用非线性预测方法研究蛋白质序列的特性(Ⅱ)
摘 要: 为了研究蛋白质序列的内在特性,通过非线性预测方法将蛋白质序列和随机序列以及混沌序列进行比较。前期研究可知:每条蛋白质序列的每个特征序列的误差比值( E2D) 图具有特异性,和随机序列的E2D 图相比具有明显差异。另外每条蛋白质序列的E2D 图曲线大体都在1 附近波动,波动走势没有任何规律可言。通过与给定混沌序列的E2D 图相比较,发现两者之间具有相似的特性。由此得出:蛋白质序列具有非随机性,可能具有非线性(混沌) 性。点击这里进入下载页面：进入下载页面......阅读全文
蛋白质序列分析和结构预测
【实验目的】1、掌握蛋白质序列检索的操作方法；2、熟悉蛋白质基本性质分析；3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测，了解基于motif、 结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测；4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素 (adiponectin)
蛋白质序列分析和结构预测
【实验目的】 1、掌握蛋白质序列检索的操作方法； 2、熟悉蛋白质基本性质分析； 3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测，了解基于motif、结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测； 4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】 1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素（ad
蛋白质序列分析和结构预测实验
蛋白质序列分析和结构预测实验 实验步骤 1. 人脂联素蛋白质序列的检索（1）调用Internet浏览器并在其
蛋白质序列分析和结构预测实验
实验步骤 1. 人脂联素蛋白质序列的检索（1）调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez）；（2）在Search后的选择栏中选择protein；（3）在输入栏输入homo sapiens adiponectin；
蛋白质序列分析和结构预测实验
实验步骤1. 人脂联素蛋白质序列的检索（1）调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez）；（2）在Search后的选择栏中选择protein；（3）在输入栏输入homo sapiens adiponectin；（
中国天眼揭秘宇宙“随机烟花”
FAST揭秘快速射电暴。课题组供图本报讯（记者崔雪芹）中国科学院国家天文台“中国天眼”（FAST）首席科学家李菂团队提出了一种全新的方法，全面分析了活跃的快速射电暴在时间-能量相空间中的行为。相关研究成果4月12日以封面文章形式发表于《科学通报》。“这一发现揭示了快速射电暴爆发的行为模式，展示了其不
预测蛋白质序列的新AI模型问世
使用CARBonAra进行序列预测（示意图）。图片来源：瑞士洛桑联邦理工学院科技日报北京8月8日电 （记者张佳欣）瑞士洛桑联邦理工学院开发了一种名为CARBonAra的新型人工智能（AI）驱动模型。该模型可以根据不同分子环境所施加限制的主链支架预测蛋白质序列，有望在蛋白质工程及包括医学和生物技术在内
预测蛋白质序列的新AI模型问世
瑞士洛桑联邦理工学院开发了一种名为CARBonAra的新型人工智能（AI）驱动模型。该模型可以根据不同分子环境所施加限制的主链支架预测蛋白质序列，有望在蛋白质工程及包括医学和生物技术在内的多个领域带来重大进展。这一成果发表在最新一期《自然·通讯》杂志上。CARBonAra是在一个包含约370000个
预测蛋白质序列的新AI模型问世
瑞士洛桑联邦理工学院开发了一种名为CARBonAra的新型人工智能（AI）驱动模型。该模型可以根据不同分子环境所施加限制的主链支架预测蛋白质序列，有望在蛋白质工程及包括医学和生物技术在内的多个领域带来重大进展。这一成果发表在最新一期《自然·通讯》杂志上。使用CARBonAra进行序列预测（示意图
