基于SOM算法的蛋白质亚细胞位置预测
摘要: 由于蛋白质的功能与亚细胞位置有关, 可以通过预测蛋白质的亚细胞位置来推断蛋白质分子的功能. 首先介绍了SOM 模型和Batch2Type SOM 模型, 并用这两个模型分别预测了蛋白质的亚细胞位置, 结果表明, 使用SOM 模型和Batch2Type SOM 模型均可以比较准确地预测蛋白质的亚细胞位置; Batch2Type SOM 模型在保持预测准确率的同时还可以减少预测的时间.点击这里进入下载页面:进入下载页面......阅读全文
单细胞测序基准数据集的标注方法有哪些?
单细胞测序基准数据集的标注方法主要包括以下几种: 1. 基于已知标志物的标注 - 利用已被广泛认可的特定细胞类型的标志物基因进行标注。例如,某些基因在特定细胞类型中特异性高表达,通过检测这些基因的表达水平来确定细胞类型。 2. 免疫组化或荧光染色验证 - 对组织样本进行免疫组
什么叫数据映射技术?
数据映射(Data Mapping) :给定两个数据模型,在模型之间建立起数据元素的对应关系,将这一过程称为数据映射。数据映射是很多数据集成任务的第一步,例如:数据迁移(data migration)、数据清洗(data cleaning)、数据集成、语义网构造、p2p信息系统。数据映射的方式有两种
IgG亚类缺陷的临床特征
中文名称IgG亚类缺陷英文名称IgG subclass deficiency定 义体液免疫缺陷病。患者体内缺少IgG2、IgG3或IgG4中的一种或数种,血清IgG含量正常。IgG2缺乏者易继发化脓性感染。应用学科免疫学(一级学科),免疫病理、临床免疫(二级学科),免疫缺陷病(三级学科)
力学信号调控细胞间的远程作用及自组织行为
细胞协同迁移在多种生理和病理过程中都至关重要,例如生命体的形态发生、伤口愈合、癌症侵袭和免疫反应。在协同迁移过程中,细胞是如何进行通讯的也是一直以来备受关注的问题。近几十年来,研究发现细胞外基质 (Extracellular matrix, ECM) 不仅为细胞迁移提供了支架,也为细胞间机械信号
利用几何学诱导人胚胎干细胞自组织
在受精后七天左右,细胞团中会发生引入注目的变化,它们最终将发育成一个人。这些细胞开始特化,它们具有一些特性,开始暗示自己最终会成为皮肤、大脑、肌肉的一部分,或人体中存在的大约200种细胞类型中的任何一个,并且它们开始形成明显的胚层。 虽然科学家们已经在动物中研究了这个过程,并试图通过用化学信号
基因表达谱数据聚类分析相关内容
DNA微阵列基因表达数据分析 对于基因表达谱数据的分析是生物信息学 的研究热点和难点。转化为数学问题,分析任务是从数据矩阵 M 中找出显著性结构,结构类型包括全局模型 (model) 和局部模式 (pattern) 。对基因表达谱数据的分析是数据挖掘问题,所采用的方法包括通过可视化进行探索性数据分析
用分离的亚细胞组分分析蛋白质的磷酸化
实验材料样品试剂、试剂盒胞内缓冲液透化缓冲液仪器、耗材离心管实验步骤1. 分离细胞器。2. 于 4℃ 用胞内缓冲液清洗细胞器样品 3 次,将相当于 1 mg 蛋白质的样品转至带螺帽的小离心管,放入冰盒。3. 离心,吸去上清,加 200 μl 预热至 37℃ 的透化缓冲液,轻轻混匀,放入 37℃ 水浴
亚精胺延缓蛋白质衰老的作用
亚精胺对不同分子量蛋白质的作用大小不同,某些大分子量谱带随亚精胺处理时间的延长而明显增强,表明可能有蛋白质的合成,只是这部分蛋白质占蛋白质总量的百分比很小,对中等分子量和小分子量蛋白质的作用不明显,主要蛋白质在72小时处理过程中则基本上保持不变,从这些结果可以推测:不同分子量的蛋白质在衰老过程中
亚精胺的延缓蛋白质衰老效果
