单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna
深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列，如测序前将dna打成小的片段，测序是从这个片段的两端测的，即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组，这要看你做什么了，一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转，这其实要看你想做什么分析，如做转录组、表达谱分析就只需rna样品，而做全基因组重测序当然就要dna了。......阅读全文
单细胞基因组测序如何实现：从实验到分析，步步解析
随着生命科学研究的微观化，基于细胞群体的研究方法已不适用于某些研究领域（如肿瘤异质性、早期胚胎发育等）。单细胞基因组测序通过在单个细胞水平上进行测序，解决了用组织样本无法获得不同细胞间的异质性信息或样本量太少无法进行常规测序的难题，为科学家研究单个细胞的行为、机制等提供了新的方向。 【应用概览
单细胞凝胶电泳法检测单细胞DNA损伤
单细胞凝胶电泳（single-cell gel eiectrophoresis，SCGE）又称慧星试验（comet assay）是一项较新的电泳方法。自1978年被Rydcbert B.等人成功地用于检验DNA单链断裂以来，经过不断的改进，已成为一种快速、灵敏、简便的检测DNA损伤的方法，广泛地应用
Namocell单细胞分离仪应用介绍——藻类单细胞分离
Namocell单细胞分离仪最新应用：随着人们对环境研究的不断深入，研究人员逐渐将目光转向藻类的单细胞层面：有些需要对藻类进行单细胞级别的分析（如藻类单细胞测序等），也有需要对单细胞藻类进行培养。这样就面临一个棘手的问题，那就是如何获取藻类的单个细胞。通常实验室里的方式，是在显微镜下用毛细管吸取。这
单细胞是什么
单细胞既可以指单细胞生物，比如细菌等，也可以指从多细胞生命体分离的单个细胞，比如实验室培养的人体细胞等。此外，受精卵也是单细胞，属于可以发育成完整生命体的全能干细胞。
什么是单细胞？
单细胞生物 生物可以根据构成的细胞数目分为单细胞生物（Protozoa）和多细胞生物（Metazoa）。单细胞生物只由单个细胞组成，个体微小，用肉眼很难看的见，大多数单细胞生物生活在水域环境中，有些寄生在我们身上。单细胞生物靠分裂繁殖（酵母菌在适宜的环境下出芽繁殖）单细胞生物包括所有古细菌和真细菌和
单细胞分离技术
单细胞测序日趋火爆的原因很大程度上得益于单细胞分离技术的不断完善。这一讲，我们将跟大家一起回顾传统的单细胞分离技术，并重点介绍单细胞分离技术的新宠微孔芯片技术及微流控技术。图1为目前常见单细胞分离设备。图1：目前常见单细胞分离设备传统单细胞分离技术相信许多实验人员，都见过下面我们要介绍的传统的单细胞
单细胞是什么
单细胞既可以指单细胞生物，比如细菌等，也可以指从多细胞生命体分离的单个细胞，比如实验室培养的人体细胞等。此外，受精卵也是单细胞，属于可以发育成完整生命体的全能干细胞。
什么是单细胞
单细胞生物 生物可以根据构成的细胞数目分为单细胞生物（Protozoa）和多细胞生物（Metazoa）。单细胞生物只由单个细胞组成，个体微小，用肉眼很难看的见，大多数单细胞生物生活在水域环境中，有些寄生在我们身上。单细胞生物靠分裂繁殖（酵母菌在适宜的环境下出芽繁殖）单细胞生物包括所有古细菌和真细菌和
单细胞的作用
在人体组织中有着令人难以置信的细胞类型、状态和相互作用的多样性。为了更好地了解这些组织和存在的细胞类型，scRNA-seq 提供了在单个细胞水平上研究表达情况的可能。scRNA-seq 可以用来：探索组织中存在哪些细胞类型识别未知/稀有细胞类型或状态阐明分化过程中或跨时间或跨状态的基因表达变化鉴定特
谢晓亮教授Science报道新型单细胞基因组线性扩增法
