《自然》及子刊综览
《自然—通讯》 尼安德特人灭绝不可避免 一个新模型表明，现代人类从非洲迁移到欧亚大陆是尼安德特人被现代人类取代的重要原因。此前，科学家认为尼安德特人的灭绝由环境压力和来自现代人类的竞争造成。相关成果11月1日发表于《自然—通讯》。 美国加利福尼亚州斯坦福大学的Oren Kolodny和同事根据物种流动建立了一个尼安德特人替代模型，该模型中，物种频率的变化源自随机事件，而非竞争优势。即使在默认尼安德特人和现代人类仅在迁移规律和初始人口大小上不同的情况下，他们仍旧发现现代人类必定会取代尼安德特人，原因是现代人类多次从非洲迁移至欧亚。该模型表明这一替代过程是循序渐进的：尼安德特人被走出非洲的一群或多群小规模现代人类的后代取代，他们在欧亚定居，数量逐渐增加，直到最终古人类占据人群的100%。 虽然环境因素或现代人类的优势也可能加速了尼安德特人的灭绝，但是新模型表明尼安德特人被取代是不可避免的。模型还为今后测试其他原因的相对作......阅读全文
微塑料改变海鸟肠道微生物群
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497279.shtm
微塑料改变海鸟肠道微生物群
意大利科学家在最新一期《自然·生态与进化》杂志发表的一项研究指出，与摄入较少微塑料的海鸟相比，摄入高水平微塑料的野生海鸟肠道内的微生物总体上更丰富多样，但目前尚不清楚这种多样性的增加对海鸟意味着什么。微塑料是宽度小于5毫米的塑料碎片。本月发表的一项研究指出，海洋上漂浮着大约230万吨微塑料。海鸟寿命
PNAS：与珊瑚有关的微生物群的宏基因组学
对珊瑚礁相关微生物群落的一个大尺度宏基因组学调查表明，这些微生物的分类学组成最多地受到了珊瑚和水藻等深海底大生物体的影响，而它们的代谢特化随着局部海洋学状况而变化。微生物群落影响相关珊瑚礁的健康，但是支配微生物群落结构和基因流的机制在很大程度上仍然未知。 Linda Wegley Kelly
科学家发现微生物群重塑肿瘤微环境的新机制
近期，美国国家癌症研究所（National Cancer Institute）的研究团队发现肠道微生物群可通过影响单核吞噬细胞系统重塑肿瘤微环境。该研究在《Cell》上发表，题为：Microbiota triggers STING-type IFN-dependent monocyte repr
微塑料影响土壤微生物群落结构等的研究获进展
微塑料污染已在世界范围内成为日益普遍的问题，但其对土壤环境的影响有待探究。近日，中国科学院城市环境研究所研究员姚槐应团队利用磷脂脂肪酸（PLFA）技术、实时荧光PCR方法、细菌16S rRNA和真菌ITS高通量测序技术以及温室气体监测气相色谱（GC）法，研究了微塑料污染对菜地土壤微生物群落结构和
青岛能源所建立工业产油微藻基因组编辑技术
自然界的一些真核微藻能够通过光合作用固定二氧化碳，并将其转化和存储为油脂。因此，作为一种潜在可规模化的清洁能源生产和固碳减排方案，微藻能源近年来受到了广泛关注。然而，高效遗传工具的匮乏，极大限制了工业产油微藻的机制研究和分子育种。近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心以微拟球藻为
生物群体多态性的定义
多态性是广义的多态性指多种表现形式。“多态性” 一词最早用于生物学，指同在一个生物群体，各个体之间存在的形态学、生理学和生化学的差异，并非所有多态性都是可以遗传的。生物群体中，同基因组存在2个或2个以上等位基因（频率>0.01）的现象称为遗传多态性。遗传多态性的形成机制是基因突变。遗传多态性类型很多
纯化的基因组－DNA－的微球菌核酸酶消化实验
实验材料0.5～1 mg 纯化的基因组 DNA微球菌核酸酶（MNase）试剂、试剂盒核缓冲液 C0.5 mol L CaCl20.25 mol L EGTA氯仿仪器、耗材设置在 68℃ 的加热器冰块实验步骤1. 取 100 ug 基因组 DNA 加入到室温的核缓冲液 C 中，使终体积为 300 ug
纯化的基因组－DNA－的微球菌核酸酶消化实验
