叶绿体基因组树优化森林大样地群落构建获揭示
群落构建是生态学家广泛关注的核心问题之一。1月2日，记者从中国科学院华南植物园获悉，该园分子生态学团队及其合作者，基于中国森林监测网络（CForBio）平台，揭示了叶绿体基因组树优化我国森林大样地群落构建认知。相关研究发表于《分子生态资源》。 据悉，系统发育群落生态学将系统发育分析方法整合到群落生态学的分析中，为探究群落生物多样性的演化与维持机制提供了新视角。建立准确可靠的群落系统树是进行群落系统发育分析的前提和基础，分辨率较低的群落系统树可能导致对系统发育多样性指数的估计产生偏差，进而影响对特定群落的生态过程的推断。 目前群落系统树的构建主要是利用Phylomatic、V.PhyloMaker等软件生成名录合成树，或是基于一代DNA条形码片段构建分子系统树。合成树方法无需采样、测序等步骤，成本较低，但结果中往往会出现较多的多歧分枝；一代DNA条形码树的物种分辨率相对更......阅读全文
纳米森林传感器应用研究获进展
中国科学院微电子研究所研究员黄成军和毛海央团队在纳米森林传感器及其应用研究方面取得进展。 呼吸是支持人类生命活动的重要过程。呼吸频率和深度是反映运动强度的关键指标，呼吸模式与心肺功能相关。呼吸检测可以实时了解运动者的身体状态，避免过度运动或运动不足，还可以评估运动者的心肺健康状况，为制定个性化
研究揭示线虫与自然产生的复杂细菌群落交互机制
近日，西北农林科技大学未来农业研究院罗文穗教授和植物保护学院韩自端教授通过模拟自然环境中的复杂微生物组，阐释了进化模式线虫 Pristionchus pacificus 与细菌群落的交互机制，相关研究成果发表在《自然-通讯》上。研究对不同时间点细菌群落的观察，支持了“streamlining the
研究揭示线虫与自然产生的复杂细菌群落交互机制
近日，西北农林科技大学未来农业研究院罗文穗教授和植物保护学院韩自端教授通过模拟自然环境中的复杂微生物组，阐释了进化模式线虫 Pristionchus pacificus 与细菌群落的交互机制，相关研究成果发表在《自然-通讯》上。研究对不同时间点细菌群落的观察，支持了“streamlining
生态中心揭示水体污染驱动浮游群落空间分布格局机制
日益频繁的人类活动带来大量污染物排放，导致河流水生生物多样性锐减，河流生态系统功能严重受损。因此，开展水质污染对河流生态系统影响的过程及机理研究，认识人类干扰胁迫下河流生态系统的演化过程、演化方向及其生态学机制，是目前水生态和水环境等多个研究领域的热点问题，也是污染河流生态修复必须回答的关键科学
我国学者发揭示南方草坡草地细菌群落主导因素
理解土壤细菌群落多样性分布格局和区域构建过程是生态学研究中的一个重要课题。以往的研究表明土壤pH值是决定区域水平上细菌分布的重要因子，然而由于我国南方草坡草地斑块化分布，和土壤植被环境的高度异质性，我们对该区域细菌群落分布格局和潜在的影响因子还没有充分的了解。植被和土壤非生物因子对南方草地细菌群
昆明动物所等发布超大规模进化树构建软件
近日，中国科学院昆明动物研究所马占山团队与天津大学教授邹权、厦门大学科研人员联合发布了为千兆(GB)级基因序列数据构建进化树的软件HPTree。该软件使用谷歌Hadoop并行技术和美国加利福尼亚大学伯克利分校Spark集群大数据技术作为并行处理平台，利用计算机集群对基因序列大数据进行分割处理和整
Nature－Genetics－|－中国农大等单位合作通过泛基因组分析揭示苹果属（Malus）的进化与多样性
近日，Nature Genetics在线发表中国农业大学等团队合作的题为“Pan-genome analysis reveals the evolution and diversity of Malus”的研究论文，该论文首次对30个苹果属物种（涵盖二倍体与多倍体）进行高质量基因组测序与组装，构
苔藓物种多样性的研究常见方法
苔藓物种多样性的研究方法常见的有以下几种：野外调查：样方法：在研究区域内设置一定大小和数量的样方，如边长为 0.5 米或 1 米的正方形样方，对样方内的苔藓植物进行采集、记录和统计，包括物种种类、数量、盖度等信息。例如在森林中，随机选取多个样方来调查苔藓植物多样性 410。样线法：沿着特定的路线（样