谢晓亮教授在4月14日的Science上发表文章报道了实验室的最新研究：一种新型的单细胞基因组线性扩增的方法——转座插入（LIANTI,Linear Amplification with Transposon Insertion）。LIANTI法在检测拷贝数目变异和单核苷酸变异上的准确度都优于以
单细胞－DNA－和－FISH－分析应用于植入前基因诊断实验2
单个卵裂球 FISH实验材料活检好的卵裂球试剂、试剂盒胚胎培养液和洗涤液低渗 部分固定液LSI杂交缓冲液乙醇DAPI Ⅱ甲酰胺冲洗液2 X SSC仪器、耗材FISH 探针橡皮泥微管Nunc 培养板带刻蚀环的Clay Adams玻片玻片染色缸盖玻片Hybrite热板荧光显微镜实验步骤1.大于 8 细胞
Science特刊论述如何利用单细胞等技术解析基因型与表型
人类细胞内的DNA，即我们熟知的基因型，为指导一系列机体的构建过程提供了蓝图。虽然我们常常认为人类基因组是稳定的，但不同个体之间仍存在着诸多差异。人类可观察到的表型由多个性状组成，这些性状则由单基因组中的许多遗传变异所引起。毛发、瞳孔及皮肤颜色，身高，体型和行为都代表着这些多基因性状。但许多这些
北京基因组所开发新型高通量单细胞多组学新技术
单细胞测序已成为生物医学领域的关键共性技术。然而，由于缺乏高效的手段降低“假单细胞率”，主流微流控平台的单通道细胞通量通常在1万细胞以下，空载率达到90%以上，且成本高昂，限制了对数百万个细胞或上千例样本的人群队列进行大规模研究。 近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）蒋岚研究组
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance
首次全面单细胞分析表明：心力衰竭由不同基因突变引起
一个国际联盟在《科学》杂志上发表论文称，个体遗传缺陷以不同方式导致心力衰竭。该研究基于对健康和衰竭心脏的心脏细胞进行的首次全面单细胞分析，从而确定导致心肌病患者心力衰竭的分子和细胞机制是由每位患者携带的特定基因变异体决定的。 由来自北美、欧洲和亚洲6个国家的53名科学家共同开展的研究表明，细胞
北京大学发布突破性单细胞基因组检测技术
全球有多达15%的夫妇受到不孕不育的影响，体外受精(IVF)是治疗这种常见疾病的一种方法。在发表于13年12月19日的《Cell》杂志上的一项新 研究中，北京大学的研究人员报道了一项安全、准确且廉价的方法，可为IVF程序选择出基因正常的胚胎，因此提高了一对夫妇生育健康孩子的机会。 通过
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can
突破性单细胞表观基因组与转录组分析新技术
由英国及比利时的研究人员开发出的一种新方法，使得在单细胞中同时研究表观基因组及转录组成为可能。发布在《自然方法》（Nature Methods）上的实验方案，可帮助科学家们精确描绘出DNA甲基化改变与基因表达之间的关系。 近年来单细胞测序技术发展迅速，被广泛用于研究细胞间的基因表达谱（转录组）
单细胞－DNA－和－FISH－分析应用于植入前基因诊断实验1
单倍体细胞具体基因位点的分析实验材料0.5ml 管中的单细胞或（卵）裂球用石蜡油覆盖使其溶化并中和试剂、试剂盒10 X 游离钾扩增缓冲液4dNTP 混合液正反引物Taq DNA 聚合酶MgCl2 扩增缓冲液轻石蜡油次级 PCR 正反内外引物10 X TBE 缓冲液DNA 凝胶上样缓冲液溴化二氨乙啡唆
单细胞分离对单细胞测序领域有着很大的帮助
单细胞分离可以采用特制的毛细管在载玻片的琼脂涂层上选取单孢子并切割下来，然后移到合适的培养基进行培养，分离法对操作技术有比较高的要求，多限于高度专业化的科学研究中采用。 它不仅仅可以用于分离单细胞，还可以用于nl级别试剂的分配和磁珠的分选，对于单细胞测序领域有着很大的帮助。快速高效接种单个活细胞
Namocell单细胞分离仪在单细胞测序领域的应用