预测蛋白质序列的新AI模型问世
瑞士洛桑联邦理工学院开发了一种名为CARBonAra的新型人工智能（AI）驱动模型。该模型可以根据不同分子环境所施加限制的主链支架预测蛋白质序列，有望在蛋白质工程及包括医学和生物技术在内的多个领域带来重大进展。这一成果发表在最新一期《自然·通讯》杂志上。CARBonAra是在一个包含约370000个
拨开重重迷雾如何在“混沌的边缘”预测未来
智能化将是复杂系统研究未来发展的一大方向。未来无论是5G、6G，还是工业互联网，人类的生产生活方式都将随着复杂系统研究的进展发生重大变化。 ——兰岳恒 北京邮电大学理学院物理系教授 北京时间10月5日，瑞典皇家科学院公布2021年诺贝尔物理学奖得主。今年的诺贝尔物理学奖颁给了两组科学家，真锅
蛋白质序列分析及结构预测策略包括哪些步骤
序列分析通常就是指同源性分析、保守位点分析，motif分析和功能预测等，结构预测通常又包括二级结构三级结构甚至四级结构，二级结构目前预测还是比较准确的，三级结构最简单的可以直接将蛋白序列提交swissmodel在线进行预测，也可以采用一些其他软件，如modeller和一些商业软件，主要原理是同源
预测蛋白质3D结构，单条蛋白质序列就能实现
7月22日，华深智药对外宣布，公司在蛋白质结构预测方面开发出一项新技术OmegaFold，突破了已有计算机预测三维结构的模式，是人工智能（AI）和生命科学领域结合实现的一个突破。华深智药是由清华大学人工智能产业研究院孵化，是一家致力于使用AI重构药物开发流程来提高新药研发速度和效率的企业。日前，华深
物种存亡或受随机性影响
两个相近物种存在于同一环境时，往往会有一方消亡。瑞典一项新研究认为，在这些物种存亡的过程中，随机性起着重要作用。 相似的物种之间存在竞争，因为需要争夺相同的食物、地盘和其他资源。传统观点认为，一个物种相对于另一个物种的某些优势会导致它在竞争中胜出。但有一种“生态漂移”理论认为，随机性也发挥着重
FAST新成果：快速射电暴随机时空行为揭秘
近日，基于被誉为“中国天眼”的500米口径球面射电望远镜（FAST）的丰富数据，中国科学院国家天文台研究员李菂带领的科研团队提出一种全新分析构架“Pincus-Lyaponov相图”，得以量化爆发事件的随机性和混沌性，揭示了快速射电暴的时间-能量表现与地震和太阳耀斑等存在本质区别，这种差异挑战了快速
真空中控制量子随机性首次实现
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504710.shtm 从真空波动生成可调随机数的实验装置。图片来源：美国科学促进会网站科技日报北京7月13日电 （记者张佳欣）据最新一期《科学》杂志报道，美国麻省理工学院研究人员在量子技术方面取得
真空中控制量子随机性首次实现
据最新一期《科学》杂志报道，美国麻省理工学院研究人员在量子技术方面取得了一项里程碑式的成就，首次展示了对量子随机性的控制。这不仅让科学家能重新审视量子光学中几十年前的概念，还开启了通向概率计算和超精密场感测领域更深处的大门。 论文主要作者之一查尔斯·罗克斯-卡姆斯博士正在操作该实验系统。
真空中控制量子随机性首次实现
据最新一期《科学》杂志报道，美国麻省理工学院研究人员在量子技术方面取得了一项里程碑式的成就，首次展示了对量子随机性的控制。这不仅让科学家能重新审视量子光学中几十年前的概念，还开启了通向概率计算和超精密场感测领域更深处的大门。 研究人员将重点放在量子物理的一种独特性质上，即所谓的“真空涨落”（也
蛋白质二级结构预测－综合各种分析方法预测
综合各种分析方法预测在实际进行蛋白质二级结构预测时，往往会综合应用各种分析方法和相关数据。综合方法不仅包括各种预测方法的综合，而且也包括结构实验结果、序列对比结果、蛋白质结构分类预测结果等信息的综合。实际应用中最常见的综合方法是同时使用多个软件进行预测，通过分析各个软件的特点以及各个软件预测结果，最
ChouFasman预测方法预测蛋白质二级结构
Chou-Fasman方法是一种基于单个氨基酸残基统计的经验参数方法，由Chou和Fasman在20世纪70年代提出来。通过统计分析，获得的每个残基出现于特定二级结构构象的倾向性因子，进而利用这些倾向性因子预测蛋白质的二级结构。每种氨基酸残基出现在各种二级结构中倾向或者频率是不同的，例如Glu主要出