海鸥与丹顶鹤居然是近亲？浙大研究将改写教科书
海鸥与丹顶鹤、老鹰与猫头鹰，这几组看似“风马牛不相及”的鸟类，不久前刚认上亲。浙江大学生命演化研究中心张国捷教授联合国内外学者，正在组织收集世界上现生一万多种鸟类的基因组及形态信息，旨在构建起鸟类物种的“生命之树”。正是因为这项万种鸟类基因组计划（B10K），科研人员进一步为全球鸟类的分类提供框架，
海鸥与丹顶鹤居然是近亲？浙大研究将改写教科书
海鸥与丹顶鹤、老鹰与猫头鹰，这几组看似“风马牛不相及”的鸟类，不久前刚认上亲。浙江大学生命演化研究中心张国捷教授联合国内外学者，正在组织收集世界上现生一万多种鸟类的基因组及形态信息，旨在构建起鸟类物种的“生命之树”。正是因为这项万种鸟类基因组计划（B10K），科研人员进一步为全球鸟类的分类提供框架，
研究揭示森林演替驱动生物固氮及其关键机制
传统观点和理论研究认为生物固氮速率在森林演替初期或中期达到峰值，而演替后期生物固氮逐渐减弱甚至停止。这样的观点主要基于两个基本假设。其一，演替初期或中期土壤养分（尤其是氮）贫瘠，固氮植物和固氮微生物在生态系统中占有优势地位；但演替过程土壤氮逐渐累积增加，因此演替后期生物固氮已不具有竞争优势，固氮
研究揭示森林土壤碳积累的新机制
中国科学院成都山地灾害与环境研究所副研究员常瑞英及合作者依托贡嘎山亚高山针叶林长期氮沉降实验平台，较为系统地阐述了三种机制在森林土壤碳积累中的作用，并基于观测结果提出新的机制认识。大气活性氮沉降增加是当前及未来我国所面临的主要环境问题之一。当前研究认为氮沉降增加可促进森林土壤碳积累，其解释机制可
破解柄锈菌抑制薇甘菊生长的秘密
近日，中国农科院（深圳）农业基因组研究所研究员钱万强团队在《植物生理学》（Plant Physiology）杂志在线发表了研究论文，深入揭示了专一性病原菌——柄锈菌通过控制薇甘菊体内茉莉酸水平来抑制其生长的分子机制，相关成果可为开发薇甘菊靶向性防控技术提供新的思路。 薇甘菊是一种入侵杂草，原产
破解柄锈菌抑制薇甘菊生长的秘密
近日，中国农科院（深圳）农业基因组研究所研究员钱万强团队在《植物生理学》（Plant Physiology）杂志在线发表了研究论文，深入揭示了专一性病原菌——柄锈菌通过控制薇甘菊体内茉莉酸水平来抑制其生长的分子机制，相关成果可为开发薇甘菊靶向性防控技术提供新的思路。 ?薇甘菊是一种入侵杂草，原产
基因组学分析揭示
英国《自然》杂志18日在线公开的一篇基因组学论文显示，来自西伯利亚阿尔泰山脉东部尼安德特人的祖先，和现代人祖先的相遇与交融繁殖可能比原先认为的更早。已有证据显示，尼安德特人在47000年到65000年前在非洲之外就向现代人贡献了遗传物质。这项新研究还显示，大约在10万年前，现代人和尼安德特人之间
研究推断出棕榈科植物系统发育关系
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/9/487011.shtm 近日，海南大学热带作物学院教授王华锋团队为了更好地了解棕榈目中棕榈科植物，分析比较了棕榈科的叶绿体基因组结构特征，推断出系统发育关系，估计出棕榈科的分歧时间，并对祖先性状特征进行
院地携手开启无人机森林生物量估计研究
日前，记者从中国林科院院省合作办了解到，2009年，中国林科院与信阳师范学院共建了“大别山种群生态模拟与控制重点实验室”，中科院院士、中国林科院首席科学家唐守正任实验室学术委员会主任。自2009年至今，双方签订了2期联合共建实验室协议。截至目前，实验室获批国家自然科学基金项目16项、河南省科技创
从豌豆组织分离叶绿体实验_叶绿体分离
实验材料叶子组织试剂、试剂盒PBF-Percoll 溶液山梨醇BSAHEPES-KOHEDTA仪器、耗材聚碳酸酯离心管实验步骤1. 制备 Percoll 梯度(1) 两个 50 ml 的聚碳酸酯离心管中分别加入 25 ml 50% 的 PBF-Percoll 溶液。50% PBF-Percoll0.
