细胞化学基础α螺旋

α-螺旋(α-helix)是蛋白质二级结构的主要形式之一。指多肽链主链围绕中心轴呈有规律的螺旋式上升,每3.6 个氨基酸残基螺旋上升一圈,向上平移0.54nm,故螺距为0.54nm,两个氨基酸残基之间的距离为0.15nm。螺旋的方向为右手螺旋。氨基酸侧链R基团伸向螺旋外侧,每个肽键的肽键的羰基氧和第四个N-H形成氢键,氢键的方向与螺旋长轴基本平行。由于肽链中的全部肽键都可形成氢键,故α-螺旋十分稳定。......阅读全文

细胞化学基础α螺旋

α-螺旋(α-helix)是蛋白质二级结构的主要形式之一。指多肽链主链围绕中心轴呈有规律的螺旋式上升,每3.6 个氨基酸残基螺旋上升一圈,向上平移0.54nm,故螺距为0.54nm,两个氨基酸残基之间的距离为0.15nm。螺旋的方向为右手螺旋。氨基酸侧链R基团伸向螺旋外侧,每个肽键的肽键的羰基氧和第

细胞化学基础α螺旋的功能

α-螺旋在DNA结合基序(DNA binding motifs)中有非常重要的作用,比如在锌指结构,亮氨酸拉链,螺旋-转角-螺旋等基序中都含有α-螺旋。这是因为α-螺旋的直径为1.2nm,正好和B-DNA大沟的直径相等,所以能够和B型DNA紧密结合。

细胞化学基础α螺旋的结构

α螺旋是一种最常见的二级结构,最先由Linus Pauling和Robert Corey于1951年提出,其主要内容是:①肽链骨架围绕一个轴以螺旋的方式伸展;②螺旋形成是自发的,肽链骨架上由n位氨基酸残基上的-C=O与n+4位残基上的-NH之间形成的氢键起着稳定的作用;被氢键封闭的环含有13个原子,

细胞化学基础螺旋袢螺旋结构域

中文名称:螺旋-袢-螺旋结构域英文名称:helix-loophelix motif定  义:存在于转录因子的DNA结合结构域中的一种蛋白质结构域。由两个α螺旋和中间的一个袢组成,识别并结合特异的DNA序列。应用学科:细胞生物学(一级学科),细胞化学(二级学科)

细胞化学基础螺旋转角螺旋结构域

中文名称:螺旋-转角-螺旋结构域英文名称:helix-turnhelix motif定  义:由两个α螺旋间隔以一定角度的转角构成的结构域。其中一个α螺旋可插入DNA大沟中与专一DNA序列结合。应用学科:细胞生物学(一级学科),细胞化学(二级学科)

细胞化学基础α螺旋基本信息

α-螺旋(α-helix):蛋白质中常见的二级结构,肽链主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状,一般都是右手螺旋结构,螺旋是靠链内氢键维持的。每个氨基酸残基(第n个)的羰基与多肽链C端方向的第4个残基(第4+n个)的酰胺氮形成氢键。在古典的右手α-螺旋结构中,螺距为0.54nm,每一圈含有3.6个氨基酸残基

细胞化学基础α螺旋的稳定性

原因α-螺旋靠氢键维持稳定影响因素1. Pro(及Hpro)使α-螺旋中断,产生“结节”。Pro的α-碳原子参与吡咯环的形成,使α-碳原子—N键不能旋转,Gly绕α-碳原子的自由度更大,所以大多α-螺旋起始或中止于Gly,还有Tyr和Ser等。2.侧链较大的氨基酸相邻时影响生成两个“α-碳上分支”(

