叶绿体基因组树优化森林大样地群落构建获揭示
群落构建是生态学家广泛关注的核心问题之一。1月2日，记者从中国科学院华南植物园获悉，该园分子生态学团队及其合作者，基于中国森林监测网络（CForBio）平台，揭示了叶绿体基因组树优化我国森林大样地群落构建认知。相关研究发表于《分子生态资源》。 据悉，系统发育群落生态学将系统发育分析方法整合到群落生态学的分析中，为探究群落生物多样性的演化与维持机制提供了新视角。建立准确可靠的群落系统树是进行群落系统发育分析的前提和基础，分辨率较低的群落系统树可能导致对系统发育多样性指数的估计产生偏差，进而影响对特定群落的生态过程的推断。 目前群落系统树的构建主要是利用Phylomatic、V.PhyloMaker等软件生成名录合成树，或是基于一代DNA条形码片段构建分子系统树。合成树方法无需采样、测序等步骤，成本较低，但结果中往往会出现较多的多歧分枝；一代DNA条形码树的物种分辨率相对更......阅读全文
叶绿体核糖体RNA加工分子机制研究获进展
RNA操作是目前研究的热点之一。要实现精确的RNA操作，需要特异地识别靶向目标RNA分子并对其进行剪切。但到目前为止，这类序列特异的RNA内切酶在自然界中还没有被发现。因此，寻找一类序列特异的RNA内切酶显得尤为重要。中科院植物研究所卢从明研究组日前在相关领域取得进展，相关论文2月6日在线发表于
李学龙：亟需构建临地安防技术体系
临地空间图。临地安防技术体系。 相干光探测。 稳定探测。 多模态认知计算。 群体智能决策。 涉水光学。 跨域侦察与联合登陆。 图
PacBio单分子测序揭示丹参叶绿体DNA修饰的相互作用
2014年6月10日，中科院药用植物研究所（IMPLAD）刘昶团队在《PLOS ONE》杂志上发表了利用PacBio测序技术揭示丹参（Salvia miltiorrhiza）叶绿体DNA修饰之间复杂相互作用的相关文章，该文章报道了丹参叶绿体中编码及非编码RNA的表达情况。这也是国内PacBio第
戚益军组揭示叶绿体逆行信号拟南芥microRNA生成重要机制
microRNA（miRNA）是一类长约21个核苷酸的内源小RNA，它们从其前体（primary miRNA, pri-miRNA）在细胞核内被 Dicer-like 1 (DCL1) 加工产生，与效应蛋白 Argonaute1 结合后通过切割靶标 mRNA 或抑制翻译等方式调节基因
戚益军组揭示叶绿体逆行信号拟南芥microRNA生成重要机制
microRNA（miRNA）是一类长约21个核苷酸的内源小RNA，它们从其前体（primary miRNA, pri-miRNA）在细胞核内被 Dicer-like 1 (DCL1) 加工产生，与效应蛋白 Argonaute1 结合后通过切割靶标 mRNA 或抑制翻译等方式调节基因表达。叶绿体
华南植物园鼎湖山植物DNA条形码研究获进展
日前，中科院华南植物园研究人员在鼎湖山木本植物DNA条形码研究方面取得重要进展。相关结果在线发表于《多样性及其分布》上。 DNA条形码技术是一种利用标准的简短基因片段来实现物种快速识别的工具。动物界，线粒体COI基因应用非常成功。但是在植物界，由于进化历史复杂，标准条形码还没有达成共识。 针
昆明植物所建立叶绿体基因组遗传信息获取技术体系
在分子生物学和基因组时代，叶绿体基因组为植物分类、系统发育和物种鉴定等提供了不可或缺的遗传信息。随着新一代测序技术的快速发展，叶绿体基因组学已经成为植物系统基因组学和超级条形码研究的热点，也是中国科学院昆明植物研究所三个重大突破目标——iFlora 研究的重要内容。 昆明植物所种质资源库多年来
《自然》及子刊综览
《自然—通讯》 尼安德特人灭绝不可避免 一个新模型表明，现代人类从非洲迁移到欧亚大陆是尼安德特人被现代人类取代的重要原因。此前，科学家认为尼安德特人的灭绝由环境压力和来自现代人类的竞争造成。相关成果11月1日发表于《自然—通讯》。 美国加利福尼亚州斯坦福大学的Oren Kolodny和同事
北京基因组所构建完成质体基因组结构变异数据库
多相催化是实现高效定向化学转化的关键技术，其中的一个重要基础科学问题是如何通过精确设计和调控催化活性位结构及所在环境，从而强化其定向催化功能并创造新型高效催化剂。近日，中国科学技术大学熊宇杰教授课题组和江俊教授课题组继在电催化体系中提出表面极化概念后,再次通过与黄伟新教授课题组合作，证实界面极化
