启动子和转录因子在动植物细胞中有不同的共演化模式

近日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员陈洛南团队与西北工业大学教授王文团队等在Zoological Research上在线发表题为Coevolutionary insights between promoters and transcription factors in the plant and animal kingdoms的研究论文。通过对跨越十亿年进化史、总共数百个动植物物种的启动子序列和转录因子理化性质分析,发现启动子和转录因子在动植物细胞中存在不同的共演化模式。 动物和植物从原始的单细胞生物(绿色鞭毛生物)分化并各自持续地演化,促成了地球上自然生态的多样性。在真核生物的基因转录和调控过程中,启动子和转录因子以及它们的相互作用扮演着决定性作用。然而,启动子和转录因子在物种水平上的演化轨迹及演化模式目前尚不清楚。 通过对跨越十亿年进化史,总计420个动物物种、223个植物物种的基因组序列分析和蛋白组理化性......阅读全文

人工转录因子的部件——人类锌指结构1

Human zinc fingers as building blocks in the construction of artificial transcription factorsKwang-Hee Bae1, 4, Young Do Kwon1, 2, 4, Hyun-Chul Shin1,

分子遗传学词汇转录起始因子

中文名称:转录起始因子英文名称:transcription initiation factor定  义:参与转录起始作用的因子。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

Sox2:从转录因子到免疫卫士

  近日著名的免疫学杂志《自然免疫》发表了中科院生物物理所关于转录因子Sox2在固有免疫中的重要作用:Sox2在中性粒细胞中能够充当胞内DNA传感器的作用,当Sox2结合了细菌DNA后,Sox2会通过激酶TAK1和转接蛋白TAB2介导下游信号通路,开始转录翻译一系列的促炎因子。  检测到细胞中的外源

亮氨酸拉链的转录因子的介绍

  酵母转录因子GCN4是通过亮氨酸拉链(bZIP)结构结合DNA的蛋白质之一,当GCN4二聚体与DNA结合时,亮氨酸拉链区的2个单体结合为平行的卷曲螺旋结构,而其基区由无规线团结构变为α螺旋.为探讨亮氨酸拉链蛋白与DNA的结合机理,设计了含有GCN4亮氨酸拉链蛋白基区结合DNA的必需氨基酸的折叠片

能控制转录终止的蛋白质ρ因子

能控制转录终止的蛋白质ρ因子(ρ factor)是一种与转录终止相关的蛋白质。1969年,Roberts J在T4噬菌体感染的大肠杆菌中发现了能控制转录终止的蛋白质,命名为ρ因子。ρ因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量为46kD  。ρ因子能结合RNA,又以对poly C的结合能力最强 

真核生物上游启动子元件包括哪些

真核生物启动子有三类,分别由RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ进行转录。 类别Ⅰ(class Ⅰ)启动子: 只控制rRNA前体基因的转录,转录产物经切割和加工后生成各种成熟rRNA。 类别Ⅰ启动子由两部分保守序列组成: 核心启动子(core promoter):位于转录起点附近,从-45至+20; 上游控制元件

中国科学院揭示调控因子σI的启动子识别机制

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510398.shtm2023年10月13日,中国科学院生物物理研究所朱平研究团队与中国科学院青岛生物能源与过程研究所冯银刚研究团队合作,在《Nature Communications》杂志发表了题为"S

Cell:揭秘转录因子如何相互作用制造心脏

  刊登于Cell杂志上的一项研究报告中,来自格莱斯顿研究所(Gladstone Institutes)的科学家们近日通过研究发现三种转录因子可以彼此相互作用,并且同基因组相互作用从而影响胚胎心脏的形成,如果没有这些蛋白质(转录因子)的相互作用就会引发新生儿出现严重的先天性心脏缺损;通过理解心脏发育

Cell子刊发布首个植物转录因子文库

  近日科学家们借助自动化平台,建立了首个植物遗传学开关的综合性文库,以帮助全球学者更好的理解植物对环境改变的适应,培育更好的植物品种。相关论文于七月十七日发表在Cell旗下的Cell Reports杂志上。  该文库的建立耗时八年,包含大约两千个植物转录因子的克隆。转录因子是天然的遗传学开关,研究

