叶绿体基因组树优化森林大样地群落构建获揭示
群落构建是生态学家广泛关注的核心问题之一。1月2日，记者从中国科学院华南植物园获悉，该园分子生态学团队及其合作者，基于中国森林监测网络（CForBio）平台，揭示了叶绿体基因组树优化我国森林大样地群落构建认知。相关研究发表于《分子生态资源》。 据悉，系统发育群落生态学将系统发育分析方法整合到群落生态学的分析中，为探究群落生物多样性的演化与维持机制提供了新视角。建立准确可靠的群落系统树是进行群落系统发育分析的前提和基础，分辨率较低的群落系统树可能导致对系统发育多样性指数的估计产生偏差，进而影响对特定群落的生态过程的推断。 目前群落系统树的构建主要是利用Phylomatic、V.PhyloMaker等软件生成名录合成树，或是基于一代DNA条形码片段构建分子系统树。合成树方法无需采样、测序等步骤，成本较低，但结果中往往会出现较多的多歧分枝；一代DNA条形码树的物种分辨率相对更......阅读全文
亚热带森林群落生物多样性维持机制研究中取得进展
亚热带常绿阔叶林是我国独特的森林植被类型，在我国的分布范围最广、面积最大、生物多样性最高，约占我国国土面积的1/4，对我国生态文明建设和生态安全极其重要。历史上，中国亚热带常绿阔叶林经历过频繁、大规模的人为干扰，绝大部分原生性植被，特别是低海拔地区的原生地带性植被多已消失殆尽，少量保存的原始林也
植食性昆虫群落时空稳定性驱动因素被揭示
近日，中国科学院成都生物研究所副研究员王明强以BEF-China样地连续6年（2017–2022）观测的鳞翅目幼虫为研究对象，联合多位研究人员，揭示了中国亚热带森林植食性昆虫群落时空稳定性驱动因素，为揭示气候变化背景下森林昆虫群落波动及害虫暴发的生态机制提供了重要证据。相关成果发表在《生态学论丛
北京基因组所实现对大样本全基因组数据的群体遗传学分析
计算基因组学旨在发展理论和方法学，对基因组数据进行数据挖掘、提取信息。其中对遗传多态性，如基因频谱、单倍型结构等进行建模，利用群体基因组水平的遗传变异数据来推断群体的历史和变迁是群体遗传学的核心内容。传统的群体遗传学分析方法通常基于小样本数据，所推断的多为相对古老的历史事件，例如，被广泛应用的L
细胞质雄性不育与叶绿体基因组
CMS 与叶绿体的关系还存在很大的争议。相对于植物线粒体而言，叶绿体基因组较为保守也较小(120～160 kb)，因此对它的认识要比对线粒体深入的多。研究发现植物叶绿体一般分为4个区：两个反向重复区，大单拷贝区和小单拷贝区。已有多种植物叶绿体的物理图谱被构建。对高粱的 CMS 系及相应保持系的叶绿体
郁文彬等研究构建斗叶组系统演化关系
记者日前从中科院昆明植物研究所获悉，该所博士郁文彬在研究员李德铢、王红指导下，较准确地构建了斗叶组种间的系统演化关系，为进一步深入开展斗叶组，尤其是大王系的物种形成机制和生物地理学打下了坚实的基础。该研究成果近日发表在《公共科学图书馆·综合》上。 据介绍，马先蒿属全球有600多种，是列当科
多维生物多样性对森林生态系统功能的影响机制
全球变化（包括气候变化、土地利用和地表覆盖变化）和人类活动等导致了生物多样性的加速丧失，进而影响了生态系统的服务功能。近年来，生物多样性对生态系统功能的影响机制受到广泛关注，是生物多样性和生态学研究领域的热点问题。大量关于生物多样性与生态系统功能关系的研究表明，生物多样性是生态系统功能的主要驱动
研究揭示多维生物多样性对森林生态系统功能的影响机制
全球变化（包括气候变化、土地利用和地表覆盖变化）和人类活动等导致了生物多样性的加速丧失，进而影响了生态系统的服务功能。近年来，生物多样性对生态系统功能的影响机制受到广泛关注，是生物多样性和生态学研究领域的热点问题。大量关于生物多样性与生态系统功能关系的研究表明，生物多样性是生态系统功能的主要驱动
增温森林生态系统土壤微生物组装过程差异获揭示
在国家自然科学基金、广东省重点研发计划及博士后基金的资助下，中科院华南植物园科研人员研究揭示了增温下森林生态系统土壤微生物组装过程差异。相关研究近日发表于《全球变化生物学》（Global Change Biology）。鼎湖山森林生态系统国家野外科学观测研究站（以下简称鼎湖山站）博士后周曙仡聃为该论
科学家在蔷薇科叶绿体系统发育基因组研究中取得进展
