中科院团队开发细胞器互作高通量统计分析方法

2022年8月5日,中国科学院生物物理研究所徐涛课题组,胡俊杰课题组与计算技术研究所肖立团队在《Journal of Cell Biology》杂志上合作发表了题为“DeepContact: High throughput quantification of membrane contact site based on electron microscopy imaging”的方法学(Tools)文章,针对二维电镜数据开发了一种基于深度学习的细胞器互作高通量统计分析方法,DeepContact。近十几年来,细胞器互作位点(membrane contact site, MCS)得到了生物学领域的广泛关注。MCS是膜性细胞器之间形成的由蛋白复合体介导的动态物理相互作用,在信号转导,脂类运输,细胞器形态重构等方面起到关键作用。然而,因缺乏高效的MCS统计量化工具,细胞器互作领域的发展受到严重限制。MCS荧光显微成像因过表达荧光指示系统......阅读全文

关于细胞器—溶酶体的基本介绍

  溶酶体是单层膜结构,是“消化车间”,内部含有多种水解酶,能分解衰老,损伤的细胞器,吞噬并杀死入侵的病毒或细菌,真核动植物细胞中都含有溶酶体。  溶酶体是由高尔基体断裂产生,单层膜包裹的小泡,数目可多可少,大小也不等,含有60多种能够水解多糖,磷脂,核酸和蛋白质的酸性酶,这些酶有的是水溶性的,有的

细胞器中的内质网

  内质网(Endoplasmic Reticulum)是细胞质中由膜构成的网状管道系统广泛的分布在细胞质基质内。它与细胞膜及核膜相通连,对细胞内蛋白质及脂质等物质的合成和运输起着重要作用。 内质网根据其表面有无附着核糖体可分为粗面内质网和滑面内质网。粗面内质网表面有附着核糖体,具有运输蛋白质的功能

关于细胞器—线粒体的基本介绍

  线粒体形状为棒状,是细胞进行有氧呼吸的主要场所,具有双层膜,内层膜向内折叠形成“嵴”(作用是可以扩大酶的附着位点)。线粒体又称"动力车间",细胞生命活动所需的能量,大约95%来自线粒体,含核糖体,可产生DNA和RNA,能相对独立遗传。存在于所有真核生物细胞中(厌氧菌及哺乳动物成熟的红细胞除外),

细胞器的光镜观察(2)

(三)方法 1. 动物细胞骨架的显示方法 (1)无菌条件下,在25 ml 培养瓶中放入清洁无菌的盖玻条,然后接种3 ml左右的细胞悬液,盖紧瓶塞,37℃恒温箱内培养24小时。 (2) 取出盖玻片条,浸入装有6mmol磷酸缓冲液的小瓶中5~

细胞器中的高尔基体

  高尔基体(Golgi apparatus,Golgi complex)亦称高尔基复合体、高尔基器。是真核细胞中内膜系统的组成之一。为意大利细胞学家高尔基Golgi于1898年首次用银染方法在神经细胞中发现。是由光面膜组成的囊泡系统,它由扁平膜囊(saccules)、大囊泡(vacuoles)、小

细胞器的观察实验——电镜切片

仪器、耗材电子显微镜镊子平皿载片实验步骤一、高尔基复合体(Golgi Complex) 1.  人体胃粘膜细胞高尔基复合体电镜照片:细胞质中有散在的高尔基复合体,其结构要由三部分组成:扁平囊、大囊泡和小囊泡,它们共同构成紧密重叠的囊泡结构。2.  扁平囊约3~8层,它们平行排列,略弯曲成弓形。3.

膜结合细胞器的功能分布

  从功能上看, 细胞内膜结合细胞器的分布是功能越重要越靠近中央; 从层次看, 上游的靠内, 下游的靠外。如细胞核位于细胞的中央,它是细胞中最重要的细胞器,有两层膜结构。细胞核的外膜与内质网的膜是联系在一起的, 细胞核的外膜是粗面内质网的一部分。粗面内质网的功能是参与蛋白质合成, 其作用仅次于细胞核

细胞器的光镜观察(1)

[实验用品] 1.材料:洋葱鳞茎、口腔上皮细胞、盖片培养的单层动物细胞、蟾蜍肾脏切片;猫或兔的脊神经节切片、马蛔虫子宫切片。 2.器具:光学显微镜、载玻片、盖玻片、小镊子、吸管、牙签、吸水纸、擦镜纸、剪刀、恒温水浴箱、小培养皿、小染色缸、大平皿。 3.试剂:中性红-詹纳

