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水生所发布高质量AB品系斑马鱼参考基因组

斑马鱼是生命科学、健康科学和环境科学等研究领域的重要模式生物之一。常见的两种实验室斑马鱼品系分别是Tubingen品系和AB品系。其中,AB品系斑马鱼被国内外很多实验室作为研究对象。然而,却缺乏一个高质量的AB品系斑马鱼参考基因组。 由于不同品系斑马鱼来源不同,各品系之间存在着大量基因序列上的差异,其中包括一些可能对表型产生重大影响的结构变异。因此,相比于通用的Tubingen品系斑马鱼参考基因组(GRCz11),品系特异性参考基因组的获得能够更加高效地揭示不同品系斑马鱼之间的遗传差异,为科研人员更精准地选择合适的斑马鱼品系以及更合理地应用来自不同品系斑马鱼的研究结果提供参考,更全面地为未来基础科学成功转化为治疗人类疾病服务。 中国科学院水生生物研究所何舜平课题组通过运用二代、三代测序技术(Nanopore),并结合Hi-C互作图谱技术辅助基因组组装,获得了一个高质量的AB品系斑马鱼参考基因组——DrAB1。 据了解,......阅读全文

斑马鱼

一、概述斑马鱼是生长在印度、巴基斯坦淡水河流中的一种硬骨鱼(鲤鱼),成年鱼全身仅长4-5厘米,因全身横向分布着一道一道褐色的斑马线而得名。斑马鱼很容易在实验室饲养,一般3个月就可以达到生殖成熟期,雌鱼每次产卵200枚左右,一生可产卵数千枚,斑马鱼所产之卵经24小时即可胚胎发育成熟,仔鱼期只有1个月。

斑马鱼出生就识数!

  意大利科学家发现,斑马鱼幼鱼在孵化后96小时里可以识别不同数量的黑条,研究者表示这一发现表明数字能力可能在新生斑马鱼中是与生俱来的。相关研究3月24日发表于《通讯—生物学》。  过去的研究表明,人类新生儿和新孵化的孔雀鱼、小鸡(孵化时脑已经高度发育的物种)具有数学能力。但在此之前,人们对新生时处

斑马鱼显微CT实验

斑马鱼作为传统的脊椎动物模型已经广泛应用于人类疾病和胚胎发育过程的研究,斑马鱼全基因已经完全清楚,与人类基因组有85%同源性,这意味着在斑马鱼身上进行的实验,其结果很多都适用于人类。斑马鱼与其他实验常用动物相比,具有较高的繁殖率和生长速率,并且其胚胎发育过程是在体外进行的,科研人员通过显微镜直接观察

斑马鱼基础研究

近期,我们收到了很多小伙伴提交的文献奖励申请,其中,有2篇成功吸引了小编的注意,这2篇文章的内容都是斑马鱼研究相关的。我们都知道,斑马鱼是一种常见的模式生物,但是市面上针对斑马鱼的抗体却非常少,我们不仅有一百多种斑马鱼抗体,而且还可以根据客户需求来进行定制生产。下面来看看这2篇文章吧。01标题:Sa

斑马鱼胚胎细胞的培养

成纤维细胞饲养层 原代培养 细胞系             实验方法原理 通过用链酶蛋白酶除去绒毛膜、用添加成分的 FGF 培养液培养细胞和采用不同的胰蛋白酶消化

斑马鱼胚胎DNA的制备

材料和试剂1.        蛋白酶K(罗氏03115836001)2.        1M的Tris,pH值8.33.        氯化钾4.        吐温20(10%,EMD4 biosciences,655207)5.        NP40(10%,Merck,492018)设备1.

斑马鱼基因编辑技术介绍

斑马鱼又叫蓝条鱼,因为其体表有暗蓝色和银色的类似于斑马一样的条纹而命名。斑马鱼属于鲤科鱼类,同属鲤科的还有我们十分熟悉的鲤鱼、鲫鱼等。斑马鱼的体型较小,成鱼体长约4-6厘米,而且成鱼常年产卵且产卵量大,可达300-1000粒,还是体外受精并发育,因此十分适合进行实验室的大规模养殖与筛选。斑马鱼这种原

转基因斑马鱼的构建

实验概要本实验对斑马鱼导入含 EGFP的质粒,观察其在动物体内的表达情况,在斑马鱼体内,绿色荧光蛋白从原肠胚到出苗期均能在荧光显微镜下观察到绿色荧光。主要试剂EGFP、绿色荧光蛋白基因、pEGFP-N2载体、E.coli主要设备试管、试管架、可调式微量加样器、电泳仪、电泳槽、染色缸、42℃恒温水浴箱

斑马鱼色素细胞如何形成条带

  一项研究发现,斑马鱼的特征条带反映了这种动物的皮肤上的色素细胞的运动和它们之间的相互作用。尽管科研人员长久以来就注意到了数学模型可以准确地重现动物界的许多特征条带和斑点,动物图案背后的生物过程在很大程度上尚未得到解释。为了更好地理解这些过程,Hiroaki Yamanaka 和Shigeru

斑马鱼人类疾病模型的构建

  斑马鱼是唯一的经过大规模遗传筛选的脊椎动物物种。许多斑马鱼的哺乳动物同源基因已经被克隆,并且发现有相似的功能,证实了斑马鱼作为人类疾病模型的可行性。通过Tol2转座子技术、基因突变(插入诱变、ENU化学诱变)、基因敲除(TALEN,CRISPER)等技术,构建在特点靶点标记荧光蛋白的转基因品系及