实验方法原理 实验材料 0.5～1 mg 纯化的基因组 DNA微球菌核酸酶（MNase）试剂、试剂盒 核缓冲液 C0.5 mol L CaCl20.25 mol L EGTA氯仿仪器、耗材 设置在 68℃ 的加热器冰块实验步骤 1. 取 100 ug 基因组 DNA 加入到室温的核缓冲液 C 中，使
青岛能源所新一代元基因组平台建设取得进展
元基因组是指一定环境下整个微生物群落中的所有遗传信息的总和。元基因组数据的收集与分析克服了传统分离培养方法仅局限于群落中可培养组分（一般仅占1%）的缺陷，使挖掘、认识与利用不可培养的组分（即另外之99%）成为可能，为全面研究自然状况下微生物群落的结构与功能提供了新途径。 元基
Caliper微流体芯片技术成为评估基因组DNA质量的新方法
随着疾病和药物治疗在遗传水平上的研究越来越普遍，高质量基因组DNA的有效性及评估其质量的方法是必不可少的。在一些研究中，比如下一代测序和分子诊断，保证基因组DNA的完整性(有大片段的分布并没有降解)是得到高质量结果的决定性步骤。 目前，琼脂糖凝胶通常被用于直观的分析基因组DNA的质量。这些
微波炉也有微生物群
在灼热的热液喷口、零度以下的极地等地球极端恶劣环境中，仍有生物顽强生存甚至茁壮成长，它们被统称为“极端微生物”。而近日一项发表于《微生物学前沿》的研究发现，极端微生物扩展出了新的“栖息地”，一个人类日常生活中十分常见的厨房工具——微波炉。这是首次研究微波炉是否也有自己的微生物群。该研究挑战了一个常见
探索神秘的微生物群落
微生物虽然看不见，但却是无处不在的。人体的肠道和皮肤、地球的海洋和土壤，甚至植物的叶片和种子，都有它们的身影。在大多数情况下，这些微生物群落是由许多不同的物种组成的。研究人员试图鉴定这些微生物群落的组成，但相当有难度。Sarah Webb在这一期的《BioTechniques》上介绍了目前的进展
哈佛大学开发人体肠道微生物器官芯片技术监测肠道菌群
人体微生物群（microbiome）是我们体内和体表大量微生物的集合，对人类健康和疾病有着深远的影响。尤其是人体肠道菌群，这里蕴藏着最密集的微生物，不仅分解营养物质释放对我们生存至关重要的分子，而且是许多疾病发展的关键因素，包括感染、炎症性肠病、癌症、代谢性疾病、自身免疫性疾病和神经精神病。
经常暴饮暴食？肠道微生物群在作怪！
暴饮暴食症（OD）患者通常表现出对可口食物的渴望。对暴饮暴食的控制减少通常会导致过度偏好高能量和美味的食物，以及在短时间内过度进食。这可能会严重影响身心健康。饮食和压力是OD发展的两个最重要的因素。在训练过的动物中也发现了类似的由压力和节食史引起的暴饮行为。ODs在当代社会仍然是一个普遍存在的问
科学家确定瓮安生物群年龄
瓮安生物群主要产于我国贵州瓮安埃迪卡拉系陡山沱组含磷地层，它以磷酸盐化方式精美保存了多种类型的微体真核生物化石，包括带刺疑源类、多细胞藻类，以及管状和球状微体化石，其中一些球状化石曾经被解释为动物胚胎和微体后生动物，随后这些化石的生物属性在国际学界引起了持续而深入的争论。 瓮安生物群为新元古代
基因测序找出肠道核心微生物群
人类肠道中有数以万亿计的微生物，也称为肠道菌群，与多种疾病如肠炎、肥胖、糖尿病等都有关系。最近，比利时鲁汶大学和荷兰格林宁根大学两个团队分别在《科学》杂志发表论文，通过两项大型研究计划找出了肠道核心微生物群，为进一步建立生物标记体系，评估肠道菌群是否正常提供了线索。 肠道微生物组能产生维生素
PNAS：从基因到植物微生物群
像人类和动物一样，植物也有微生物群。一个由芝加哥大学领导的研究小组，包括INRAE，研究了一种植物物种内的遗传变异是否控制其叶片微生物群的组成。研究人员在两年多的时间里在四个地点的实验装置中种植了3万多株植物，以分析一株模型植物的200个基因型的叶片微生物群的变异和繁殖成功率(通过种子产量估计)。7
中国发现典型埃迪卡拉生物群
最近，中国科学院南京地质古生物研究所研究员陈哲、周传明等在三峡地区灯影组的碳酸盐地层中，发现了多种类型的埃迪卡拉生物群典型分子，总体面貌可以与纳米比亚、澳大利亚等世界其他地区的相比较。 埃迪卡拉生物群是“寒武纪大爆发”前夕埃迪卡拉纪最为独特的宏体化石生物群，它在早期宏体生物的演
清江生物群打开寒武纪“新宝藏”
