细胞化学基础疏水性结合
在药物分子中大都会有非极性部分,即只由碳氢原子组成的部分,在受体分子中含有非极性氨基酸残基,如苯丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸,这些氨基酸残基的侧链在形成蛋白质的立体结构时,可能遇到一起形成活性部位的非极性区,称为疏水袋(hy-drophobic pocket)。在体内,药物的非极性部分和受体的非极性区的表面均为有序排列的水分子所包围。当药物与受体接近到一定程度时,由于中间空间的缩小,将有序排列的水分子排挤出去。发生去水合现象(desolvation),这样便使系统的熵值增高,由此使系统的自由能降低,而成为较稳定的状态。这种自由能的降低是维持药物与受体形成复合物的力,称之为疏水性结合(hydrophobic binding),参见图3。疏水性相互作用示意图疏水性结合力的含义是不明确的,因此,这种作用力的强度没有明确的计算方法,但它在药物与受体相互作用中几乎是普遍存在的。据估算,两个次甲基间的疏水性作用可释放出0.7kcal/m......阅读全文
细胞化学基础疏水性结合
在药物分子中大都会有非极性部分,即只由碳氢原子组成的部分,在受体分子中含有非极性氨基酸残基,如苯丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸,这些氨基酸残基的侧链在形成蛋白质的立体结构时,可能遇到一起形成活性部位的非极性区,称为疏水袋(hy-drophobic pocket)。在体内,药物的非极性部分和受体的非
细胞化学基础疏水性
疏水性分子偏向于非极性,并因此较会溶解在中性和非极性溶液(如有机溶剂)。疏水性分子在水里通常会聚成一团,而水在疏水性溶液的表面时则会形成一个很大的接触角而成水滴状。
细胞化学基础亲水性原理
容易与水成氢键而结合的性质称亲水性。许多亲水性基团,如羟基、羧基、氨基、磺酸基等都易与氢键结合,因而是亲水性的。亲水性在材料表面为水分所润湿的性质。是一种界面现象,润湿过程的实质是物质界面发生性质和能量的变化。当水分子之间的内聚力小于水分子与固体材料分子间的相互吸引力时,材料被水润湿,此种材料为亲水
细胞化学基础疏水性分析
蛋白质肽链上各残基侧链对溶剂的相对亲水性是一个重要的特征参量。超二级结构中各残基对溶剂的相对亲水性或疏水性的性质是超二级结构的一个重要结构特征。在天然状态,构成蛋白质的疏水氨基酸残基多数是处在分子的内部,形成疏水内核,从而维系蛋白质的紧密三维结构。对于超二级结构这一局域空间结构的疏水特性的形成,疏水
细胞化学基础亲水性的定义
带有极性基团的分子,对水有大的亲和能力,可以吸引水分子,或溶解于水。这类分子形成的固体材料的表面,易被水所润湿。具有这种特性都是物质的亲水性。亲水性指分子能够透过氢键和水形成短暂键结的物理性质。因为热力学上合适,这种分子不只可以溶解在水里,也可以溶解在其他的极性溶液内。一个亲水性分子,或说分子的亲水
细胞化学基础亲水性的概念
亲水性,英文释义:hydrophilic property;hydrophilicity,指带有极性基团的分子,对水有较大的亲和能力,可以吸引水分子,或易溶解于水。
细胞化学基础超疏水性理论
超疏水性物质,如荷叶,具有极难被水沾湿的表面,其水在其表面的接触角超过150°,滑动角小于20°。理论气体环绕的固体表面的液滴。接触角θ,是由液体在三相(液体、固体、气体)交点处的夹角。1805年,托马斯·杨通过分析作用在由气体环绕的固体表面的液滴的力而确定了接触角θ。气体环绕的固体表面的液滴,形成
细胞化学基础疏水性的应用介绍
在CAC(水泥)中掺加疏水剂的做法虽然在俄罗斯和其他独联体(CIS)国家已得到采用,但却未在其他地方被普遍接受。这种做法能使水泥应用在不利的气候条件下。如果把CAC与约占0.05%泥重量的合适的疏水剂如月桂酸、硬脂酸和油酸等共磨,就会在水泥颗粒周围形成一个疏水的密封层。这样就得到了一种能在潮湿条件下
细胞化学基础卫星DNA的结合优点
卫星DNA具有很多优点,然而如何获得所需要的卫星位点,一般有以下两种方法:一种是利用卫星位点的保守性,从卫星数据库中搜索出某物种已知卫星引物,然后以相近物种的基因组总DNA为模板,用已知引物进行扩增并进行多态性分析,再对特异扩增产物进行测序,从而获得适合另一物种的高度多态的微卫星位点。另一种方法则是
什么是疏水性结合?