亚精胺对不同分子量蛋白质的作用大小不同,某些大分子量谱带随亚精胺处理时间的延长而明显增强,表明可能有蛋白质的合成,只是这部分蛋白质占蛋白质总量的百分比很小,对中等分子量和小分子量蛋白质的作用不明显,主要蛋白质在72小时处理过程中则基本上保持不变,从这些结果可以推测:不同分子量的蛋白质在衰老过程中的作
“自组织”让“电老虎”少吃多干
云计算、大数据、人工智能等技术的快速发展和广泛应用,让这些领域成了“电老虎”。新思界产业研究中心的《2021年全球及中国数据中心加速器产业深度研究报告》预测,到2025年,仅全球数据中心消耗的电能将占全球总发电量的五分之一。 近日,中科院脑智卓越中心研究员徐波、蒲慕明联合研究团队在线发表于《科学
细胞亚株的概念
中文名称细胞亚株英文名称cell substrain定 义由原细胞株再次克隆形成的与原株性状有部分不同的细胞群。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞培养与细胞工程(二级学科)
亚细胞成分及组成
细胞是生物体的构造和生理的基本单位,却不能因此认为所有的生物细胞都相同,即使在同一个个体内,也有因为分化而产生各式各样外观与功能不同的细胞,即使相同种类的细胞,也可能正在执行的生理工作也有差异,但是基本上彼此都有共同的基本构造。细胞膜细胞膜为细胞与环境之间以及细胞器与细胞质之间的分界,能够调节物质的
怎么亚细胞定位分析
用报告基因技术呀 比如说最常用的绿色荧光蛋白GFP或者改造过的EGFP等。和目的基因构建成为融合蛋白,转入细胞中以后,用激光扫描共聚焦显微镜就可以观察到基因的亚细胞定位
LSCM细胞亚微结构
细胞亚微结构(细胞器探针)一般的光学显微镜由于分辨率有限,在观察细胞器结构时受到一定的限制,而共聚焦激光扫描显微镜可获得较一般普通光学显微镜分辨率高的细胞内线粒体、高尔基复合体、内质网、溶酶体等细胞器图像,同时还可动态观察活细胞状态下细胞器的形态学变化情况,此外还可通过光学切片即断层扫描技术进行三维
亚细胞的成分介绍
细胞是生物体的构造和生理的基本单位,却不能因此认为所有的生物细胞都相同,即使在同一个个体内,也有因为分化而产生各式各样外观与功能不同的细胞,即使相同种类的细胞,也可能正在执行的生理工作也有差异,但是基本上彼此都有共同的基本构造。细胞膜细胞膜为细胞与环境之间以及细胞器与细胞质之间的分界,能够调节物质的
带你认识强大的基因表达专家——GeneSpring
GeneSpring是一款广受好评的基因组学工作人员必知软件 ,使用者可在短时间内分析运算出目的基因的序列,称得上系统生物学分析软件中的佼佼者,受到相关科研工作者的欢迎和肯定。本文对GeneSpring GX的优势做详细分析。GeneSpring生物数据分析软件GeneSpring GX是一套特别针
蛋白质红外特征峰的范围
蛋白质红外特征峰的范围:1250~4000 CM∧-1。蛋白质红外特征峰红外射线(IR)或者单独成为红外线是指那些能量在电磁波频谱范围内,频率比可见光略低的,但是又比无线电波频率高的射线。相应地,红外线的频率高于微波,但是低于可见光。红外光的波长在几个微米(符号μ,1μ=10-6m)或者纳米范围内(
传感器网络启动式自组织方法
无线传感器网络在环境监测、医疗卫生,目标跟踪等方面有广泛运用,它能实时的感知,采集并传送监测数据,可以认为是物联网,云计算等计算网络的一部分。应用型无线传感器网络的自组织方法一般从某项网络特征入手,突出网络的某一项或某几项功能,最终建立网络的基本工作方式,网络自组织可从地址分配,路由协议,拓扑控制等
科研人员精准设计多样化菌落斑图
生物斑图是生命体通过自组织形成的时空有序结构。生物斑图展现出生命系统的复杂性,并在生物发育、生态适应和疾病进展等领域发挥关键作用。尽管生物斑图在自然界广泛存在,其形成机制仍是未解之谜。 中国科学院深圳先进技术研究院傅雄飞团队通过构建合成基因回路“基因开关”,阐明了简单双稳态调控系统与微环境时空