细胞化学基础β转角

β-转角是一种常见的蛋白质二级结构,它通常出现在球状蛋白表面,因此含有极性和带电荷的氨基酸残基。

细胞化学基础嘌呤

嘌呤(Purine),分子式C5H4N4,是一种杂环芳香有机化合物,是新陈代谢过程中的一种代谢物。

细胞化学基础腺苷

腺苷,是指由腺嘌呤的N-9与D-核糖的C-1通过β糖苷键连接而成的化合物,化学式为C10H13N5O4,其磷酸酯为腺苷酸。腺苷是一种遍布人体细胞的内源性核苷,可直接进入心肌经磷酸化生成腺苷酸,参与心肌能量代谢,同时还参与扩张冠脉血管,增加血流量。腺苷对心血管系统和肌体的许多其它系统及组织均有生理作用

细胞化学基础核酶

科学家在研究RNA的转录后加工时发现某些RNA有催化活性,可以催化RNA的剪接,这些由活细胞合成、起催化作用的RNA称为核酶。许多核酶的底物也是RNA,甚至就是其自身,其催化反应也具有专一性。已经阐明的天然核酶有锤头状核酶、发夹状核酶、I型内含子、Ⅱ型内含子、丁型肝炎病毒核酶、核糖核酸酶P、肽基转移

细胞化学基础碱基

碱基,在化学中本是“碱性基团”的简称。有机物中大部分的碱性基团都含有氮原子,称为含氮碱基,氨基(-NH2)是最简单的含氮碱基。碱基,在生物化学中又称核碱基、含氮碱基,是形成核苷的含氮化合物,核苷又是核苷酸的组分。碱基、核苷和核苷酸等单体构成了核酸的基本构件。核碱基间可以形成碱基对,且彼此堆叠,所以,

细胞化学基础锌指

锌指是一种常出现在DNA结合蛋白质中的一种结构基元。锌螯合在氨基酸链中形成锌的指状结构。锌是某些酶的活性辅助因子,也是某些蛋白质,包括RNA聚合酶的转录因子,如TFIIIA(transcription factor III,Asubtype)、类固醇受体等能结合脱氧核糖核酸(DNA)的蛋白质亦含有锌

细胞化学词汇DNA超螺旋

由于双螺旋DNA的弯曲,正超螺旋或负超螺旋而造成的DNA分子的进一步扭曲所形成的DNA的三级结构。有两种:当DNA分子沿轴扭转的方向与通常双螺旋的方向相反时,造成双螺旋的欠旋而形成负超螺旋;方向相同时则形成正超螺旋。生物体内一般以负超螺旋结构存在。

细胞化学词汇负超螺旋

中文名称:负超螺旋外文名称:Negative Supercoiled类       别:生物学定       义:负超螺旋,指顺时针右手螺旋的DNA双螺旋以相反方向绕它的轴扭转而成。

细胞化学词汇超螺旋DNA

中文名称:超螺旋DNA外文名称:closed circular DNA定       义:闭环DNA(closed circular DNA)没有断口的双链环状DNA,亦称为超螺旋DNA (DNA supercoil)。结       构:由于具有螺旋结构的双链各自闭合,结果使整个DNA分子进一步旋

细胞化学词汇正超螺旋

中文名称:正超螺旋外文名称:The positive supercoiling正超螺旋:由线性双螺旋分子两端连接起来或因与蛋白质结合而固定的环状DNA分子,进一步扭曲都可形成超螺旋·双螺旋DNA处于拧紧状态时所形成的超螺旋为正超螺旋(左手超螺旋)。

细胞化学基础腺苷计算化学数据

疏水参数计算参考值(XlogP):无氢键供体数量:4氢键受体数量:8可旋转化学键数量:2互变异构体数量:3拓扑分子极性表面积:140重原子数量:19表面电荷:0复杂度:335同位素原子数量:0确定原子立构中心数量:4不确定原子立构中心数量:0确定化学键立构中心数量:0不确定化学键立构中心数量:0