森林管理：开出应对气候变化“分解良方”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519625.shtm“分解者生物群落的复杂性是森林生物多样性的一个核心组成部分，但一直以来被学术界忽视。”国际竹藤中心研究员栾军伟11年前在加拿大留学期间就开始对生物多样性与生态系统功能之间的关系萌生研究
科学家解析猴面包树属植物的演化历史
5月15日，中国科学院武汉植物园、中国科学院中-非联合研究中心牵头，联合英国伦敦玛丽女王大学、英国皇家植物园邱园、华大基因、马达加斯加塔那那利佛大学、肯尼亚国家博物馆、上海辰山植物园等，在《自然》（Nature）上发表了题为The rise of baobab trees in Madagasc
榕树气生根发育、性别决定和榕蜂协同多样化的分子机制
榕属植物是热带雨林的关键类群，具有极高的物种多样性、生活型多样性。榕属植物和与传粉榕小蜂有的高度专性共生关系，在探讨物种形成、动植物协同进化等方面均具有重要的研究价值，然而榕树和榕小蜂高质量参考基因组信息的缺乏，严重制约了以上榕树相关问题的深入研究。 10月8日，中国科学院西双版纳热带植物园陈
中国学者首次绘制哺乳动物高分辨率微生物图谱
复旦大学公共卫生学院教授粟硕团队首次系统解析了大量此前未知的哺乳动物微生物组多样性，并绘制了临床重要功能元件ARGs的跨宿主共享网络，就像给微生物世界绘制了一张前所未有的“地图”，拓展了人类对于微生物组成和多样性的认知边界和深度，并为微生物源疾病和抗生素耐药性防控提供重要理论基础。相关研究8月26日
科学家成功解析叶绿体基因转录蛋白质机器构造
叶绿体中的光合作用将光能转化为化学能，吸收二氧化碳，释放氧气，是地球生物圈的重要塑造者。叶绿体约在15亿年前通过蓝藻内共生进化而来。在进化过程中，叶绿体基因要么被废弃，要么逐渐转移到细胞核染色体中，导致多数陆地植物叶绿体基因组只保留了110-130个基因。其中，大部分基因编码基因转录、蛋白翻译和光合
中国主栽食用玫瑰起源复杂？科学家提出新假说
17日从中国科学院昆明植物研究所获悉，该所植物分子遗传与适应研究组收集了16个国内主栽食用玫瑰品系，构建了迄今为止涵盖蔷薇属所有主要分类群且最稳定的质体基因组系统树，并提出中国主栽食用玫瑰的“复杂网状起源”假说。 玫瑰兼具园林观赏和药食两用等功能，为“四大切花”之首。中国具有悠久的玫瑰利用
中国主栽食用玫瑰起源复杂？科学家提出新假说
17日从中国科学院昆明植物研究所获悉，该所植物分子遗传与适应研究组收集了16个国内主栽食用玫瑰品系，构建了迄今为止涵盖蔷薇属所有主要分类群且最稳定的质体基因组系统树，并提出中国主栽食用玫瑰的“复杂网状起源”假说。 玫瑰兼具园林观赏和药食两用等功能，为“四大切花”之首。中国具有悠久的玫瑰利用历史，
昆明植物所竹亚科青篱竹族的系统发育和进化研究获进展
竹亚科青篱竹族 (Arundinarieae) 约有32属600种，既包括了全球经济价值最高的竹种如毛竹，也包括了箭竹、方竹、冷箭竹等国宝大熊猫赖以生存的主食竹种，分布于亚洲、非洲和北美温带和亚热带地区，东亚是该族的现代分布中心。青篱竹族具有多样化的形态特征，比如，地下茎包括单轴型、合轴型和复轴
构建水稻基因组倒位变异图谱
近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合国内多家单位发布了迄今为止最大的水稻群体水平倒位变异图谱，并挖掘获得了新的水稻耐热优异等位基因，该研究对水稻育种改良具有重要意义。相关研究成果发表在《科学通报（Science Bulletin）》上。 水稻中的基因组倒位变异是指染色体上的DNA序列发
科学家构建鹰嘴豆属超级泛基因组
鹰嘴豆是世界第三大豆类作物，具有重要的经济价值和营养价值，其固氮能力能改善土壤肥力，具有独特的生态价值。但鹰嘴豆的遗传背景相对狭窄、抵抗生物或非生物胁迫的能力不足，限制了它的育种改良。 5月29日，华大生命科学研究院联合国际半干旱热带作物研究中心、西澳大学、莫道克大学等单位的研究成果发表于《自
科学家构建鹰嘴豆属超级泛基因组
鹰嘴豆是世界第三大豆类作物，具有重要的经济价值和营养价值，其固氮能力能改善土壤肥力，具有独特的生态价值。但鹰嘴豆的遗传背景相对狭窄、抵抗生物或非生物胁迫的能力不足，限制了它的育种改良。5月29日，华大生命科学研究院联合国际半干旱热带作物研究中心、西澳大学、莫道克大学等单位的研究成果发表于《自然—遗传
基因组文库和cDNA文库的构建及筛选
刘芝华 中国医学科学院肿瘤研究所 分子肿瘤学国家重点实验室 概念： 基因组文库是含有某种生物体全部基因的随机片段的重组DNA克隆群体；cDNA文库是指含有所有重组cDNA的克隆群体。 基因组文库：来源于基因组DNA，反映基因组的全部信息，用于基因组物理图谱的构建，基因组序列分析，基因在染色体上