如何分离各种各样的细胞器

细胞器的分离主要用到的是离心技术。主要用到:(一)、差速离心在密度均一的介质中由低速到高速逐级离心,用于分离不同大小的细胞和细胞器。在差速离心中细胞器沉降的顺序依次为:核、线粒体、溶酶体与过氧化物酶体、内质网与高基体、最后为核蛋白体。由于各种细胞器在大小和密度上相互重叠,而且某些慢沉降颗粒常常被快沉

半自主性细胞器的简介

  半自主性细胞器(semiautomous organelle)的概念:自身含有遗传表达系统(自主性);但编码的遗传信息十分有限,其RNA转录、蛋白质翻译、自身构建和功能发挥等必须依赖核基因组编码的遗传信息(自主性有限)。叶绿体和线粒体都属于半自主性细胞器。

半自主性细胞器的组成

  线粒体和叶绿体中有DNA和RNA、核糖体、氨基酸、活化酶等。这两种细胞器均有自我繁殖所必需的基本组分,具有独立进行转录和转译的功能。迄今为止,已知线粒体基因组仅能编码约20种线粒体膜和基质蛋白并在线粒体核糖体上合成;线粒体和叶绿体的绝大多数蛋白质是由核基因编码,在细胞质核糖体上合成,然后转移至线

细胞器分离和细胞脱核技术

一、破碎细胞的方法 1.杆状玻璃匀浆器法 •该匀浆器由一根端部表面磨砂的玻璃杆和一个内壁磨砂的玻璃套管组成。使用时,先用锋利的刀片把组织块切碎,然后把碎块加入套管中,用力使玻杆移动使组织细胞破碎。 2.高速组织捣碎机法 •使用时将4℃预冷的组织碎块或细胞悬液加入捣碎机的梅

海藻与细菌“内共生”出新细胞器

  进化是一个相当奇妙而漫长的过程,一些随机活动的爆发,造就了当今地球上生命的多样性。它们可能会大规模发生,比如高效的肢体进化;也可能发生在微观细胞层面,比如细胞不同部分的首次形成。  现在,一组科学家发现了一个重大生命事件的迹象,该事件可能至少十亿年来都没有发生过了。他们在实验室环境中观察到初级内

海藻与细菌“内共生”出新细胞器

进化是一个相当奇妙而漫长的过程,一些随机活动的爆发,造就了当今地球上生命的多样性。它们可能会大规模发生,比如高效的肢体进化;也可能发生在微观细胞层面,比如细胞不同部分的首次形成。现在,一组科学家发现了一个重大生命事件的迹象,该事件可能至少十亿年来都没有发生过了。他们在实验室环境中观察到初级内共生现象

关于细胞器的基本分类介绍

  细胞器分为:线粒体;叶绿体;内质网;高尔基体;溶酶体;液泡,核糖体,中心体。其中,叶绿体只存在于植物细胞,液泡只存在于植物细胞和低等动物,中心体只存在于低等植物细胞和动物细胞。另外,在中学阶段,细胞核并不承认为细胞器,而在大学阶段,细胞核则被认为是细胞中最大,最重要的细胞器。  细胞器是悬浮在细

简述细胞器—液泡的基本内容

  在成熟的活的植物细胞中经常都有一个大的充满液体的中央液泡,是在细胞生长和发育过程中由小的液泡融合而成的,是单层膜包围的充满水液的泡。液泡中含有无机盐、氨基酸、糖类以及各种色素等代谢物,甚至还含有有毒化合物,并处于高渗状态,使细胞处于吸涨饱满的状态。  单层膜,只存在于植物细胞,是调节细胞内的环境

细胞组分和细胞器——细胞骨架

Fixation and Immunofluorescence of the Cytoskeleton (Mitchison Lab)  Recycling Tubulin (Mitchison Lab)  Labeling Tubulin and Quantifying Labeling Stoi

关于细胞器的不同类型介绍

  细胞器分为:线粒体;叶绿体;内质网;高尔基体;溶酶体;液泡,核糖体,中心体。其中,叶绿体只存在于植物细胞,液泡只存在于植物细胞和低等动物,中心体只存在于低等植物细胞和动物细胞。另外,在中学阶段,细胞核并不承认为细胞器,而在大学阶段,细胞核则被认为是细胞中最大,最重要的细胞器。  细胞器是悬浮在细

细胞组分和细胞器——细胞膜

Isoelectric Focussing of Membrane Protein by Slab Gel Method (Hancock Lab)  Isolation of Outer Membrane Protein from P.Aeruginosa with Octyl-Poe (Hanc