转录因子MdERF2调控苹果表皮蜡质合成

近日,山东理工大学农业工程与食品科学学院教授李富军团队完成的研究在《农业科学学报(英文)》 (Journal of Integrative Agriculture,JIA)正式发表。该研究发现了转录因子MdERF2调控苹果表皮蜡质合成的分子机制。表皮蜡质是影响果蔬品质形成与保持的重要因子。植物激素乙

PIL家族转录因子抑制植物分蘖机制获解析

近日,山东省农业科学院水稻研究所研究员谢先芝、中国农业科学院作物科学研究所研究员孙加强和孔秀英等合作,报道了PIL家族转录因子直接与SPLs互作,并在抑制小麦、水稻和拟南芥分蘖/分枝方面发挥重要作用。相关论文在线发表于《新植物学家》。株高、分蘖数、分蘖角等结构是小麦、水稻等作物株型的重要决定因素之一

大鼠核转录因子(NFkB-)ELISA检测法

大鼠核转录因子(NF-kB )ELISA试剂盒 原理本实验采用双抗体夹心 ABC-ELISA法。用抗大鼠 NF-kB 单抗包被于酶标板上,标准品和样品中的 NF-kB 与单抗结合,加入生物素化的抗大鼠NF-kB ,形成免疫复合物连接在板上,辣根过氧化物酶标记的Streptavidin与生物素结合,加

Pol-II转录暂停因子NELF促进抗肿瘤免疫

多个转录因子在调控记忆T细胞分化中发挥重要作用,包括TCF1、FOXO1和MYB等。特别是,由TCF7基因编码的TCF1蛋白在T细胞发育、分化和耗竭(T cell exhaustion)时效应功能的保留中发挥着至关重要的作用。在免疫检查点阻断免疫疗法中,TCF1+ T细胞群的响应同样很关键。尽管目前

关于蛋白质分类的介绍

  真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录机构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所必须的。一般可将这些转录所需的蛋白质分为三大类:  (1)RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。  (2)某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复合物

关于基因转录的蛋白质的分类介绍

  真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录机构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所必须的。一般可将这些转录所需的蛋白质分为三大类:  (1)RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。  (2)某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复合物

如何证明基因需要转录调控元件调控表达

如何证明基因需要转录调控元件调控表达如果此转录因子能够激活靶启动子,则荧光素酶基因就会表达,从而对基因的表达起抑制或增强的作用,通过检测荧光的强度可以测定荧光素酶的活性:(1)构建一个将靶启动子的特定片段插入到荧光素酶表达序列前方的报告基因质粒,荧光素酶与底物反应,如pGL3-basic等。(3)

关于顺式作用元件的简介

  顺式作用元件是指与结构基因串联的特定DNA序列,是转录因子的结合位点,它们通过与转录因子结合而调控基因转录的精确起始和转录效率。  在分子遗传学领域,相对同一染色体或DNA分子而言为“顺式”(cis);对不同染色体或DNA分子而言为“反式”(trans)。  顺式作用元件是转录调节因子的结合位点

启动子是什么?

启动子 (promoter),是位于基因5'端上游紧靠转录起点的一段非编码序列,其功能是引导RNA 聚合酶与基因相应部位的正确结合,启动基因的转录。一般来说, 原核基因的启动子比较简单,只有数十个碱基组成,而真核基因的启动子较大,可能涉及数千个碱基。启动子有方向性, 位于结构基因转录起始点的

荧光素酶报告基因的应用原理

应用原理转录因子是一种具有特殊结构、行使调控基因表达功能的蛋白质分子,也称为反式作用因子。某些转录因子仅与其靶启动子中的特异序列结合,这些特异性的序列被称为顺式作用元件,转录因子的DNA结合域和顺式作用元件实现共价结合,从而对基因的表达起抑制或增强的作用。荧光素酶报告基因实验(luciferase

荧光素酶报告基因的应用原理

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