启动子和转录因子在动植物细胞中有不同的共演化模式

近日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员陈洛南团队与西北工业大学教授王文团队等在Zoological Research上在线发表题为Coevolutionary insights between promoters and transcription factors in the plant and animal kingdoms的研究论文。通过对跨越十亿年进化史、总共数百个动植物物种的启动子序列和转录因子理化性质分析,发现启动子和转录因子在动植物细胞中存在不同的共演化模式。 动物和植物从原始的单细胞生物(绿色鞭毛生物)分化并各自持续地演化,促成了地球上自然生态的多样性。在真核生物的基因转录和调控过程中,启动子和转录因子以及它们的相互作用扮演着决定性作用。然而,启动子和转录因子在物种水平上的演化轨迹及演化模式目前尚不清楚。 通过对跨越十亿年进化史,总计420个动物物种、223个植物物种的基因组序列分析和蛋白组理化性......阅读全文

转录因子Nanog的双重作用

  来自中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所的朱学良研究组发表了题为“Nanog suppresses cell migration by downregulating Thymosin β4 and Rnd3”的文章,发现干细胞转录因子Nanog可通过下调下游基因Thymosin

转化生长因子β信转录

磷酸化的RSMAD/coSMAD复合物进入细胞核,与转录启动子及转录辅助因子结合,引起DNA转录。成骨蛋白引起参与骨发生、神经形成及腹部中胚层分化的mRNA的转录。TGF-β引起参与细胞凋亡、细胞外基质再生及免疫抑制的mRNA的转录。它也与细胞周期中的G1期阻滞有关。激活素引起参与性腺生长、胚胎分化

转录因子定义和结合位点

定义人类金属巯基因调节区转录因子(transcription factor)是一群能与基因5`端上游特定序列专一性结合,从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子。结合位点转录因子的结合位点(transcription factor binding site,TFBS)是转录因子

分子遗传学词汇​转录因子

真核生物转录起始过程十分复杂,往往需要多种蛋白因子的协助,转录因子与RNA聚合酶Ⅱ形成转录起始复合体,共同参与转录起始的过程。根据转录因子的作用特点可分为二类;第一类为普遍转录因子,它们与RNA聚合酶Ⅱ共同组成转录起始复合体时,转录才能在正确的位置开始。除TFⅡD以外,还发现TFⅡA,TFⅡB,TF

ArrayStar转录因子活性ELISA检测法

ArrayStarTM转录因子活性ELISA试剂盒可以快速、灵敏地检测细胞核提取物中转录因子的DNA结合活性。试剂盒采用96微孔板,标记探针是生物素标记的双链寡核甘酸片段,含有转录因子的特异性DNA结合序列。当标记探针与细胞核抽提物一起孵育时,核抽提物中活性形式的转录因子与探针特异性结合,形成转录因

转录因子的基本信息介绍

  RNA的转录合成从化学角度来讲类似于DNA的复制,多核苷酸链的合成都是以5’→3’的方向,在3’-OH末端与加入的核苷酸形成磷酸二酯键,但是,由于复制和转录的目的不同,转录又具有其特点:  (1)对于一个基因组来说,转录只发生在一部分基因,而且每个基因的转录都受到相对独立的控制;  (2)转录是

通用转录因子的主要种类介绍

TFⅡD该通用转录因子识别TATA元件(大约在转录起始位点上游30个碱基对处)。像很多通用转录因子一样,TFⅡD实际上是一个多亚基复合体。TFⅡD中与TATA序列结合的成分称为TBP(TATA binding protein)。此复合体中的其他亚基称为TAF,即TBP关联因子(TBP-associa

精确转录因子结合位点绘图

  “掌握转录因子活动控制高等生物发育的基本原理非常有用,”纽约大学生物学系教授Stephen Small说。“更具体地讲,这项机理的发现为由于转录因子受到干扰的突变基因导致胚胎发育深层破坏和一系列疾病提供了一个潜在的治疗途径。”  这项研究发表于《Genes & Development》,参与研究

关于通用转录因子的成员介绍

  1、TFⅡD  该通用转录因子识别TATA元件(大约在转录起始位点上游30个碱基对处)。像很多通用转录因子一样,TFⅡD实际上是一个多亚基复合体。TFⅡD中与TATA序列结合的成分称为TBP(TATA binding protein)。此复合体中的其他亚基称为TAF,即TBP关联因子(TBP-a

高通量的转录因子活性检测

  转录因子(transcription factor,TF)在真核生物的基因表达过程中发挥着重要作用,或调节基因表达的强度,或控制目的基因的时空特异性表达,或应答外界刺激和环境胁迫。近年来,随着干细胞研究的不断升温,人们对转录因子的兴趣也日益浓厚。同一个基因组,为何最终分化成不

转录起始因子的功能介绍

中文名称转录起始因子英文名称transcription initiation factor定  义参与转录起始作用的因子。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

玉米转录因子ZmMADS47和籽粒转录因子Opaque2互作可协同调...