关于细胞器的基本信息介绍

  细胞器是细胞质中具有特定形态结构和功能的微器官,也称为拟器官或亚结构。其中质体与液泡在光镜下即可分辨,其他细胞器一般需借助电子显微镜方可观察。 [1]  细胞器(organelle)一般认为是散布在细胞质内具有一定形态和功能的微结构或微器官。但对于“细胞器”这一名词的范围,还存在着某些不同意见。

细胞组分和细胞器——染色体

Chromosomal DNA Prep : cultured cells/tissue samples (Mike A Dyer)This protocol was developed for cultured cells but should be appropriate for dissoci

细胞器中核糖体的介绍

  简介  核糖体是无膜结构,分为附着核糖体和游离核糖体,将氨基酸合成蛋白质是由rRNA和核糖核蛋白构成的微小颗粒,是合成蛋白质的场所,所有细胞都含有核糖体。  核糖体是细胞内一种核糖核蛋白颗粒,主要由RNA(rRNA)和蛋白质构成,其惟一功能是按照mRNA的指令将氨基酸合成蛋白质多肽链,所以核糖体

基因“开关”控制植物细胞器演化速度

近日,中国农业科学院农业基因组研究所绿色轻简超级稻遗传解析与分子育种创新团队首次揭示了细胞器基因组的动态演化模式,绘制了线粒体和叶绿体基因组的精细图谱,并证实了通过突变与恢复MSH1基因的功能可以驱动线粒体基因组主要构型的快速演化,为开发利用细胞器遗传资源提供理论支撑。相关研究成果发表在《基因组生物

细胞器的观察实验——光镜切片

仪器、耗材光学显微镜镊子平皿载片实验步骤一、高尔基复合体(Golgi Complex)1.  用镀银法染色的豚鼠脊神经节光镜切片:神经细胞因合成运输大量的蛋白质而含有发达的内质网和高尔基复合体,在低倍镜下观察,神经节的假单极细胞体被神经束分隔成群。2.  神经细胞的胞体呈圆形或椭圆形。3.  转换高

植物细胞器核糖体的功能

  核糖体,旧称“核糖核蛋白体”或“核蛋白体”,普遍被认为是细胞中的一种细胞器,除哺乳动物成熟的红细胞,植物筛管细胞外,细胞中都有核糖体存在。一般而言,原核细胞只有一种核糖体,而真核细胞具有两种核糖体(其中线粒体中的核糖体与细胞质核糖体不相同)。  核糖体的结构和其它细胞器有显著差异:没有膜包被、由

关于细胞器—高尔基体的简介

  高尔基体(Golgi apparatus,Golgi complex)亦称高尔基复合体、高尔基器。是真核细胞中内膜系统的组成之一。为意大利细胞学家高尔基Golgi于1898年首次用银染方法在神经细胞中发现。是由光面膜组成的囊泡系统,它由扁平膜囊(saccules)、大囊泡(vacuoles)、小

关于细胞器—内质网的功能介绍

  内质网是指细胞质中一系列囊腔和细管,彼此相通,形成一个隔离于细胞质基质的管道系统。它是细胞质的膜系统,外与细胞膜相连,内与核孔复合体相通,将细胞中的各种结构连成一个整体,具有承担细胞内物质运输的作用。  内质网能有效地增加细胞内的膜面积,内质网能将细胞内的各种结构有机地联结成一个整体。这两种内质

鼠肝细胞器的超速分离方法举例

Ⅰ.前处理:鼠肝匀浆,台式离心机1,000xg,10分,取上清,沉淀稀释后再1,000xg,10分,取上清,再重复一次取上清,三次上清液合并用于超速离心。Ⅱ. 密度梯度离心:日立超速离心机(各种型号)转头:P45AT(6×94ml,实际容量85ml)不连续蔗糖梯度:10%,20%,30%,40%,5

简述细胞器观察方法—尼氏小体观察

  1. 细胞器观察方法—尼氏小体观察:甲苯胺兰染色的牛脊髓涂片,尼氏小体即光镜下的粗面内质网。  2. 细胞器观察方法—尼氏小体观察:在低倍镜卡观察,染成蓝色的大三角形、星形细胞就是脊髓前角神经细胞,染色较深的小细胞为神经胶质细胞。  3. 细胞器观察方法—尼氏小体观察:转换高倍镜观察,可见脊髓前

差速离心法分离各种细胞器的原理

解析: 差速离心是指低速与高速离心交替进行,使各种沉降系数(不同的细胞器有不同的沉降系数)不同的颗粒先后沉淀下来,达到分离的目的。沉降系数差别在一个或几个数量级的颗粒,可以用此法分离。样品离心时,在同一离心条件下,沉降速度不同,通过不断增加相对离心力,使一个非均匀混合液内的大小、形状不同的粒子分部沉