系统发育基因组学是基因组学和系统发育生物学融合产生的一个交叉学科，主要用基因组水平的大规模分子数据解析生物之间的系统发育关系，并利用系统发育原理研究基因组进化机制。基因组大量的数据信息具有“缓冲”作用，能减少系统发育重建中的随机误差，使得引起基因树冲突的各种生物学因素被逐一分析，是当前重建生命之
激光雷达视野下的森林
什么是激光雷达？激光雷达（Light Detection and Ranging，LiDAR）是一种新兴的主动遥感技术，能够在多时空尺度上获取森林生态系统高分辨率的三维地形、植被结构参数、叶面积指数等参数。它的工作原理是通过测定传感器发出的激光在传感器与目标物体之间的传播距离，来分析目标地物表面的反
激光配合自动箱用于森林土壤树δ13C通量测量
量子级联激光光谱仪配合自动箱用于森林土壤、树干和树根δ13C通量的测量文献信息：Brndholt, A., Ibrom, A., Ambus, P., Larsen, K. S., & Pilegaard, K. (2019). Combining a quantum cascade laser
蛋白质数据+基因序列精准构建进化树
西班牙基因组调控研究中心的科学家们在最新一期《自然·通讯》上发表了一项创新研究，展示了如何利用蛋白质三维形状，解开生命中古老的“历史密码”，揭示了生命之树中最古老的进化关系。这项研究首次将蛋白质的形状数据与基因序列数据结合，提高了进化树的准确性。蛋白质结构解决“饱和问题”（艺术概念图）。图片来源：《
森林覆盖增加和减少的气候效应的不对称性获揭示
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506236.shtm
木本植物系统发育特性对森林土壤真菌群落分布的影响
天然林土壤是真菌多样性的沃土和热区，包括了种类繁多的功能类群。这些功能类群对森林的养分循环、林木健康和生态系统稳定有重要作用。木本植物是森林的主体，不间断地将光合碳源转移至邻近土壤（以下简称根基土），并与土壤微生物间维系着紧密的联系。近期研究发现森林树木-真菌关系中存在极强的系统发育信号，然而，
83.2米！青藏科考发现迄今中国最高树木
近日，第二次青藏高原科考“森林和灌丛生态系统与资源管理”专题的中科院植物所团队在西藏察隅县考察时，发现了成片高大的云南黄果冷杉原始森林。经无人机吊绳多次测量，其林冠高度达70米，最高的一株高度83.2米、胸径207厘米，刷新了曾报道的贡山的秃杉（72米）、墨脱的不丹松（76.8米）和台湾的秃杉的
Science：HIV家族树可揭示病毒传播机制
HIV病毒非常善于躲避免疫系统的追踪同时也让HIV的疫苗研究停滞不前。这种“特异功能”或许也正可以成为HIV病毒的致命弱点。 最新一期的《Science》发表了一篇评论文章，分析了如何通过分析HIV病毒的家族进化树来研究病毒的传播扩散。HIV病毒是一种RNA病毒，变异速率很快。这就导致每一代的
武汉植物园完成掌叶木和伞花木的叶绿体基因组解
掌叶木和伞花木是我国特有的无患子科植物，分别所属的掌叶木属和伞花木属是无患子科的单种属。近期，中国科学院武汉植物园研究人员通过浅层基因组测序技术组装了这两种植物的叶绿体基因组，为开展针对性种群遗传学研究和保护工作等提供重要的理论数据。在2021年公布的《国家重点保护野生植物名录》中，掌叶木和伞花木均
“巨型真菌”破坏森林基因机理获解
英国《自然·生态与演化》杂志近日发表论文，报告了蜜环菌四个物种的基因组。该研究成功揭示了这些真菌扩散并感染植物的基因机理，为制定策略以控制它们破坏森林提供了宝贵资源。 蜜环菌属囊括了地球上最大的陆生生物体以及最具破坏性的森林病原体。一个被称为“巨型真菌”的蜜环菌，个体覆盖面积达965公顷，重达
“巨型真菌”破坏森林基因机理获解
英国《自然·生态与演化》杂志近日发表论文，报告了蜜环菌四个物种的基因组。该研究成功揭示了这些真菌扩散并感染植物的基因机理，为制定策略以控制它们破坏森林提供了宝贵资源。 蜜环菌属囊括了地球上最大的陆生生物体以及最具破坏性的森林病原体。一个被称为“巨型真菌”的蜜环菌，个体覆盖面积达965公顷，
叶绿体基因组遗传信息获取技术体系建立