华裔牛人Nature－Methods发布基因组编辑优化新技术
来自哈佛大学、麻省总医院的研究人员开发出了一项能推动基因组工程领域的新技术。这一技术可显著提高科学家们靶向特定缺陷基因，然后“编辑”它们，用健康DNA替代这一受损遗传密码的能力。这一重要的研究成果发布在《自然方法》（Nature Methods）。 论文的通讯作者是哈佛大学化学及化学生物学教授
凭部分基因和表型“认亲”不靠谱
巢穴中的小山猴 Roberto F. Nespolo摄■本报记者 张文静长期以来，用物种形态特征和分子数据构建物种关系树，是很多研究常用的做法。而实际上用这两种方法推断物种演化历程时，常常出现相互矛盾的情况，但相关研究非常有限。4月20日，《细胞》刊发了一项由中国科学家领衔的中外联合团队进行的
凭部分基因和表型“认亲”不靠谱
长期以来，用物种形态特征和分子数据构建物种关系树，是很多研究常用的做法。而实际上用这两种方法推断物种演化历程时，常常出现相互矛盾的情况，但相关研究非常有限。 4月20日，《细胞》刊发了一项由中国科学家领衔的中外联合团队进行的研究。该研究不仅公布了对有袋类哺乳动物物种辐射性大爆发过程的研究结果，
土壤病毒群落对土地利用类型响应研究获新进展
病毒（Virus）是地球上种类最多样、数量最丰富的生物实体（biological entities）。目前保守估计病毒粒子在全球的数量可以达到1031个，生物量可以达到两亿吨，在整个地球生态系统中占据重要生态位。然而，目前对不同环境中的病毒的认识仍十分有限。截至2022年5月，上传到NCBI的已分离
橡胶树花青素合成调控研究获进展
近日，中国热科院橡胶所在橡胶树花青素生物合成的转录调控方面取得重要进展，相关成果发表于《工业作物和产品》。该成果不仅丰富了对橡胶树花青素合成转录调控的认识，也为橡胶树遗传转化体系提供了高效的选择标记。橡胶树叶片的发育过程可分为古铜期、变色期、淡绿期和稳定期四个阶段。研究团队通过高效液相色谱分析发现一
橡胶树花青素合成调控研究获进展
近日，中国热科院橡胶所在橡胶树花青素生物合成的转录调控方面取得重要进展，相关成果发表于《工业作物和产品》。该成果不仅丰富了对橡胶树花青素合成转录调控的认识，也为橡胶树遗传转化体系提供了高效的选择标记。 橡胶树叶片的发育过程可分为古铜期、变色期、淡绿期和稳定期四个阶段。研究团队通过高效液相色谱分
中科院华南植物园建立中国竹类一新属
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454742.shtm 中国科学院华南植物园植物中心覃俏梅和童毅华在研究员夏念和的指导下，发表了中国竹类一新属——华赤竹属。相关研究近日发表于《分类单元》。 赤竹属是青篱竹亚族的一个小属，其主要特征
窥一斑而见全貌－科学家首次验证“一树一森林”理论
“一沙一世界”是英国诗人布莱克《天真的预言》中为人传颂的诗句。而美国亚利桑那州大学(UA)生态学和进化生物学系的科学家，在实际研究中提出并验证了“一树一森林”的观点，它指的是：通过一棵树就可以揭示整个森林的“秘密”。 具体而言，研究发现跨物种的树木尽管在外观上存在差异，但有着非常相似的架构
今夏最热门的基因组测序研究，中国学者再立新功
大千世界无奇不有，这都是进化的功劳。大航海时代，科学家们扬帆远航去探索大自然的神奇造化。如今，科学家们正在测序技术的帮助下进一步揭示生命的奥秘。The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点，我国学者参与的两项测序研究格外引人注目。 种属：虎鲸（Orcinus orc
林业科创让石山变金山
尽管没有北方的天寒地冻，万物凋零，但在初冬的广西凭祥市，四处依然是万木枯荣。但当记者走进中国林科院热带林业实验中心（下称“热林中心”）大院，却被院子的三面大山牢牢吸引：和附近的其他环境相比，这里生机勃勃，绿意盎然，尤其是耸立在其西边的那座大青山。热林中心研究员卢立华介绍说：“别看这座山现在丛林茂
新版树鼩基因组测序－填补首版约73％拼装缺口
