细胞化学基础α螺旋
α-螺旋(α-helix)是蛋白质二级结构的主要形式之一。指多肽链主链围绕中心轴呈有规律的螺旋式上升,每3.6 个氨基酸残基螺旋上升一圈,向上平移0.54nm,故螺距为0.54nm,两个氨基酸残基之间的距离为0.15nm。螺旋的方向为右手螺旋。氨基酸侧链R基团伸向螺旋外侧,每个肽键的肽键的羰基氧和第四个N-H形成氢键,氢键的方向与螺旋长轴基本平行。由于肽链中的全部肽键都可形成氢键,故α-螺旋十分稳定。......阅读全文
细胞化学基础黄嘌呤
黄嘌呤,是一种有机化合物,分子式为C5H4N4O2,分子量为152.111,白色至灰白色结晶粉末。黄嘌呤是一组通常用作温和的兴奋剂和支气管扩张剂,特别用于治疗哮喘症状。黄嘌呤的衍生物包括咖啡因,茶碱,可可碱(主要在巧克力中发现) ,和马黛因。 主要的化合物,黄嘌呤,是嘌呤降解途径的产物,并会在黄嘌呤
细胞化学基础卫星DNA
卫星DNA(satelliteDNA)是一类高度重复序列DNA。在介质氯化铯中作密度梯度离心(离心速度可以高达每分钟几万转)时,DNA分子将按其大小分布在离心管内不同密度的氯化铯介质中,小的分子处于上层,大的分子处于下层。从离心管外看,不同层面的DNA形成了不同的条带。根据荧光强度的分析,可以看到在
细胞化学基础稀有碱基
又称修饰碱基,这些碱基在核酸分子中含量比较少,但他们是天然存在不是人工合成的,是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。
细胞化学基础转移RNA
转移RNA(tRNA)在蛋白质合成过程中负责转运氨基酸、解读mRNA遗传密码。tRNA占细胞总RNA的10%~15%,绝大多数位于细胞质中。tRNA由Crick于1955年提出其存在,Zamecnik和 Hoagland于1957年鉴定。1.tRNA一级结构具有以下特点:①是一类单链小分子RNA,长
细胞化学基础锌指结构
定义指的是在很多蛋白中存在的一类具有指状结构的结构域,这些具有锌指结构的蛋白大多都是与基因表达的调控有关的功能蛋白。共同特征锌指结构的共同特征是通过肽链中氨基酸残基的特征基团与Zn2+的结合来稳定一种很短的,可自我折叠成“手指”形状的的多肽空间构型。发现锌指蛋白最初在非洲爪蟾的卵母细胞中发现,已知广
细胞化学基础修饰碱基
又称稀有碱基,这些碱基在核酸分子中含量比较少,但他们是天然存在不是人工合成的,是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。如:5-甲基胞苷、5,6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷:假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同,即尿嘧啶5位碳与核苷形成
细胞化学基础β片层
中文名称:β片层英文名称:β sheet定 义:免疫球蛋白分子中常见的二级结构,可分为平行式和反平行式两种类型,两条或多条几乎完全伸展的多肽链侧聚集在一起,相邻肽链间形成有规则的氢键。应用学科:免疫学(一级学科),免疫系统(二级学科),免疫分子(三级学科)
细胞化学基础信使RNA
信使RNA(mRNA)最早发现于1960年,在蛋白质合成过程中负责传递遗传信息、直接指导蛋白质合成,具有以下特点。 1.含量低,占细胞总RNA的1%~5%。 2.种类多,可达105种。不同基因表达不同的mRNA。 3.寿命短,不同mRNA指导合成不同的蛋白质,完成使命后即被降解。细菌mRNA的平均半
细胞化学基础千碱基
中文名称:千碱基英文名称:kilobase;kb定 义:描述多核苷酸链的长度单位,相当于单链核酸中1000个碱基。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
细胞化学基础叶绿体DNA
chloroplast DNA(cpDNA),存在于叶绿体内的DNA。高等植物叶绿体的DNA为双链共价闭合环状分子,其长度随生物种类而不同,其大小在120kb到217kb之间,相当于噬菌体基因组的大小,例如,T4噬菌体的基因组约165kb。叶绿体DNA不含5-甲基胞嘧啶,这是鉴定cpDNA及其纯度的
细胞化学基础鸟嘌呤
鸟嘌呤是一种有机化合物,化学式为C5H5N5O,为白色至淡黄色晶体粉末,对紫外线有强烈的吸收性,为鸟苷和鸟苷酸的组成成分。鸟嘌呤广泛存在于动、植物界。是核酸(DNA和RNA)的基本组分之一。鸟嘌呤是一种嘌呤衍生物,由具有共轭双键的稠合嘧啶-咪唑环系统组成。为组成核酸的重要碱基,是DNA和RNA中4种
细胞化学基础腺嘌呤
维生素B4(腺嘌呤),又称6-氨基嘌呤,是组成DNA和RNA分子的四种核碱基的一种,化学式为C5H5N5。其在体内主要以腺嘌呤核苷酸的形式存在。在体内代谢途径(metabolic pathways)中参与形成多种重要的中间物质,如ATP、NADP等。 维生素B4为核酸和辅酶的组成成分,参与体内DNA
细胞化学基础锌指蛋白
定义通常由一系列锌指组成。 具有重复结构的氨基酸模式,相隔特定距离的胱氨酸结合锌指,能与某些RNA/DNA 结合。作用锌指蛋白是一类具有手指状结构域的转录因子,对基因调控起重要的作用。根据其保守结构域的不同,可将锌指蛋白主要分为C2H2型、C4型和C6型。锌指通过与靶分子DNA、RNA、DNA-RN
细胞化学词汇负超螺旋化
中文名称:负超螺旋化英文名称:negative supercoiling定 义:生成负超螺旋的过程。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