在药物分子中大都会有非极性部分,即只由碳氢原子组成的部分,在受体分子中含有非极性氨基酸残基,如苯丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸,这些氨基酸残基的侧链在形成蛋白质的立体结构时,可能遇到一起形成活性部位的非极性区,称为疏水袋(hy-drophobic pocket)。在体内,药物的非极性部分和受体的非
细胞化学基础碱基
碱基,在化学中本是“碱性基团”的简称。有机物中大部分的碱性基团都含有氮原子,称为含氮碱基,氨基(-NH2)是最简单的含氮碱基。碱基,在生物化学中又称核碱基、含氮碱基,是形成核苷的含氮化合物,核苷又是核苷酸的组分。碱基、核苷和核苷酸等单体构成了核酸的基本构件。核碱基间可以形成碱基对,且彼此堆叠,所以,
细胞化学基础锌指
锌指是一种常出现在DNA结合蛋白质中的一种结构基元。锌螯合在氨基酸链中形成锌的指状结构。锌是某些酶的活性辅助因子,也是某些蛋白质,包括RNA聚合酶的转录因子,如TFIIIA(transcription factor III,Asubtype)、类固醇受体等能结合脱氧核糖核酸(DNA)的蛋白质亦含有锌
细胞化学基础核酶
科学家在研究RNA的转录后加工时发现某些RNA有催化活性,可以催化RNA的剪接,这些由活细胞合成、起催化作用的RNA称为核酶。许多核酶的底物也是RNA,甚至就是其自身,其催化反应也具有专一性。已经阐明的天然核酶有锤头状核酶、发夹状核酶、I型内含子、Ⅱ型内含子、丁型肝炎病毒核酶、核糖核酸酶P、肽基转移
细胞化学基础嘌呤
嘌呤(Purine),分子式C5H4N4,是一种杂环芳香有机化合物,是新陈代谢过程中的一种代谢物。
细胞化学基础β转角
β-转角是一种常见的蛋白质二级结构,它通常出现在球状蛋白表面,因此含有极性和带电荷的氨基酸残基。
细胞化学基础α螺旋
α-螺旋(α-helix)是蛋白质二级结构的主要形式之一。指多肽链主链围绕中心轴呈有规律的螺旋式上升,每3.6 个氨基酸残基螺旋上升一圈,向上平移0.54nm,故螺距为0.54nm,两个氨基酸残基之间的距离为0.15nm。螺旋的方向为右手螺旋。氨基酸侧链R基团伸向螺旋外侧,每个肽键的肽键的羰基氧和第
细胞化学基础腺苷
腺苷,是指由腺嘌呤的N-9与D-核糖的C-1通过β糖苷键连接而成的化合物,化学式为C10H13N5O4,其磷酸酯为腺苷酸。腺苷是一种遍布人体细胞的内源性核苷,可直接进入心肌经磷酸化生成腺苷酸,参与心肌能量代谢,同时还参与扩张冠脉血管,增加血流量。腺苷对心血管系统和肌体的许多其它系统及组织均有生理作用
分子疏水性的结合过程
在药物分子中大都会有非极性部分,即只由碳氢原子组成的部分,在受体分子中含有非极性氨基酸残基,如苯丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸,这些氨基酸残基的侧链在形成蛋白质的立体结构时,可能遇到一起形成活性部位的非极性区,称为疏水袋(hy-drophobic pocket)。在体内,药物的非极性部分和受体的非
细胞化学基础腺苷计算化学数据
