细胞化学基础结构域的性质

又称基元。蛋白质分子的一种折叠单位,是较大的蛋白质分子或亚基三维折叠中的一个层次或一种相对独立的三维实体。一条长链多肽链最后一步折叠就是结构域缔合(association),而成一个有活性的蛋白质分子或亚基。在一级(维)结构中的氨基酸序列的某些区域相邻的氨基酸残基形成有规则的二级(维)结构(如α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲等);然后再把相邻的二级结构片段集装在一起,形成超二级结构;在此基础上,多肽链再进一步折叠,或为近乎球状的三维(级)结构而成(一个)结构域。对于一个较大球状蛋白质分子来说,一条庞大的多肽链往往由两个或两个以上相对独立的三维实体缔合而成三维结构体。最常见的结构域约含有100~200个氨基酸残基,一般至少40个、多的可至400个以上;对于较小的蛋白质分子或亚基,“结构域”和“三级结构”往往是一个概念,也就是说,这些蛋白质是属于单结构域分子(如卵溶菌酶等)。从功能角度看,很多属于多结构域的酶蛋白,其活性中心都......阅读全文

细胞化学基础​​亲水性的概念

亲水性,英文释义:hydrophilic property;hydrophilicity,指带有极性基团的分子,对水有较大的亲和能力,可以吸引水分子,或易溶解于水。

细胞化学基础嘌呤的合成代谢

体内嘌呤核苷酸的合成有两条途径,一是从头合成途径,一是补救合成途径,其中从头合成途径是主要途径。1.嘌呤核苷酸的从头合成肝是体内从头合成嘌呤核苷酸的主要器官,其次是小肠粘膜和胸腺。嘌呤核苷酸合成部位在胞液,合成的原料包括磷酸核糖、天门冬氨酸、甘氨酸、谷氨酰胺、一碳单位及CO2等。主要反应步骤分为两个

细胞化学基础卫星DNA的分类

卫星DNA按其浮力密度的大小可以分成I、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四类,其浮力密度分别是1.687,1.693,1.697和1.700g/cm3。各类卫星DNA都是由各种不同的重复序列家族所组成。卫星DNA通常是串联重复序列。卫星DNA按其重复单元的核苷酸的多少,可以分为两类。一类是小卫星DNA(minisatel

细胞化学基础腺苷药物分析

方法名称灵芝子珍珠口服液—腺苷的测定—高效液相色谱法应用范围本方法采用高效液相色谱法测定灵芝子珍珠口服液中腺苷的含量。本方法适用于灵芝子珍珠口服液。方法原理取供试品加甲醇,超声处理,放置待沉淀完全,滤过,取许滤液蒸干,残渣加水溶解,以水饱和的正丁醇提取,正丁醇提取液蒸干,残渣加50%甲醇溶解并定容,

细胞化学基础Z型DNA

Z-DNA又称Z型DNA,是DNA双螺旋结构的一种形式,具有左旋型态的双股螺旋(与常见的B-DNA相反),并呈现锯齿形状。

细胞化学基础次黄嘌呤

本品水中溶解度为0.078/100m1(19℃)1.4g/100ml(100℃)。溶于稀酸和碱,如0.5mol/L硫酸或10mol/L氢氧化钠中,100℃,1h后小于5%分解。在生物学上,次黄嘌呤用大写字母“I”表示,可以由腺嘌呤脱去一个氨基得到(鸟嘌呤脱氨基成为黄嘌呤,胞嘧啶脱氨基成为尿嘧啶)。

细胞化学基础​疏水键

疏水键是多肽链上的某些氨基酸的疏水基团或疏水侧链(非极性侧链),由于避开水而造成相互接近、粘附聚集在一起。它在维持蛋白质三级结构方面占有突出地位。

细胞化学基础​分子诱导力

诱导力(induction force)在极性分子和非极性分子之间以及极性分子和极性分子之间都存在诱导力。由于极性分子偶极所产生的电场对非极性分子发生影响,使非极性分子电子云变形(即电子云被吸向极性分子偶极的正电的一极),结果使非极性分子的电子云与原子核发生相对位移,本来非极性分子中的正、负电荷重心

细胞化学基础碱基对

碱基对是形成DNA、RNA单体以及编码遗传信息的化学结构。组成碱基对的碱基包括A、G、T、C、U。严格地说,碱基对是一对相互匹配的碱基(即A:T,G:C,A:U相互作用)被氢键连接起来。然而,它常被用来衡量DNA和RNA的长度(尽管RNA是单链)。它还与核苷酸互换使用,尽管后者是由一个五碳糖、磷酸和