细胞化学词汇DNA解超螺旋
中文名称:DNA解超螺旋英文名称:DNA untwisting定 义:生物体内通常处于负超螺旋状态的DNA分子在复制或转录过程中负超螺旋解除的过程。是在解超螺旋酶,即拓扑异构酶Ⅰ催化下进行的。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
细胞化学词汇负超螺旋DNA
中文名称:负超螺旋DNA英文名称:negatively supercoiled DNA定 义:具有负超螺旋结构的环状或双链DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
细胞化学词汇正超螺旋化
中文名称:正超螺旋化英文名称:positive supercoiling定 义:产生正超螺旋的过程。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
细胞化学词汇正超螺旋DNA
中文名称:正超螺旋DNA英文名称:positively supercoiled DNA定 义:具有正超螺旋结构的环状DNA分子。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
细胞化学词汇三股螺旋
中文名称:三股螺旋定 义:各型胶原都是由三条相同或不同的肽链形成三股螺旋,含有三种结构
细胞化学基础黄嘌呤计算化学数据
1、 疏水参数计算参考值(XlogP):-0.72、 氢键供体数量:33、 氢键受体数量:34、 可旋转化学键数量:05、 互变异构体数量:156、 拓扑分子极性表面积(TPSA):86.97、 重原子数量:118、 表面电荷:09、 复杂度:21710、 同位素原子数量:011、 确定原子立构中心
细胞化学基础鸟嘌呤计算化学数据
1、疏水参数计算参考值(XlogP):无2、氢键供体数量:33、氢键受体数量:24、可旋转化学键数量:05、互变异构体数量:266、拓扑分子极性表面积:96.27、重原子数量:118、表面电荷:09、复杂度:22510、同位素原子数量:011、确定原子立构中心数量:012、不确定原子立构中心数量:0
细胞化学基础分子诱导力
诱导力(induction force)在极性分子和非极性分子之间以及极性分子和极性分子之间都存在诱导力。由于极性分子偶极所产生的电场对非极性分子发生影响,使非极性分子电子云变形(即电子云被吸向极性分子偶极的正电的一极),结果使非极性分子的电子云与原子核发生相对位移,本来非极性分子中的正、负电荷重心
细胞化学基础β折叠链结构
肽平面之间呈手风琴状折叠,股与股之间会通过氢键固定,但氢键主要在股间而不是股内。氨基酸残基的R侧链分布在片层的上下。β折叠层并不是平的,因为侧链的存在使得它看上去像手风琴一样波纹起伏。(英语pleated)这样每一股会更紧密排列,氢键更容易建立。氢键的距离为7埃。在蛋白质结构中β折叠通常会用箭头表示
细胞化学基础亲水性原理
容易与水成氢键而结合的性质称亲水性。许多亲水性基团,如羟基、羧基、氨基、磺酸基等都易与氢键结合,因而是亲水性的。亲水性在材料表面为水分所润湿的性质。是一种界面现象,润湿过程的实质是物质界面发生性质和能量的变化。当水分子之间的内聚力小于水分子与固体材料分子间的相互吸引力时,材料被水润湿,此种材料为亲水
细胞化学基础β转角特定构象
β-转角的特定构象在一定程度上取决与他的组成氨基酸,某些氨基酸如脯氨酸和甘氨酸经常存在其中,由于甘氨酸缺少侧链(只有一个H),在β-转角中能很好的调整其他残基的空间阻碍,因此使立体化学上最合适的氨基酸;而脯氨酸具有环状结构和固定的角,因此在一定程度上迫使β-转角形成,促使多台自身回折且这些回折有助于
细胞化学基础分配系数
分配系数是指在一定温度下,达到分配平衡时某一物质在两种互不相溶的溶剂中的活度(常近似为浓度)之比,为一常数。分配系数可用于表示该物质对两种溶剂的亲和性的差异。对分配系数的测定可提供该物质在环境行为方面许多重要的信息。常用的溶剂体系是由水和一种与水不互溶的有机溶剂组成,如正辛醇-水体系,所得的分配系数
细胞化学基础腺苷一磷酸
腺苷一磷酸(Adenosine 3'-monophosphate,from Yeast,简称AMP)是一种有机化合物。化学式为C10H14N5O7P。外观为白色针状结晶或结晶性粉末 。是一种在核糖核酸(RNA)中发现的核苷酸。它是一种磷酸及核苷腺苷的酯,并由磷酸盐官能团、戊糖核酸糖及碱基腺嘌
细胞化学基础疏水键
疏水键是多肽链上的某些氨基酸的疏水基团或疏水侧链(非极性侧链),由于避开水而造成相互接近、粘附聚集在一起。它在维持蛋白质三级结构方面占有突出地位。
细胞化学基础核苷酸
核苷酸是一类由嘌呤碱或嘧啶碱、核糖或脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的化合物,又称核甙酸。戊糖与有机碱合成核苷,核苷与磷酸合成核苷酸,8种核苷酸组成核酸。核苷酸主要参与构成核酸,许多单核苷酸也具有多种重要的生物学功能,如与能量代谢有关的三磷酸腺苷(ATP)、脱氢辅酶等。
细胞化学基础碱基对
碱基对是形成DNA、RNA单体以及编码遗传信息的化学结构。组成碱基对的碱基包括A、G、T、C、U。严格地说,碱基对是一对相互匹配的碱基(即A:T,G:C,A:U相互作用)被氢键连接起来。然而,它常被用来衡量DNA和RNA的长度(尽管RNA是单链)。它还与核苷酸互换使用,尽管后者是由一个五碳糖、磷酸和