苏州纳米所在半导体超晶格研究领域取得进展
超晶格概念自1970年一提出，就被认为是半导体物理领域一个具有里程碑意义的进展，在上世纪80年代和90年代成为半导体物理十分热门的研究领域。超晶格中微带输运和量子阱之间的级联共振隧穿会导致负微分电导效应，这使得超晶格成为一个理想的具有多个自由度的非线性系统。许多与空时非线性效应相关的物理现象都能
Science颠覆传统认知，揭示基因表达的随机性
来自Ludwig癌症研究所的研究人员揭示了一种现象，其有可能改变人们关于基因组如何表达从而生成及维持哺乳动物生命的一个普遍观点。这篇发表在《科学》(Science)杂志上的论文，帮助解释了为何基因相同的动物有时在生物学和外形上会如此的不同，以及为何由共同的一组异常基因引起的一些遗传疾病在不同个体
国家天文台揭秘快速射电暴随机时空行为
快速射电暴是来自宇宙深处短暂而强烈的无线电波爆发，在千分之一秒的时间内能够释放巨大的能量，足够驱动人类社会万亿年。2007年，科学家第一次发现快速射电暴，但这些强大的能量如何产生尚不清楚。科学家猜测，快速射电暴的源头可能是某种蕴含着极高能量密度的致密天体如中子星或黑洞。中子星的信号如同灯塔一样，规律
灵感来源于鲍鱼壳！科学家研制出真随机数生成器
近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员胡墅、研究员郭敬为、研究员谭彦楠团队提出了一种基于随机激光实现真随机数生成的新方法。该方法利用仿生随机激光相干模式作为物理熵源，实现了单通道随机数瞬时速率初步达到40Gbps，为真随机数的生成提供了新思路。相关成果发表在《光学快报》。随机数在安全通信、信息加密
灵感来源于鲍鱼壳！科学家研制出真随机数生成器
近日，中国科学院大连化学物理研究所研究员胡墅、研究员郭敬为、研究员谭彦楠团队提出了一种基于随机激光实现真随机数生成的新方法。该方法利用仿生随机激光相干模式作为物理熵源，实现了单通道随机数瞬时速率初步达到40Gbps，为真随机数的生成提供了新思路。相关成果发表在《光学快报》。随机数在安全通信、信息加密
土壤养分速测仪特征值与随机性和结构性
土壤养分速测仪对 测试样品区的土壤养分进行传统统计分析只能在一定程度上,反映了土壤养分含量的总体状况,不能准确定量描述土壤养分含量分布与随机性和结构性的变化。因 此,必须使用数据统计方法分析土壤养分的空间变异性。根据土壤养分速测仪的统计特征值,分析有机质、全磷、全钾、有效钾含量变异函数与高斯模型拟合
预测蛋白质相互作用的计算方法
蛋白质相互作用研究能够从分子水平上揭示蛋白质的功能，帮助揭示生长发育、新陈代谢、分化和凋亡等细胞活动的规律。在全基因组范围内识别蛋白质相互作用对是解释细胞调控机制的重要一步。随着蛋白质相互作用实验技术的发展，人们能够获得大量的蛋白质相互作用数据，甚至能够在全基因组范围内对蛋白质相互作用进行分析。
《Genome－Research》：根据基因组序列预测MRSA毒性
微生物毒力一直是一个复杂的多因素表型，与病原体的进化轨迹有着复杂的关联。毒性，破坏宿主细胞膜和粘附的能力，粘附到人体组织的能力，是许多细菌病原体的主要毒力因子，包括金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。 金黄色葡萄球菌是临床上常见的毒性较强的细菌，自从上世纪40
用动态融合策略提高长期时间序列预测性能
在数据分析和机器学习领域，时间序列预测一直是一个关键且具有挑战性的任务。它在经济、气象、交通等多个领域发挥着重要作用，其中长期时间序列预测因其复杂性和不确定性而更受关注。近日，中国科学院软件研究所天基综合信息系统全国重点实验室研究团队提出了一种新的动态融合频率方法，显著提高了长期时间序列预测的准确性
用动态融合策略提高长期时间序列预测性能
在数据分析和机器学习领域，时间序列预测一直是一个关键且具有挑战性的任务。它在经济、气象、交通等多个领域发挥着重要作用，其中长期时间序列预测因其复杂性和不确定性而更受关注。近日，中国科学院软件研究所天基综合信息系统全国重点实验室研究团队提出了一种新的动态融合频率方法，显著提高了长期时间序列预测的准确性