北京时间3月22日凌晨，《科学》发表西北大学早期生命与环境创新研究团队张兴亮、傅东静等人的最新研究成果，在国际上首次公布了该团队在中国宜昌长阳地区发现的距今5.18亿年的寒武纪特异埋藏软躯体化石库，即“清江生物群”。 寒武纪大爆发与生命起源、智能起源等重大里程碑事件一起被列为六大自然科学难题。
青岛能源所元基因组计算方法学研究取得新进展
近日，在科技部863计划、国家自然科学基金等项目的支持下，中国科学院青岛生物能源与过程所功能基因组团队在元基因组计算方法学取得了系列进展。 纤维素降解、沼气生成等生物能源过程均由复杂微生物群落完成。元基因组学可克服自然界中大部分微生物难以培养的问题，通过直接测定、分析微生物群落
早产或与胎盘中微生物有关
美国一个研究小组说，孕妇胎盘并不像人们此前认为的那样是一个无菌环境，而是生存着一个小型但多元的微生物群落。这些微生物直接影响胎儿的健康，甚至可能与胎儿是否早产有关。 微生物群落是细菌、病毒与真菌等的总称。休斯敦贝勒医学院副教授谢斯蒂·奥高及同事在美国《科学—转化医学》杂志上报告说，新研究表明，
早产或与胎盘中微生物有关
美国一个研究小组说，孕妇胎盘并不像人们此前认为的那样是一个无菌环境，而是生存着一个小型但多元的微生物群落。这些微生物直接影响胎儿的健康，甚至可能与胎儿是否早产有关。 微生物群落是细菌、病毒与真菌等的总称。休斯敦贝勒医学院副教授谢斯蒂·奥高及同事在美国《科学转化医学》杂志上报告说，新研究表明，孕
我国学者根际微生物组响应作物生长和氮素输入
根际是指靠近植物根系、受植物根系活动影响的微区域，是植物与土壤生态系统之间的交互界面。大量微生物定殖于此并与植物根系以及周边土壤存在密切的相互作用，对植物养分获取、生长发育等方面起到重要作用。根际微生物基因组被视作植物第二基因组。我国是世界上氮肥施用量最大的国家，过量的氮肥投入已造成严重的环境污
宏基因组及宏转录组测序揭示极端环境微生物的生态学作用
中山大学与千年基因合作应用宏基因组及宏转录组测序对极端环境酸性矿山废水（Acid mine drainage, AMD）中的微生物群落进行研究，相关成果于11月7日发表于The ISME Journal杂志。 本研究是继2012年11月发表于The ISME Journal杂志的微生物群落多样
单细胞分离策略的优缺点
据美国能源部微生物基因组学计划的主管Tanja Woyke介绍，研究人员使用几种方法分离单细胞，它们各有优缺点。Quake曾使用微流体方法来分离一种称为TM7的无法培养微生物1。TM7是杆状的，于是Quake及其团队专门捕获口腔微生物群落中的杆状细菌。随后他们通过核糖体RNA来追踪所要的细胞。在35
“蓝田生物群”现场讨论会在安徽休宁举行
考察现场 6月17日，由中国科学院南京地质古生物研究所和安徽省黄山市休宁县政府共同举办的“蓝田生物群”现场研讨会在休宁县举行。 中国科学院副院长丁仲礼院士、院资源环境科学与技术局局长范蔚茗等领导出席了本次会议。休宁县县长金涛等热情接待了与会人员。出席本次会议的领导和专家还有：国土资
迄今最详细合成肠道微生物群构建
美国研究人员在最新一期《细胞》杂志上撰文指出，他们构建出了迄今最详细、最完整的合成肠道微生物群——由100多种细菌组成，并将其成功移植到小鼠体内。能够添加、删除和编辑单个细菌，将使科学家更好地理解肠道微生物群与健康之间的联系，并最终开发出一流的微生物组疗法。 此前研究表明，肠道微生物群会影响人的
－Science：人类肠道微生物群有多稳定
研究人员研发出了一种改进了的、用来分析在我们肠道中和平相处的细菌群落的技术，这使得他们能够对这些细菌群落随着时间的推移而呈现的稳定性有所了解。对于为了长期的健康干预而用这些多样的微生物作为标靶而言，定义人类肠道微生物群落的稳定性是至关重要的。然而，科学家们对有关这些微生物株在我们肠道中是多么难以
道虎沟生物群发现最早的昆虫母爱
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/7/482620.shtm 卡拉划蝽的生态复原图（孙捷绘制） 昆虫不仅有母爱，而且昆虫母性关怀的适应行为至少可追溯至中侏罗世。这项发现由中国科学院南京地质古生物研究所（以下简称南京古生物所）博士研究生