从中国科学院昆明动物研究所获悉，近期，该所科研人员完成了新版的树鼩基因组高精度测序、组装和注释。新版树鼩基因组填补了第一版基因组中约73%的拼装缺口。 据介绍，树鼩是一种与实验大鼠差不多大小的小型哺乳动物，为灵长类动物的近亲，在生物医学研究中颇具潜力。目前，树鼩已被用于感染性疾病如乙型肝炎、丙
昆明动物所等发布最新版树鼩基因组注释
树鼩是一种与实验大鼠差不多大小的小型哺乳动物，是灵长类的近亲。由于其繁殖周期短（约6周），饲养成本低，单胎产仔数较高（每胎2-5只）等特点，在某些方面有望替代非人灵长类用于生物医学研究和应用。目前，树鼩已被用于多种感染性疾病模型创建，是研究视觉系统与功能的很好的动物。中国科学院昆明动物研究所研究
研究提出离子载体构建自优化锌负极的新策略
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507924.shtm
南京土壤所在滨海盐渍农田细菌群落结构中获进展
土壤盐分引起渗透胁迫，造成作物水肥吸收障碍，影响土壤微生物生长及其活性，制约土壤碳氮转化等生物化学功能，进一步降低土壤养分利用效率。改善微生物生物量和活性对提升土壤有机质库容、促进养分循环与周转、提高养分利用效率具有重要意义。已有研究表明，盐渍土地区土壤盐分和pH主导土壤细菌的群落多样性、结构和
湖泊草藻不同群落遥感自动识别算法研究获进展
在人类活动和气候变暖双重压力下，湖泊水环境问题日益突出。全球超过60%湖泊呈现富营养化状态，8.8%湖泊出现藻华。草、藻型不同稳态类型的演变和转化是湖泊生态学研究的热点之一，但因缺乏长时序草藻数据支撑而无明显突破。 Landsat系列卫星数据可快速获取高分辨率的地表现状信息，并可重建自1980
季风对南海浮游生物群落影响研究获进展
中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室浮游生物生态学研究团队在季风对南海浮游生物生态学影响研究领域取得重要进展。他们从浮游植物和浮游动物两个方面量化阐明了浮游生物群落对季风变化的响应规律。近日，相关成果相继发表于《地球物理学研究期刊：海洋》（Journal of Geophys
干旱区盐渍土农田土壤细菌群落分布模式研究获进展
土壤微生物是维系土壤生态功能的核心，认知土壤微生物分布模式有助于农田养分管理和作物生产。尽管农田土壤微生物分布模式被广泛研究，但人们对盐渍农田土壤微生物多样性和分布知之甚少。干旱区的盐渍农田土壤呈现高pH值、高含盐量、低有机质、低含水量等特点，可能具有较独特的微生物分布模式。 中国科学院新疆生
上海光机所提出对二维材料光谱学进行机器学习研究方案
近期，中国科学院上海光学精密机械研究所微纳光电子功能材料实验室在利用随机森林算法实现二维材料层数和缺陷识别研究中取得新进展，揭示了机器学习算法在二维材料光谱学研究领域的应用潜力。 机器学习是人工智能领域的重要分支，其基本思想是基于数据构建统计模型，并利用模型对数据进行分析和预测。随着大数据技
森林生态系统森林植被与大气间汞的交换过程研究获进展
森林生态系统是全球大气汞（Hg）的重要汇，从全球尺度看，每年森林生态系统从大气吸收1180吨左右的汞。但是对植被吸收的大气汞是否存在向大气的再释放过程以及再释放通量大小的认识还不清楚。通量箱（袋）传统方法只能获得植被与大气间汞交换的净通量值，无法区分植被吸收大气汞的通量和植被向大气排汞的通量。这
森林生态系统森林植被与大气间汞的交换过程研究获进展
森林生态系统是全球大气汞（Hg）的重要汇，从全球尺度看，每年森林生态系统从大气吸收1180吨左右的汞。但是对植被吸收的大气汞是否存在向大气的再释放过程以及再释放通量大小的认识还不清楚。通量箱（袋）传统方法只能获得植被与大气间汞交换的净通量值，无法区分植被吸收大气汞的通量和植被向大气排汞的通量。这
中科院最新文章解析人类母乳微生物菌群
母乳是婴儿最健康、理想的营养来源, 也是人类进化和文明最重要的特征之一. 最新的宏基因组学研究表明母乳含有高达数百种细菌, 而且包括一些常见的病原菌. 母乳微生物菌群是人类与微生物协同进化相互适应的产物, 而“微生物群落-宿主”生态系统的动态平衡则应是保持健康母乳的基础. 然而, 迄今为止, 从