记者日前从中科院昆明植物所获悉，该所种质资源库多年来致力于叶绿体基因组学研究，并建立了较为完善的叶绿体基因组遗传信息获取技术体系。该技术体系解决了叶绿体基因组获取方法需要大量新鲜材料以及一些物种因个体微小须通过二代测序方法获取叶绿体基因组的难题。 2012年以来，科研人员利用二代测序技术研究了
关于蓝藻和叶绿体基因组的比较研究介绍
原核的蓝藻和真核植物（包括其他藻类）中的叶绿体，都同样进行放氧的光合作用，这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析，证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。 蓝藻基因组的
植物叶绿体基因组可以全部转录的新机制
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能、供给地球上的其它生物能量来源的重要细胞器，对叶绿体的功能和叶绿体基因组转录机制的研究一直以来是全球细胞生物学家、遗传学家和分子生物学家孜孜以求的研究热点。中国科学院昆明植物研究所研究员高立志带领的研究团队，历时五年，通过对三种高等植物（水稻、玉米和拟南芥
细胞化学基础蓝藻和叶绿体基因组的比较研究
原核的蓝藻和真核植物（包括其他藻类）中的叶绿体，都同样进行放氧的光合作用，这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析，证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。蓝藻基因组的作图和测
草莓和可可树基因组图谱出炉
据美国物理学家组织网12月26日报道，在26日出版的《自然—遗传学》杂志上，两组科学家表示，他们分别解开了野生草莓和克里奥洛可可树的基因密码，新发现有助于育种专家培育出品质更高的草莓和可可树品种。 英国生物工艺学和生物学研究委员会(BBSRC)和其他4个国家的70名研究人员绘制出了野生草莓
中国科学家成功破译树鼩基因组
2013年2月6日，中科院昆明动物所、深圳华大基因研究院等单位对树进行了全基因组测序，并对其分类地位和相关生物学特征进行了深度解析。树基因组的完成，将为其在生物医学研究中用作动物模型奠定重要的遗传学基础，进而使其更好的应用于生物医药研究。研究成果在《自然•通讯》(Nature Communi
稻田稗草基因组及水稻—草竞争分子机制获揭示
中国水稻研究所和浙江大学共同开展研究并取得重要进展，获得了稻田稗草基因组，揭示了稗草通过基因簇合成防御性次生代谢化合物，用于与水稻竞争和抵御稻田病菌的遗传机制，并为水稻C4育种提供了一个重要基因遗传资源。近日，相关研究成果在线发表于《自然—通讯》。 该研究表明，稗草可以合成异羟肟酸类次生代谢产
异源多倍化中亚基因组优势形成机制获揭示
近日，南京农业大学园艺学院教授陈劲枫团队在《尖端科学》在线发表研究论文。该研究历经20多年，围绕甜瓜属人工异源四倍体新物种“金瓜”开展了系统深入研究，完成了世界首例人工合成异源多倍体全基因组测序，揭示并初步阐明了在异源多倍化物种形成3个阶段中，种间杂交的作用最为显著，以及亚基因组优势形
地理资源所中国森林生态系统性状与功能研究获系列进展
性状（Trait）或功能性状（Functional trait）是生物对外界环境长期适应和进化后所呈现出来的可量度的特征。20世纪80年代以来，植物性状研究作为生物学、地学和环境科学交叉研究的纽带，成为现代生态学研究的热点，尤其是涉及碳收支、养分和水分利用的植物性状更是倍受重视。科学家通过各种途
青藏高原第二次科考发现迄今为止中国最高树木
青藏高原二次科考“森林和灌丛生态系统与资源管理”专题的中国科学院植物研究所郭柯团队近日在西藏察隅县考察时，发现了成片高大的云南黄果冷杉原始森林。经无人机吊绳多次测量，其林冠高度达70米，最高的一株高度83.2米、胸径207厘米，高度超过了此前曾报道的位于西藏的不丹松（76.8米)和位于台湾的台湾
83.2米！科学家发现迄今中国最高树木
近日，中国科学院植物研究所研究员郭柯团队在西藏察隅县考察时，在云南黄果冷杉原始森林发现我国迄今为止最高树木。经无人机吊绳多次测量，该树木高度83.2米、胸径207厘米，高度超过了此前报道的位于西藏的不丹松（76.8米)和位于台湾的台湾杉（81-82米），刷新了中国最高树纪录。 青藏高原二次