细胞化学基础β折叠链结构

肽平面之间呈手风琴状折叠,股与股之间会通过氢键固定,但氢键主要在股间而不是股内。氨基酸残基的R侧链分布在片层的上下。β折叠层并不是平的,因为侧链的存在使得它看上去像手风琴一样波纹起伏。(英语pleated)这样每一股会更紧密排列,氢键更容易建立。氢键的距离为7埃。在蛋白质结构中β折叠通常会用箭头表示

细胞化学基础腺苷一磷酸

腺苷一磷酸(Adenosine 3'-monophosphate,from Yeast,简称AMP)是一种有机化合物。化学式为C10H14N5O7P。外观为白色针状结晶或结晶性粉末 。是一种在核糖核酸(RNA)中发现的核苷酸。它是一种磷酸及核苷腺苷的酯,并由磷酸盐官能团、戊糖核酸糖及碱基腺嘌

细胞化学基础β折叠链作用

能形成β折叠的氨基酸残基一般不大,而且不带同种电荷,这样有利于多肽链的伸展,如甘氨酸、丙氨酸在β折叠中出现的几率最高。免疫球蛋白有大量的β折叠层。另一种常见的蛋白质模序是α螺旋和三种不同的β转角。不属于一个模序的蛋白质一级结构部分被称之为不规则螺旋。这些部分对蛋白质的空间构象非常重要。

细胞化学基础核苷酸

核苷酸是一类由嘌呤碱或嘧啶碱、核糖或脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的化合物,又称核甙酸。戊糖与有机碱合成核苷,核苷与磷酸合成核苷酸,8种核苷酸组成核酸。核苷酸主要参与构成核酸,许多单核苷酸也具有多种重要的生物学功能,如与能量代谢有关的三磷酸腺苷(ATP)、脱氢辅酶等。

细胞化学基础疏水性结合

在药物分子中大都会有非极性部分,即只由碳氢原子组成的部分,在受体分子中含有非极性氨基酸残基,如苯丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸,这些氨基酸残基的侧链在形成蛋白质的立体结构时,可能遇到一起形成活性部位的非极性区,称为疏水袋(hy-drophobic pocket)。在体内,药物的非极性部分和受体的非

细胞化学基础分配系数

分配系数是指在一定温度下,达到分配平衡时某一物质在两种互不相溶的溶剂中的活度(常近似为浓度)之比,为一常数。分配系数可用于表示该物质对两种溶剂的亲和性的差异。对分配系数的测定可提供该物质在环境行为方面许多重要的信息。常用的溶剂体系是由水和一种与水不互溶的有机溶剂组成,如正辛醇-水体系,所得的分配系数

细胞化学基础核苷多磷酸

含两个以上磷酸基的核苷酸。只带一个磷酸基的核苷酸,叫核苷一磷酸,带两个磷酸基的核苷酸叫核苷二磷酸,依此类推。如腺嘌呤核苷酸有腺苷一磷酸(即腺苷酸,AMP)、腺苷二磷酸(ADP)、腺苷三磷酸(ATP)和脱氧腺苷一磷酸(即脱氧腺苷酸,dAMP)、脱氧腺苷二磷酸(dADP)、脱氧腺苷三磷酸(dATP)。天

细胞化学基础​分子取向力

取向力(orientation force 也称dipole-dipole force)取向力发生在极性分子与极性分子之间。由于极性分子的电性分布不均匀,一端带正电,一端带负电,形成偶极。因此,当两个极性分子相互接近时,由于它们偶极的同极相斥,异极相吸,两个分子必将发生相对转动。这种偶极子的互相转动

细胞化学基础端粒DNA序列

端粒DNA 序列(telomere DNA sequence,TEL)端粒的功能是与端粒酶结合,完成染色体末端复制。端粒酶以其自身的RNA 为模板,在染色体端部添加上端粒的重复序列。作为模板的RNA 比较短,含有1.5 个端粒重复单元。端粒结构还能防止染色体融合及降解。端粒是保护DNA分子中的基因的

细胞化学基础疏水性分析

蛋白质肽链上各残基侧链对溶剂的相对亲水性是一个重要的特征参量。超二级结构中各残基对溶剂的相对亲水性或疏水性的性质是超二级结构的一个重要结构特征。在天然状态,构成蛋白质的疏水氨基酸残基多数是处在分子的内部,形成疏水内核,从而维系蛋白质的紧密三维结构。对于超二级结构这一局域空间结构的疏水特性的形成,疏水