细胞化学基础腺苷用途

抗心律失常药,可使阵发性室上性心动过速转为窦性心律。用于和房室有关的室上心律失常。治疗心绞痛、心肌梗塞、冠脉功能不全、动脉硬化、原发性高血压、脑血管障碍、中风后遗症、进行性肌肉萎缩等。也可用于生化研究。

细胞化学基础​​疏水性

疏水性分子偏向于非极性,并因此较会溶解在中性和非极性溶液(如有机溶剂)。疏水性分子在水里通常会聚成一团,而水在疏水性溶液的表面时则会形成一个很大的接触角而成水滴状。

细胞化学基础兆碱基

兆碱基megabase (Mb)定义:DNA片段长度单位,相当于1百万个核苷,大约等于1M。

细胞化学基础黄嘌呤

黄嘌呤,是一种有机化合物,分子式为C5H4N4O2,分子量为152.111,白色至灰白色结晶粉末。黄嘌呤是一组通常用作温和的兴奋剂和支气管扩张剂,特别用于治疗哮喘症状。黄嘌呤的衍生物包括咖啡因,茶碱,可可碱(主要在巧克力中发现) ,和马黛因。 主要的化合物,黄嘌呤,是嘌呤降解途径的产物,并会在黄嘌呤

细胞化学基础千碱基

中文名称:千碱基英文名称:kilobase;kb定  义:描述多核苷酸链的长度单位,相当于单链核酸中1000个碱基。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学基础锌指蛋白

定义通常由一系列锌指组成。 具有重复结构的氨基酸模式,相隔特定距离的胱氨酸结合锌指,能与某些RNA/DNA 结合。作用锌指蛋白是一类具有手指状结构域的转录因子,对基因调控起重要的作用。根据其保守结构域的不同,可将锌指蛋白主要分为C2H2型、C4型和C6型。锌指通过与靶分子DNA、RNA、DNA-RN

细胞化学基础锌指结构

定义指的是在很多蛋白中存在的一类具有指状结构的结构域,这些具有锌指结构的蛋白大多都是与基因表达的调控有关的功能蛋白。共同特征锌指结构的共同特征是通过肽链中氨基酸残基的特征基团与Zn2+的结合来稳定一种很短的,可自我折叠成“手指”形状的的多肽空间构型。发现锌指蛋白最初在非洲爪蟾的卵母细胞中发现,已知广

细胞化学基础β折叠链

在β折叠中,两条以上氨基酸链(肽链),或同一条肽链之间的不同部分形成平行或反平行排列,成为“股”。

细胞化学基础​诱导力

诱导力(induction force)在极性分子和非极性分子之间以及极性分子和极性分子之间都存在诱导力。由于极性分子偶极所产生的电场对非极性分子发生影响,使非极性分子电子云变形(即电子云被吸向极性分子偶极的正电的一极),结果使非极性分子的电子云与原子核发生相对位移,本来非极性分子中的正、负电荷重心

细胞化学基础β片层

中文名称:β片层英文名称:β sheet定  义:免疫球蛋白分子中常见的二级结构,可分为平行式和反平行式两种类型,两条或多条几乎完全伸展的多肽链侧聚集在一起,相邻肽链间形成有规则的氢键。应用学科:免疫学(一级学科),免疫系统(二级学科),免疫分子(三级学科)

细胞化学基础线粒体DNA

线粒体DNA是线粒体中的遗传物质,线粒体能为细胞产生能量(ATP),是在细胞线粒体内发现的脱氧核糖核酸特殊形态。线粒体是为细胞提供能量(ATP)的细胞器。一个线粒体中一般有多个DNA分子。它们携带着自己的DNA——mtDNA,而这些基因的突变能引起线粒体疾病。虽然疾病症状是多变的,但大脑、肌肉和心脏

细胞化学基础修饰碱基

又称稀有碱基,这些碱基在核酸分子中含量比较少,但他们是天然存在不是人工合成的,是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。如:5-甲基胞苷、5,6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷:假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同,即尿嘧啶5位碳与核苷形成