玉米转录因子ZmMADS47和籽粒转录因子Opaque2互作可协同调控醇溶蛋白的表达玉米(Zea mays)原产于墨西哥和中美洲地区,是一种由古印第安人(Indians)在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍(Euchlaenamexicana)(现存在于墨西哥和尼加拉瓜)杂交而来的品种。但是,作为一类

测量任一细胞因子转录因子的其他技术

虽然其他技术可以测量任一细胞因子,转录因子,或另外的磷酸化蛋白质,细胞内流式细胞仪可以测量多个细胞内标记同时上面的singlecell电平。这种方法提供了数据信号反应,分化状态,和其他细胞活动。特定的细胞表面和细胞内标记物的荧光抗体的结合使用使高分辨率的样本之间的多种细胞类型内的表型和功能的差异比较

靶向转录因子,阻止肺纤维化

  迄今为止,肺纤维化的分子机理还未能得到很好阐明。  本月一篇名为“男子喝百草枯经抢救,依然在后悔中痛苦离世”的新闻将几乎无药可救的肺纤维化疾病再次拉入大众视线。  12月7日,马克斯普朗克心肺研究所(Max Planck Institute for Heart and Lung Research

角朊细胞的其他转录因子介绍

  K17基因的上游启动子中有γ干扰素激活的STAT因子的结合位点,被称为γ干扰素活化序列(GAS),在皮肤发生迟发型接触性过敏时,STAT-91可转位至角朊细胞核内与启动子中的GAS元件结合而激活K17的表达[8]。兔K3基因的5’上游序列中则有NFκB的结合位点(5’GGGCTTTCC-3’),

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子转录因子分子量(kD)功能TBP30与TATA盒结合TFⅡ-B33介导RNA聚合酶Ⅱ的结合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35稳定TFⅡ-D的结合TFⅡ-I120促进TFⅡ-D的结合

分子遗传学词汇转录终止因子

中文名称:转录终止因子英文名称:transcription termination factor定  义:辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等),其作用导致转录终止。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子转录因子分子量(kD)功能TBP30与TATA盒结合TFⅡ-B33介导RNA聚合酶Ⅱ的结合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35稳定TFⅡ-D的结合TFⅡ-I120促进TFⅡ-D的结合

分子遗传学词汇转录终止因子

中文名称:转录终止因子英文名称:transcription termination factor定  义:辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等),其作用导致转录终止。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

分子遗传学词汇通用转录因子

中文名称:通用转录因子 外文名称:general transcription factors, GTFs定义:通用转录因子(general transcription factors, GTFs)  。真核生物中有效的和启动子特异性的起始过程中需要几个起始因子,这些起始因子称为通用转录因子  。

依赖ρ因子的转录终止的功能介绍

依赖ρ因子的转录终止:在依赖ρ因子终止的转录中,产物RNA的3'-端会依照 DNA 模板,产生较丰富而且有规律的C碱基。ρ因子正是识别产物 RNA 上这些终止信号序列,并与之结合。结合 RNA后的ρ因子和 RNA pol都可发生构象变化,从而使RNA pol的移动停顿,ρ因子中的解旋酶活性使

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子

RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子转录因子分子量(kD)功能TBP30与TATA盒结合TFⅡ-B33介导RNA聚合酶Ⅱ的结合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35稳定TFⅡ-D的结合TFⅡ-I120促进TFⅡ-D的结合

关于转录因子的基本信息介绍

  真核生物转录起始过程十分复杂,往往需要多种蛋白因子的协助,转录因子与RNA聚合酶Ⅱ形成转录起始复合体,共同参与转录起始的过程。根据转录因子的作用特点可分为二类;第一类为普遍转录因子,它们与RNA聚合酶Ⅱ共同组成转录起始复合体时,转录才能在正确的位置开始。除TFⅡD以外,还发现TFⅡA,TFⅡB,

转录因子的人工设计新方法

    人工设计转录因子来调控目标基因的表达已经不是梦想,基于锌指蛋白结构域的设计已经展开。锌指蛋白结构域能够结合于特定的三个碱基配对的DNA序列上。RNA干扰和反义核酸技术能够抑制基因的表达,而人工设计转录因子能够升高目标基因的表达,从而为疾病的新治疗方法开辟了新的思路。Nature Biotec

分子遗传学词汇转录延伸因子

中文名称:转录延伸因子英文名称:transcriptional elongation factor定  义:能够使基因转录不断进行的因子。如激活RNA聚合酶活性的蛋白质。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

Nature:缺失重要转录因子让血管“疯长”

  血管在动物整个生命过程中都扮演着重要角色。血管生长决定着器官是否能够在胚胎发育阶段及时得到营养供应,到了成年阶段,新血管的发育在血管修复和再生过程中发挥重要作用,血管生长过程的紊乱是癌症,糖尿病以及眼部疾病发展的重要因素。  最近来自德国的科学家发现血管内皮细胞的生长能够通过代谢机制进行调控,这

Sox2:从转录因子到免疫卫士

  近日著名的免疫学杂志《自然免疫》发表了中科院生物物理所关于转录因子Sox2在固有免疫中的重要作用:Sox2在中性粒细胞中能够充当胞内DNA传感器的作用,当Sox2结合了细菌DNA后,Sox2会通过激酶TAK1和转接蛋白TAB2介导下游信号通路,开始转录翻译一系列的促炎因子。  检测到细胞中的外源

分子遗传学词汇转录起始因子

中文名称:转录起始因子英文名称:transcription initiation factor定  义:参与转录起始作用的因子。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

亮氨酸拉链的转录因子的介绍

  酵母转录因子GCN4是通过亮氨酸拉链(bZIP)结构结合DNA的蛋白质之一,当GCN4二聚体与DNA结合时,亮氨酸拉链区的2个单体结合为平行的卷曲螺旋结构,而其基区由无规线团结构变为α螺旋.为探讨亮氨酸拉链蛋白与DNA的结合机理,设计了含有GCN4亮氨酸拉链蛋白基区结合DNA的必需氨基酸的折叠片

人工转录因子的部件——人类锌指结构1

Human zinc fingers as building blocks in the construction of artificial transcription factorsKwang-Hee Bae1, 4, Young Do Kwon1, 2, 4, Hyun-Chul Shin1,