细胞化学基础​分子色散力

色散力(dispersion force 也称“伦敦力”)所有分子或原子间都存在。是分子的瞬时偶极间的作用力,即由于电子的运动,瞬间电子的位置对原子核是不对称的,也就是说正电荷重心和负电荷重心发生瞬时的不重合,从而产生瞬时偶极。色散力和相互作用分子的变形性有关,变形性越大(一般分子量愈大,变形性愈大

细胞化学基础腺苷临床应用

腺苷是内源性嘌呤核苷,能使房室结传导减慢,阻断房室结折返途径,阵发性室上性心动过速(PSVT)(伴或不伴预激综合征)患者恢复正常窦性心律。腺苷能迅速为红细胞所摄取,因此作用时间很短,游离腺苷的血浆半衰期小于10s。PSVT的最常见形式是通过折返途径,因此腺苷能有效地终止这类心律失常。对非房室结或窦房

细胞化学基础β转角特定构象

β-转角的特定构象在一定程度上取决与他的组成氨基酸,某些氨基酸如脯氨酸和甘氨酸经常存在其中,由于甘氨酸缺少侧链(只有一个H),在β-转角中能很好的调整其他残基的空间阻碍,因此使立体化学上最合适的氨基酸;而脯氨酸具有环状结构和固定的角,因此在一定程度上迫使β-转角形成,促使多台自身回折且这些回折有助于

细胞化学基础​​亲水性原理

容易与水成氢键而结合的性质称亲水性。许多亲水性基团,如羟基、羧基、氨基、磺酸基等都易与氢键结合,因而是亲水性的。亲水性在材料表面为水分所润湿的性质。是一种界面现象,润湿过程的实质是物质界面发生性质和能量的变化。当水分子之间的内聚力小于水分子与固体材料分子间的相互吸引力时,材料被水润湿,此种材料为亲水

细胞化学基础核糖核酸

核糖核酸(缩写为RNA,即Ribonucleic Acid),存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种,即A(腺嘌呤)、G(鸟嘌呤)、C(胞嘧啶)、U(尿嘧啶),其中,U(尿

细胞化学基础B-型-DNA

中文名称:B 型 DNA英文名称:B-form DNA定  义:一种右手双螺旋构型的DNA。螺旋每一圈为11个核苷酸,核苷酸对的平面与双螺旋轴倾斜20°角。应用学科:细胞生物学(一级学科),细胞化学(二级学科)

细胞化学基础腺苷一磷酸计算化学数据

疏水参数计算参考值(XlogP):-2.7氢键供体数量5氢键受体数量:11可旋转化学键数量:4互变异构体数量:3拓扑分子极性表面积(TPSA):186重原子数量:23表面电荷:0复杂度:481同位素原子数量:0确定原子立构中心数量:4不确定原子立构中心数量:0确定化学键立构中心数量:0不确定化学键立

细胞化学基础卫星DNA的结合优点

卫星DNA具有很多优点,然而如何获得所需要的卫星位点,一般有以下两种方法:一种是利用卫星位点的保守性,从卫星数据库中搜索出某物种已知卫星引物,然后以相近物种的基因组总DNA为模板,用已知引物进行扩增并进行多态性分析,再对特异扩增产物进行测序,从而获得适合另一物种的高度多态的微卫星位点。另一种方法则是

细胞化学基础​疏水键的作用

蛋白质分子中许多氨基酸的疏水侧链有形成疏水键的倾向,由于疏水效应,这些疏水残基常被水驱入蛋白质分子内总聚集成簇,带动肽链盘曲折叠,对蛋白质三、四级结构的形成和稳定起重要作用。

细胞化学基础嘌呤的分解代谢

嘌呤核苷酸分解代谢反应基本过程是核苷酸在核苷酸酶的作用下水解成核苷,进而在酶作用下成自由的碱基及1-磷酸核糖。嘌呤碱最终分解成尿酸,随尿排出体外。黄嘌呤氧化酶是分解代谢中重要的酶。嘌呤核苷酸分解代谢主要在肝、小肠及肾中进行。嘌呤代谢异常:尿酸过多引起痛风症,患者血中尿酸含量升高,尿酸盐晶体可沉积于关

细胞化学基础B-型-DNA的特点

1.两条反向平行的互补双螺旋链,一条方向为5‘→3’,另一条方向为3‘→5’,围绕同一中心纵轴,从右向上盘旋。2.双螺旋磷酸-脱氧核糖主链在外,位于内的碱基平面与中心轴垂直。3.每个碱基相聚0.34nm,同条链相邻碱基夹角36度,每10个碱基形成螺旋1周,螺距3.54nm。4.露于螺旋外的磷原子离中