疏水参数计算参考值(XlogP):无氢键供体数量:4氢键受体数量:8可旋转化学键数量:2互变异构体数量:3拓扑分子极性表面积:140重原子数量:19表面电荷:0复杂度:335同位素原子数量:0确定原子立构中心数量:4不确定原子立构中心数量:0确定化学键立构中心数量:0不确定化学键立构中心数量:0
细胞化学基础互补-DNA
中文名称:互补 DNA英文名称:complementary DNA;cDNA定 义:利用反转录酶以mRNA为模板合成的DNA。应用学科:细胞生物学(一级学科),细胞化学(二级学科)
细胞化学基础腺苷用途
抗心律失常药,可使阵发性室上性心动过速转为窦性心律。用于和房室有关的室上心律失常。治疗心绞痛、心肌梗塞、冠脉功能不全、动脉硬化、原发性高血压、脑血管障碍、中风后遗症、进行性肌肉萎缩等。也可用于生化研究。
细胞化学基础转移RNA
转移RNA(tRNA)在蛋白质合成过程中负责转运氨基酸、解读mRNA遗传密码。tRNA占细胞总RNA的10%~15%,绝大多数位于细胞质中。tRNA由Crick于1955年提出其存在,Zamecnik和 Hoagland于1957年鉴定。1.tRNA一级结构具有以下特点:①是一类单链小分子RNA,长
细胞化学基础锌指结构
定义指的是在很多蛋白中存在的一类具有指状结构的结构域,这些具有锌指结构的蛋白大多都是与基因表达的调控有关的功能蛋白。共同特征锌指结构的共同特征是通过肽链中氨基酸残基的特征基团与Zn2+的结合来稳定一种很短的,可自我折叠成“手指”形状的的多肽空间构型。发现锌指蛋白最初在非洲爪蟾的卵母细胞中发现,已知广
细胞化学基础锌指蛋白
定义通常由一系列锌指组成。 具有重复结构的氨基酸模式,相隔特定距离的胱氨酸结合锌指,能与某些RNA/DNA 结合。作用锌指蛋白是一类具有手指状结构域的转录因子,对基因调控起重要的作用。根据其保守结构域的不同,可将锌指蛋白主要分为C2H2型、C4型和C6型。锌指通过与靶分子DNA、RNA、DNA-RN
细胞化学基础兆碱基
兆碱基megabase (Mb)定义:DNA片段长度单位,相当于1百万个核苷,大约等于1M。
细胞化学基础β片层
中文名称:β片层英文名称:β sheet定 义:免疫球蛋白分子中常见的二级结构,可分为平行式和反平行式两种类型,两条或多条几乎完全伸展的多肽链侧聚集在一起,相邻肽链间形成有规则的氢键。应用学科:免疫学(一级学科),免疫系统(二级学科),免疫分子(三级学科)
细胞化学基础合成碱基
在医学中,几种核苷类似物用作抗癌剂和抗病毒剂。病毒聚合酶将这些化合物与非主要碱基结合。病人服用的核苷类似物进入体内被转化为核苷酸而在细胞中被激活。
细胞化学基础β折叠链
在β折叠中,两条以上氨基酸链(肽链),或同一条肽链之间的不同部分形成平行或反平行排列,成为“股”。
细胞化学基础A-型-DNA
中文名称:A 型 DNA英文名称:A-form DNA定 义:一种右手双螺旋构型的DNA。螺旋每一圈为11个核苷酸,核苷酸对的平面与双螺旋轴倾斜20°角。应用学科:细胞生物学(一级学科),细胞化学(二级学科)
细胞化学基础色散力
色散力(dispersion force 也称“伦敦力”)所有分子或原子间都存在。是分子的瞬时偶极间的作用力,即由于电子的运动,瞬间电子的位置对原子核是不对称的,也就是说正电荷重心和负电荷重心发生瞬时的不重合,从而产生瞬时偶极。色散力和相互作用分子的变形性有关,变形性越大(一般分子量愈大,变形性愈大