9月26至27日2019年细胞产业大会暨2019第四届（上海）细胞与肿瘤医疗高峰论坛在上海新南雅酒店举行。本届会议，邀请了全国30位专家学者、人物演讲、40家企业参展，400余人报名参会，逾500人参加了会议，就细胞储存、细胞治疗、细胞培养、细胞工程、细胞银行、细胞能量与代谢、细胞免疫学、细胞生理学
单细胞分离技术应用于众多领域的单细胞分析
单细胞分离目前主要有三种选择：手动分离、荧光激活细胞分选和微流体技术。当然，除了成熟的方法，巧妙的新方法也在不断涌现，能以更高的准确性和特异性来分离单细胞。 将细胞分散到悬液中，会失去它们在组织里的位置信息。如果想了解单细胞所处的环境，就需要用到激光捕获显微切割技术，这种技术通过扫描组织切片来
单细胞分离仪在单细胞测序领域有着很大的帮助
单细胞分离仪可以实现从微孔芯片转移单细胞到细胞收集管中。单细胞转移分离系统集单细胞成像，单细胞隔离，单细胞选择功能于一体，自动聚焦成像。 转移单细胞到微管，PCR微孔板或其它反应微管中，在隔离单细胞后，它可以对选定收集的细胞进行扫描并成像，采用倒置荧光显微镜，配备自动扫描显微镜载物台，自
北京大学Cell发布突破性单细胞基因组检测技术
全球有多达15%的夫妇受到不孕不育的影响，体外受精(IVF)是治疗这种常见疾病的一种方法。在发表于12月19日的《Cell》杂志上的一项新研究中，北京大学的研究人员报道了一项安全、准确且廉价的方法，可为IVF程序选择出基因正常的胚胎，因此提高了一对夫妇生育健康孩子的机会。 通过对单个的卵细
单细胞统计数据体细胞归类与作用发掘的遗传基因
触碰过单细胞转录组统计数据的朋友们都了解，统计数据的关键結果取决于依据每一体细胞的基因的表达统计数据，来对体细胞开展“分类”归类。目前通用性的剖析构思给出：最先依据转录组稀疏矩阵，根据测算和剖析，寻找不一样的体细胞Cluster，并寻找每类别集群服务器的Marker遗传基因。依据现有对体细胞特殊
Nature－Genetics：单细胞全基因组DNA甲基化组新发现
北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心，北大生命科学学院与第三医院等处的研究人员发表了题为“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimplantation Embryos”的文章，利用单细胞DNA甲基化组高通量测序方法，首次在单细胞分辨
PerkinElmer以0.28美元/股现金收购单细胞基因组学公司RHS
分析测试百科网讯 近日，据外媒报道，PerkinElmer同意支付约1980万美元现金(每股0.28美元)收购澳大利亚细胞基因组学公司RHS Ltd，这项决议得到了RHS公司全体董事会的支持。 RHS董事长David Brookes说：“PKI提案受到了董事会的欢迎，作为奖励股东忠诚度并在重要
Nature单细胞测序分析：超过25万个细胞中数千个基因
来自Sanger研究所，EMBL欧洲生物信息学研究所完成了一项大规模单细胞基因组测序研究：通过对六种哺乳动物物种中超过25万个细胞的基因进行测序，描绘了免疫反应中的基因如何在细胞和物种之间产生不同的活性。 这一研究成果公布在10月24日的Nature杂志上，这项研究以前所未有的细节展示了细胞在
华大基因再出手－单细胞转录组学测序技术的系统分析
单细胞转录组测序(Single-cell RNA-seq)是在单细胞水平对转录组（mRNA）进行测序的一项新技术，可发现细胞群体中真正起作用的细胞，特别适合对高度异质性的干细胞、肿瘤细胞及胚胎发育早期的细胞群体进行研究，认识细胞分子机制和基因调控网络。单细胞RNA-seq技术需要在测序前制备文库
新型基因组学工具ECCITEseq扩展多模态单细胞分析
单细胞RNA测序是基因组研究的重要领域之一。其能够帮助研究人员深入探索单细胞的特性，有效区分不同的细胞类型，并在单细胞水平下研究多种人类疾病的发病机制。随着对复杂人体组织甚至整个生物体的研究进展，研究人员越来越认识到需要大规模并行技术及数据集才能更加深入地揭示微妙的细胞状态。 近日，一种新型单