研究揭示蛋白质亚硝基化修饰调控造血干细胞再生新机制
暨南大学衰老与再生医学研究院研究员鞠振宇研究组与中国科学院生物物理研究所研究员陈畅研究组合作研究,揭示了蛋白质亚硝基化修饰对自我更新时期的造血干细胞蛋白稳态及存活新的调控机制。3月30日,相关研究成果在线发表在《细胞报告》上。 造血干细胞(Hematopoietic stem cell,HSC
细胞的属性特征
大小 原核细胞直径平均: 1~10μm; 真核细胞直径平均: 3~30μm; 某些不同来源的细胞大小变化很大: 人卵细胞:直径0.1mm;鸵鸟卵细胞:直径5cm; 同类型细胞的体积一般是相近的,不依生物个体的大小而增大或缩小; 器官的大小主要决定于细胞的数量,与细胞的数量成正比,而与
细胞凋亡的特征
细胞凋亡的特征是细胞由于降解酶,主要是水解酶(蛋白酶与核酸酶)的作用,在近乎正常的细胞质膜内趋向死亡。这与坏死时细胞质膜早期破损不同。在细胞凋亡过程中,质膜脂双层丧失二侧不对称性,磷脂酰丝氨酸暴露于细胞表面,从而导致被吞噬。
细胞凋亡的特征
细胞凋亡的特征是细胞由于降解酶,主要是水解酶(蛋白酶与核酸酶)的作用,在近乎正常的细胞质膜内趋向死亡。这与坏死时细胞质膜早期破损不同。在细胞凋亡过程中,质膜脂双层丧失二侧不对称性,磷脂酰丝氨酸暴露于细胞表面,从而导致被吞噬。
细胞老化的特征
1.普遍性:所有的细胞、组织、脏器和机体都会在不同水平上出现老化改变。 2.不可逆性:随着时间的推移,老化不断进行性的发展。 3.内因性:不是由于外伤、事故等的外因作用,而是细胞内在决定性的衰退。 4.有害性:细胞老化时,细胞代谢、适应、代偿等多种功能低下且缺乏恢复能力,机体患病率和死亡率
细胞的属性特征
大小 原核细胞直径平均: 1~10μm; 真核细胞直径平均: 3~30μm; 某些不同来源的细胞大小变化很大: 人卵细胞:直径0.1mm;鸵鸟卵细胞:直径5cm; 同类型细胞的体积一般是相近的,不依生物个体的大小而增大或缩小; 器官的大小主要决定于细胞的数量,与细胞的数量成正比,而与
植物细胞的特征
植物细胞的细胞壁构造在细胞膜外,由纤维素,半纤维素和果胶组成。其组成与对比的细胞壁的真菌,其是由几丁质的,细菌,这是由肽聚糖和古细菌,其是由pseudopeptidoglycan。在许多情况下,原生质体将木质素或木栓质分泌为初级细胞壁内的次级壁层。角蛋白它被分泌到叶片,茎和其他地上器官的表皮细胞的原
细胞衰老的特征
研究表明,衰老细胞的细胞核、细胞质和细胞膜等均有明显的变化: ①细胞内水分减少,体积变小,新陈代谢速度减慢; ②细胞内大多数酶的活性降低; ③细胞内的色素会积累; ④细胞内呼吸速度减慢,细胞核体积增大,核膜内折,染色质收缩,颜色加深。线粒体数量减少,体积增大; ⑤细胞膜通透性功能改变,
细胞衰老的特征
细胞衰老:是指细胞在执行生命活动过程中,随着时间的推移,细胞增殖与分化能力和生理功能逐渐发生衰退的变化过程。细胞的生命历程都要经过未分化、分化、生长、成熟、衰老和死亡几个阶段。衰老死亡的细胞被机体的免疫系统清除,同时新生的细胞也不断从相应的组织器官生成,以弥补衰老死亡的细胞。细胞衰老死亡与新生细胞生
肝亚细胞部分的制备
肝是代谢药物的主要场所,而在代谢药物中起关键作用的酶是位于线粒体的细胞色素P-450系统.常称药酶或混合功能氧化酶,或单加氧酶。一般说来,许多药物经肝药酶代谢后生成低毒或无毒分子随尿和胆汁排出,但亦有一些药物及其他化合物经肝药酶代谢激活成毒性更大的中间产物,引起毒性。因此,肝药酶代谢药物的分子机制及
细胞化学词汇亚致死基因
中文名称:亚致死基因英文名称:sublethal gene定 义:其存在可以妨碍或减弱生物体正常功能发挥的一种基因。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)