示煤矿来源酸性废水的抗性组特征
不同种类矿物的开采活动均能产生极端酸性，富含多种重金属和高浓度SO42-的酸性矿山废水（AMD，acid mine drainage）。此前关于AMD的研究集中在极端微生物的代谢特征以及处理工艺开发。金属和抗生素抗性基因共选择理论认为，富含多种重金属的环境可能是抗生素抗性基因（antibiotic
研究揭示中国森林生态系统水源涵养
明确中国森林生态系统水源涵养能力的空间分异规律，分析全国尺度和流域尺度森林水源涵养能力及其影响因素的空间差异，可为制定森林生态系统服务决策提供科学依据。 近期，中国科学院地理科学与资源研究所史文娇和陶福禄等基于Meta分析系统地收集了1045个关于全国森林水源涵养能力的相关参数及其影响因素的站
研究揭示氮沉降下真菌对热带森林土壤碳库的调控
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504058.shtm近日，中国科学院华南植物园小良热带海岸带生态系统定位研究站（以下简称小良站）站长、生态中心研究员王法明团队，基于小良站长期模拟氮沉降试验样地，揭示了氮沉降增强真菌驱动热带森林土壤有机碳
BMC－System－Biology发布超大规模进化树构建软件
中国科学院昆明动物研究所马占山团队与天津大学教授邹权、厦门大学科研人员联合发布了为千兆(GB)级基因序列数据构建进化树的软件HPTree。该软件使用谷歌Hadoop并行技术和美国加利福尼亚大学伯克利分校Spark集群大数据技术作为并行处理平台，利用计算机集群对基因序列大数据进行分割处理和整合，相
科学家开发出BEST技术来构建酵母细胞家族树
在利用四分体分析技术进行遗传研究中，酿酒酵母是被广泛使用的有机体之一。两个亲代酵母之间的交配产生四个子代酵母或者说孢子，这四个子代酵母粘连在一起，因而被称作四分体。为了在遗传上分析这些子代酵母，人们需要在物理上将每个四分体中的四个孢子分离开。当前的分离方法相当费时费力，而且75年以来，基本上都没
两院院士Nature子刊携手发表基因组研究新成果
来自中国农业科学院棉花研究所、深圳华大基因研究所、北京大学等机构的研究人员，报告称他们成功对栽培陆地棉（TM-1）进行了基因组测序，揭示出了其基因组进化的一些重要见解。研究论文发表在4月20日的《自然生物技术》（Nature Biotechnology）杂志上。 中国工程院院士、农业科学院棉花
应急管理部：南北多地森林火险形势较为严峻
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/3/474832.shtm 中新社北京3月1日电 (记者 陈溯)记者1日从中国应急管理部获悉，当前中国南北多地森林火险形势较为严峻。 近日，国家减灾委员会办公室、应急管理部会同有关部门召开会商会，对3月
应急管理部：南北多地森林火险形势较为严峻
记者1日从中国应急管理部获悉，当前中国南北多地森林火险形势较为严峻。 近日，国家减灾委员会办公室、应急管理部会同有关部门召开会商会，对3月份中国自然灾害风险形势进行会商研判，当天，将研判结果进行发布。 综合分析认为，3月份，中国大部地区气温接近常年同期到偏高，江南大部降水较常年同期偏少，西南
详细介绍一下生态模型法在苔藓物种多样性恢复速度评估指标研究中的应用
生态模型法在苔藓物种多样性恢复速度评估指标研究中具有重要的应用价值。以下是对其应用的详细介绍：模型构建首先，需要收集大量与苔藓生长和生态相关的数据，包括苔藓的生物学特性（如繁殖方式、生长速度、竞争能力等）、环境因子（如光照、温度、湿度、土壤质地和养分等）以及与其他生物的相互作用信息。基于这些数据，选
东北森林国家级保护区植物群落和土壤生物调查即将展开
东北森林国家级自然保护区约占东北有林地面积的7.03%，涵盖了区域内绝大多数森林群落类型，且保护区内自然土壤特征显著，开展对东北森林国家级保护区及毗邻区植物群落和土壤生物的系统调查，对于保护该地区生物多样性和生态系统、拯救珍稀濒危物种、开展相关科学研究等方面具有重要的作用。虽然部分自然保护区开展
望天树叶功能性状随不同树高垂直梯度而改变
近日，中国科学院西双版纳热带植物园西双版纳生态站依托林冠塔吊，对望天树个体尺度上不同树冠高度的形态结构、光合生理、水分生理和养分元素四类共计14个叶功能性状的变异性和相关性进行了研究，相关成果发表于《植物科学前沿》。热带森林生态系统具有非常复杂的群落结构、丰富的生物多样性和极其重要的生态意义。望天树
中国第一高树等身照亮相－380岁仍健康生长
图为科考队员攀爬巨树收集样本。国家重要野生植物种质资源库辰山中心供图 日前，由中国科学院植物研究所、国家重要野生植物种质资源库辰山中心-上海辰山植物园等组成的中国巨树科考队，发布了“中国第一高树”云南黄果冷杉的准确高度——83.4米，同时发布了巨树的等身照。 这是继中国西南野生生物种质资源库对高
生物量是什么意思
生物量(biomass) ，是生态学术语，或对植物专称植物量(phytomass)，是指某一时刻单位面积内实存生活的有机物质(干重)(包括生物体内所存食物的重量)总量，通常用kg/m或t/hm或g/m²表示。植物群落中各种群的植物量很难测定，特别是地下器官的挖掘和分离工作非常艰巨。出于经济利用和科研
成都生物所等在生物多样性调查模型研究中获进展
野外生态调查费时费力，一次甚至若干次的野外调查几乎不可能彻底把研究地区里面所有的角落进行无间隙覆盖。而且很多时候，能进行野外调查的样点常常需要考虑研究物种的生境偏好与周围环境条件的限制。 样线调查法可能是比较经济的生物多样性调查手段，经常用在植物、两栖爬行动物、鸟类兽类等几乎所有高等生物类群的